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| 1 | Metabolic and Signaling Aspects Underpinning the Regulation of Plant Carbon Nitrogen Interactions显示文摘除了光和水, CO2 和矿物质元素为植物生长和开发被要求。在这些因素之中,自从综合被需要,氮是批评的氨基酸,它是蛋白质,核苷酸,叶绿素,和众多的其它的造的元素代谢物和细胞的部件。因此,氮被植物在更高的数量要求,在氮的这项投资支持生产糖,器官的酸,和氨基酸的 CO2,水,和无机的氮的使用,生物资源累积的基本积木。这个系统被复杂新陈代谢的机械维持,它根据象光, CO2,和滋养的可获得性那样的环境因素在不同层次被调整。植物经由一个发信号的网络集成这些信号,它包含代谢物以及滋养察觉到的蛋白质。由于它的重要性,许多研究努力被花费了理解碳和氮新陈代谢怎么根据光合作用, photorespiration,和呼吸的率综合、调整。在这篇文章,因此,我们两个都象在 C3 种的照亮的叶子察觉到并且发信号系统一样在碳 / 氮新陈代谢讨论最近的进展并且提供现在被要求以便带我们的理解去高水平的实验的类型的一个观点。 | Adriano Nunes-Nesi Alisdair R. Fernie Mark Stitt | 2010 | Molecular Plant2010，3，6： | 32 |
| 2 | Metabolic and Phenotypic Responses of Greenhouse-Grown Maize Hybrids to Experimentally Controlled Drought Stress显示文摘到象干旱一样的不能生活的压力的改编是农业上的重要获得相关庄稼相似玉米。在在干旱是一个很主导的应力因素的气候的地区种的庄稼的提高的干旱公差的开发因此在植物繁殖起一个必要作用。以前的研究证明玉米收益潜力和提高的压力忍耐是联系特点。在这研究,我们为他们在一个温室实验处理干旱应力的能力分析了六个不同玉米混血儿。我们能从从不同机关与新陈代谢的数据在浇得好的条件下面并且在水限制下面测量的 morphophysiological 参数联合数据。这些不同机关拥有了不同代谢物作文,与显示最可观的 metabolome 变化追随者水缺乏的叶片。虽然我们能在干旱应力下面在代谢物层次显示出一般增加,包括在 TCA 周期的氨基酸,糖,糖白酒,和中介变化,这些变化不在以前基于领域试用数据被指定了为干旱容忍或易受影响的玉米混血儿之间是微分的。这里描述的数据与相当不同的生长源于一个温室实验的事实调节与相比这个领域里的可以解释忍耐为什么组织的天赋不能在这研究被证实。然而,我们能加亮象其层次某些生理的特点地相关很好的代谢物一样显示了保存回答到干旱的几代谢物。 | Sandra Witt Luis Galicia Jan Lisec Jill Cairns Axel Tiessen Jose Luis Araus Natalia Palacios-Rojas Alisdair R. Fernie | 2012 | Molecular Plant2012，5，2： | 12 |
| 3 | The Metabolic Response of Arabidopsis Roots to Oxidative Stress is Distinct from that of Heterotrophic Cells in Culture and Highlights a Complex Relationship between the Levels of Transcripts, Metabolites, and Flux显示文摘新陈代谢的调整是一重要,但是糟糕理解,到氧化应力的植物的反应的部分。在以前的研究(巴斯斯特等, 2007 ) ,在到由甲蔡醌的氧化应力的正式就职的文化的 Arabidopsis 房间的新陈代谢的反应被描绘。紧急情况幸存策略在 anabolism 的主要新陈代谢大部分在哪个是下面调整的赞成被揭开分解代谢并且抗氧化剂新陈代谢。在整个植物纸巾的反应可能是不同的,我们因此调查了 Arabidopsis 根的反应到甲蔡醌处理,分析有主要以及第二等的新陈代谢的焦点的 transcriptome, metabolome 和关键新陈代谢的流动。用氧化还原作用敏感的 GFP,甲蔡醌引起氧化还原作用不安,这也被显示出,不是就在线粒体,而且在根的 cytosol 和质体。在里面开始的 30 ? 处理的 min,反应类似于房间文化:在 TCA 周期和氨基酸生合成的代谢物有减少, transcriptomic 反应被 DNA 规章的蛋白质的起来规定统治。在 2 和 6 以后 ? 处理的 h,根的反应对房间文化不同。代谢物层次没仍然保持沮丧,但是相反恢复并且在 pyruvate 的情况中,一些氨基酸和脂肪族的 glucosinolates 在控制层次上面显示出稳定的增加。然而,在中央碳新陈代谢的流动的主要变化都没被观察,新陈代谢的抄本主要独立于相应代谢物变化了。一起,结果建议根纸巾能在氧化抑制以后恢复新陈代谢的活动并且为 glycolysis 和氧化戊糖磷酸盐小径加亮潜在地重要的角色。 | Martin Lehmann Markus Schwarzlander Toshihiro Obata Supaart Sirikantaramas Meike Burow Carl Erik Olsen Takayuki Tohge Mark D. Fricker Birger Lindberg Moiler Alisdair R. Fernie Lee J. Sweetlove Miriam Laxa | 2009 | Molecular Plant2009，2，3： | 8 |
