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| 1 | 辣椒SRAP-PCR反应体系的建立与优化显示文摘SRAP标记(Sequence-related amplified polymorphism,序列相关扩增多态性)是由Li和Quiros发展了一种新的分子标记技术。SRAP标记具有简便、稳定、中等产率、在基因组中分布均匀的特点,已经应用于在水稻、棉花、油菜、马铃薯、苹果、柑橘类果树、樱桃、梅子、大蒜、莴苣及芹菜等植物和水稻稻瘟病的研究中,对开展遗传图谱构建、基因定位与克隆、比较基因组学、cDNA指纹图谱、生物多样性研究、预测杂种优势等研究是一个十分实用的工具。本研究对辣椒SRAP反应体系的程序、模板、Mg2+等参数进行优化研究,结果表明:辣椒的PCR程序为94℃预变性5min,94℃变性1min,35℃复性1min,72℃延伸1min,5循环,94℃变性1min,50℃复性1min,72℃延伸1min,35循环,最后72℃延伸10min;25滋l反应体系中,模板量为15ng,Mg2+为2.0mmol/L。本研究建立的辣椒SRAP体系重复性好、稳定性强。 | 任羽 王得元 张银东 李颖 王恒明 | 2004 | 分子植物育种2004，2，5： | 149 |
| 2 | 新型分子标记——SRAP与TRAP及其应用显示文摘SRAP与TRAP是最近发展的新型分子标记系统,具有简单、高效、高共显性、重复性、易测序等优点,尤其是可检测基因的可译框(ORFs)区域。本文对分别在芸薹属作物与向日葵中开发的SRAP、TRAP标记系统的基本原理与分析程序进行介绍。引物设计是SRAP与TRAP分析的关键,目前已开发出多个SRAP正、反向引物;与SRAP标记技术无须任何序列信息不同,TRAP技术需要基于已知cDNA或EST序列信息设计固定引物才可进行PCR扩增;二者PCR条件采用复性变温法,前5个循环复性温度为35℃,后30~35个循环为50℃;扩增产物可在聚丙烯酰胺或琼脂糖凝胶上电泳,同位素或银染、EB检测。目前这两种标记系统已开始在多种作物的种质资源鉴定评价、遗传图谱构建(包括转录图谱)、重要性状标记乃至基因分离克隆等方面成功应用。 | 柳李旺 龚义勤 黄浩 朱献文 | 2004 | 遗传2004，26，5： | 165 |
| 3 | 黄瓜SRAP遗传连锁图的构建及始花节位的基因定位显示文摘在由黄瓜自交系S06与S52杂交产生的F2群体中,应用SRAP(sequence-related ampli-fied polymorphism)标记构建黄瓜的分子遗传连锁图谱.使用了64个多态性引物组合,共得到108个多态性条带,单对引物组合最多的产生5个多态性条带,平均1.7个.在F2群体中对这些多态性位点进行连锁分析,并用Mapmaker 3.0构建连锁群,77个标记位点进入9个连锁群(LOD≥3.0),总长1114.2 cM,标记平均间距14.5 cM,标记均匀分布于整个连锁群.同时将始花节位性状控制基因ffn(first flower node)定位在第Ⅸ连锁群上,与两侧标记DC1EM5和ME7EM2A的距离分别为10.3和12.1 cM. | 潘俊松 王刚 李效尊 何欢乐 吴爱忠 蔡润 | 2005 | 自然科学进展2005，15，2： | 129 |
| 4 | 烟草DNA的提取与SRAP反应体系的建立显示文摘以10个烟草栽培品种为试验材料,研究了烟草DNA的提取方法以及对建立烟草SRAP-PCR反应体系的影响因子设置梯度实验,筛选和建立可扩增多态性高、重复性好、带型清晰的最佳SRAP-PCR反应条件:在25μL的反应体系中,MgCl22.0mmol、dNTP200μmol,上下引物各30ng、DNA模板40ng、DNA聚合酶1.5U,扩增程序为:在94℃预变性5min,反应前5个循环在94℃1min,33℃1min,72℃1min条件下运行;随后的30个循环复性温度提高到53℃,最后72℃延伸5min。本文还讨论了不同分子标记在烟草中应用的优缺点以及SRAP分子标记在烟草上的应用前景,提出了应用SRAP分子标记构建烟草遗传图谱的可行性。 | 梁景霞 祁建民 吴为人 周东新 陈顺辉 王涛 陶爱芬 | 2005 | 中国烟草学报2005，11，4： | 66 |
