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| 1 | Double-stranded DNA in exosomes: a novel biomarker in cancer detection显示文摘 | Basant Kumar Thakur Haiying Zhang Annette Becker Irina Matei Yujie Huang Bruno Costa-Silva Yan Zheng Ayuko Hoshino Helene Brazier Jenny Xiang Caitlin Williams Ruth Rodriguez-Barrueco Jose M Silva Weijia Zhang Stephen Hearn Olivier Elemento Navid Paknejad Katia Manova-Todorova Karl Welte Jacqueline Bromberg Hector Peinado David Lyden | 2014 | Cell Research2014，24，6： | 98 |
| 2 | DNA聚丙烯酰胺凝胶电泳及银染方法的探讨显示文摘 | 李其松 王金玉 沈华 戴国俊 杨风萍 陈义权 焦彩兰 | 2006 | 黑龙江畜牧兽医2006，，10： | 12 |
| 3 | 多发性结直肠癌中抑癌基因p53的表达与突变显示文摘目的探讨抑癌基因p53与多发性结直肠癌的关系。方法实验组为同时多发性结直肠癌19个癌灶和结直肠再发癌12个癌灶,对照组为散发性结直肠癌17个癌灶。分别采用免疫组织化学抗生物素蛋白生物素过氧化物酶复合物(ABC)方法和单链DNA构像多态性(PCRSSCP)方法对癌组织和癌旁正常组织进行p53蛋白以及p53基因第5、7、8外显子突变的检测,比较各组蛋白表达和基因突变的不同。结果在同时多发癌组、再发癌组以及对照组中p53蛋白阳性表达率分别为73.7%、75%、35.3%,3组比较差异有统计学意义(χ2=6.952,P<0.05);突变率3组分别为52.6%、41.7%、29.4%,差异均无统计学意义。癌旁正常组织均未检出突变;但蛋白表达在同时性三发性癌患者中为阳性。结论多发性结直肠癌中p53基因突变率和蛋白表达高于散发性结直肠癌。p53过度表达的结直肠癌患者要警惕多发癌的发生。 | 张常华 何裕隆 詹文华 王方金 汪建平 蔡世荣 黄美近 | 2005 | 中华实验外科杂志2005，22，3： | 11 |
| 4 | RPA-coated single-stranded DNA as a platform for post-translational modifications in the DNA damage response显示文摘复制蛋白质 A (RPA ) 建筑群是真核细胞的 DNA 新陈代谢的一个必要管理者。RPA 贪心地通过多重 oligonucleotide/oligosaccharide-binding 褶层绑在搁浅单人赛的 DNA (ssDNA ) 并且协调染色体维护因素的招募和交换调整 DNA 复制,再结合和修理。RPA-ssDNA 平台也组成激活主人 ATR kinase 在复制应力期间保护并且修理阻止或崩溃的复制叉的一个关键生理的信号。在最近的年里, RPA 建筑群响应 DNA 损坏作为一个关键目标和 translational 以后修正的一个重要管理者出现了,它为它的染色体保护者功能是批评的。RPA 复杂、更最近调整 RPA 的 ubiquitination 的 Phosphorylation 和 SUMOylation,都被显示了控制 DNA 损坏发信号的特定的方面并且由 modulating 修理在 RPA 和它的搭挡之间的相互作用。这里,我们通过共有原子价修正的一个精致的网络在染色体稳定性和它的规定的维护考察我们 RPA-ssDNA 平台的批评函数的当前的理解。 | Alexandre Marechal Lee Zou | 2015 | Cell Research2015，25，1： | 9 |
| 5 | 基于荧光标记核酸探针及核酸染料SYBR GreenⅠ定量检测单链DNA显示文摘建立了同步双色荧光定量检测单链DNA的方法。利用氧化石墨烯将荧光标记核酸探针的荧光猝灭,而当其与待测液中的目标DNA发生杂交反应,生成的双链DNA脱离氧化石墨烯而使得染料荧光得以恢复,同时生成的双链DNA与核酸染料SYBR GreenⅠ结合,使荧光增强。在优化条件下,目标DNA浓度在1×10'10~2×10'9mol/L范围内时,两种荧光染料的荧光强度之和与目标DNA的浓度之间具有良好的线性关系,拟合的回归方程为y=63.388x+9.3862,R2=0.9954,检出限为85 pmol/L。本方法灵敏度高、准确性及选择性好。 | 郑爱华 朱庆 向东山 何治柯 | 2013 | 分析化学2013，41，3： | 7 |