| 4 | Combined Transcriptomics and Metabolomics of Arabidopsis thaliana Seedlings Exposed to Exogenous GABA Suggest Its Role in Plants Is Predominantly Metabolic显示文摘 | Albert Batushansky Menny Kirma Nicole Grillich David Toubiana Phuong Anh Pham Ilse Balbo Hillel Fromm Gad Galili Alisdair R. Fernie Aaron Fait | 2014 | Molecular Plant2014，7，6： | 7 |
| 5 | Induction of the AOX1D Isoform of Alternative Oxidase in A. thaliana T-DNA Insertion Lines Lacking Isoform AOX1A Is Insufficient to Optimize Photosynthesis when Treated with Antimycin A显示文摘植物呼吸被二条小径为电子转移描绘到 O2,也就是被连接到 ATP 生产的细胞色素小径(CP ) ,和其他的小径(AP ) ,没有伴随物 ATP,从 ubiquinol 的电子在哪儿,直接经由其他的 oxidase (AOX ) 转到 O2 生产。这条后者小径很好被适合在光过量电子处理,导致优化光合的性能。我们描绘了不表示主要 isoform 的 Arabidopsis thaliana 的 T-DNA-insertion 变异的线, AOX1A。处于标准生长条件,这些植物没由抗霉素 A 通过 CP 显示出电子流动的任何显型,而是限制,它导致 AOX1A 表示在野类型,在 aox1a 大美人异种的叶子导致了 AOX1D 的增加的表情。尽管有在异种的 AOX1D isoform 的增加的存在,抗霉素 A 引起了光合作用的抑制,增加了 ROS,并且当时,最终导致了放大的膜漏和坏死与相比野类型,它被禁止者仅仅在边际地影响。经由 CP 的电子流动什么时候被限制,因此出现 AOX1D 是不能的充分补偿 AOX1A 的损失。抑制的联合学习,联合了到代谢物介绍并且指向了 glycine decarboxylase 建筑群(GDC ) 的 P 蛋白质的表示分析,建议 aox1a 异种试图为 photorespiration 增加他们的能力。然而,给他们的缺乏,在当与抗霉素 A 对待时,任何一个 AOX1D 都不能充分补偿让 AOX1A 的缺乏优化光合作用的表示增加,是吸引人的。我们建议 aox1a 异种能进一步被用来有关对光合的性能和基因表示的 mitochondrial 氧化还原作用的影响证实当前的模型。 | Inga Strodtkotter Kollipara Padmasree Challabathula Dinakar Birgit Speth Pamela S. Niazi Joanna Wojtera Ingo Voss Phuc Thi Do Adriano Nunes-Nesi Alisdair R. Fernie Vera Linke Agepati S. Raghavendra Renate Scheibe | 2009 | Molecular Plant2009，2，2： | 5 |
| 6 | Catabolism of Branched Chain Amino Acids Supports Respiration but Not Volatile Synthesis in Tomato Fruits显示文摘分支链氨基酸 transaminases (BCAT ) 在分支链氨基酸白氨酸,异白氨酸,和缬氨酸的新陈代谢有一个关键角色。这些酶催化合成的最后步和这些氨基酸的降级的起始的步。尽管在植物的分叉的链氨基酸的 biosynthetic 小径广泛地被调查了,很多基因被描绘了,他们在植物的分解代谢完全还没被理解。我们以前在西红柿描绘了分叉的链氨基酸 transaminase 基因家庭,揭示 subcellular 本地化和六基因编码的酶的运动性质。这里,我们在水果开发期间检验了酶的可能的功能。我们进一步描绘了在分叉的链氨基酸 transaminases 的表示不同的转基因的植物 1 和 3,在线 overexpressing 任何一个 BCAT1 或 BCAT3 在在 BCAT1 和 volatiles 的层次缺乏的水果评估呼吸的率。我们测试的份量上经由喂实验的先锋和同位素,在水果 volatiles 的形成的分叉的链氨基酸和他们的相应 keto 酸的重要性。我们的结果不仅第一次在水果呼吸表明分叉的链氨基酸的重要性,而且揭示那 keto 酸,而非氨基酸,是为分叉的链风味 volatiles 的可能的先锋。 | Andrej Kochevenko Wagner L. Araujo Gregory S. Maloney Denise M. Tieman Phuc Thi Do Mark G. Taylor Harry J. Klee Alisdair R. Fernie | 2012 | Molecular Plant2012，5，2： | 4 |
