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| 1 | 新型冠状病毒主要蛋白酶6YNQ黄酮类化合物抑制剂的鉴定:一项分子对接研究显示文摘目的新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的病原体新型冠状病毒(SARS-CoV-2)是导致最近疫情全球大流行的原因,由于目前尚无针对SARS-CoV-2的有效药物或疫苗,我们研究了黄酮类化合物对抗SARS-CoV-2主要蛋白酶6YNQ的潜力。方法对SARS-CoV-2的主要蛋白酶6YNQ进行计算机模拟研究。结果所选的21种黄酮类化合物中,芦丁结合能(−8.7 kcal/mol)最高,与催化位点结合良好。结论黄酮类化合物对SARS-CoV-2主要蛋白酶6YNQ有抑制作用,这些计算模拟研究支持了黄酮类化合物可能有助于COVID-19治疗的假设。 | SUMIT Arora GOVIND Lohiya KESHAV Moharir SAPAN Shah SUBHASH Yende | 2020 | Digital Chinese Medicine2020，3，4： | 2 |
| 2 | 靶向TNF-α的植物抗炎先导化合物的计算机模拟筛选显示文摘目的通过计算机模拟进行分子对接,研究多种植物中的抗炎成分对肿瘤坏死因子α(TNF-α,一种参与炎症疾病的介质)的抑制作用。方法基于先前的研究,我们使用AutoDock Vina软件对不同药用植物的抗炎植物成分进行计算机模拟评估,以了解它们与TNF-α的结合模式(PDB ID:6OP0)。分子对接模拟分析中,网格箱(25×25×25)Å中心设为[-12.817×(-1.618)×19.009]Å,网格间距为0.375Å。此外,使用Discovery Studio Client 2020程序评估与靶标和配体氨基酸相关的二维和三维(2D和3D)氢键间的相互作用,并根据里宾斯基类药五规则和SwissADME数据库预测其理化性质,以支撑分子对接模拟结果。结果我们从选取的药用植物中筛选出200多种植物化合物与抗TNF-α蛋白结合,结合评分在-12.3至-2.5 kcal/mol范围内。其中,大黄素、芦荟大黄素、水黄皮籽素、紫花青素、附根含希米拉因、鞣花酸、欧前胡素、α-生育酚和八降葫芦素A表现出良好的结合亲和力,分别为-10.6、-10.0、-10.5、-10.1、-11.2、-10.3、-10.1、-10.1和-10.0 kcal/mol。此外,这些成分的吸收、分布、代谢、排泄及毒性(ADMET)特征参数均在正常范围内。结论根据初步研究结果,我们认为本研究选取的植物成分可以通过抑制TNF-α靶标成为良好的抗炎候选物。可以将这些化合物作为治疗炎症的新成分进行进一步优化和验证,以开发更加有效、安全的抗炎药物。 | Sumit Arora Pallavi Rushiya Kalpana Tirpude Nidhi Sapkal Subhash Yende Abhay Ittadwar Sapan Shah | 2022 | Digital Chinese Medicine2022，5，3： | 0 |
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