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| 1 | A Genetic Pathway for Tapetum Development and Function in Arabidopsis显示文摘In anther development, tapetal cells take part in complex processes, including endomitosis and apoptosis (programmed cell death). The tapetum provides many of the proteins, lipids, polysaccharides and other molecules necessary for pollen development. Several transcription factors, including DYT1, TDF1, AMS, MS188 and MS1, have been reported to be essential for tapetum development and function in Arabidopsis thaliana. Here, we present a detailed cytological analysis of knockout mutants for these genes, along with an in situ RNA hybridization experiment and double mutant analysis showing that these transcription factors form a genetic pathway in tapetum development. DYT1, TDF1 and AMS function in early tapetum development, while MS188 and MS1 are important for late tapetum development. The genetic pathway revealed in this work facilitates further investigation of the function and molecular mechanisms of tapetum development in Arabidopsis. | Jun Zhu Yue Lou Xiaofeng Xu Zhong-Nan Yang | 2011 | Journal of Integrative Plant Biology2011，53，11： | 32 |
| 2 | Genomic Survey and Expression Profiling of the MYB Gene Family in Watermelon显示文摘Myeloblastosis(MYB)proteins constitute one of the largest transcription factor(TF)families in plants.They are functionally diverse in regulating plant development,metabolism,and multiple stress responses.However,the function of watermelon MYB proteins remains elusive to date.Here,a genome-wide identification of watermelon MYB TFs was performed by bioinformatics analysis.A total of 162 MYB genes were identified from watermelon(Cla MYB).A comprehensive overview of the Cla MYB genes was undertaken,including the gene structures,chromosomal distribution,gene duplication,conserved protein motif,and phylogenetic relationship.According to the analyses,the watermelon MYB genes were categorized into three groups(R1R2R3-MYB,R2R3-MYB,and MYB-related).Amino acid alignments for all MYB motifs of Cla MYBs demonstrated high conservation.Investigation of their chromosomal localization revealed that these Cla MYB genes distributed across the 11watermelon chromosomes.Gene duplication analyses showed that tandem duplication events contributed predominantly to the expansion of the