| 7 | 低糖野生种与高糖栽培种西瓜果实代谢产物组分差异分析显示文摘采用高效液相色谱—串联质谱(UHPLC–MS/MS)技术对西瓜5份具有代表性的材料果实进行代谢产物分析,在此基础上选取栽培西瓜高糖材料‘97103’和野生西瓜低糖材料‘PI296341’,利用气相色谱—质谱联用(GC–MS)方法对主代谢产物进行定量分析。从成熟果实中定量鉴定出58种代谢物,其中22种在‘97103’和‘PI296341’间存在显著差异。韧皮部运输的棉籽糖在野生低糖材料果实中大量滞留,而在栽培高糖材料中极少积累。综合差异代谢物及其代谢途径分析发现,高糖材料‘97103’果实在水苏糖、棉籽糖等光合产物卸载途径及蔗糖积累代谢途径上的代谢产物积累较高;而低糖材料‘PI296341’,则在氨基酸代谢、有机酸代谢途径及6–磷酸葡萄糖等糖代谢途径上产物积累较高。这些发现为野生西瓜进化到栽培种果实品质的代谢产物积累和调控提供了重要依据,也可为提高西瓜品质提供指导。 | 崔霞霞 王亚钦 任毅 Alisdair R Fernie Saleh Alseekh 何洪巨 宫国义 张海英 郭绍贵 张洁 许勇 | 2018 | 园艺学报2018，45，4： | 4 |
| 8 | Is There a Metabolic Requirement for Photorespiratory Enzyme Activities in Heterotrophic Tissues?显示文摘Dear Editor, Photorespiration is an essential metabolic process in leaves that facilitates recovery of carbon lost by the oxygenase reaction of Rubisco and avoids the accumulation of the toxic product,2-phosphoglycolate (2PG) of this reaction (Bauwe et al.,2012).However,there is also evidence to suggest that photorespiration has a more complex role during normal growth than the mere detoxification of 2PG and the recovery of 3-phosphoglycerate (3PGA) (Bauwe et al.,2012).The current view is that photorespiration is an essential mechanism to maintain optimal photosynthesis,normal growth,and development of oxygenic photosynthetic organisms in an oxygen-containing environment (Bauwe et al.,2012). | Adriano Nunes-Nesi Alexandra Florian Andrew Howden Kathrin Jahnke Stefan Timm Hermann Bauwe Lee Sweetlove Alisdair R. Fernie | 2014 | Molecular Plant2014，7，1： | 3 |
| 9 | Mapping theArabidopsis Metabolic Landscape by Untargeted Metabolomics at Different Environmental Conditions显示文摘新陈代谢的染色体宽的协会研究(mGWAS ) ,因此,代谢物层次被认为是特点,帮助能解开新陈代谢的网络的基因基础。309 Arabidopsis 就职的一个总数在二个独立环境条件(控制和应力) 下面被种并且使遭到到介绍的 untargeted LC-MS-based metabolomic;获得的吸水的代谢物的层次在 GWAS 被使用。我们为超过 3000 半极的代谢物的 two-condition-based GWAS 导致了 123 高度解决的代谢物的察觉量的特点 loci ?(p 1.0E-08 ) 。有趣地,不同地,从在 Arabidopsis 主要代谢物,趋于被很多小效果的 loci 控制,的自然变化,我们在发现几个学生大效果的 loci 控制第二等的代谢物的变化的小效果的 loci 的一个广阔数字。two-condition-based GWAS 被集成用一个时间功课压力实验与导出网络的代谢物抄本关联跟随。通过这条综合途径,我们选择了在结构的基因和代谢物之间的 70 个关键候选人协会,并且试验性地验证了八个新奇协会,他们中的二个在二环境的出现微分基因规定学习了。我们表明联合有 time-course-derived 网络的基于 metabolomics 的 GWAS 两个都为识别代谢物基因协会在不同不能生活的环境下面执行了的大规模 untargeted 的力量,提供进 Arabidopsis 的新陈代谢的风景的新奇全球卓见。 | Si Wu Takayuki Tohge Alvaro Cuadros-lnostroza Hao Tong Hezi Tenenboim Rik Kooke Michael Meret Joost B. Keurentjes Zoran Nikoloski Alisdair R. Fernie Lothar Willmitzer Yariv Brotman | 2018 | Molecular Plant2018，11，1： | 3 |
