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1Activation and signaling of the p38 MAP kinase pathway显示文摘The family members of the mitogen-activated protein (MAP) kinases mediate a wide variety of cellular behaviors in response to extracellular stimuli. One of the four main sub-groups, the p38 group of MAP kinases, serve as a nexus for signal transduction and play a vital role in numerous biological processes. In this review, we highlight the known characteristics and components of the p38 pathway along with the mechanism and consequences of p38 activation. We focus on the role of p38 as a signal transduction mediator and examine the evidence linking p38 to inflammation, cell cycle, cell death, development, cell differentiation, senescence and tumorigenesis in specific cell types. Upstream and downstream components of p38 are described and questions remaining to be answered are posed. Finally, we propose several directions for future research on p38.Tyler ZARUBIN 2005Cell Research2005,15,1:148
2Wnt signaling in disease and in development显示文摘The highly conserved Wnt secreted proteins are critical mediators of cell-to-cell signaling during development of animals. Recent biochemical and genetic analyses have led to significant insight into understanding how Wnt signals work. The catalogue of Wnt signaling components has exploded. We now realize that multiple extracellular, cytoplasmic, and nuclear components modulate Wnt signaling. Moreover, receptor-ligand specificity and multiple feedback loops determine Wnt signaling outputs. It is also clear that Wnt signals are required for adult tissue maintenance. Perturbations in Wnt signaling cause human degenerative diseases as well as cancer.Roel NUSSE 2005Cell Research2005,15,1:83
3SHEsis,a powerful software platform for analyses of linkage disequilibrium,haplotype construction,and genetic association at polymorphism loci显示文摘In multiloci-based genetic association studies of complex diseases, a powerful and high efficient tool for analyses oflinkage disequilibrium (LD) between markers, haplotype distributions and many chi-square/p values with a large numberof samples has been sought for long. In order to achieve the goal of obtaining meaningful results directly from raw data,we developed a robust and user-friendly software platform with a series of tools for analysis in association study withhigh efficiency. The platform has been well evaluated by several sets of real data.Yong Yong SHI1,2, Lin HE2,3,*1Bio-X Life Science Research Center, Shanghai Jiao Tong University, Shanghai, China 2Institute for Nutritional Sciences, Shanghai Institute of Biological Sciences, Chinese Academy of Sciences, Shanghai,China 3NHGG, Bio-X Center, Shanghai Jiao Tong University, Shanghai, China 2005Cell Research2005,15,2:375
