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1基因本体论研究进展及在生物信息数据库中的应用显示文摘随着cDNA微阵列等生物技术发展的日新月异,产生了大量丰富的生物信息资源,海量生物信息与知识的共享是当前生物学研究面临的瓶颈问题,相对于其他查询与搜索工具,由本体论发展而来的基因本体工具在解决海量生物W eb信息共享时具有独特优势,从而有望实现世界范围内的知识共享和智能信息集成。本文概述本体论和基因本体论的概念、研究进展以及基因本体论在生物信息数据库中的应用等情况,并对基因本体论在海量生物信息处理中的应用与研究前景进行了展望。栾德琴 白云峰 包文斌 陈国宏 2009江苏农业科学2009,37,4:6
2基于基因本体论的生物信息个人数据库平台显示文摘论述了一个基于基因本体论(geneontology)的生物信息个人数据库平台BIO.该数据库平台根据自身研究的需要,用基因本体论中的相关的规范术语来对基因序列信息进行注释,从而可以让用户从基因本体论的角度对生物信息序列进行查询.由于因特网上生物数据库中大量的关于基因序列信息的术语不统一、不规范,存在大量的信息冗余,用此方式可最大限度地精确所要查找的结果.文中详细论述了该数据库平台的研究背景、查询功能以及维护.高芸 2004生命科学研究2004,8,S2:4
3如皋鸡不同时期肌肉组织生长相关基因的表达谱分析显示文摘旨在了解如皋鸡不同时期肌肉生长发育机制。本研究利用基因芯片技术,分析在不同生长阶段下(2~12周龄)如皋鸡肌肉组织基因的表达情况。获得了13 379个基因的差异表达动态图谱。在不同生长阶段下肌肉组织生长基因的表达发生变化,与2周龄相比,4和12周龄下调表达的基因数量多于上调表达的基因数量,6、8和10周龄下调表达的基因数量少于上调表达的基因数量。同时对杂交数据进行多种聚类分析。利用实时荧光定量PCR验证4个基因的差异表达,其结果和芯片杂交分析的结果基本一致。初步建立了不同时期肌肉生长应答基因的动态表达谱,比较全面地获得了肌肉生长应答基因,初步揭示了如皋鸡不同时期肌肉生长发育机制。栾德琴 常国斌 盛中伟 黄正洋 周伟 龚琳琳 陈丹艳 刘岩 王克华 窦套存 陈国宏 2012畜牧兽医学报2012,43,1:4
4利用基因芯片技术研究隐性白鸡不同时期肌肉组织相关差异表达基因显示文摘应用包含13 319条鸡基因探针序列的表达谱芯片,对从隐性白鸡不同时期肌肉组织抽提及纯化的cRNA进行芯片杂交,并对基因表达谱进行分析,旨在筛选隐性白鸡不同时期肌肉组织相关差异表达基因,探讨造成不同时期肌肉组织生长发育的分子生物学机理。结果显示,在不同生长时期(2周和12周)共筛选出差异表达基因78条(表达上调34条,表达下调44条),其中已知功能基因39条,主要涉及生长发育、分子代谢、免疫应答、生物合成、细胞通信以及蛋白质合成与分解等相关基因,其中包括一些尚未在GenBank上登陆的序列,推测可能是未知的新基因,它们在鸡生长发育、能量代谢等的过程所起到的作用还需进一步证明。栾德琴 常国斌 龚琳琳 周伟 陈丹艳 刘岩 王克华 窦套存 陈国宏 2012中国兽医学报2012,32,1:2
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