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| 1 | The SOC1-like gene BoMADS50 is associated with the flowering of Bambusa oldhamii显示文摘Bamboo is known for its edible shoots and beautiful texture and has considerable economic and ornamental value.Unique among traditional flowering plants,many bamboo plants undergo extensive synchronized flowering followed by large-scale death,seriously affecting the productivity and application of bamboo forests.To date,the molecular mechanism of bamboo flowering characteristics has remained unknown.In this study,a SUPPRESSOR OF OVEREXPRESSION OF CONSTANS1(SOC1)-like gene,BoMADS50,was identified from Bambusa oldhamii.BoMADS50 was highly expressed in mature leaves and the floral primordium formation period during B.oldhamii flowering and overexpression of BoMADS50 caused early fl owering in transgenic rice.Moreover,BoMADS50 could interact with APETALA1/FRUITFULL(AP1/FUL)-like proteins(BoMADS 14-1/2,BoMADS15-1/2)in vivo,and the expression of BoMADS50 was signi ficantly promoted by BoMADS14-1,further indicating a synergistic effect between BoMADS50 and BoAP1/FUL-like proteins in regulating B.oldhamii flowering.We also identi fi ed four additional transcripts of BoMADS50(BoMADS50-1/2/3/4)with different nucleotide variations.Although the protein-CDS were polymorphic,they had flowering activation functions similar to those of BoMADS50.Yeast one-hybrid and transient expression assays subsequently showed that both BoMADS50 and BoMADS50-1 bind to the promoter fragment of itself and the SHORT VEGETATIVE PHASE(SVP)-like gene BoSVP,but only BoMADS50-1 can positively induce their transcription.Therefore,nucleotide variations likely endow BoMADS50-1 with strong regulatory activity.Thus,BoMADS50 and BoMADS50-1/2/3/4 are probably important positive flowering regulators in B.oldhamii.Moreover,the functional conservatism and speci ficity of BoMADS50 and BoMADS50-1 might be related to the synchronized and sporadic flowering characteristics of B.oldhamii. | Dan Hou Ling Li Tengfei Ma Jialong Pei Zhongyu Zhao Mengzhu Lu Aimin Wu Xinchun Lin | 2021 | Horticulture Research2021，8，1： | 4 |
| 2 | 竹类植物遗传育种研究进展显示文摘作为森林植物的重要组成部分,竹类植物在维持生态平衡、保持物种多样性、减缓气候变化、防止水土流失等多方面发挥着积极作用,国际社会对竹资源开发利用的高度关注促进了竹产业的持续快速发展。良种是产业发展的基石,竹子专用品种的缺乏是限制其工业化利用的重要因素,因此竹类植物的遗传育种已成为竹学领域研究的焦点。文章对竹类植物遗传育种中的变异来源、种类识别、育种现状进行了系统总结,尤其是对选择育种、杂交育种、分子育种、智能化育种和新品种审定进行重点概述。针对竹类植物遗传学理论基础薄弱、内在固有遗传障碍和育种技术瓶颈问题,提出了构建遗传学理论、加强种质资源保护与评价和突破育种技术瓶颈的应对策略,以期为竹类植物的新品种选育提供参考。 | 高志民 | 2023 | 世界竹藤通讯2023，21，1： | 2 |