MYB gene family in the watermelon genome.Phylogenetic comparison of the Cla MYB proteins with Arabidopsis MYB proteins revealed that watermelon MYB proteins underwent a more diverse evolution after divergence from Arabidopsis.Some watermelon MYBs were found to cluster into the functional clades of Arabidopsis MYB proteins.Expression analysis under different stress conditions identified a group of watermelon MYB proteins implicated in the plant stress responses.The comprehensive investigation of watermelon MYB genes in this study provides a useful reference for future cloning and functional analysis of watermelon MYB proteins. | XU Qing HE Jie DONG Jianhui HOU Xiaojin ZHANG Xian | 2018 | Horticultural Plant Journal2018，4，1： | 14 |
| 3 | The functional analysis of OsTDF1 reveals a conserved genetic pathway for tapetal development between rice and Arabidopsis显示文摘在花药开发期间, tapetum 为花粉开发提供材料和营养素。在 Arabidopsis,几个抄写因素被识别了为 tapetal 开发和功能形成一条基因小径(DYT1TDF1AMSMS188MS1 ) 。在 TAPETAL 开发和 FUNCTION1 (TDF1 ) 的有缺陷者是 R2R3 MYB 家庭的一个成员并且为在 Arabidopsis 的早 tapetum 开发是必要的。这里,我们在米饭描绘了 Arabidopsis TDF1 的 ortholog, OsTDF1 (LOC_Os03g18480 ) 。OsTDF1 分享 69 ? 有在 N 终端区域附近的通常认为的 MYB 领域的 AtTDF1 的 % 氨基酸顺序身份。RT-PCR 并且在 situ 杂交表演,那 OsTDF1 明确地在米饭花药的 tapetal 房间被表示。在 Arabidopsis tdf1 异种的 OsTDF1 的表达式恢复它的富饶,建议这个相当或相同的事物能完成在 Arabidopsis 的 TDF1 的正常函数。ostdf1 大美人异种展出男性无菌的显型。它的 tapetal 房间展出类似于 Arabidopsis tdf1 异种的 vacuolated 和 hypertrophic 显型。终端 deoxynucleotidyl 当为 tapetum 的一个必要管理者规划了房间死亡,把试金标记的调停 transferase 的 dUTP 刻痕结束揭示了 OsTDF1 行为。qRT-PCR 分析表明 OsTDF1 UDT1 下游地行动,建议为 tapetum 开发的基因小径通常在米饭和 Arabidopsis 之间被保存并且在米饭的 TDR, EAT1, OsMYB103 和 PTC1 在上游。 | Ci-Feng Cai Jun Zhu Yue Lou Zong-Li Guo Shuang-Xi Xiong Ke Wang Zhong-Nan Yang | 2015 | Science Bulletin2015，60，12： | 13 |
| 4 | Arabidopsis AT-hook Protein TEK Positively Regulates the Expression of Arabinogalactan Proteins for Nexine Formation显示文摘Nexine 是花粉墙的保存的层。我们以前报导 nexine 层在经由在钩(TEK ) 基因的 Arabidopsis TRANSPOSABLE 元素 SILENCING 的猛烈异种是不在的。在这研究,我们在花粉开发调查了 TEK 的分子的规章的功能并且识别了作为 TEK 的直接目标编码 Arabinogalactan 蛋白质(AGP ) 的基因,它为 nexine 形成是必要的。tek 和 TEK-SRDX 的 Phenotypic 类似转基因的线建议 TEK 在花药开发在 transcriptional 激活起一个作用。Microarray 分析在 tek 识别了 661 基因 downregulated 的一个总数,包括编码 AGP, AGP6, AGP11, AGP23,和 AGP40 的四基因。Electrophoretic 活动性移动试金证明 TEK 能直接绑原子矩阵附件区域(3 月) 和 AGP6 的倡导者。PCR 分析跟随的染色质 immunoprecipitation 证明 TEK 在四 AGP 基因的倡导者被充实。TEK 倡导者在 tek 驾驶的 AGP6 的表示部分救了 nexine 形成和植物富饶。这些结果显示 TEK 直接在花药调整 AGP 表示控制 nexine 层形成。我们也建议 glycoproteins 可能是在花粉墙中的 nexine 层的必要部件。 | Qi-Shi dia Jun Zhu Xiao-Feng Xu Yue Lou Zhan-Lin Zhang Zhi-Ping Zhang Zhong-Nan Yang | 2015 | Molecular Plant2015，8，2： | 10 |
