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| 1 | 中国家鸡和红色原鸡mtDNA控制区遗传多态性及系统进化分析显示文摘通过线粒体DNA控制区的结构和多态性来研究中国家鸡和红色原鸡的遗传多态性与系统进化。测定14个中国地方鸡种和红色原鸡2个亚种的256个个体线粒体DNA控制区部分序列约560bp,结果表明,A、C、G、T这4种核苷酸的平均比例分别为25.∞%、37.40%、4.40%和33.20%。共发现44个变异位点,约占分析位点总数的7.86%,没有观测到插入/缺失,颠换和转换之比为0.13;共具有32种单倍型,9种为共享单倍型;16个群体内单倍型多样度从0到0.964,单倍型变异度总体为0.909±0.014,整体的平均核苷酸差异数为7.276,核苷酸多样度为1.851%。群体间核苷酸分歧度(Dxy)在0.747%~3.125%之间变化,核苷酸净遗传距离(Da)为0.015%~2.633%。16个群体表现出较高水平的遗传多态性,群体间表现出显著的遗传分化。群体遗传多态性和亲缘关系分析表明,一些中国家鸡的群体(如固始鸡和仙居鸡)起源于泰国红色原鸡Gallus gallu sgallus亚种,一些中国家鸡的群体(如茶花鸡和藏鸡等)起源于中国红色原鸡Gallus gallus spadiceus亚种,在一些中国地方鸡种还同时具有这2种红色原鸡的遗传贡献;认为中国家鸡起源于泰国或单纯起源于中国的观点都是不全面的。 | 包文斌 束婧婷 王存波 张红霞 Steffen Weigend 陈国宏 | 2008 | 畜牧兽医学报2008，39，11： | 60 |
| 2 | 12个中国地方鸡种群体遗传结构及遗传多样性分析显示文摘利用29对微卫星引物对我国的12个地方鸡种进行群体遗传结构及遗传多样性评估,结果表明:每个座位的等位基因数从2到23不等,所有的12个群体均显示较高水平的杂合度,固始鸡最低,为0.453 2,大骨鸡最高,为0.627 1。鸡种间存在较大的遗传分化,16.7%的遗传变异源于品种间的差异。基于Reynolds’遗传距离的邻近(NJ)聚类图显示,12个群体可以分为2个主要的类群:重体型的鸡种首先聚在一起,然后轻体型鸡种加入。struc-ture程序同时也被用于评价鸡种间的遗传关系,结果与NJ聚类法相似,重体型的鸡种首先与轻体型鸡种分成两类。 | 陈国宏 季从亮 王敏强 Steffen Weigend | 2006 | 畜牧兽医学报2006，37，2： | 39 |
| 3 | 中国红原鸡和泰国红原鸡遗传多样性分析显示文摘利用29个微卫星DNA标记对来自中国的红原鸡Gallus gallus spadiceus亚种和来自泰国的红原鸡Gallus gallus gallus亚种进行遗传多样性分析,评估亚种内的遗传变异和亚种间的遗传分化,结果表明:共检测到168个等位基因,每个位点的等位基因数从2到13不等,所有位点平均的期望杂合度和PIC值分别为0.5780和0.53。中国和泰国红原鸡29个微卫星位点平均有效等位基因数分别为3.79和4.79,平均基因杂合度为0.5379和0.6385,两个红原鸡亚种均表现出较高的群体杂合度和丰富的遗传多样性。群体分化系数为19.4%(P<0.01),两个红原鸡亚种间的Reynolds’遗传距离和Nm值分别为0.157和1.040。由此可见,Gallus gallus spadiceus亚种和Gallus gallu sgallus亚种群体具有不同的群体遗传结构,群体之间存在明显的遗传分化,并不能将其认定为是同一亚种,这也为中国家鸡具有独立的起源提供了一定的佐证。 | 包文斌 陈国宏 吴信生 徐琪 吴圣龙 束婧婷 Steffen Weigend | 2007 | 遗传2007，29，5： | 25 |
| 4 | 红色原鸡和中国家鸡遗传多样性及亲缘关系显示文摘对红色原鸡(Gallus gallus)和中国家鸡(Gallus domesticus)之间的遗传多样性和亲缘关系进行系统分析,可以为中国家鸡的起源进化、种质资源保护以及科学开发利用等研究提供理论依据,但迄今尚未见用微卫星标记进行分析比较的公开报道.本研究利用29对微卫星引物对红色原鸡Gallus gallus spadiceus亚种和Gallus gallus gallus亚种以及14个中国家鸡品种的568只个体进行扫描,共检测到286个等位基因,平均值为9.86±6.36;所有群体的期望杂合度为0.6708±0.0251,皖南三黄鸡的期望杂合度最高(0.6442),固始鸡的最低(0.4532).单个位点偏离Hardy-Weinberg平衡的群体数从0-7不等.整个群体平均遗传分化为17.9%(P〈0.001),约有16.7%的遗传变异源自群体间的差异,所有的位点都极显著地贡献于这一结果(P〈0.001);杂合子缺失的水平很高,为0.015(P〈0.01),有8个位点显示显著的杂合子缺失.群体间的Reynolds’遗传距离从0.036(萧山鸡-鹿苑鸡)~0.371(泰国红色原鸡-河南斗鸡)不等,而Nm值变异范围为从0.583(泰国红色原鸡-河南斗鸡)~5.833(萧山鸡鹿苑鸡).NJ系统发生树中,鹿苑鸡、萧山鸡、北京油鸡、河南斗鸡、淮南麻黄鸡、狼山鸡等重体型的鸡种首先形成一大类;鹿苑鸡与萧山鸡以及茶花鸡与藏鸡有着较近的遗传关系;茶花鸡和藏鸡与两个红色原鸡亚种亲缘关系较近,中国红色原鸡Gallus gallus spadiceus亚种与所有中国家鸡品种的亲缘关系比泰国红色原鸡Gallus gallus gallus亚种要近.结果表明:29个微卫星位点均具有较高的多态性,红色原鸡和中国家鸡群体间存在着极显著的遗传分化;中国家鸡和红色原鸡两个亚种的亲缘关系从近到远的排序是:进化型品种-原始型品种(茶花鸡与藏鸡)-中国红色原鸡亚种(Gallus gallus spadiceus)-泰国红色原鸡亚种(Gallus gallus gallus).提示家鸡可能起源于不同的原鸡亚群体,且中国家鸡具有独立的起源. | 包文斌 陈国宏 李碧春 吴信生 束婧婷 吴圣龙 徐琪 Steffen Weigend | 2008 | 中国科学(C辑)2008，38，1： | 15 |
| 5 | 泰国红色原鸡和中国红色原鸡mtDNA控制区遗传多态性和分类关系研究显示文摘对泰国红色原鸡Gallus gallus gallus亚种和中国红色原鸡Gallus gallus spadiceus亚种各16个个体mtDNAD-loop序列进行系统分析,测定线粒体D-loop部分序列大小约为560bp,A、C、G、T这4种核苷酸的平均比例分别为13.6%、43.2%、4.3%和38.9%,A+T含量高于G+C含量。结果共发现27个变异位点,颠换和转换之比为0.13,没有观测到插入/缺失情况。测定的6种单倍型中,2个红色原鸡亚种没有共享单倍型,单倍型多样度分别为0.250和0.695,平均核苷酸差异数分别为3.750和10.833,核苷酸多样度分别为0.954%和2.757%。泰国红色原鸡中性检验的Tajima'sD值为-1.800(P<0.05),不符合中性突变。2个红色原鸡亚种间核苷酸分歧度(Dxy)为2.847%,核苷酸净遗传距离(Da)为0.991%。序列群体间的方差组分(Va)占总变异的47.31%,Fst=0.473,差异极显著(P<0.01);群体间mtDNAD-loopFst值也差异显著(P=0.035)。红色原鸡2个亚种具有不同的群体遗传结构,群体之间存在明显的遗传分化,本研究支持这2个亚种并非是同一个亚种的观点。 | 吉挺 包文斌 束婧婷 栾德琴 Steffen Weigend 陈国宏 | 2008 | 中国畜牧杂志2008，44，23： | 2 |
