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| 1 | 核型似近系数的聚类分析方法显示文摘本文根据近年来核型分析所积累的大量资料,以及谭远德(1991)提出的似近分析理论,提出了核型似近系数A聚类分析方法,确定了核型计算公式,井应用于lo种淡水鱼核型似近系数聚类分析,获得了与形态分类学非常一致的结果。此外,还提出了染色体带型计算公式,从而使核型公式和校型似近系数从核型的整体结构、染色体形态结构和染色体内部结构等三个层次上,较精确地刻画了物种核型特性和物种间校型的等同性或同源性。以此核型似近系数作为分类依据所获得的物种分类结果,能真实地和客观地反映物种的自然分类模式。 | 谭远德 吴昌谋 | 1993 | Acta Genetica Sinica1993，20，4： | 56 |
| 2 | AFLP标记在研究家蚕遗传多态性方面的应用显示文摘AFLP是一种多态检出效率很高的分子标记技术,在构建遗传图谱,遗传多态性研究,重建分子系统演化树,品种鉴定,基因克隆等众多研究领域有着其它分子标记技术不可比拟的优势。本文在前人用AFLP技术对植物多态性研究的基础上,将AFLP用于家蚕的遗传多态性研究,结果发现在家蚕中同样具有丰富的AFLP标记的多态性。由此暗示AFLP技术亦适合研究家蚕等昆虫类动物的遗传多态性,构建遗传图谱,或用于其分子生态学,分子进化和分类等方面的研究。此外本文还探讨了适合于家蚕等昆虫的AFLP分析的实验条件。 | 万春玲 谭远德 朱玉芳 鲁成 | 1999 | 生物技术1999，9，5： | 46 |
| 3 | AFLP的一种改进方法显示文摘扩增片段长度多态性(AmplifiedFragmentLengthPolymorphism)技术是一种兼具稳定性及多态检出率高的DNA指纹分析技术,具有广泛应用前景,但该技术费用高、操作较复杂.本文对AFLP技术从限制性内切酶水解、扩增条件、检测方法三方面作了一些改进,建立了一套稳定的和简便易行的实验条件,同时用这种改进的方法对家蚕基因组DNA的多态性进行了初步研究,得到了良好的DNA的多态性检测效果,不仅分辨力较高。 | 万春玲 谭远德 | 1999 | 南京师大学报(自然科学版)1999，22，2： | 36 |
| 4 | 利用AFLP标记构建家蚕分子连锁图谱显示文摘AFLP技术构建了家蚕分子标记连锁图谱,在扩增中使用了18组双引物及两个单引物在家蚕品系782和od 100的回交子代中得到了1177个扩增位点,有359个非分离位点,818个分离位点。分离位点中有292个位点符合孟德尔1:1分离比例。用MAPMAKER软件将292个标记位点及形态标记基因od分成26个连锁群,19个二联体及81个未进入连锁关系的标记。每个连锁群包含3~14个标记。平均为 6.5个标记。该连锁图总图距为 3285.5cM。标记间平均距离为 20.0cM。形态标记od被定位于该图谱中 3号连锁群上,而od基因位于家蚕Z染色体上,故可确定该分子标记连锁群对应于传统的家蚕形态标记图谱中的Z染色体。 | 万春玲 谭远德 朱玉芳 贺一原 鲁成 周择扬 向仲怀 | 2001 | 中国农业科学2001，34，3： | 29 |
| 5 | 家蚕AFLP连锁框架图谱的构建显示文摘利用改进的AFLP分子标记方法 ,对家蚕Bombyxmori回交一代BC1群体进行连锁图谱的构建。经 17组AFLP引物的选择性扩增 ,共得到 4 30个多态位点 ,卡方检验后有 2 5 3个为有效位点。利用Mapmaker Exp (Version 3 0b)软件作连锁分析 ,其中 16 3个标记分属 2 8个连锁群 ,连锁群标记数变化范围是 2~ 2 8个 ,平均每个连锁群标记数为 5 8个 ,该图覆盖的基因组长度为 2 998 9cM(图距单位 ) ,连锁群长度变化范围为 4 5~ 6 5 2 8cM ,连锁群的平均长度为 10 7 1cM ,平均图距为4 5~ 36 7cM。 | 朱玉芳 谭远德 万春玲 鲁成 贺一原 周泽扬 向仲怀 | 2001 | 昆虫学报2001，44，4： | 23 |
