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| 1 | Large-Scale Analyses of Glycosylation in Cellulases显示文摘Cellulases are important glycosyl hydrolases (GHs) that hydrolyze cellulose polymers into smaller oligosaccharides by breaking the cellulose β (1→4) bonds,and they are widely used to produce cellulosic ethanol from the plant biomass.N-linked and O-linked glycosylations were proposed to impact the catalytic efficiency,cellulose binding affinity and the stability of cellulases based on observations of individual cellulases.As far as we know,there has not been any systematic analysis of the distributions of N-linked and O-linked glycosylated residues in cellulases,mainly due to the limited annotations of the relevant functional domains and the glycosylated residues.We have computationally annotated the functional domains and glycosylated residues in cellulases,and conducted a systematic analysis of the distributions of the N-linked and O-linked glycosylated residues in these enzymes.Many N-linked glycosylated residues were known to be in the GH domains of cellulases,but they are there probably just by chance,since the GH domain usually occupies more than half of the sequence length of a cellulase.Our analysis indicates that the O-linked glycosylated residues are significantly enriched in the linker regions between the carbohydrate binding module (CBM) domains and GH domains of cellulases.Possible mechanisms are discussed. | Fengfeng Zhou Victor Olman Ying Xu | 2009 | Genomics, Proteomics & Bioinformatics2009，7，4： | 3 |
| 2 | 细胞膜离子单通道电流重构的计算机仿真显示文摘细胞膜离子单通道电流十分微弱(PA级),用膜片钳技术测量离子电流往往淹没在强噪声背景中。目前,采用阈值检测方法恢复通道电流信号。但是,通道开放和关闭的电流阈值需要人为设定,并且阈值法在较低信噪比时失效。采用隐马尔可夫模型(HMM)重构离子单通道电流并估计模型参数。对离子通道HMM进行描述和分析;运用Baum-Welch迭代算法训练HMM并估计模型参数;利用Viterbi算法重构通道电流最佳状态序列。将HMM与阈值法进行比较,对不同信噪比和不同转移概率情况下HMM恢复算法进行计算机仿真。结果表明:HMM与阈值法相比,具有较强抗噪能力。在较低信噪比情况下,该模型恢复信号精度高,参数收敛速度快,且电流重构误差主要出现在状态突变点。 | 乔晓艳 吴晋芝 耿晓勇 董有尔 | 2011 | 计算机工程与应用2011，47，16： | 2 |
| 3 | BLAST序列比对脱机移植研究显示文摘BLAST序列比对算法是NCBI综合性生物信息平台整合的众多重要功能之一。研究建立BLAST算法的脱机环境移植,可使生物信息学研究人员在构建自己专有序列数据库的同时,对DNA序列进行脱机环境比对,以期更高的序列数据安全性,避免联网状态下造成的数据丢失和泄露等严重问题。通过研究BLAST序列比对过程中涉及的标准数据格式与调用细节,实现了脱机环境下的BLAST序列比对,为建立安全序列比对提供了一种可行参考。 | 马尔仑 | 2020 | 内蒙古师范大学学报(自然科学汉文版)2020，49，4： | 2 |
| 4 | 一种基于BLAST的多种遗传标记序列比对方法显示文摘设计并实现了一种基于BLAST(Basic Local Alignment Search Tool)的生物序列比对方法,它可以应用于法庭科学多种遗传标记的检索比对。引入BLAST算法并设计合理的打分函数,使其在兼容序列多态性比如线粒体DNA比对的同时,可以有效地进行长度多态性比如常染色体STR的比对。实验表明,采用这种方法可以实现不同序列的有效比对,输出准确的有序结果集,具有较高的比对效率。 | 赵钊 王彤 孙洁 周勤虎 刘亚楠 胡蓉 | 2017 | 科技与创新2017，，18： | 1 |
| 5 | 兰科植物系统分类学研究方法综述与展望显示文摘兰科植物品种众多且栽培历史悠久,自然界中尚有许多野生兰花有待开发、保护和利用。指甲兰亚族隶属兰科万代兰族,是兰科中最为复杂多样的类群之一,亦是中国兰科属种多样性最高的亚族之一,因其属种复杂多样且在园艺上应用广泛研究不断深入。研究结果表明:亚族内的主要分支间的系统发育关系主线仍未清楚,且大量基部类群的系统位置不定,致使一直存在争议;充分利用隐马尔可夫模型、最大简约法、最大似然法和贝叶斯法等统计学方法进行基因组学分析,重建主要分支和亚支之间的进化关系,验证单系性,评价支和亚支间的系统发育关系,有望澄清兰科指甲兰亚族的主要分支和亚支的系统发育主线及其相关近缘类群关系,可为今后该类群的保护和资源合理利用提供坚实基础。 | 张敬华 | 2020 | 花卉2020，，20： | 0 |
| 6 | 基于小波包分解的细胞膜离子电流重构显示文摘提出了一种基于小波包算法重构离子电流信号的新方法,利用小波包分解对离子电流进行多分辨率分析,获得尺度能量分布特征信号.然后,进行小波包重构,再经过平滑滤波,恢复通道离子电流信号.仿真实验结果表明,采用小波包算法,在较低信噪比时,离子电流恢复精度高,算法收敛速度快,且具有较强的抗噪能力. | 乔晓刚 吴晋芝 乔晓艳 | 2011 | 山西大学学报(自然科学版)2011，34，1： | 0 |
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