4Beyond tumorigenesis: cancer stem cells in metastasis显示文摘在肿瘤开始的癌症干细胞(CSC ) 的重要性坚定地在白血病被建立了并且最近为许多稳固的肿瘤报导了。然而,特别地关于转移,在多级式的癌症前进的 CSC 的角色有不定义 beenwell。癌症转移要求在远机关播种和 specializedCSCs 的成功的殖民。正常干细胞和 CSC 的生物学分享显著类似并且当适用于癌症的学习时,可以有重要含意转移。而且,重叠分子和小径的集合最近被识别了调整干细胞移植和癌症转移。这些分子组成两个都为移植 CSC 由主要肿瘤和养育的机关微型环境的形成便于转移前壁龛的开始的细胞的相互作用的一个复杂网络。在这评论,我们在这个动态领域里调查了最近的进展并且建议 CSC 在 tumorigenesis 和转移在假定一个中央角色的癌症前进的一个统一模型。更好作为变形串联的一个基本部件理解 ofCSCs 将对变形癌症导致新奇治疗学的策略。Feng Li Benjamin Tiede Joan Massague Yibin Kang 2007Cell Research2007,17,1:85
5Physiological functions of Atg6/Beclin 1: a unique autophagy-related protein显示文摘真核细胞的房间的最惹人注目的形态特征是各种各样的围住膜的分隔空间的存在。包括细胞器和短暂运输中介,这些分隔空间不是静态的。更确切地说,蛋白质和膜的动态交换被需要维持细胞的动态平衡。膜动员的最戏剧的例子之一在 macroautophagy 的过程期间被看见。Macroautophagy 是为长寿蛋白质和细胞器的降级的主要细胞的小径。响应环境暗示,例如饥饿或应力的另外的类型,房间生产唯一的膜结构, phagophore.The phagophore 扣押它形成一个双膜 cytosolic 泡的细胞质, anautophagosome。在结束之后, autophagosome 与溶酶体熔化或在酵母的一个液泡,它交付水疗院放射激光与它的货物,和产生大分子一起毁坏内部 autophagosome 膜回来被释放进 cytosol 因为 reuse.Autophagy 因此是正在骑车过程,允许房间熬过滋养的限制的时期;然而,它有一个更宽的生理的角色,参予开发和老化,并且另外在对病原体侵略,癌症和某些 neurodegenerative 的保护疾病。在许多情况中, autophagy 的角色通过 autophagy 相关的蛋白质的研究被识别, Atg6/Beclin 1。这蛋白质是类脂化合物 kinase 建筑群的部分,并且最近的研究建议它在协调 autophagy 并且在反对 apoptosis 的细胞的死亡过程的 thecytoprotective 功能起一个中央作用。这里,我们总结我们 Atg6/Beclin 的当前的知识 1 在在细胞的不同模型有机体和它的唯一的功能。Yang Cao Daniel J Klionsky 2007Cell Research2007,17,10:100
6MicroRNA-21 targets tumor suppressor genes in invasion and metastasis显示文摘MicroRNAs (miRNAs ) 是在 post-transcriptional 指向编码蛋白质的 mRNAs 的小非编码的 RNA 铺平的自然地发生的一个班。我们的以前的研究建议 mir-21 作为 oncogene 工作并且在 tumorigenesis 有一个角色,部分地通过肿瘤的规定压制或基因对流肌浆球蛋白 1 (TPM1 ) 。给那 TPM1 在房间移植被含有,在我们进一步调查了的这研究在房间侵略和肿瘤转移的 mir-21 的角色。我们发现在变形乳癌 MDA-MB-231 房间的 mir-21 的抑制显著地减少了侵略和肺转移。与这一致, TPM1 的宫外的表示显著地减少了房间侵略。而且,我们识别了二个另外的直接 mir-21 目标,规划房间死亡 4 (PDCD4 ) 并且妈大头针,哪个在侵略和转移被含有。象 TPM1 一样, PDCD4 和妈大头针也减少了 MDA-MB-231 房间的侵略海角。最后, PDCD4 的表示和妈大头针相反地在人的胸肿瘤标本与 mir-21 表示相关,显示由在这些肿瘤的 mir-21 的 PDCD4 和妈大头针的潜在的规定。总起来说,结果建议作为 oncogenic miRNA, mir-21 由指向多重肿瘤 / 转移不仅在肿瘤生长而且在侵略和肿瘤转移有一个角色压制或基因。因此, mir-21 的抑制可以为先进癌症的治疗提供一条新奇途径。Shuomin Zhu Hailong Wu Fangting Wu Daotai Nie Shijie Sheng Yin-Yuan Mo 2008Cell Research2008,18,3:205