| 6 | 品种综合评价的数学方法显示文摘品种的好坏、优劣直接影响农业生产,因此,选育的新品种在投入生产前需要进行 品比实验、生产试验和品种鉴定.这些工作实际上就是对选育的新品种进行综合的客观评价.基于 这种需要,本文给出了一种建立在主成分分析基础上的综合评价数学方法.应用这种方法对家蚕 30个品种进行综合评价,获得了与实际情况相当吻合的评价结果.根据评价值Ak,将这30个家 蚕品种分为4大类,Ak>700的为优秀品种,7.00>Ak>0的为优良品种,0>Ak>-7.00 的为低劣品种,而Ak<-7.00则为极低劣品种. | 谭远德 鲁成 向仲怀 | 2000 | 生物数学学报2000，15，4： | 21 |
| 7 | 鲤科鱼肠道菌分布及共生关系研究显示文摘对草鱼、青鱼、白鲢、鳙鱼、团头鲂、三角鲂、鲤鱼和鲫鱼等 4个亚科鱼肠道菌群中的好氧菌或兼性厌氧菌进行了分离鉴定 ,并对菌群种类和分布进行了X2 和相关分析 ,给出了一种测度菌群在寄主中广泛分布的广谱系数。结果发现同一亚科的鱼内菌群分布有极高的相似性。而不同亚科的鱼间菌群分布有较大的差异 ,但雅罗鱼亚科 (Leuciscinae)和鳊亚科 (Abramid nae)在菌群分布也有极显著的正相关性。哈夫尼亚菌属、致病杆菌属、气单胞菌属、柠檬酸菌属、假单胞菌属在这 8种鱼中有较高的广谱系数 (9.8937~ 19.0 177)且其x2 测验不显著 :而链球菌属、拉思氏菌属、芽孢杆菌属和葡萄球菌属的广谱系数很低 ,在 0 .5 4~ 2 .392 2之间各自只在 1种或 2种亚科中能检测到 。 | 赵庆新 谭远德 | 2001 | 中国预防兽医学报2001，23，2： | 15 |
| 8 | 杂种优势的一种可能的分子机理——杂合酶的协同效应显示文摘根据酶的结构与催化功能关系原理,提出了杂种优势的一种分子机理的假设,即杂合酶的协同效应,显性互补和异质等位基因互补是其中两个特例.应用杂合酶的正负协同效应能够很好地解释杂种优势的正负性和强弱性.杂合酶的特性与杂种优势的许多性质是一致的.杂合酶的活性多态性得到了同工酶的验证,其中的杂合酶活性强度与杂种优势有很强的正相关.从多聚酶的亚基间相互作用所产生的构象变化的传递形成的催化反应的协同性,讨论了杂合酶产生协同效应的可能性,以及与杂种优势之间的关系.已有许多间接证据暗示基因→酶→协同效应→杂种优势这机制存在的可能性. | 谭远德 | 1998 | 南京师大学报(自然科学版)1998，21，3： | 11 |
| 9 | 构建分子标记连锁图谱的一种新方法:三点自交法显示文摘作者从数学上导出了基因作图的三点自交方法。这一方法同三点测交法一样能提供各种作图信息,但不需要选育三隐性纯合基因亲本或品系,因而能大大提高作图功效。从理论上证明,该方法也适合于小群体作图分子标记连锁图谱。同时用Rsher单一观察信息(即F信息)量证明,三点自交法是一种有效的作图方法。应用 MAPMAKER程序中所提供的老鼠 F2群体中333个个体的12个RFLP标记位点中前6个位点的数据对三点自交法的作图功能进行了检测。结果表明,三点自交法在位点间的连锁关系检测,连锁群中位点的排序和图距计算具有与MAPMAKER程序一样的功能,而且还提供了位点间的交叉干涉和位点的相引或相斥构型等信息以及紧密位点间发生负干涉作用的证据。 | 谭远德 | 2001 | Acta Genetica Sinica2001，28，1： | 9 |
| 10 | 利用肠道菌群的分布和DNA序列对鲤科鱼类系统演化关系的研究显示文摘用检测到的肠道微生物菌群的含量对鲤科鱼类的草鱼 (Ctenopharyngodonidellus)和青鱼 (My lopharyngodonpiceus)、鲢 (Hypophthalmichthysmolitrix)和鳙 (Aristichthysnobilis) ,鲤 (Cyprinuscarpiohaematopterus)和鲫 (Carassiusauratus) ,团头鲂 (Megalobramaamblycephala)和三角鲂 (Megalopbramater minalis) 8个种进行系统演化分析。所获得的系统演化树中 ,每个亚科内的物种邻接为 1个接点。在亚科间 ,雅罗鱼亚科与亚科相邻邻接 1个共同接点。该接点与鲢亚科和鲤亚科连结为 1个共同祖先接点。用线粒体基因组中的cytb和ND4基因全序列分别构建 5个亚科 13和 11个种的NJ树 ,这 2个树在 5个亚科之间的邻接拓扑结构上亦不相同。 3种树可推出一个共同的结论是在所分析的亚科中鲤亚科为最原始的类群 ,而鲫是最原始的类型。 | 谭远德 赵庆新 | 2001 | 中国水产科学2001，8，1： | 8 |