| 5 | 部分柿属植物SRAP-PCR反应体系的优化显示文摘SRAP技术是一种多态性和信息量丰富的新的分子标记技术,其技术简便、快速,不需预知序列信息,近年来在植物遗传多样性分析、种质鉴定、遗传连锁图的构建以及比较基因组学研究等方面得到广泛应用。为了建立柿属植物SRAP技术体系,对影响SRAP-PCR的Mg2+、dNTPs、Taq聚合酶、引物浓度等因素进行了优化。确定优化的反应体系为:模板DNA30ng,Buffer1×,Mg2+2.5mmol/mL,dNTPs0.2mmol/L,Taq酶1u,引物0.3μmol/L,反应总体积25μL。该体系在柿属植物6种1类型共29个基因型中获得较好的扩增结果,可望在柿属植物起源和进化研究中应用。 | 郭大龙 罗正荣 | 2006 | 果树学报2006，23，1： | 79 |
| 6 | 小麦基因组SRAP扩增体系的初步研究显示文摘对影响SRAP扩增结果的各种因素包括DNA、引物、dNTPMixture、TaqDNA聚合酶的浓度及变性、复性、延伸的时间及温度进行了摸索。获得了能够稳定扩增小麦基因组的体系:20μL体系中DNA25ng,dNTP188mmol/L,TaqDNA聚合酶0 75U,引物25ng。扩增程序为:94℃1min,37℃1min,72℃10sec,5个循环;94℃1min,50℃1min,72℃10sec,35个循环;72℃1min。 | 武志朴 杨文香 刘大群 张汀 | 2005 | 河北农业大学学报2005，28，3： | 56 |
| 7 | 盐胁迫下棉花基因组DNA表观遗传变化的MSAP分析显示文摘盐胁迫是非生物逆境中对作物危害比较严重的自然灾害之一,严重影响和制约作物的产量和种植面积。本研究以陆地棉品系YZ1为材料,调查不同NaCl浓度下棉花幼苗生长及根基因组DNA的甲基化水平和变化模式。结果表明,对棉花幼苗的株高和根长生长100mmolL-1NaCl有促进作用,200mmolL-1NaCl有显著抑制作用;100~200mmolL-1NaCl胁迫严重抑制棉花幼苗的侧根数量。甲基化敏感扩增多态性(methylation-sensitive amplification poly-morphism,MSAP)分析表明,经100、150和200mmolL-1NaCl处理后根基因组DNA甲基化比率分别为38.1%、35.2%和34.5%,均低于对照(41.2%),同时棉花幼苗根DNA的甲基化水平与NaCl处理浓度呈显著负相关(r=-0.986)。与对照相比,100、150和200mmolL-1NaCl胁迫下棉花幼苗根基因组DNA的甲基化和去甲基化分别为6.4%、7.6%、11.3%和12.7%、11.1%、8.2%。此外,序列和RT-PCR分析表明,与MSAP差异片段高度同源的基因的表达在处理与对照间差异显著。 | 李雪林 林忠旭 聂以春 郭小平 张献龙 | 2009 | 作物学报2009，35，4： | 55 |
| 8 | SRAP标记技术在花生种子纯度鉴定中的应用显示文摘研究了分属3个市场型的10个中国花生栽培种的序列相关扩增多态性(SRAP)。结果表明, SARP技术可以揭示花生栽培种的遗传差异。在所试验的74对SRAP引物中,2对只获得了单态性条 带,其余72对总共产生了1,812条带,其中1035条(57.12%)为多态性带,每对引物组合平均获得25.16 条带、14.38条多态性带。在这73对引物组合中,总带数和多态性条带的数目分别为7-63和2-44 条。10个花生栽培种的简单匹配相似系数为0.6967-0.9171不等,根据SRAP指纹图谱进行聚类分析 可将这10个品种分为5类。用64对引物筛选作图亲本24-3与B4,获得329条多态性条带。此项研究 为花生品种鉴定和遗传研究提供了新的DNA分子标记技术手段。 | 张建成 王传堂 焦坤 杨新道 | 2005 | 中国农学通报2005，21，12： | 45 |