| 3 | Whole-genome Duplication Reshaped Adaptive Evolution in A Relict Plant Species,Cyclocarya paliurus显示文摘Cyclocarya paliurus is a relict plant species that survived the last glacial period and shows a population expansion recently.Its leaves have been traditionally used to treat obesity and diabetes with the well-known active ingredient cyclocaric acid B.Here,we presented three C.paliurus genomes from two diploids with different flower morphs and one haplotype-resolved tetraploid assembly.Comparative genomic analysis revealed two rounds of recent whole-genome duplication events and identified 691 genes with dosage effects that likely contribute to adaptive evolution through enhanced photosynthesis and increased accumulation of triterpenoids.Resequencing analysis of 45 C.paliurus individuals uncovered two bottlenecks,consistent with the known events of environmental changes,and many selectively swept genes involved in critical biological functions,including plant defense and secondary metabolite biosynthesis.We also proposed the biosynthesis pathway of cyclocaric acid B based on multi-omics data and identified key genes,in particular gibberellinrelated genes,associated with the heterodichogamy in C.paliurus species.Our study sheds light on evolutionary history of C.paliurus and provides genomic resources to study the medicinal herbs. | Yinquan Qu Xulan Shang Ziyan Zeng Yanhao Yu Guoliang Bian Wenling Wang Li Liu Li Tian Shengcheng Zhang Qian Wang Dejin Xie Xuequn Chen Zhenyang Liao Yibin Wang Jian Qin Wanxia Yang Caowen Sun Xiangxiang Fu Xingtan Zhang Shengzuo Fang | 2023 | Genomics, Proteomics & Bioinformatics2023，21，3： | 1 |
| 4 | 毛竹不同组织总RNA提取质量的比较显示文摘【目的】探讨适合于毛竹不同组织尤其是毛竹根系以及种子等总RNA提取的最优方法,获得高质量RNA样品,为今后开展毛竹的分子生物学研究奠定理论基础。【方法】分别采用柱式Trizol法、Trizol法、SDS法、改良CTAB法提取毛竹的细根、气雾根、成熟叶、幼叶、枝、种子、笋等不同组织的RNA,通过NanoDrop 2000微量分光光度计检测浓度、1.5%琼脂糖凝胶电泳检测样品完整度以及RT-PCR检测是否存在目标条带,采用Excel和SPSS软件对提取结果进行统计学分析。【结果】4种方法均能从毛竹不同组织中提取到总RNA,其中SDS法提取的RNA浓度较高,但提取时间过长且步骤繁琐,RNA容易发生降解,其质量不适合用于后续的分子生物学试验;柱式Trizol法和Trizol法用时短且提取方法简单便捷,除了对毛竹细根和种子的提取效果不佳外,其余组织的RNA纯度和质量都可以满足后续的试验开展;改良CTAB法适用于各组织,包括木质化程度较高的毛竹细根以及富含淀粉的毛竹种子,缺点是DNA残留明显。除SDS法所获得的浓度较高并与其他3种方法有显著性差异外,其余3种RNA抽提方法对样品总RNA浓度无统计学差异,且各组织RNA反转录为cDNA,以内参基因PhPP2A为目的基因进行RT-PCR扩增,均可在目标位置获得明亮单一条带,约为150 bp。【结论】改良CTAB法最适合毛竹细根以及种子的RNA提取,柱式Trizol法和Trizol法适合毛竹气雾根、叶、枝和笋总RNA的提取。 | 方婷 徐倩 金爱武 邓莹 骆争荣 朱强根 | 2021 | 中南林业科技大学学报2021，41，9： | 1 |