| 6 | Binding energy and preferred adsorption sites of CO on gold and silver-gold cluster cations:adsorption kinetics and quantum chemical calculations 显示文摘 | Marco Neumaier Florian Weigend Oliver Hampe | 2008 | J Phys Chem2008，138，： | 1 |
| 7 | Some Elements in the Study of Por t Geography显示文摘 | Guido G Weigend | 1958 | Geographical1958，1958，48： | 1 |
| 8 | Prediction the future: a connectionist approach显示文摘 | Weigend A S Rumelhart D E Huberman B A | 1990 | International Journal of Neural Systems1990，1，3： | 1 |
| 9 | Candiate gene promoter polymorphisms and antibody response kinetics in chickens:interferon-γ,interleukin-2,and immunoglobulin light chain显示文摘 | ZHOU H BUITENHUIS A J WEIGEND S | 2001 | Poult Sci2001，80，12： | 1 |
| 10 | Isolation and characterization of 18 microsatellites in the Peking duck (Arias platyrhynchos) and their application in other waterfowl species 显示文摘 | Maak S Wimmers K Weigend S et ol | 2005 | Mol Ecol Notes2005，3，： | 1 |
| 11 | Bayesian back-propagation 显示文摘 | Buntine W L Weigend A S | 1991 | Complex Systems1991，5，6： | 1 |
| 12 | DNA polymorphisms in the chicken growth hormone gene: response to selection for disease resistance and association with egg production 显示文摘 | Kuhnlein U Ni L Weigend S | 1997 | Anim Genet1997，28，： | 1 |
| 13 | 显示文摘 | WEIGEND F AHLRICHS R | 2005 | Phys Chem Chem Phys2005，7，： | 1 |
| 14 | A first application of independent component analysis to extracting structure from stock returns显示文摘 | Back A D Weigend A S | 1998 | International Journal on Neural Systems1998，8，： | 1 |
| 15 | A- nalysis of two Chinese yak (Bos grunniens) populations using bovine microsatellite primers 显示文摘 | Wang Minqiang Weigend S Barre-Dirie A | 2003 | J Anita Breeding and Ge- netics2003，120，： | 1 |
| 16 | Predicting the future:a connectionist approach显示文摘 | Weigend A S Huberman B A Rumelhart D E | 1990 | International Journal of Neural Systerns1990，1，3： | 1 |
| 17 | Auxiliary basis sets for main row atoms and transition metals and their use to approximate coulomb potentials 显示文摘 | Eichkorn K Weigend F Treutler O | 1997 | Theor Chem Acc1997，97，： | 1 |
| 18 | Resistance to Marek's disease virus in White Leghorn chickens:effects of avian leukosis virus infection genotype, reciprocal mating,and major histocompatibility complex 显示文摘 | Weigend S Matthes S Lamont S J | | Pouh Sci0，80，8： | 1 |
| 19 | Predicting of the Future: A Conneetionist Approach显示文摘 | A S Weigend D E Rumelhart B A Huberman | 1990 | International Journal of Neural Systems1990，1，3： | 1 |
| 20 | Analysis of genetic relationships between various populations of domestic and jungle fowl using microsatellite markers显示文摘 | ROMANOV M N WEIGEND S | 2001 | Poultry Science2001，80，： | 1 |
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