7Characterization of microRNAs in serum: a novel class of biomarkers for diagnosis of cancer and other diseases显示文摘在各种各样的纸巾的 microRNAs (miRNAs ) 的 Dysregulated 表示与许多疾病被联系了,包括癌症。这里,我们证明 miRNAs 在象老鼠,老鼠,牛的胎儿,小牛,和马那样的人和另外的动物的浆液和血浆是在场的。在浆液的 miRNAs 的层次在一样的种类的个人之中稳定、可再现、一致。采用 Solexa,我们定序健康中国题目的所有浆液 miRNAs 并且分别地在男、女的题目发现超过 100 和 91 浆液 miRNAs。我们也为肺癌症, colorectal 癌症,和糖尿病识别了浆液 miRNAs 的特定的表示模式,提供证据那浆液 miRNAs 为各种各样的疾病包含指纹。癌症特定的浆液 miRNAs 由 Solexa 获得了的二个非小的房间肺进一步在 75 个健康施主和 152 个癌症病人的独立审判被验证,用量的反向的抄写聚合酶链反应试金。通过这些分析,我们断定浆液 miRNAs 能为各种各样的癌症和另外的疾病的察觉用作潜在的 biomarkers。Xi Chen Yi Ba Lijia Ma Xing Cai Yuan Yin Kehui Wang Jig ang Guo Yujing Zhang Jiangning Chen Xing Guo Qibin Li Xiaoying Li Wenjing Wang Yan Zhang Jin Wang Xueyuan Jiang Yang Xiang Chen Xu Pingping Zheng Juanbin Zhang Ruiqiang Li Hongjie Zhang Xiaobin Shang Ting Gong Guang Ning Jun Wang Ke Zen Junfeng Zhang Chen-Yu Zhang 2008Cell Research2008,18,10:975
8Isolation and initial characterization of GW5, a major QTL associated with rice grain width and weight显示文摘谷物重量是庄稼谷物产量的一个主要决定因素并且被自然地发生的量的特点 loci (QTL ) 控制。我们更早识别了控制米饭谷物宽度和重量的主要 QTL, GW5,它在米饭染色体 5 上被印射到一个再结合热点。获得 GW5 怎么控制米饭谷物宽度的更好的理解,我们进行了这个地点的好印射并且揭开在米饭栽培变种 Asominori 与增加的谷物宽度联系的 1 212-bp 删除,与苗条谷物米饭 IR24 比较。另外, 46 米饭栽培变种的 genotyping 分析表明这删除高度与谷物宽度显型被相关,建议 GW5 删除可能在米饭驯服期间被选择了。GW5 编码对原子核局部性的 144 氨基酸的新奇原子蛋白质。而且,我们证明 GW5 身体上在酵母与 polyubiquitin 交往二混血儿的试金。一起,我们的结果建议 GW5 代表主要 QTL 内在的米饭宽度和重量,并且它多半在 ubiquitin-proteasome 小径行动在种子开发期间调整房间分割。这研究提供新奇卓见进控制米饭谷物开发的分子的机制并且建议 GW5 能为庄稼的产量很高的繁殖用作一个潜在的工具。Jianfeng Weng Suhai Gu Xiangyuan Wan He Gao Tao Guo Ning Su Cailin Lei Xin Zhang Zhijun Cheng Xiuping Guo Jiulin Wang Ling Jiang Huqu Zhai Jianmin Wan 2008Cell Research2008,18,12:248
9TGF-β-induced epithelial to mesenchymal transition显示文摘在开发期间并且在不同形态基因的事件的上下文,上皮的房间经历对间充质的转变或 transdifferentiation (EMT ) 上皮的叫的一个过程。在这个过程,房间失去他们的上皮的特征,包括他们的极性和专业化房间房间接触,并且获得迁移的行为,甚至在遥远的地点,允许他们移动离开他们的上皮的房间社区并且集成到包围织物。EMT 在开发期间说明区别粘性并且被另一进程补充,打电话对上皮的转变间充质(相遇) 。当在开发期间是一个不可分的过程时, EMT 也在病理学的条件下面被概括,显著地在纤维变性并且在癌的侵略和转移。因此, EMT 在肿瘤前进被看作重要的步。发信号的 TGF- 尾被显示了在 EMT 起一个重要作用。事实上,在文化把 TGF- 尾加到上皮的房间是在各种各样的上皮的房间导致 EMT 的一个方便方法。尽管更不描绘的、上皮的粘性能被 TGF- 也调整,尾 - 联系了骨头形态基因的蛋白质(BMP ) ,和 BMP 被显示了导致 EMT 或相遇取决于发展上下文。在这评论,我们将响应 TGF- 尾讨论 EMT 的正式就职,并且集中于内在的发信号和抄写机制。Jian Xu Samy Lamouille Rik Derynck 2009Cell Research2009,19,2:218