| 5 | 12个竹种的45S rDNA和5S rDNA分布特性比较显示文摘【目的】分析12个竹种的45S rDNA和5S rDNA分布特征,并调查这些竹种的染色体数目和结构,为竹类植物系统分类和染色体结构等研究提供相应的细胞遗传学资料,为相关的染色体识别提供相应的染色体物理标记。【方法】以毛竹、花毛竹、龟甲竹、早竹、金镶玉竹、白哺鸡竹、紫竹、斑竹、黄秆乌哺鸡竹、人面竹、大明竹和茶秆竹为材料,以45S rDNA和5S rDNA为探针,采用双色荧光原位杂交技术分析45S rDNA和5S rDNA在这些竹种染色体上的分布。【结果】1)12个竹种的染色体数目均为2 n=48,45S rDNA在12个竹种染色体上展现出一定的多态性分布。①毛竹、花毛竹、龟甲竹、早竹、黄秆乌哺鸡竹和斑竹均具有2个45S rDNA位点,且2个45S rDNA位点信号强度和分布位置表现一致。②茶秆竹、人面竹、白哺鸡竹和金镶玉竹也具有2个45S rDNA位点,其中1个位点较为稳定,位于染色体末端,另外1个位点断裂严重,经常脱离分布位置。③紫竹和大明竹具有2个45S rDNA位点,这对位点在信号强度上存在较大差异,特别是紫竹表现更明显。2)5S rDNA在12个竹种染色体上展现出了一定的多态性分布。①毛竹、花毛竹和龟甲竹的5S rDNA分布模式相似,具有2对信号强度不同的5S rDNA位点,其中1对5S rDNA位点信号很强,位于染色体末端,另外1对5S rDNA位点信号微弱,位于染色体近中间区域。②早竹、白哺鸡竹和黄秆乌哺鸡竹的5S rDNA分布模式较为相似,具有2对较强的5S rDNA信号,且2对信号强度差异不大,以成对形式位于2对同源染色体近中间区域。③金镶玉竹、紫竹和大明竹的5S rDNA分布模式比较特殊,均有3个位点,明显不对称,其中紫竹的3个5S rDNA位点,2个位于染色体末端,1个位于染色体近中间区域,金镶玉竹的3个5S rDNA,2个强弱不同的信号位于染色体中间,还有1个位于染色体末端,而大明竹的3个5S rDNA均位于染色体近中间区域。④斑竹与人面竹的5S rDNA分布模式非常相似,具有2对5S rDNA位点,且信号较弱,均位于染色体近中间区域。⑤茶秆竹具有1对较弱的5S rDNA位点,位于染色体短臂近着丝粒区域。【结论】1)根据45S rDNA和5S rDNA在金镶玉竹、紫竹、人面竹、白哺鸡竹、大明竹和茶秆竹染色体上的分布特征,推测这些竹种的染色体可能发生过断裂、易位、删除或插入等遗传重组。2)毛竹、花毛竹和龟甲竹3个竹种的45S rDNA和5S rDNA分布模式非常相似,该分布模式与3个竹种系统分类地位具有一定的一致性。 | 徐川梅 王子晗 谢峰 金旭胤 吴心妍 陈荣 黄坚钦 | 2022 | 林业科学2022，58，7： | 1 |
| 6 | 慈竹纤维素合酶BeCesA4的克隆及功能分析显示文摘非木造浆是解决国内纸浆短缺的重要手段。慈竹(Bambusa emeiensis)是我国非木造浆的主要原材料之一,提高慈竹中纤维素的含量能够有效提高竹类造浆的效率。通过前期对慈竹进行的转录组测序分析,挖掘出慈竹中一个与植物中纤维素合酶亚基A(cellulose synthase A,CesA)同源的基因,命名为BeCesA4。结果显示,克隆出的BeCesA4基因编码一个含有982个氨基酸的蛋白质,具备CesA家族的保守结构域;BeCesA4在慈竹快速生长的笋与茎中显著表达;过量表达该基因会使转基因植物出现生物量提升、纤维素含量升高和次生细胞壁加厚等现象。结果表明,BeCesA4的表达量与慈竹茎内纤维素的积累呈正相关。本研究结果为进一步揭示慈竹纤维素合成机制奠定了基础。 | 王博雅 姜勇 黄艳 曹颖 胡尚连 | 2022 | 生物技术通报2022，38，11： | 0 |
| 7 | 竹类植物分蘖相关基因的生物信息学分析显示文摘从水稻中选取相关的候选基因,对毛竹和4种新测序的竹类植物以及水稻、谷子和二穗短柄草的分蘖数相关基因和氨基酸序列进行比较,对粗型和细型2种地下茎类型的竹类植物中分蘖基因的同源序列进行分析。结果表明:D10、DLT、Gn1a、HTD1、LAX1、MOC1、OsAAP3、OsCYP19-4、 OsEATB、 OsIAGLU、 OsPIN1、 OsPIN5b、 OsSPL14、 OsSUT2、 OsTB1、 RFL、THIS1等17个基因序列在不同地下茎类型的竹子中存在较明显的结构差异,在基因的进化树中,2种草本竹和禾草类植物关系较近,而与木本竹区分开,这或许为木本竹独特的地下茎系统提供一些分子依据;17个基因中调控分蘖增加或抑制分蘖生长的基因存在结构域的缺失,这种差异可能抑制毛竹(即细型地下茎竹类)的合轴生长,并使其进行地下茎延伸,从而形成真鞭,某些分蘖基因参与到各植物激素的信号通路中相互作用从而影响分蘖的产生。通过以上结果可推测,粗型地下茎与细型地下茎的形成可能与调控分蘖数目的基因,以及各类激素的作用相关。 | 孙佳玮 郭振华 | 2021 | 西南林业大学学报(自然科学)2021，41，2： | 0 |