| 9 | 利用SRAP标记研究四川高原青稞育成品种的遗传多样性显示文摘利用SRAP(Sequence-related Amplified Polymorphism)分子标记技术,对25份来自四川高原的青稞育成品种进行了遗传多样性研究。结果表明:64对引物组合共检测出999条清晰条带,62对可以获得多态性条带,多态性引物组合占96.9%,共产生225条多态性条带,占总条带数的22.5%。64对引物组合共扩增出333种等位变异,平均每个引物组合检测到5.20种等位变异。遗传多样性在0(me9/em14,me9/em15)~0.8928(me6/em18)之间,平均为0.5126。聚类分析结果表明,25份材料可分成A、B、C3大类,材料聚类与其来源地有明显的相关性。25份材料间的平均遗传距离较小(0.3240),平均遗传多样性较低(0.5126),遗传基础较为狭窄。 | 杨平 刘仙俊 刘新春 李俊 王希文 何守朴 李刚 杨武云 冯宗云 | 2008 | 遗传2008，30，1： | 41 |
| 10 | SRAP与TRAP标记及其在园艺植物研究中的应用显示文摘SRAP与TRAP是最近发展的新型分子标记系统,具有简便、高效、重复性好等优点,已在园艺植物遗传育种和种质资源研究的各个方面得到广泛应用.本文介绍了SRAP和TRAP标记的原理、特点,综述了这两种新型分子标记在园艺植物遗传图谱构建、遗传多样性分析以及比较基因组学研究等方面的应用,并对其应用前景进行了展望. | 李莉 彭建营 白瑞霞 韩斌 | 2006 | 西北植物学报2006，26，8： | 35 |
| 11 | 苎麻基因组SRAP扩增体系的优化研究显示文摘以苎麻自交系品种为材料,研究了苎麻SRAP分析过程中的影响因素,包括10×PCRBuffer、模板浓度、Mg2+、dNTP、引物、Taq酶、循环次数、退火温度等,建立了适于苎麻SRAP分析的PCR反应体系:即在20μl反应体系中,引物浓度为0.3μmol/L;模板DNA的用量为60￣100ng;Mg2+浓度为2.0mmol/L;dNTP浓度为0.2mmol/L;Taq酶用量为1U。适宜的扩增程序为先94℃变性1min,前5个循环以94℃变性1min、33℃复性1min、72℃延伸1min进行,接下来将复性温度提高到52℃,其它条件不变,进行30个循环,最后72℃延伸5min,4℃保存。本文讨论了SRAP分子标记在苎麻上的应用前景,提出了应用SRAP分子标记构建苎麻遗传图谱的可行性。 | 刘立军 蒙祖庆 邢秀龙 彭定祥 | 2006 | 分子植物育种2006，4，5： | 36 |
| 12 | 海岛棉遗传多样性的SRAP标记分析显示文摘利用SRAP标记,选用132对带型清晰的多态性引物,对我国引入海岛棉以来培育的36个国内品种及20个国外品种进行遗传多样性分析。共检测到419个多态性位点,每组合的多态性条带数从2-9不等,平均为3.17。利用NTSYS-pc2.10e软件采用Jaccard’s相似系数和UPGMA方法进行聚类分析。结果表明,大部分具有亲缘关系的品种聚在同类中,说明其结果与系谱具有一定的相符性;56个品种的平均遗传相似系数为0.497,变化范围在0.312-0.876之间,说明我国海岛棉品种在分子水平上存在较大差异;我国3个育种时期育成品种的平均相似系数依次为0.501、0.507和0.548,表明我国现在育成的品种相对于早期品种遗传多样性在逐渐降低。这些结果为我国海岛棉育种提供了有益的参考。 | 李武 倪薇 林忠旭 张献龙 | 2008 | 作物学报2008，34，5： | 39 |