| 6 | 噪声损伤引起耳蜗外毛细胞凋亡时细胞核内单链DNA的产生及EndoG的转移显示文摘目的观察噪声损伤后耳蜗外毛细胞内单链DNA和EndoG的变化,探讨耳蜗外毛细胞的死亡机制。方法豚鼠随机分为噪声暴露组、MNNG耳蜗灌流组和对照组(每组各12只);小鼠随机分为噪声暴露组和对照组(每组12只)。分离解剖耳蜗后,用碘化丙啶(PI)染色细胞核、Pholloidin染色F-actin,免疫荧光抗体分别染色单链DNA(ssDNA)、核酸内切酶G(Endonuclease G EndoG)和凋亡诱导因子(Apoptosis inducing factors,AIF),制备耳蜗铺片,激光共聚焦显微镜下观察凋亡和坏死毛细胞内的荧光信号变化。结果(1)暴露于120dBSPL的白噪声环境中每天4小时,连续2天后引起豚鼠和小鼠耳蜗外毛细胞凋亡时,其细胞核内产生ssDNA,而在正常细胞内没有三ssDNA;(2)在正常情况下,EndoG分布于耳蜗毛细胞的细胞核外,在暴露于上述噪声后发生凋亡和坏死的豚鼠耳蜗外毛细胞中,EndoG从细胞核外转移到细胞核内,细胞核中的EndoG显著增加;(3)豚鼠耳蜗外淋巴灌流烷化剂MNNG后发生耳蜗外毛细胞凋亡和坏死,在凋亡和坏死的耳蜗外毛细胞中,AIF自线粒体转移到细胞核,其变化与噪声损伤引起耳蜗外毛细胞凋亡和坏死时一致。结论噪声刺激或烷化剂MNNG灌流后,造成耳蜗外毛细胞DNA损伤,产生ssDNA,引起AIF和EndoG自线粒体释放,激活Caspase-3,AIF和EndoG进一步向细胞核转移,最终使细胞核内的DNA降解,导致耳蜗毛细胞的死亡。 | 韩维举 史晓瑞 Alfred Nuttall | 2008 | 中华耳科学杂志2008，6，2： | 6 |
| 7 | Single strand DNA binding proteins 1 and 2 protect newly replicated telomeres显示文摘人单个海滨(ss ) DNA 有约束力的蛋白质 1 和 2 (hSSB1 并且 2 ) hSSB1/2-INTS3-C9orf80 heterotrimeric 蛋白质建筑群的部件被显示参予 DNA 损坏反应和染色体稳定性的维护。然而,他们在 telomeres 的角色仍然保持未知。这里,我们产生了鼠科的 SSB1 有条件的猛烈老鼠和房间并且发现 mSSB1 在 telomere 结束保护起一个关键作用。mSSB1 和 mSSB2 本地化到 telomeres 的一个子集并且被要求修理 TRF2 缺乏的 telomeres。mSSB1 的删除导致了包含的增加的染色单体类型熔化领先海滨并且落后海滨 telomeric DNA,建议它为 G 悬于的保护被要求。mSSB1 和 INTS3 的相互作用为它的本地化被要求到损坏 DNA。mSSB1 与 Pot1a,然而并非 Pot1b 交往,并且它有 telomeric ssDNA 的协会要求 Pot1a。mSSB1 Δ/Δ 老鼠与发展畸形在出生死,当时有 hypomorphic mSSB1 F/F 等位基因活出生并且显示增加了敏感到电离放射(红外) 。我们的结果建议 mSSB1 被要求维持染色体稳定性,并且在保护为 mSSB1/2 记录一个以前未被认出的角色最新复制了领先海滨并且落后海滨 telomeres。 | Peili Gu Wei Deng Ming Lei Sandy Chang | 2013 | Cell Research2013，23，5： | 6 |
| 8 | 金纳米粒子与单链DNA的相互作用显示文摘研究了金纳米粒子与单链DNA在不同pH值时的相互作用以及金纳米粒子与不同碱基序列单链DNA的相互作用.结果表明,在pH为12.6的强碱性条件下,单链DNA能使金纳米粒子稳定分散在溶液中;在pH为1.4的强酸性条件下,单链DNA能保护金纳米粒子不发生融合,而只发生团聚,且团聚现象具有可逆性.不同寡核苷酸对金纳米粒子的亲和力按poly dA>poly dC>poly dT的顺序依次减弱.单链DNA对纳米金的保护作用强度与单链DNA的长度成正比. | 孙莉萍 张建锋 李辉 王秀燕 张召武 王霜 张其清 | 2009 | 高等学校化学学报2009，30，1： | 6 |
| 9 | 适体SELEX筛选中单链DNA的制备显示文摘探讨建立适体SELEX筛选中单链DNA(ssDNA)的制备方法,生成适体筛选的次级库,为适体SELEX筛选奠定基础。将PCR扩增后带生物素标记的双链DNA(dsDNA)连接在链霉亲和素标记的凝胶上,用NaOH变性解链制备ssDNA。利用荧光法分析dsDNA与凝胶结合所需的时间及NaOH对生物素与链霉亲和素标记凝胶结合的影响,在优化的试验条件下制备ssDNA,用琼脂糖和聚丙烯酰胺凝胶电泳对其产物进行鉴定。结果显示:生物素标记的dsDNA与链霉亲和素标记的凝胶结合的时间以40 min为佳,0.01 mol/L、0.10 mol/L和1.00 mol/L的NaOH均不影响生物素与链霉亲和素标记凝胶的结合;在优化试验条件下制备的产物为ssDNA。表明采用上述方法制备ssDNA,操作简单、方便,所需时间短,适用于适体SELEX筛选中次级库的生成。 | 王丽 贺江 王耘 雷兆静 屠康 刘贤进 | 2011 | 江苏农业学报2011，27，5： | 5 |
