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| 1 | 大熊猫辅酶Q-细胞色素C氧化还原酶的辅酶Q连接蛋白基因cDNA的克隆及序列比较显示文摘In order to provide scientific material for promulgating the giant panda(Ailuropoda melanoleuca)nucleus gene inheritance characteristic,for the formulation gene protection countermeasure and to put resources to rational use,the expression sequence of ubiquinol-cytochrome c reductase complex ubiquinone-binding protein(QP-C)gene from the giant panda was analyzed.The result indicates that the cDNA sequence length is 335 bp and contains a 246-nucleotide open reading frame encoding 81 amino acid residues.The pI of the protein is 10.50 and its mole cular weight is 9.60×103 Da.Topology prediction shows these QP-C proteins contain a N-glycosylation site,a potential protein kinase C phosphorylation site and a Casein kinase II phosphorylation site.Comparing the cDNA sequence with amino acid sequence of giant panda’s QP-C gene and cDNA sequence with the amino acid sequence of other species’ QP-C gene shows high similarity.The similarity is 82.3% to 95.2% and 81.5% to 95.1%. | 侯万儒 陈瑜 彭正松 吴夏 唐宗祥 | 2007 | 兽类学报2007,27,2: | 18 |
| 2 | 大熊猫生长激素受体(GHR)cDNA的克隆与序列分析显示文摘根据已报道的若干物种GHR基因cDNA序列设计引物 ,利用RT -PCR技术首次从大熊猫肝脏组织总RNA中扩增出GHR基因编码区全长cDNA序列 ,克隆于pGEM R○-T载体后进行测序和序列分析。结果表明 ,大熊猫GHR的ORF为 1917bp ,编码 6 38个氨基酸的前体蛋白 ,由 18个氨基酸的信号肽和 6 2 0个氨基酸的成熟肽组成 ,与人、狗、猪GHR结构相似 ,大熊猫GHR成熟肽由 2 4 6个氨基酸的胞外区、 2 4个氨基酸的跨膜区和 35 0个氨基酸的胞内区组成 ,并具GHR的特征性结构。序列相似性比较显示 ,大熊猫GHR与哺乳类GHR具有 6 9%~ 93%的高序列相似性 ,与爬行类和鸟类的序列相似性也达到 6 0 % ,而与鱼类的序列相似性较低 ,仅为 30 %左右。与其它哺乳动物GHR相比 。 | 廖鸣娟 张志和 张安居 朱睦元 | 2005 | 兽类学报2005,25,1: | 12 |
| 3 | 大熊猫酸性核糖体磷酸蛋白P1基因cDNA克隆及序列分析显示文摘运用RT-PCR技术,从大熊猫的肌肉组织总RNA中成功克隆了酸性核糖体磷酸蛋白P1(RPLP1)基因的表达序列,并对其进行了测序及初步分析。结果表明:大熊猫RPLP1基因的表达序列全长为448bp,开放阅读框(ORF)为344bp,编码114个氨基酸的蛋白质,该蛋白的分子量为11.566kDa,pI为4.4,含有3个酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点和2个N-酰基化位点。进一步分析发现,大熊猫RPLP1基因的表达序列及其编码的氨基酸序列与已报道的部分哺乳动物具有很高的相似性。 | 杜玉杰 侯万儒 彭正松 周材权 | 2008 | 兽类学报2008,28,1: | 10 |
| 4 | 大熊猫RPS15 cDNA的克隆及序列分析显示文摘本研究运用RT-PCR技术,首次从大熊猫Ailuropoda melanoleuca的肌肉组织总RNA中成功克隆了核糖体蛋白S15(RPS15)基因的表达序列,并对其进行了初步分析。结果表明:大熊猫RPS15基因的表达序列全长为442bp,开放阅读框(ORF)为438bp,编码145个氨基酸,该蛋白的分子量为17.0401KDa,等电点为10.3,含有2个依赖于cAMP和cGMP的蛋白激酶磷酸化位点,5个蛋白激酶C磷酸化位点,4个N-酰基化位点及1个RPS19蛋白signature位点。进一步分析发现,大熊猫RPS15基因的表达序列及其编码的氨基酸序列与已报道的部分哺乳动物具有很高的相似性。 | 罗晓燕 胡锦矗 侯万儒 | 2008 | 四川动物2008,27,2: | 8 |
