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| 1 | Chelex-100快速提取放线菌DNA作为PCR扩增模板显示文摘旨在建立有效扩增16S rRNA基因序列的放线菌DNA快速提取的方法。采用Chelex-100法提取放线菌DNA,使用PCR扩增16S rRNA基因序列评价提取核酸的质量。结果显示,Chelex-100法能够在10 min之内从放线菌中快速提取DNA,所提取的DNA可以直接用于PCR扩增反应,PCR扩增产物电泳条带清晰,符合理论预期结果。因此,Chelex-100法提取放线菌DNA可以作为16S rRNA基因序列PCR扩增的模板,该方法具有经济、简便、快速的特点,适合于放线菌菌株大规模地筛选和分类鉴定。 | 周双清 黄小龙 黄东益 胡新文 陈吉良 | 2010 | 生物技术通报2010，26，2： | 102 |
| 2 | 一种简单、有效的适于PCR操作的放线菌DNA提取方法显示文摘目的:利用改良酶法发展了一种从微量(几百微升)发酵液中快速安全的提取放线菌基因组DNA的方法。方法:利用溶菌酶破壁,蛋白酶K和SDS除蛋白,成功提取较高质量的放线菌基因组DNA,所得的DNA可作为PCR反应的模板进行16SrRNA等基因有效扩增。结果:能从海绵和土壤分离的放线菌中成功提取基因组DNA。结论:该方法操作简单、费用低廉、不使用酚、氯仿等有毒害作用有机试剂,非常适于长期从事放线菌操作的研究人员。为大量放线菌菌株的快速鉴别、高通量筛选和系统分类研究创造了条件。 | 姜淑梅 张龙 戴世鲲 李翔 | 2007 | 生物技术2007，17，1： | 57 |
| 3 | 玉米秸秆深翻还田土壤氨氧化细菌amoA基因多样性分析显示文摘以常规旋耕无秸秆还田(对照)、1年秸秆深翻还田、2年秸秆深翻还田土壤总DNA为模板,采用氨氧化细菌(Ammonia-oxidizing bacteria,AOB)的氨单加氧酶α亚基(amo A)基因特异性引物扩增AOB amo A基因,构建amo A基因文库。运用BLAST程序进行序列比较发现,玉米秸秆深翻还田土壤中分布有亚硝化弧菌属(Nitrosovibrio)、亚硝化螺菌属(Nitrosospira)和亚硝化单胞菌属(Nitrosomonas)微生物菌群,秸秆深翻还田土壤AOB amo A基因序列主要与保护性耕作、长期施肥、间作、温室和植被恢复土壤中的amo A基因序列相似;常规旋耕无秸秆还田土壤AOB amo A基因序列主要与秸秆焚烧大田土壤和内蒙古草原土的amo A基因序列相似。玉米秸秆深翻还田2年处理(SF-Ⅱ)AOB amo A基因多样性指数最高,其次是玉米秸秆深翻还田1年处理(SF-I),常规旋耕无秸秆还田(CK)最低。 | 萨如拉 高聚林 于晓芳 闹干朝鲁 青格尔 赵吉睿 | 2015 | 玉米科学2015，23，3： | 5 |
| 4 | 玉米秸秆深翻还田土壤细菌群落16SrDNA-PCR-DGGE分析显示文摘以秸秆深翻还田土壤为研究对象,利用嵌套式PCR和DGGE电泳技术对细菌16SrDNAV3。V5区进行扩增和产物分离,分析3个秸秆深翻处理下春玉米各生育期土壤细菌群落变化,探索高寒灌溉农区春玉米秸秆深翻还田中细菌群落结构特征。结果初步表明,秸秆还田处理细菌多样性高于常规旋耕无秸秆还田处理,这种多样性同时受玉米生育期和不同秸秆还田处理的影响。3个处理相同生育期DGGE条带数有明显的变化,玉米秸秆深翻还田两年处理(SF—II)条带数最多,其次是玉米秸秆深翻还田1年处理(SF—I),常规旋耕无秸秆还田(CK)最少;在成熟期,SF—II条带数为12,是CK处理的两倍。玉米全生育期一直存在数种优势菌群,但各时期细菌的种类不同,整体表现为随着玉米的生长细菌种类逐渐增加,成熟期减少。秸秆深翻还田能丰富土壤微生物多样性,玉米生长中期土壤微生物多样性较丰富。 | 萨如拉 高聚林 青格尔 于晓芳 闹干朝鲁 赵吉睿 | 2014 | 玉米科学2014，22，3： | 4 |