10Highly efficient differentiation of human ES cells and iPS cells into mature pancreatic insulin-producing cells显示文摘人的 pluripotent 干细胞代表功能的胰腺的内分泌的系房间的潜在地无限的来源。这里,我们报导一条高度有效的途径导致人的胚胎的茎(ES ) 细胞和导致的 pluripotent 茎(iPS ) 在一个定义化学药品的文化系统区分进成熟生产胰岛素的细胞的细胞。这条途径获得的区分的人的 ES 房间由流动 cytometry 分析作为 assayed 包括了将近 25% 胰岛素积极的房间,它以比得上成年人的小岛的一种方式响应葡萄糖刺激释放了 insulin/C-peptide。大多数这些生产胰岛素的房间共同表示成熟尾房间特定的标记象 NKX6-1 和 PDX1 那样,在 vivo 显示一个类似的基因表示模式到成年小岛尾房间。在这研究,我们也证明 EGF 便于 PDX1 积极的胰腺的祖先的扩大。而且,我们的协议也成功了高效地导致人的 iPS 房间区分进生产胰岛素的房间。因此,这个工作不仅提供一个新模型在 vitro 学习人的胰腺的专门化和成熟的机制,而且提高为糖尿病的处理利用病人特定的 iPS 房间的可能性。Donghui Zhang Wei Jiang Meng Liu Xin Sui Xiaolei Yin Song Chen Yan Shi Hongkui Deng 2009Cell Research2009,19,4:90
11A partition-ligation-combination-subdivision EM algorithm for haplotype inference with multiallelic markers: update of the SHEsis (http://gffzzfcd63c5b87fd4ae2hfc0nwk5cbpk96vxw.ffgz.tsg.suse.edu.cn)显示文摘Zhiqiang Li Zhao Zhang Zangdong He Wei Tang Tao Li Zhen Zeng Lin He Yongyong Shi 2009Cell Research2009,19,4:122
12Crosstalk of reactive oxygen species and NF-kB signaling显示文摘2011Cell Research2011,21,1:97
13NF-kB and STAT3-key players in liver inflammation and cancer显示文摘2011Cell Research2011,21,1:119
14NF-KB in immunobiology显示文摘Matthew S Hayden Sankar Ghosh 2011Cell Research2011,21,2:101
15Regulation of chromatin by histone modifications显示文摘染色质不是惰性的结构,而是能对外部暗示作出回应调整 DNA 的许多使用的有启发性的 DNA 脚手架。在这条规定起一个关键作用的染色质的一个原则部件是 histones 的修正。有这些修正的一张曾经成长的表,他们的行动的复杂性开始仅仅仅仅正在理解。然而, histone 修正在涉及 DNA 的操作和表达式的很生物的进程起基本作用,是清楚的。这里,我们描述已知的 histone 修正,定义他们在哪儿 genomically 被发现并且讨论一些他们的功能的后果,主要专注于描述的多数发生了的抄写。Andrew J Bannister Tony Kouzarides 2011Cell Research2011,21,3:178
16Exogenous plant MIR168a specifically targets mammalian LDLRAPI: evidence of cross-kingdom regulation by microRNA显示文摘Lin Zhang Dongxia Hou Xi Chen Donghai Li Lingyun Zhu Yuj ing Zhang Jing Li Zhen Bian Xiangying Liang Xing Cai Yuan Yin Cheng Wang Tianfu Zhang Dihan Zhu Dianmu Zhang Jie Xu Qun Chen Yi Ba Jing Liu Qiang Wang Jianqun Chen Jin Wang Meng Wang Qipeng Zhang Junfeng Zhang Ke Zen Chen-Yu Zhang 2012Cell Research2012,22,1:155
17Photoperiod- and thermo-sensitive genic male sterility in rice are caused by a point mutation in a novel noncoding RNA that produces a small RNA显示文摘光周期敏感、 thermo 敏感的遗传因子的男绝育(PGMS 和 TGMS ) 是为在庄稼的混合繁殖的核心部件。基于使用的较普通活字大一倍的系统, PGMS 和 TGMS 衬里的混合大米是成功地在农业广泛地发展了并且适用。然而,位于 PGMS 和 TGMS 的控制下面的分子的机制仍然保持阴暗。在这研究,我们印射并且克隆一个主要地点, p/tms12-1 (染色体 12 上的感光性或 thermo 敏感的遗传因子的男绝育地点) 它在装饰用的梨树米饭线 Nongken 58S (NK58S ) 授与 PGMS 和在 indica 米饭的 TGMS 衬里 Peiai 64S (PA64S,源于 NK58S ) 。包含野类型的等位基因 P/TMS12-1 的 A 2.4-kb DNA 碎片能在基因互补恢复 NK58S 和 PA64S 植物的花粉富饶。P/TMS12-1 编码唯一的 noncoding RNA,它生产 21 核苷酸我们说出 osa-smR5864w 的小 RNA。