| 13 | 罗氏沼虾缅甸引进种和浙江本地种及其杂交种的生长性能与SRAP分析显示文摘为改良罗氏沼虾(Macrobrachium rosenbergii)的养殖特性,将缅甸引进种群(BP)和浙江本地种群(ZP)杂交,获得了4个杂交群体,A、B、C、D分别为BP(♀)与ZP(♂)、ZP(♀)与BP(♂)、ZP(♀)与B(♂)、ZP(♀)与A(♂)的杂交子一代。比较BP、ZP、A、B、C、D 6个不同群体的繁殖和生长性能。结果表明,BP、B、C、D的抱卵率显著高于ZP和A群体,BP、A、B、D平均出苗量显著高于ZP和C群体。在快速生长期(8月2日至9月28日)BP群体的生长速度显著高于ZP、B、C群体,A群体显著高于ZP、B群体,D群体显著高于ZP群体;其他时期各群体间差异不显著。应用SRAP(Sequence-related amplified polymorphism)对BP、ZP、A、B、C、D 6个不同群体的遗传多样性进行比较分析,其多态位点比例分别是60.3%、55.6%、60.7%、63.3%、61.9%、64.1%,遗传多样指数(H0)分别为0.185、0.175、0.196、0.192、0.193、0.197。以上结果表明,罗氏沼虾缅甸引进种的遗传多样性高于浙江本地种,同时通过杂交可提高遗传多样性,改良养殖性状。[中国水产科学,2006,13(4):667-673] | 周劲松 曹哲明 杨国梁 李建林 张志伟 吴婷婷 | 2006 | 中国水产科学2006，13，4： | 33 |
| 14 | 草鱼种质相关SRAP及SCAR的分子标记显示文摘采用相关序列扩增多态性(Sequence-realted Amplified Polymorphism,SRAP)技术分析野生草鱼和家养草鱼,筛选与草鱼种质退化相关的分子遗传标记。共进行88对引物组合的检测,产生标记数目共计905个。依据标记在群体中出现的频率和变化规律,共筛选出21个可能与种质相关的特异性标记,对这些特异性标记进行测序并将测序结果进行BLAST分析。发现测得片段中有8个片段在GenBank中找到同源性较高的序列,而其他片段与数据库中序列的相似性较低。根据序列信息分别设计了3对引物。用这3对引物分别对草鱼三个群体进行PCR扩增,分别产生了SCAR1(308bp)、SCAR2(66bp)、SCAR3(114bp)3个扩增带。采用大样本对这3个标记进行验证,发现其中SCAR1在家养群体中呈现阳性,在野生群体中为阴性,可区分出这两种群体。以SCAR3为引物在174条家养群体中得到目的片段,在26个家养群体没有扩增出条带,分布频率为87%;在100个野生群体中有6个个体检测到该条带,分布频率为6%。以SCAR2为引物在野生群体中完全扩增出目的条带,淡水中心群体中有7条扩增到条带,前洲群体中没有扩增出条带,标记在家养种群中的分布频率为96.50%。因此SCAR1可作为草鱼家养群体的一个重要的分子遗传特征指标,为进一步进行分子标记辅助育种奠定了基础。 | 丁炜东 曹丽萍 曹哲明 | 2008 | 动物学报2008，54，3： | 29 |
| 15 | 青藏高原老芒麦种质基于SRAP标记的遗传多样性研究显示文摘采用SRAP分子标记技术,对采自青藏高原的52份老芒麦材料进行遗传多样性分析,结果表明,1)用16对随机引物组合共扩增出318条清晰可辨的条带,其中多态性条带275条,占86.48%,材料间的遗传相似系数(GS)范围为0.5064~0.9586,平均值为0.7921,物种水平上的Nei氏遗传多样性为0.2270,这些结果说明供试老芒麦具有较为丰富的遗传多样性;2)对所有材料的聚类分析发现,在犌犛=0.80的水平上,供试材料可聚为5类,大部分来自相同或相似生态地理环境的材料聚为一类,表明供试材料的聚类和其生态地理环境间有一定的相关性;3)对5个老芒麦地理类群基于Shannon-Weaver指数的遗传分化估算发现,类群内遗传变异占总变异的65.29%;而类群间遗传变异占总变异的34.71%;4)对各生态地理类群基于Nei氏无偏估计的遗传一致度聚类分析表明,各生态地理类群间的遗传分化与其所处的生态地理环境具有一定的相关性。 | 鄢家俊 白史且 张新全 游明鸿 张昌兵 李达旭 曾怡 | 2010 | 草业学报2010，19，1： | 28 |