| 5 | 唐家河自然保护区大熊猫的家庭网络:当代基因流评估显示文摘利用福尔马林固定的粪便材料、寡核苷酸指纹技术以及SRY基因的性别判定技术,构建了唐家河自然保护区大熊猫的家庭网络图,同时对当代基因流(个体迁移)进行了评估. 从124份粪便样品中,鉴定出37只大熊猫(22只雌性和15只雄性). 通过分析这些个体的家庭关系,获得如下主要结果:(ⅰ) 一级亲戚间的遗传相似性为50%~90%,无关个体间的相似性高达77%,说明唐家河自然保护区的大熊猫整体具有很高的遗传相似性;(ⅱ) 鉴定了15对已繁殖过的大熊猫,发现其中5对是高度近亲繁殖,提示唐家河自然保护区的大熊猫近亲繁殖现象较为严重;(ⅲ) 发现4对繁殖大熊猫和5个子代呈远距离迁移,表明保护区内的栖息地是整体相连的;(ⅳ) 有4对全胞兄妹(均为雌雄对)的扩散距离很近,且彼此交配繁殖了高度近交的子代,反映了长距离迁移对于避免近亲繁殖是非常重要的;(ⅴ) 共有17只成年大熊猫为短或中等距离扩散,并在景观上被分为3个群组,提示有必要进一步开展栖息地的质量调查,查明保护区内是否存在着某种因素,阻碍了大熊猫的远距离迁移扩散,从而导致近亲繁殖,威胁大熊猫的生存. | 万秋红 方盛国 李建国 张黎明 欧维富 鲜方海 陈万里 | 2005 | 科学通报2005,50,16: | 7 |
| 6 | 大熊猫LSM3c DNA序列的克隆及序列分析显示文摘运用RT-PCR技术首次从大熊猫Ailuropoda melanoleuca的肌肉组织总RNA中成功克隆了LSM3的表达序列,并对其进行了测序及初步分析。结果表明:大熊猫LSM3基因的表达序列含有一个完整的开放阅读框,长度为306bp,编码102个氨基酸的蛋白质,分子量为11.845kDa,pI为4.58,含有1个蛋白激酶C磷酸化位点、4个酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点、1个酪氨酸激酶磷酸化位点和1个细胞附着序列。进一步分析发现,大熊猫LSM3基因的表达序列与已报道的部分哺乳动物具有很高的相似性,其编码的氨基酸序列与其他哺乳动物完全一致。 | 郝彦哲 侯万儒 杜玉杰 张田 | 2009 | 四川动物2009,28,2: | 5 |
| 7 | 大熊猫核糖体蛋白S12亚基基因(rpS12)的cDNA克隆及序列分析显示文摘根据已报道的部分哺乳动物核糖体蛋白S12亚基基因(rpS12)的相关信息设计引物,运用RT-PCR技术,从大熊猫的肌肉组织总RNA中成功克隆了核糖体蛋白S12亚基基因的表达序列,对其进行了克隆、测序及分析.结果表明:大熊猫核糖体蛋白S12亚基基因的表达序列全长为422bp,开放阅读框(ORF)为399bp,编码132个氨基酸的蛋白质,该蛋白的相对分子质量为1.45×104,PI为6.81,含有1个酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点,3个N-豆蔻酰化位点和一个核糖体蛋白S12 signature位点.该基因的表达序列及其编码的氨基酸序列与已报道的部分哺乳动物有很高的相似性. | 张田 郝彦哲 侯万儒 | 2009 | 北京师范大学学报(自然科学版)2009,45,4: | 5 |
| 8 | 大熊猫核糖体蛋白L30亚基基因(RPL30)的cDNA克隆及序列分析显示文摘RPL30是核糖体大亚基60S的组成部分,由RPL30基因所编码,主要存在于真核生物中.根据已报道的部分哺乳动物核糖体蛋白L30亚基基因(RPL30)的相关信息设计引物,运用RT-PCR技术,以大熊猫(Ailuropoda melanoleuca)的肌肉组织为材料,成功地克隆了核糖体蛋白L30亚基RPL30基因,并对其进行了测序及初步分析.结果表明:大熊猫L30亚基基因的表达序列长为388bp,开放阅读框(ORF)为348 bp,编码115个氨基酸的蛋白质,并含有6个功能位点.进一步分析发现,该基因的表达序列及其编码的氨基酸序列与已报道的人、牛、褐家鼠、小家鼠有很高的相似性,其表达序列同源性分别为93.97%,96.26%,89.66%和89.94%,其编码的氨基酸序列同源性分别为99.13%,98.26%,99.13%,99.13%,且其蛋白质的高级结构相似性也很高. | 侯怡铃 侯万儒 | 2010 | 四川大学学报(自然科学版)2010,47,5: | 1 |
| 9 | 大熊猫Sjogren综合症/硬皮病自身抗原1基因(SSSCA1)的克隆及比较显示文摘Scleroderma is a connective tissue disease characterized by the fibrosisization of skin and internal organs.In this study,the genomic sequence and cDNA of Sjogren’s syndrome/scleroderma autoantigen 1(SSSCA1)gene of the giant panda was cloned successfully using RT-PCR.The cDNA fragment cloned was 642 bp in length,and contained an open reading frame (ORF) of 600 bp encoding 199 amino acids.The genomic sequence was 1 262 bp,containing four exons and three introns. The deduced amino acid sequence showed that this protein was composed of 199 amino acids and its estimated molecular weight was 21.53841 kDa with a pI of 5.14. Three different patterns of functional sites were found:one protein kinase C phosphorylation site,five casein kinase Ⅱ phosphorylation sites,and three N-myristoylation sites. The SSSCA1 gene of the giant panda were highly homologous to those of some other mammals. | 侯怡铃 张田 侯万儒 | 2010 | 兽类学报2010,30,2: | 0 |