3篇
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| 1 | Intragenic DNA methylation modulates alternative splicing by recruiting MeCP2 to promote exon recognition显示文摘尽管在基因倡导者区域的 DNA methylation 的函数很好在 transcriptional 压抑被建立,在基因身体区域的 DNA methylation 的 evolutionarily 保存的普遍分发的函数仍然保持不完全地理解。这里,我们证明 DNA methylation 在包括的或者拼接的 exons (ASEs ) 被充实,并且 DNA methylation 的那抑制导致 ASEs 的异常拼接。methyl-CpG-binding 蛋白质 MeCP2 在包括的 ASEs 被充实,特别地也是的那些高度, DNA methylation 的 methylated,和抑制破坏到 exons 的 MeCP2 的特定的指向。有趣地, MeCP2 的脱离导致增加的 histone acetylation 和异常跳过 ASE 事件。我们进一步显示出那显示出的活动导致 exon 跳过的 histone deacetylase (HDAC ) 的那抑制有那的重叠的高度重要的度由 MeCP2 引起了击倒。一起,我们的数据显示 DNA methylation 在 exon 定义操作调制拼接的其他的 RNA 的那 intragenic 并且能经由多功能的蛋白质 MeCP2 的招募提高 exon 识别,它从而通过 HDAC 的随后的招募维持本地 histone hypoacetylation。 | Alika K Maunake Iouri Chepelev Kairong Cui Keji Zhao | 2013 | Cell Research2013，23，11： | 19 |
| 2 | Dynamic regulation of alternative splicing and chromatin structure in Drosophila gonads revealed by RNA-seq显示文摘抄写和 post-transcriptional 过程例如其他的拼接,在在 metazoans 控制发展节目起关键作用。最近出现的 RNA-seq 方法把我们真核细胞的 transcriptomes 的理解带到新水平,因为它能两个都同时解决基因表示水平和其他的拼接事件。在性腺获得细胞的区别的更好的理解,我们用 RNA-seq 从果蝇睾丸和卵巢分析了 mRNA 侧面。我们识别了有性特定的 isoforms 在的一套基因野类型(WT ) 性腺,包括几个抄写因素。我们发现从无差别的细菌房间的精子的区别导致了拼接的 RNA 的戏剧的 downregulation 因素。我们的数据证实 RNA 拼接事件是显著地在云石(欺骗) 的无差别的充实房间的袋子里更经常在在 WT 的区别之上的变异的睾丸,而是 downregulated 睾丸。与这一致,我们证明基因在 WT 为成熟分裂和终端区别要求睾丸主要在 transcriptional 水平被调整,然而并非由选择拼接。出人意料地,我们在在无差别的充实房间的欺骗睾丸改变因素和 histone 修改酶的染色质的所有家庭的表示观察了增加。更有趣地,有相反的酶的活动的染色质管理者和 histone 修改酶是在在睾丸的无差别的房间的 coenriched,建议这些房间可以拥有动态染色质建筑学。最后,我们的数据表明果蝇 gonadal transcriptomes 的许多新特征,和愿望导致的更全面的理解微分基因表示并且拼接在果蝇调整 gametogenesis。我们的数据为在果蝇在细菌房间生物学的许多有趣的区域拼接的基因表示和选择的系统的学习提供了一个基础,例如性同种二形和在 germline 干细胞系的增长对终端区别程序的规定的分子的基础。为未加工、分析的 RNA-seq 数据的 GEO 就职数字是 GSE16960。 | Qiang Gan Iouri Chepelev Gang Wei Lama Tarayrah Kairong Cui Keji Zhao Xin Chen | 2010 | Cell Research2010，20，7： | 9 |
| 3 | Alternative splicing switching in stem cell lineages显示文摘到再生药的干细胞的申请取决于位于他们的 pluripotency 下面的分子的机制的彻底的理解。许多研究识别了关键抄写调整因素的 transcriptional 网络和染色质风景胚胎并且很多个成年干细胞。另外,最近的出版物揭示了茎 cellsa 的另一个有趣的分子的特征不同其他的拼接模式。因此,干细胞的身份和活动被茎维持,是可能的房间特定的 mRNA isoforms,当换到时,不同 isoforms 保证合适的区别。在这评论,我们将讨论 mRNA isoform 切换和它和另外的分子的机制的相互作用调整干细胞 pluripotency,以及区分的房间在被导致成为 pluripotent 茎的 reprogramming 过程的概论像房间的房间(iPSCs ) 。 | Iouri CHEPELEV Xin CHEN | 2013 | Frontiers in Biology2013，8，1： | 1 |
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