| 5 | 运用ITS克隆文库解析桉树种植地土壤真菌群落多样性显示文摘为了研究桉树种植地土壤真菌群落多样性,该试验利用ARDRA和ITS系列分析相结合的方法,提取桉树土壤微生物DNA,构建真菌的ITS克隆文库进行阳性克隆检测,分析显示含有ITS序列的阳性克隆子95个,并归类为13个不同的类群OTUs,随机挑取各类群进行测序,构建系统发育进化树.结果表明:用限制性内切酶HinfⅢ进行酶切鉴定,检测到13种不同的分类操作单位(OTUs),其中有3种为单一基因型(OTUs),占总数的23.1%.根据库容(coverage)公式计算得出文库的库容值为97.5%.采用ARDRA酶切图谱和测序结果分析,桉树人工林地土壤真菌群落由Ant fungus garden metagenome,Freshwater metagenome,Coral metagenome,Marine metagenome 4大类群组成,这为进一步研究桉树人工林土壤微生物及环境质量的变化提供了基础资料,并为西南地区桉树与土壤微生物数量、群落之间的变化关系提供了可靠的依据. | 谭燕 何文高 米瑶 朱琳慧 黄靖 李关荣 胡凯 | 2013 | 西南师范大学学报(自然科学版)2013，38，9： | 3 |
| 6 | 菌种类型及EDTA二钠用量对生物甲烷生成的影响显示文摘采用平板分离和培养瓶厌氧技术,结合PCR扩增技术,以沙曲矿煤为发酵基底,中泰矿业和沙曲矿井水及白腐菌为菌种来源,进行产甲烷菌培养实验,并添加不同浓度梯度的EDTA二钠,进行产甲烷菌培养实验,测定实验结束后的产甲烷量。实验证明:中泰矿业矿井水中有产甲烷菌的存在,而沙曲矿井水在含反硝化菌和pH偏高的情况下,抑制了产甲烷菌的生长。同等条件下沙曲矿批次实验中没有甲烷气体的产生,而中泰矿业的有气体产出,适宜浓度的EDTA二钠浓度会显著提高产气量,EDTA二钠用量为1.0 g/L时,中泰矿井水CH4产率达到最大,为10.0 mL/g煤,反应后溶液的pH值明显增高。 | 夏大平 司青 苏现波 胥帅帅 马俊强 | 2014 | 微生物学杂志2014，34，4： | 2 |
| 7 | 淮南地区土壤氨氧化细菌属的组成研究显示文摘采用琼脂糖凝胶电泳法研究淮南地区土壤氨氧化细菌群落组成。将提取的土壤DNA溶液经过纯化、PCR扩增,与氨氧化细菌的4个属的细菌DNA进行琼脂糖凝胶电泳,发现土壤中主要含有亚硝化单胞菌属(Nitrosomonas)和亚硝化球菌属(Nitrosococcus),不含有亚硝化螺菌属(Nitrososoira)。对土壤DNA的提取采用了SDS高盐提取法、Edgcomb改进法和Tsai报道法3种方法。比较电泳条带发现,Tsai报道法提取效果最好。 | 杜晓光 | 2007 | 安徽农学通报2007，13，5： | 2 |
| 8 | 一种高效提取桑树根围土壤微生物总DNA的方法显示文摘为了建立桑树根围土壤微生物群落结构的分子生态学试验技术体系,采取不同的细胞裂解方法及DNA沉淀方法直接提取桑树根围土壤微生物总DNA,并以采用试剂盒提取的桑树根围土壤微生物总DNA为参照,筛选出一种能有效提取高纯度、多样性土壤微生物总DNA的方法:以十六烷基三甲基溴化铵(CTAB)、溶菌酶、蛋白酶K、十二烷基磺酸钠(SDS)为裂解液,经反复冻融裂解细胞,在DNA提取液中添加聚乙烯吡咯烷酮K30(PVP K30)、牛血清蛋白(BSA)、CaCl2去除腐殖酸,并结合聚乙二醇8000(PEG8000)沉淀和纯化DNA。该方法简便、快速,获得的桑树根围土壤微生物基因组DNA分子长度在23 kb以上,土壤鲜样的微生物DNA产率为11.2μg/g,且纯度较高,D(260 nm)/D(230 nm)=1.42,D(260 nm)/D(280 nm)=1.37,可直接用于PCR扩增及变性梯度凝胶电泳(DGGE)分析。 | 黄淑君 胡兴明 于翠 邓文 叶楚华 | 2012 | 蚕业科学2012，38，3： | 1 |
| 9 | 微生物DNA提取通用试剂盒的研究显示文摘以培养好的细菌、霉菌、酵母菌、放线菌为实验材料,在CTAB法基础上配制成了含有dissociation buffer、purification buffer、DNA wash buffer和elution buffer 4种缓冲液的试剂盒,并增加了DNA收集柱.采用该试剂盒分别提取了细菌、霉菌、酵母菌、放线菌的DNA.分别采用感官、核酸检测仪Agilent 2100、NanoDropRND-1000和琼脂糖凝胶方法评定了提取到的DNA质量.试验结果表明:利用该试剂盒可以获得4种微生物的高浓度和高纯度DNA,其操作简单,费用低廉. | 张杰 李研 杨琳 李新欣 赵新 候珺淇 代振玉 | 2019 | 周口师范学院学报2019，36，5： | 0 |
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