Plant Cell Wall Proteomics: Mass Spectrometry Data, a Trove for Research on Protein Structure/Function Relationships

查看全文 作　　者：Cecile Albenne Herve Canut Georges Boudart Yu Zhang Helene San Clemente Rafael Pont-Lezica Elisabeth [1]Jamet

机构地区：[1]Surfaces Cellulaires et Signalisation chez les Vegetaux, UMR 5546 CNRS-UPS-Universite de Toulouse, Pole de Biotechnologie Vegetale, 24 chernin de Borde- Rouge, BP 42617 Auzeville, 31326 Castanet-Tolosan, France

出　　处：《Molecular Plant》索引2009年第2卷第5期,共13页

摘　　要：Proteomics 在整个有机体或在净化的细胞器允许蛋白质表示的大规模学习。特别地,分开胶化的蛋白质的集体 spectrometry (MS ) 分析不仅为蛋白质鉴定,而且为蛋白质结构生产数据,地点,并且也处理。深入的分析从 Arabidopsis thaliana 的变白的胚轴房间墙 proteomics 在 MS 数据上被执行。这些分析证明 multigene 家庭的高度相应的成员能被区分。介绍 93% 氨基酸身份的二 lectins 用采指纹的肽质量被识别。尽管象 extensins 那样的结构的蛋白质或 hydroxyproline/proline-rich 蛋白质(H/PRPs ) 的鉴定是艰巨的, MS 系列的不同类型被利用识别并且描绘 H/PRP。在几房间墙蛋白质(CWP ) 的成熟事件用地点印射被分析。氨基酸的 CWP 以及 hydroxylation 或氧化的 N-glycosylation 也被探索,增加信息改进我们 CWP 结构 / 功能关系的理解。一个生物信息的工具被开发借助于 MS 定位成熟分泌蛋白质和 N-glycosylation 的 N 终点。 关键词：蛋白质组学蛋白质结构植物细胞壁质谱数据生物信息学冷却用水蛋白质鉴定细胞壁蛋白

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