| 11 | 不同作图群体对显隐性分子标记位点的作图效率显示文摘根据位点组合和位点的有效性 ,发展了一种对使用 3种不同的作图群体作图显隐性分子标记的作图效率评价方法 .应用该方法所评价的结果是 ,双单倍体 ( DH)群体的作图效率最高 ,自交群体 ( F2 群体 )与回交群体的作图效率相同 .因此使用双单倍体群体作图不仅所用费用低 ,而且作图速度快 .但只有在极少数植物中能获得双单倍体群体 .对于那些不能获得双单倍体的动植物物种而言 ,可使用自交群体或回交群体作图 .如果作高密度的分子标记连锁图谱 ,则使用自交群体要优于回交群体 ,因为回交群体作图的位点仅仅是由非回交亲本提供的 ,而单一亲本的基因组中可检测的标记位点是有限的 . | 谭远德 万春玲 | 2000 | 生命科学研究2000，4，3： | 6 |
| 12 | 在雌不发生交换的鳞翅目类昆虫中使用F2群体作图显隐性分子标记连锁图谱的极大似然(ML)法显示文摘在鳞翅目昆虫中,雌性个体的减数分裂细胞不发生遗传重组.这类物种的杂交F2群体中杂合子基因型的与一般物种中雌雄个体的减数分裂细胞都发生遗传重组的F2群体杂合子表型不同.由于这个原因,作图这类物种的遗传连锁图谱通常是使用回交群体.但是,用回交群体作图所得的图谱是不完整的,因为图谱上所有的标记都是非轮回亲本提供的,因此标记数不会超过杂交F2群体的一半.另外,目前还没有任何方法和软件可以用杂交F2群体来作图鳞翅目类昆虫,如家蚕等连锁图谱.为了解决这一问题,本文发展了用F2群体作图这类昆虫连锁图谱的两点和三点极大似然法,同时还给出了大群体作图形态基因连锁图谱的一般方法. | 谭远德 万春玲 鲁成 向仲怀 | 2000 | 生物数学学报2000，15，2： | 5 |
| 13 | 连锁与交换理论问题的研究显示文摘在Perkins方程的基础上导出了交换率、交叉数和符合系数之间在正负干涉作用下的函数关系式;给出了正干涉及交叉发生的概率;此外,还导出了负干涉作用下的符合系数计算公式和正负干涉系数的统一性质及其定义域;引入Kosambi方程,建立了用于计算两点测交或三点测交中单交换的符合系数的联立方程。通过上述公式的数学推论,获得了两点重要结论:(1)具有互斥性的正负干涉作用都强烈地发生在短距离的两基因之间;(2)在全负干涉时,有权交换的极大值并等于两个单交换值。后一结论与PatriciaSt.Lawrence所观察的试验结果完全一致。 | 谭远德 鲁成 邓礼容 向仲怀 | 1996 | 遗传1996，18，3： | 5 |
| 14 | QTL形态标记定位的一种数学方法显示文摘根据家蚕中位于Z染色体上的伴性遗传的双形态标记和假定与其有连锁关系的一个具有一对主基因差异的数量性状在测交世代中,所作的理论分布,本文建立了QTL形态标记定位的数学方法,即频数分布面积法,并给出了相应的检测一对主基因在测交世代中的同分离比例及其与形态标记是否有连锁关系的X2统计量.这种定位方法亦适应于非伴性遗传方式的QTL形态标记定位.与单标记定位的极大似然方法相比,我们的方法所作的双标记定位能显示QTL与形态标记发生重组的交叉干步作用,并且定位结果不受作用于数量性状的环境效应所影响. | 谭远德 鲁成 周泽杨 李发德 向仲怀 | 1998 | 生物数学学报1998，13，3： | 5 |
| 15 | 对似近分析的一点改进及其拓广显示文摘本文给出了似近分析一个重要的改进,并将改进的似近分析推广为m维似近分析,同时给出了两个数学定理及其证明。根据多维似近系数的数学性质,提出了一种新的聚类方法,即逐步多维聚类法。实例分析证明,这种聚类法比二维系数聚类优越,聚类功能强,所获得的结果更为客观。 | 王晓佳 谭远德 | 1994 | 生物数学学报1994，9，4： | 4 |