| 8 | 竹子对低温的响应及转基因抗寒育种的研究进展显示文摘综述了竹子耐寒性相关的研究现状,主要包括竹子耐寒相关的生理生化指标、抗性生理研究、以及通过转基因技术提高竹子耐寒性等方面的研究进展;并提出竹子分子生物学、转基因及基因编辑育种在竹子耐寒育种方面的应用可能是今后竹子耐寒研究的新课题和方向。研究结果可为后续竹子耐寒性的研究提供参考。 | 罗素珍 | 2023 | 福建林业科技2023，50，2： | 0 |
| 9 | Phylogenomic insights into the reticulate evolution of Camellia sect.Paracamellia Sealy(Theaceae)显示文摘Polyploids are common in Camellia sect.Paracamellia,which contain many important oil crop species.However,their complex evolutionary history is largely unclear.In this study,22 transcriptomes and 19 plastomes of related species of Camellia were sequenced and assembled,providing the most completed taxa sampling of Camellia sect.Oleifera and C.sect.Paracamellia.Phylogenetic trees were reconstructed with predicted single-copy nuclear genes and plastomes.Phylogenetic trees with nuclear genes demonstrated that C.sect.Oleifera should be merged into C.sect.Paracamellia.Cytonuclear discordance and network analyses suggested hybridizations among polyploid species and relatives.The divergence of major clades in C.sect.Paracamellia was dated to be during the middle to late Miocene from the ancestral Lingnan region,and a rapid diversification during the Quaternary was found,probably through hybridization and polyploidization.The tetraploid Camellia meiocarpa Hu may have originated from hybridization between closely related diploid species.The hexaploid Camellia oleifera C.Abel probably originated from hybridization between closely related diploid and tetraploid(e.g.,C.meiocarpa)species.The octoploid Camellia vietnamensis T.C.Huang ex Hu could have originated from hybridization between hexaploid C.oleifera and the closely related diploid species.Hybridization and polyploidization played an important role in generating the rich variation of important fruit traits,especially increased fruit size in polyploid species. | Sheng-Yuan Qin Kai Chen Wen-Ju Zhang Xiao-Guo Xiang Zheng-Yu Zuo Cen Guo Yao Zhao Lin-Feng Li Yu-Guo Wang Zhi-Ping Song Ji Yang Xiao-Qiang Yang Jian Zhang Wei-Tao Jin Qiang Wen Song-zi Zhao Jia-Kuan Chen De-Zhu Li Jun Rong | 2024 | Journal of Systematics and Evolution2024，62，1： | 0 |