| 10 | DNA电化学生物传感器测定水中痕量铅显示文摘采用物理涂附法将单链DNA固定到金表面得到ssDNA/Au修饰电极。研究表明,该电极在pH5,0.2mol/L NaAc-HAc缓冲底液中,可用于测定水中痕量pb^2+。pb^2+以Pb-DNA络合物的形式吸附在电极上,以示差脉冲伏安法测定Pb^2+,在0.15V(vs SCE)处有灵敏的氧化峰,其峰电流与Pb^2+浓度在5.0×10^-8~-1.0×10^-6mol/L范围内呈良好的线性关系,此法的检测限为2.0×10^-8 mol/L,该修饰电极的稳定性和抗干扰性都较好。用该电极对饮用水中的Pb进行检测,得到了满意的结果。 | 干宁 王志颖 徐伟民 李天华 | 2007 | 广东微量元素科学2007，14，1： | 5 |
| 11 | 肝细胞癌病人中p53基因突变状况探讨显示文摘目的 了解肿瘤抑制基因p5 3在肝细胞癌中的突变情况 ,探讨乙型肝炎病毒 (HBV)感染与p5 3基因突变之间的关系。方法 提取 5 0例有乙型肝炎病毒感染史肝癌患者手术样本中的DNA ,用聚合酶链式反应 (PCR)扩增 5~ 9外显子 ,作单链构象多态性 (SSCP)分析。结果 p5 3基因突变率超过 2 6 % ,突变主要分布于 5~ 8外显子 ,5、6、7、8外显子分别有 3、3、4、3例 ,另有 4个可疑突变。结论p5 3基因突变可能是肝细胞癌的病因之一 ,而乙型肝炎病毒感染在中国肝癌患者p5 3基因突变中可能起到比较重要的作用。 | 康光明 方志正 Martin Volkmann | 2001 | 中华实验和临床病毒学杂志2001，15，2： | 4 |
| 12 | 人源性汉坦病毒噬菌体抗体基因的筛选、测序和表达显示文摘目的为了获取人源性HFRS基因工程抗体。方法直接从人体PBL构建人全套ScFv、VH噬菌体表面呈现文库,以panning方法筛至四级文库,以ELISA方法鉴定各克隆抗汉坦病毒活性。结果获得了14个ScFv阳性克隆和11个VH阳性克隆。其中ScFv最高阳性克隆A410值为0.44,VH最高阳性克隆A410值为0.50。对最高阳性克隆进行了测序分析,证明连接和克隆正确,获得了抗HTV人源性ScFv和VH抗体的基因片段。克隆再转化于HB2151菌株,成功地进行了分泌型抗体片段的表达。结论采用噬菌体抗体库技术直接从人体克隆人源性汉坦病毒噬菌体抗体可行。 | 侯颖春 杨为松 白雪帆 许国双 李光玉 | 1999 | 中华微生物学和免疫学杂志1999，19，1： | 4 |
| 13 | 人的搁浅单人赛的 DNA 有约束力的蛋白质: 染色体稳定性的保护者显示文摘搁浅单人赛的 DNA 有约束力的蛋白质(SSB ) 为在所有有机体维持染色体的正直是必要的。与 DNA 有关的 Allprocesses 例如复制,切除,修理,和再结合,要求褶层领域是的 SSB whoseoligonucleotide/oligosaccharide-binding ( OB )的参予为和搁浅单人赛的 DNA ( ssDNA ) .For 的相互作用负责很长时间, heterotrimeric 复制蛋白质 A ( RPA )建筑群被相信是在 eukaryotesto 的唯一的原子 SSB 参予 ssDNA 处理,当时 mitochondrial SSB ?那与原核生物的 SSB 被保存被显示是 essentialfor 妈在最近的年,二新蛋白质, hSSB1 和 hSSB2 (人的 SSBs1/2 ) 里,被鉴别并且让更好的顺序类似到细菌并且 archaeal SSB 比 RPA。在 DNA 损坏修理并且处于房间周期检查点激活追随者 DNA 损坏的这些人的 SSB 的这评论 summarizesthe 水流理解,以及他们与癌症的关系。 | Yuanzhong Wu Jinping Lu Tiebang Kang | 2016 | Acta Biochimica et Biophysica Sinica2016，48，7： | 4 |