| 10 | Complex Assembly and Metabolic Profiling of Arabidopsis thaliana PlantsOverexpressing Vitamin B6 Biosynthesis Proteins显示文摘在植物,维生素 B6 生合成要求 PDX1 和 PDX2 蛋白质的活动。Arabidopsis thaliana 为三 PDX1 蛋白质编码,命名 PDX1.1, 1.2,和 1.3,但是仅仅一 PDX2。这里,我们在 PDX 蛋白质的 planta 建筑群汇编出现,基于 split-YFP 和 FPLC 试金,并且能在约 750 的更高的建筑群表明他们的存在 ? kDa。宫外地表示不同 PDX 蛋白质的植物的新陈代谢的介绍为 PDX1.3 明确地在在异常维生素 B6 内容, PDX1 基因表示,和轻敏感之间的维生素 B6 生合成和关联上显示 PDX1.2 的否定影响。这些调查结果提供第一卓见进在 planta 维生素 B6 synthase,不同 PDX 蛋白质怎么影响的复杂汇编和新信息种新陈代谢。 | Jan Erik Leuendorf Sonia Osorio Agnieszka Szewczyk Alisdair R. Fernie Hanjo Hellmann | 2010 | Molecular Plant2010，3，5： | 3 |
| 11 | Quantitative Trait Loci Analysis Identifies a Prominent Gene Involved in the Production of Fatty Acid-Derived Flavor Volatiles in Tomato显示文摘到进在西红柿的类脂化合物新陈代谢的基因规定的获得卓见,我们进行了跟随水果果皮和茄属 pennellii 基因渗入的叶织物介绍的 lipidomic 的分析衬里的新陈代谢的特点 loci (mQTL )(IL ) 。提高为选择水果特定的 mQTL 印射分辨率,我们在独立地导出的 S 的一个子集介绍了类脂化合物。pennellii 回交生来的线,以及在 near-isogenic sub-IL ? 人口。我们识别了控制班 III 脂肪分解酵素家庭, LIP1 和 LIP2 的几类脂化合物,和二个成员的层次的通常认为的 lecithin:cholesterol acyltransferase,那与 diacylglycerols (DAG ) 和 triacylglycerols (标签) 的减少的层次被联系。这个班的脂肪分解酵素从 acylglycerols 的甘油脊梁劈开丰满的酸。释放的丰满的酸用作风味 volatiles 的先锋。我们证明那 LIP1 表情与丰满的导出酸的不稳定的层次相关。我们进一步用转基因的植物在标签和 DAG 故障和不稳定的合成证实 LIP1 的功能。一起拿,我们的学习广泛地在西红柿描绘了脂性的混合物的基因建筑学并且在分子的水平证明从甘油脊梁的免费的丰满的酸的版本能在下游地不稳定的合成上有主要影响。 | Karolina Garbowicz Zhongyuan Liu Saleh Alseekh Denise Tieman Mark Taylor Anastasiya Kuhalskaya Itai Ofner Dani Zamir Harry J. Klee Alisdair R. Fernie Yariv Brotman | 2018 | Molecular Plant2018，11，9： | 2 |
| 12 | Analysis of the Interface between Primary and Secondary Metabolism in Catharanthus roseus Cell Cultures Using ^13C-Stable Isotope Feeding and Coupled Mass Spectrometry显示文摘Dear Editor, The tropical plant Madagascar periwinkle Catharanthus roseus (L.) G.Don is a rich source of plant-derived medicinal terpenoid indole alkaloids (TIAs),including the anti-hypertensive ajmalicine,the sedative compound serpentine,and the anticancer drugs vinblastine and vincristine.However,the latter two compounds are produced in C roseus plants only in very low amounts.Elicitors such as hormones (e.g.jasmonates or salicylic acid) activate plant natural defense responses,including increased secondary metabolite production (EI-Sayed and Verpoorte,2007;Lackman et al.,2011).There are two different metabolic pathways for the biosynthesis of terpenoids leading to the formation of the Cs central precursor isopentenyl diphosphate (IPP),namely the classical cytosolic mevalonate pathway and the mevalonate-independent plastidic 2-C-methyI-D-erythritol 4-phosphate (MEP) pathway. | Carla Antonio Natali R. Mustafa Sonia Osorio Takayuki Tohge Patrick Giavalbco Lothar Willmitzer Heiko Rischer Kirsi-Marj Oksman-Caldentey Robert Verpoorte Alisdair R. Fernie | 2013 | Molecular Plant2013，6，2： | 2 |