| 16 | 构建分子标记连锁图谱的图论构图方法显示文摘结合统计学、遗传学和图论原理,建立了一种新的分子标记连锁图谱构建的方法,即图论构图法.应用这种方法,从77个家蚕RAPD标记位点中构建了7个标记位点的两个连锁群.与MAPMARKER程序所构建的结果相比表明,图论构图法具有更为可靠的构图效果. | 谭远德 万春玲 周泽阳 鲁成 向仲怀 | 1999 | 生物数学学报1999，14，3： | 4 |
| 17 | 应用频数分布面积法定位家蚕QTL显示文摘利用生态型差异较大的两个家蚕品种782和odl00作正反杂交,得到F1.让F1雄蚕与带双隐性标记的od100回交,得到回交子代.应用频数分布面积定位QTL方法,对家蚕的全茧量和茧层量进行QTL定位.茧层量的一个QTL即q(ω)被定位于性连锁群中标记基因od油蚕一侧的58.14.cM处;全茧量的一个QTL即q(ωc)与sch完全连锁,因此定位于sch基因处.这2种数量性状在测交子代中实际分布与理论分布的吻合表明我们在前文建立的频数分布面积定位方法是有效可行的. | 谭远德 李发德 鲁成 向仲怀 | 1998 | 生物数学学报1998，13，1： | 4 |
| 18 | DNA序列信息的一种新的测度(英文)显示文摘根据信息理论给出了测度DNA序列信息的一种新的方法.获得DNA序列4个层次的信息量测度:Ib;If(1),If(2)andIf(3)这4种信息测度可分别用来测度DNA的碱基序列、密码子序列、编码蛋白质序列和功能蛋白质序列的信息量.从 M edulis的线粒体基因组中两个较短的编码蛋白质的 DNA序列和使用具有不同信性的间并密码子组组成的模拟DNA序列中所获得计算结果表明,这些信息测度确实能用来揭示所隐含在编码蛋白质的DNA中不同层次的有序性.虽然我们还不知道隐含在编码一种蛋白质的DNA中各种子序列信息量是否可以反映这种蛋白质的结构与功能的关系,但是有趣的是,这些信息测度可用来比较编码一种同源蛋白的同源DNA序列,并且这一DNA序列的进化信息. | 谭远德 | 2000 | 生物数学学报2000，15，1： | 4 |
| 19 | 利用肠道菌群的分布和16S DNA序列研究鲤科肠道菌系统演化关系显示文摘肠道微生物与寄主具有复杂的、多方面的相互依存效应,这种依存效应所产生的共生关系或协同进化关系既可反映寄主间的系统演化关系,也可显示肠道微生物间的系统演化关系,共生关系或协同进化关系是由于寄主与肠道微生物两者之间存在着相互自然选择作用所形成的,在长期的进化历程中逐步发生的共生关系信息很可能被记录在DNA序列中。本文通过检测鲤鱼科8种鱼中9种肠道菌群的分布含量对这9种菌群进行分析,且利用从 GenBank调取这 9种肠道细菌菌属的 43个种或亚种的 165 DNA序列的构建 NJ树和 MP树,将这 6个科 9个属43个种或亚种分为革兰氏阴性和革兰氏阳性两大类群(一级分枝)。在这两类群中,又以科为单位分为6个亚类群(二级分枝),而肠杆菌科中则以属为单位分为4个小类群(三级分枝),此外球状菌与杆状菌也能截然分开。将 165 DNA的 NJ树隐去所有的种,以属为单位所得到的以分枝形式的无根树在拓扑结构上与菌群分布含量(寄主范围)所构建的无根树相近,但芽抱杆菌在两种无根树的位置中有较大的差异。如果提高检测水平,扩大所检测的寄主对象,这种差异有可能消除。 | 赵庆新 谭远德 | 2002 | 遗传2002，24，4： | 4 |
| 20 | 家蚕中赤蚁(sch)和油蚕(od)基因对数量性状影响的遗传分析显示文摘应用家蚕BC1世代数据 ,按标记基因型重新组合成 4种类型 ,以消除标记基因型间的差异。在 4种重新组合类型中就赤蚁 (sch)和油蚕 (od)基因对茧长、全茧量和茧层量等 3种数量性状的作用进行了遗传分析 ,发现这 2种质量性状基因对茧长的影响是由与茧长主基因相连锁的连锁效应引起的 ,而sch对全茧量和茧层量可能产生减效作用。F和t测验表明 ,这 2种数量性状值在 4种基因组合类型间无论是方差比值还是平均数都达到显著或极显著水平 。 | 谭远德 鲁成 向仲怀 | 2000 | 蚕业科学2000，26，1： | 3 |
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