| 14 | Application of diazo-thiourea and gold nano-particles in the design of a highly sensitive and selective DNA biosensor显示文摘An effective procedure for constructing a DNA biosensor is developed based on covalent immobilization of NH_2 labeled,single strand DNA(NH_2-ssDNA) onto a self-assembled diazo-thiourea and gold nanoparticles modified Au electrode(diazo-thiourea/GNM/Au).Gold nano-particles expand the electrode surface area and increase the amount of immobilized thiourea and single stranded DNA(ssDNA) onto the electrode surface.Diazo-thiourea film provides a surface with high conductibility for electron transfer and a bed for the covalent coupling of NH_2-ssDNA onto the electrode surface.The immobilization and hybridization of the probe DNA on the modified electrode is studied by differential pulse voltammetry(DPV) using methylene blue(MB) as a well-known electrochemical hybridization indicator.The linear range for the determination of complementary target ssDNA is from 9.5(±0.1) × 10^(-13) mol/L to1.2(±0.2) x 10^(-9) mol/L with a detection limit of 1.2(±0.1) > 10^(-13) mol/L. | Mohammad Hossein Mashhadizadeh Rasoul Pourtaghavi Talemi | 2015 | Chinese Chemical Letters2015，26，1： | 4 |
| 15 | 石英晶体DNA传感器检测单链DNA显示文摘利用自组装法 ,将 5’末端标记有巯基醇的单链DNA探针 ,固定在 4 43MHzAT切石英晶体的镀金表面 ,制成石英晶体DNA传感器 。 | 李家洲 刘耘 刘仲明 刘芳 郑文岭 | 2002 | 生物技术2002，12，1： | 4 |
| 16 | Endonuclease-rolling circle amplification-based method for sensitive analysis of DNA-binding protein显示文摘为微数组上的 DNA 有约束力的蛋白质的质的察觉的一条敏感途径被开发。一个部分双区域从一份 biotin 教材和圆单身者海滨 DNA (ssDNA ) 在被形成的 DNA 建筑群在一个微数组上被看到。endonuclease 识别地点(ERS ) 和 DNA 有约束力的地点(DBS ) 在双区域以内并排被安排。察觉系统的工作原则如下被描述:什么时候 DNA 有约束力的蛋白质俘获 DBS, endonuclease 不能在 DNA 建筑群属于 ERS,和使不能调动的教材能被卷圆扩大(RCA ) 沿着圆 ssDNA 扩大。当没有蛋白质保护 DBS 时, ERS 能被 endonuclease 攻击,随后,没有滚动的圆扩大发生。从而,我们能检测顺序特定的 DNA 有约束力的活动与由于 RCA 的信号扩大高敏感。 | Min Li Li Dong Rui Zhou Hong Zhao Jin Ke Wang Zu Hong Lu | 2009 | Chinese Chemical Letters2009，20，11： | 4 |
| 17 | 图的最小顶点覆盖问题的质粒DNA计算模型显示文摘给出了图的最小顶点覆盖问题的质粒DNA计算模型及其实现算法 .算法的时间复杂性是O(q) ,编码最小覆盖问题所需的核苷酸片段种类为n ,其中n ,q分别是图的规模和边数 .在算法中 ,所用酶的种类也等于图的规模 .而且 。 | 王淑栋 刘文斌 许进 | 2004 | 华中科技大学学报(自然科学版)2004，32，11： | 4 |