| 13 | GC–MS libraries for the rapid identification of metabolites in complex biological samples显示文摘 | Nicolas Schauer Dirk Steinhauser Sergej Strelkov Dietmar Schomburg Gordon Allison Thomas Moritz Krister Lundgren Ute Roessner-Tunali Megan G. Forbes Lothar Willmitzer Alisdair R. Fernie Joachim Kopka | 2005 | FEBS Letters2005，，6： | 2 |
| 14 | Analysis of Short-Term Metabolic Alterations in Arabidopsis Following Changes in the Prevailing Environmental Conditions显示文摘尽管我们有关到相反的 growthconditions 的新陈代谢的调整的重要性的知识的可观的增加最近被提供了,相对,很少对响应 fluctuationin 发生的调整被知道环境因素。评估发生在这样改变环境条件下面的新陈代谢的调整增加我们在是影响 bysuch 的主要小径之间的串音的当前的理解的好机会调节的 offersa。到这个目的,在正常条件下面成长的植物被转移到不同的光,温度 conditionswhich 被期望影响(在另外的过程之中) 光合作用和 photorespiration 和 characterizedat 的率跟随这转变的生理、分子、新陈代谢的层次。我们的结果揭示了类似的行为 inresponse 到处理并且与植物 metabolism.They 的小径进一步加亮的专业一起暗示 photorespiration 的一个紧密的连接这些小径的规定的多数没在叶新陈代谢是的 transcriptionbut 的水平被调停,这相当预先平衡在这些输入 parameters.Key 适应变化词: | Alexandra Florian Zoran Nikoloski Ronan Sulpice Stefan Timm Wagner L. Araujo Takayuki Tohge Hermann Bauwe Alisdair R. Fernie | 2014 | Molecular Plant2014，7，5： | 2 |
| 15 | At Long Last: Evidence for Pexophagy in Plants显示文摘 | Tamar Avin-Wittenberg Alisdair R. Fernie | 2014 | Molecular Plant2014，7，8： | 2 |
| 16 | Mild Reductions in Mitochondrial NAD- Dependent Isocitrate Dehydrogenase Activity Result in Altered Nitrate Assimilation and Piqmentation But Do Not Impact Growth显示文摘 | Agata Sienkiewicz-Porzucek Ronan Sulpice Sonia Osorio Ina Krahnert Andrea Leisse Ewa Urbanczyk-Wochniak Michael Hodges Alisdair R. Fernie Adriano Nunes-Nesi | 2010 | Molecular Plant2010，3，1： | 2 |
| 17 | Active Metal Brazing of Zirconia显示文摘 | W B Hanson K I Ironside J A Fernie | 2000 | Acta Materialia2000，48，： | 1 |
| 18 | Metaboliteprofiling:From diagnostics to systems biology显示文摘 | FERNIE A R TRTHEWEY R N KROTZKY A J | 2004 | Nature Reviews MolecularCell Biology2004，，5： | 1 |
| 19 | Mechanical response of the lumbar spine to seated postural loads显示文摘 | Hedman TP Fernie GR | 1997 | Spine1997，22，7： | 1 |
| 20 | Mechanical response of the lumbar spine to seated postural loads显示文摘 | Hedman TP Fernie GR | 1997 | Spine1997，22，7： | 1 |
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