| 5 | 亚洲百合MYB转录因子家族的鉴定及调控花粉败育MYB基因的筛选显示文摘v-myb禽成髓细胞瘤病毒致癌基因同源物(v-myb avian myeloblastosis viral oncogene homolog,MYB)转录因子家族在调控植物生殖及生长发育过程中发挥着重要的作用,本研究在转录水平上鉴定出亚洲百合品种'小小的吻'(Lilium Asiatic hybrids'Little Kiss')MYB转录因子家族成员并对其进行生物信息学分析,旨在筛选出调控花粉败育的基因,为亚洲百合MYB的功能研究提供基础资料。基于百合转录组数据,利用Pfam31.0和BLASTP等软件对百合MYB蛋白序列进行筛选与鉴定,使用MEGA 7.0、Web Logo 3.0等生物信息学软件,重点对占比最多的R2R3-MYB类转录因子进行保守结构域和系统进化树分析,并用Mev软件对LaMYB基因在小孢子减数分裂时期和单核花粉粒时期的表达水平进行分析。共筛选出69个LaMYB基因,包含50个R2R3-MYB类基因,15个1R-MYB类基因和4个3R-MYB类基因,所有LaMYB蛋白均为亲水性不稳定蛋白;亚细胞定位预测结果表明LaMYB基因编码的蛋白均定位于细胞核;Web logo3.0分析发现R2R3-MYB类蛋白结构域比较保守,但其C-端转录激活域的易变性使其具有功能多样性;系统进化分析将百合R2R3-MYB类蛋白划分为22个亚家族,其中参与花粉败育的拟南芥同源基因主要属于S18、S23、S21和S22亚家族;同时,RNA-Seq数据分析结果表明,和花粉发育的正常时期(减数分裂时期)相比,在花粉败育的关键时期(单核花粉粒时期),69个LaMYB基因中有42个的表达量呈现上调趋势,仅27个基因的表达量呈现下调趋势;qRT-PCR分析结果表明6个候选基因在百合花粉正常时期(减数分裂时期)和败育时期(单核花粉粒时期)的表达量有显著差异。该研究结果表明LaMYB基因在花粉败育过程中发挥重要的调控作用。此研究为深入探究LaMYB基因在花粉败育过程中发挥的功能提供基础资料。 | 王雪倩 袁国振 吴泽 李茜 滕年军 | 2019 | 农业生物技术学报2019，27，11： | 8 |
| 6 | 基于不同颜色山楂花MYB家族的挖掘与比较分析显示文摘为了研究MYB转录因子家族对山楂花色的影响,明确MYB转录因子在花色芽变品种中的表达情况,采用MYB蛋白质理化性质分析、motif结构预测、基因进化树分析以及基因表达量分析等方法对转录组数据进行深度挖掘。结果表明,共筛选出73个MYB转录因子,其中35个1R-MYB成员、36个2R-MYB成员、2个3R-MYB成员。1R-MYB蛋白序列的长度在50~786个氨基酸之间,2R-MYB蛋白序列长度在88~979个氨基酸之间,且仅有3个MYB基因家族蛋白为稳定蛋白。以拟南芥2R-MYB蛋白为参考进行系统进化树分析,19个山楂2R-MYB蛋白被分入14个已有一定研究基础的亚组中;1R-MYB蛋白进行单独分析,被分为6个亚组。通过差异表达分析,发现8个可能调控山楂花色的MYB转录因子。本研究结果为进一步研究影响山楂花色的MYB转录因子提供了一定的参考数据。 | 李戌彦 杨忠义 纪薇 杨明霞 | 2021 | 核农学报2021，35，1： | 6 |
| 7 | 大白菜pol CMS育性恢复基因的表达分析显示文摘为进一步探明polCMS育性恢复基因作用的分子机理,利用数字基因表达谱技术,选用不育系与恢复系杂交的F2代分离群体,对大白菜polCMS育性恢复相关基因的差异表达进行了分析,并选取部分基因进行了实时荧光定量PCR验证。共有2826个基因差异表达,其中441个上调表达,2385个下调表达。GO功能注释表明,差异表达基因显著富集的细胞位置为细胞质、细胞器及大分子复合物等位置,细胞器包括线粒体、叶绿体及质体等,分子功能主要为核酸外切酶的活性,参与的生物过程是花粉壁的形成和组装。与polCMS显著相关的通路主要是核糖体、糖和氨基酸代谢、核苷酸切除和修复、RNA降解等通路。表达谱和RT-PCR结果表明恢复基因主要通过下调表达调控育性恢复,有4个差异表达基因与育性恢复密切相关。 | 徐文玲 王淑芬 王翠花 刘贤娴 付卫民 何启伟 赵双宜 | 2013 | 园艺学报2013，40，8： | 2 |
| 8 | 花药绒毡层发育的转录调控机制研究进展显示文摘绒毡层是花药药室最内部的一层体细胞结构,在花粉的形成、发育和成熟方面发挥重要的作用.研究表明绒毡层的发育是一个短暂而复杂的过程,受到很多基因的精密调控.本文总结了调控绒毡层发育的关键转录因子及其主要调控网络,并对关键转录因子在绒毡层发育过程中发挥的调控作用进行了综述. | 隋娟娟 曹兴 邓红祥 吴晨雨 | 2016 | 聊城大学学报(自然科学版)2016，29，3： | 1 |
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