4篇
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| 1 | 水稻功能基因组育种数据库(RFGB):3K水稻SNP与InDel子数据库显示文摘水稻是全世界最重要的粮食作物之一.对全球水稻品种资源进行基因组研究,挖掘有利等位基因和指导基于全基因组信息的分子育种具有重大的理论和实践意义,是关系国家乃至全球粮食安全的重大战略问题.本研究通过全球3000份水稻资源(3K水稻)的全基因组重测序,获取了其中质量较好的2859份水稻基因组的单核苷酸多态性(SNP)及小片段插入缺失(In Del)的基因组变异数据,建立了综合性的水稻功能基因组育种数据库的SNP与In Del多态性子数据库.该子数据库包含了3K水稻多态性信息检索、基因组浏览器可视化系统、特定区段基因组数据导出系统等多项功能.本数据库的建立将为研究水稻基因功能、指导水稻全基因组选择育种提供重要平台. | 郑天清 余泓 张洪亮 吴志超 王文生 太帅帅 迟璐 阮珏 韦朝春 石建新 高用明 傅彬英 周永力 赵秀琴 张帆 McNally Kenneth L. 李自超 张耕耘 李家洋 张大兵 徐建龙 黎志康 | 2015 | 科学通报2015，60，4： | 9 |
| 2 | A High-throughput Genomic Tool: Diversity Array Technology Complementary for Rice Genotyping显示文摘差异数组技术(DArTTM ) 是胶化无关的描绘的一个 genotyping 工具和高产量。现在的学习的主要目的是为米饭(Oryza sativa L.) 验证飞镖以一种高产量方式的 genotyping。技术上,主要目的是产生米饭通用的基因分享,并且优化这个 genomic 工具以便评估米饭 germplasm 基因差异。为了完成这,第一,一个通用飞镖数组被开发。从 24 个变化的十个代表是有通用数组的 hybridized 决定在数组上打印的克隆的增进知识。增进知识 1 152 克隆在一个幻灯片上被重新穿并且过去常采指纹 24 germplasms 中的 17 个。从是到 DNA 数组的 assayed 的 germplasm 准备的 Hybridizing 目标给了 germplasms 的 DNA 指纹。未加工的数据被使正常化并且转变了成二进制数据,它然后被使用 NTSYSpc 分析(为簇和分类分析的数字分类系统, v。2.02j ) 软件包裹。图形地显示的 dendrogram 源于数组试验性的数据与简单顺序重复 genotyping 轮廓和变化不同变化的家谱偏差被匹配。考虑到飞镖是一条顺序无关的 genotyping 途径,它将在印射的基因差异和基因的研究被使用有机体多样,特别为有开发更少的分子的标记的那些庄稼。 | Yong Xie Kenneth McNally Cheng-Yun Li Hei Leung You-Yong Zhu | 2006 | Journal of Integrative Plant Biology2006，48，9： | 4 |
| 3 | Variation in root system architecture and drought response in rice ( Oryza sativa ): Phenotyping of the OryzaSNP panel in rainfed lowland fields显示文摘 | Amelia Henry Veeresh R.P. Gowda Rolando O. Torres Kenneth L. McNally Rachid Serraj | 2010 | Field Crops Research2010，，2： | 2 |
| 4 | Development of a Core Set from a Large Rice Collection using a Modified Heuristic Algorithm to Retain Maximum Diversity显示文摘A new heuristic approach was undertaken for the establishment of a core set for the diversity research of rice. As a result, 107 entries were selected from the 10 368 characterized accessions. The core set derived using this new approach provided a good representation of the characterized accessions present in the entire collection. No significant differences for the mean, range, standard deviation and coefficient of variation of each trait were observed between the core and existing collections. We also compared the diversity of core sets established using this Heuristic Core Collection (HCC) approach with those of core sets established using the conventional clustering methods. This modified heuristic algorithm can also be used to select genotype data with allelic richness and reduced redundancy, and to facilitate management and use of large collections of plant genetic resources in a more efficient way. | Hun-Ki Chung Kyu-Won Kim Jong-Wook Chung Jung-Ro Lee Sok-Young Lee Anupam Dixit Hee-Kyoung Kang Weiguo Zhao Kenneth L. McNally Ruraidh S. Hamilton Jae-Gyun Gwag Yong-Jin Park | 2009 | Journal of Integrative Plant Biology2009，51，12： | 2 |
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