| 18 | In vitro selection of high-affinity DNA aptamers for streptavidin显示文摘在这研究,我们由指数的丰富(SELEX ) 开发了 ligands 的系统的进化用磁性的祷告固定和流动 cytometric 测量的联合的方法。作为一个例子, streptavidin 特定的 aptamers 的选择被执行。在这个协议,常规 SELEX 过程被优化,首先使用磁性的祷告让目标固定从未装订的 ssDNAs 便于有约束力的搁浅单人赛的 DNA (ssDNA ) aptamers 的高度有效的分离,并且第二使用标记监视丰富的流动 cytometry 和荧光黄。流动 cytometry 的敏感在 SELEX 过程期间为 ssDNA quantification 是足够的。当为有 biotinylated 的修改 streptavidin 的表面的占有的描述的工具指向分子,在这个工作获得的 streptavidin 特定的 aptamers 能被使用。在学习描述的方法通常也是适用的指向除 streptavidin 以外的分子。 | Chenglong Wang Guang Yang Zhaofeng Luo Hongmei Ding | 2009 | Acta Biochimica et Biophysica Sinica2009，41，4： | 3 |
| 19 | Sensitive monitoring of RNA transcription levels using a graphene oxide fluorescence switch显示文摘Catalytic transfer of genetic information from DNA to RNA is very important in life activities. The unconventional RNA transcription level may be related to the source of genetic diseases. At present, conventional methods for detection of RNA transcripts usually involve cumbersome preparative steps, or require sophisticated laboratory equipments. In this study, we presented a rapid, sensitive nano-detection platform for monitoring of RNA transcript levels. T7 RNA polymerase transcription reaction is employed as the example to test the feasibility of this method. In this design, in vitro synthesized RNA products can be hybridized to the FAM labeled single strand DNA (ssDNA) probes which can be adsorbed onto the graphene oxide (GO) surface. Using GO as the fluorescence switch, excellent capacity of the signal-on fluorescence platform for detection of RNA transcripts level is demonstrated. Transcription levels sensing with this nano-platform achieved a sensitivity of 5 pmol/L transcription template. It is antici- pated that current developed RNA transcript nano-detection mode has the potential to be an alternative to the conventional RNA transcript detection methods. | ZHOU XiaoMing LIAO YuHui XING Da | 2013 | Chinese Science Bulletin2013，58，21： | 3 |
| 20 | 提高10-23 DNA enzyme催化RNA切割反应效率的策略显示文摘10 2 3DNAenzyme是一种高效且广泛催化RNA切割反应的单链DNA分子。目前国内外学者已用于许多病毒的特异切割和基因表达的阻断。本文针对如何提高其在RNA切割反应中催化效率的有关策略进行综述。 | 侯伟 沃健儿 刘克洲 | 2005 | 国外医学(病毒学分册)2005，12，1： | 3 |
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