| 10 | 林木新种质创制研究进展显示文摘林以种为本,种以质为先。林木种质创新是林木种业振兴的基础,是保障国家木材安全、粮油安全和生态安全的坚实根基。随着仪器设备的更新换代和多组学、智能与信息等技术的发展及相关理论水平的提升,我国林木种质的研究由传统的经验性收集和粗放式评价,向现代、定向、高效的新种质创制及规模化、精准化及系统化评价和挖掘转变。从林木新种质的创制现状、核心关键技术、规模化繁育和未来发展方向4个方面综述我国林木新种质创制进展,并提出传统杂交育种与现代生物技术相结合,加快开发林木表型和基因型高通量精准评价、全基因组选择、基因组精准操作、合成生物学和细胞工厂等种质创制及繁育新技术,支撑优质种质创制和突破性新品种培育。 | 王军辉 | 2022 | 中国农业科技导报2022，24，12： | 0 |
| 11 | 毛竹PhebHLH6基因克隆及表达分析显示文摘【目的】研究PhebHLH6转录因子在毛竹Phyllostachys edulis逆境胁迫应答中的作用,为毛竹抗逆分子机制研究奠定一定的基础。【方法】以毛竹实生苗为材料进行非生物胁迫处理[干旱胁迫、盐胁迫、水杨酸(SA)和脱落酸(ABA)处理],利用转录组数据筛选出1条差异表达基因,命名为PhebHLH6,并对其进行了基因克隆及生物信息学分析;采用实时荧光定量PCR方法分析PhebHLH6在干旱、盐胁迫及SA、ABA处理下的表达模式。【结果】PhebHLH6基因编码区长度为801 bp,编码266个氨基酸,包含bHLH结构域,属于典型的bHLH转录因子。组织特异性表达分析表明:PhebHLH6在毛竹各个组织均有表达,其中在1.5和3.0 m的笋顶部表达丰度最高。在干旱和高盐胁迫处理下,PhebHLH6的表达水平在处理3 h时被强烈诱导,但在处理24 h后显著下调。在SA和ABA处理下,PhebHLH6的表达水平被SA和ABA诱导也呈先上升再下降的趋势,其中受SA强烈诱导,受ABA诱导作用较弱。【结论】PhebHLH6可能参与了毛竹干旱和盐胁迫早期响应途径,并可能在SA和ABA信号通路中起一定的调控作用。 | 卓娟 侯丹 林新春 | 2023 | 浙江农林大学学报2023，40，4： | 0 |
| 12 | 流式细胞术在测定竹类植物基因组大小中的应用显示文摘【目的】分析竹类植物不同组织部位及不同处理方法对其基因组大小的影响,可提高植物基因组大小测定精度。【方法】以竹类植物叶片和笋为材料,以水稻Oryza sativa为参照,设置细胞核染色时间为1、3、5、7、9、12、18、24和30 min共9个梯度,利用流式细胞仪对不同组织部位及处理的基因组大小进行分析。【结果】①对同一竹种而言,其叶片和笋流式峰形图相似,基因组大小仅存在微小差异,差值为0.04~0.20 pg。②不同竹种对染色时间要求不同,其中,唐竹Sinobambusa tootsik、花叶唐竹Sinobambusa tootisik f.albo-striata、平安竹Pseudosasa japonica var.tsutsumiana、曙筋矢竹Pseudosasa japonica f.akebono、美丽箬竹Indocalamus decorus、花叶赤竹Sasaella glabra f.albo-striata及红秆寒竹Chimonobambusa mamorea f.variegata染色1 min即达到最大荧光峰值,孝顺竹Bambusa multiplex和黄皮绿筋竹Phyllostachys sulphurea染色3 min达到最大峰值,茶竿竹Pseudosasa amabilis var.amabilis和柳叶细竹Thyrsostachy ssiamensis染色5 min达到最大峰值,仅黄皮刚竹Phyllostachys sulphurea(叶片)7 min达到最大峰值。③12个竹种的荧光强度在1~30 min内存在较大变化,除茶竿竹、柳叶细竹、孝顺竹叶片及唐竹笋外,其他竹种的荧光强度变化值均在5%以上,特别是平安竹和花叶赤竹变化更大,分别为12.93%和12.88%。④热带木本竹种孝顺竹和柳叶细竹基因组大小为(1.64±0.54)~(2.69±1.01)pg,其他10个温带竹种基因组大小为(3.76±1.51)~(5.73±1.85)pg。10个温带竹种中,刚竹属Phyllostachys竹种基因组较小,大小为(3.76±1.51)~(3.91±0.95)pg,其他竹属的一些竹种基因组较大,大小为(4.82±0.54)~(5.73±1.85)pg。【结论】①竹类植物叶片和笋均可作为基因组大小分析材料,细胞核染色时间对基因组大小测定结果存在一定影响,染色时间以3~5 min最佳。②热带木本竹种基因组大小明显小于温带木本竹种,温带木本竹种中,刚竹属竹种的基因组大小明显小于其他竹种。 | 陈蓉芬 黄坚钦 陈荣 徐川梅 | 2021 | 浙江农林大学学报2021，38，1： | 0 |
| 13 | 竹子基因资源和应用技术研究进展显示文摘竹子是世界和我国最重要的经济林木树种之一,具有重要的经济和生态价值。竹子种质资源的提升是竹产业发展的重大需求。随着分子生物学研究的不断进步,特别是竹子基因组的解析和遗传转化体系的建立,使得人们利用现代生物学技术提升竹子种质逐渐成为可能。笔者详细综述了近年来竹子研究的进展,包括竹子基因组的解析过程、调节竹子生长发育关键基因的挖掘,以及竹子再生和遗传转化体系的建立等。最后,对遗传转化新技术在竹子中的应用进行了展望。笔者系统地对目前竹子研究发掘的关键基因和关键技术进行了整理汇总,为今后竹子种质创新研究提供参考。 | 徐丹丹 李新林 邓伟芬 蒋思媛 任慧敏 王安可 杜旭华 柳参奎 亓果宁 | 2022 | 竹子学报2022，41，4： | 0 |
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