在 p/tms12-1 的 C-to-G 的替换,相对 P/TMS12-1 的唯一的多型性,在变异的小 RNA 是在场的,也就是 osa-smR5864m。而且,在转基因的 NK58S 和 PA64S 植物的 P/TMS12-1 的一个 375-bp 序列的 overexpression 也生产了 osa-smR5864w 并且恢复了花粉富饶。小 RNA 在年轻圆锥花序优先地被表示,但是它的表示没被不同的天长度或温度显著地影响。我们的结果表明在 p/tms12-1 的点变化,可能为 osa-smR5864m 导致 loss-of-function,分别地在装饰用的梨树和 indica 线为 PGMS 和 TGMS 组成一个普通原因。我们的调查结果因此建议那小 RNA 基因是的这 noncoding 男开发的一个重要管理者由在基因网络和环境条件之间的串音控制了。Hai Zhou Qinjian Liu Jing Li Dagang Jiang Lingyan Zhou Ping Wu Sen Lu Feng Li Liya Zhu Zhenlan Liu Letian Chen Yao-Guang Liu Chuxiong Zhuang 2012Cell Research2012,22,4:99
18The novel quantitative trait locus GL3.1 controls rice grain size and yield by regulating Cyclin-T1;3显示文摘增加的庄稼收益被要求支持世界范围的快速的人口生长。谷物重量是米饭产量的一个关键部件,但是控制它的内在的分子的机制留下逃犯。这里,我们报导为米饭谷物长度,重量和产量的控制克隆和一个新量的特点地点(QTL ) 的描述。这个地点, GL3.1,编码蛋白质磷酸酶 kelch (PPKL ) 家庭 —Ser/Thr 磷酸酶。GL3.1 是大谷物 WY3 变化的一个成员,它比小谷物 FAZ1 变化与更弱的 dephosphorylation 活动被联系。GL3.1-WY3 在小穗状花小穗影响蛋白质 phosphorylation 加速房间分割,从而导致更长的谷物和更高的收益。进一步的研究直接显示出那 GL3.1 dephosphorylates 它的底层, Cyclin-T1; 3,它很少仅仅在植物被学习了。Cyclin-T1 的 downregulation; 3 在更短的谷物导致了米饭,它在房间周期规定为 Cyclin-T 显示新奇功能。我们的调查结果为通过影响 Cyclin-T1 的 phosphorylation 的新奇调停磷酸酶的进程被驾驶的谷物尺寸和产量的规定建议新机制; 3 在房间周期前进期间,并且这样提供新卓见进位于庄稼种子开发下面的机制。我们引起了包含表明了增加的谷物产量的自然 GL3.1 等位基因的一个新变化,它显示 GL3.1 是为引起产量很高的庄稼的一个强大的工具。Peng Qi You-Shun Lin Xian-Jun Song Jin-Bo Shen Wei Huang Jun-Xiang Shan Mei-Zhen Zhu Liwen Jiang Ji-Ping Gao Hong-Xuan Lin 2012Cell Research2012,22,12:132
19Genome editing with RNA-guided Cas9 nuclease in Zebrafish embryos显示文摘有类型 II 的最近的进展定期聚类 interspaced 短 palindromic 重复(CRISPR ) 系统诺言染色体编辑的一条改进途径。然而,在模型有机体的这个系统的适用性和效率例如 zebrafish,几乎没被学习。这里,我们报导那指导 RNA 的 Cas9 核酸酶高效地便于染色体以一种简单、柔韧的方式在哺乳动物的房间和 zebrafish 胚胎编辑。当特定的 Cas/gRNA 被用来在 vivo 在 zebrafish 胚胎指向任何一个 etsrp, gata4 或 gata5 时,超过 35% 地点特定的体的变化被发现。Cas9/gRNA 高效地在结果导致了 etsrp 或 gata5 的 biallelic 变换体的房间,在 etsrp 在 fau 异种胚胎或贲门 bifida 显型 > tm236a 异种胚胎。最后,我们成功地完成了 Cas9/gRNA 系统在 zebrafish 胚胎导致的 mloxP 顺序的地点特定的插入。这些结果证明 Cas9/gRNA 系统有为 zebrafish 和另外的模型有机体成为一个简单、柔韧、有效的反向的基因工具的潜力。和另外的染色体工程技术, Cas9 系统为在生物学,农业,环境研究和药的应用是有希望的。Nannan Chang Changhong Sun Lu Gao Dan Zhu Xiufei Xu Xiaojun Zhu Jing-Wei Xiong Jianzhong Jeff Xi 2013Cell Research2013,23,4:155
20Efficient genome editing in plants using a CRISPR/Cas system显示文摘Zhengyan Feng Botao Zhang Wona Ding Xiaodong Liu Dong-Lei Yang Pengliang Wei Fengqiu Cao Shihua Zhu Feng Zhang Yanfei Mao Jian-Kang Zhu 2013Cell Research2013,23,10:211
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