| 16 | 利用SSR和SRAP技术分析广西柑橘种质遗传多样性显示文摘利用SSR和SRAP2种分子标记技术对11份广西野生柑橘种质、13份广西地方品种和10份对照品种,共计34份柑橘类材料进行遗传多样性分析,结果表明:选用22对SSR和11对SRAP引物组合进行PCR扩增,依次获得221和215条多态性条带,平均每对引物获得10.1和19.5条多态性条带;SSR聚类图显示34份柑橘种质两两之间的遗传相似系数为0.78~0.96,SRAP聚类显示遗传相似系数为0.60~0.92;2种分子标记基本上能有效地区分宽皮柑橘类、枸橼类、柚类、大翼橙类、宜昌橙类和马蜂柑;同时,广西地区宽皮柑橘类与道县野橘、皱皮柑类与元橘、印度野橘与枸橼类的尤力克柠檬、大种橙与大翼橙类和阳朔金柑、柚类与大翼橙类亲缘关系紧密。 | 刘通 邓崇岭 程玉芳 李秋景 陈传武 刘冰浩 伊华林 | 2016 | 华中农业大学学报2016，35，2： | 27 |
| 17 | Construction of a genetic map with SRAP markers and localization of the gene responsible for the first-flower-node trait in cucumber (Cucumis sativus L.)显示文摘With an F 2 population from the cross of two cucumber inbred lines, S06 and S52, sequence-related amplified polymorphism (SRAP) was used to construct a genetic linkage map in cucumber (Cucumis sativus L.). Sixty-four SRAP primer combinations generated 108 polymorphic bands in the F 2 population analysis. The average of polymorphic bands produced by one primer pair was 1.5, and the maximum was 5. Using Mapmaker 3.0, a linkage map was constructed, which consisted of 77 SRAP markers distributed in nine linkage groups (LOD≥3.0) and spanned 1114.2 cM with an average interval of 14.5 cM between markers. The gene for the first-flower-node trait, termed ffn, was mapped to linkage group Ⅸ, flanked by DC1EM5 and ME7EM2A at 10.3 cM and 12.1 cM distance, respectively. | PANJunsong WANGGang LIXiaozun HEHuanle WUAizhong CAIRun | 2005 | Progress in Natural Science:Materials International2005，15，5： | 26 |
| 18 | DNA指纹图谱技术在作物品种(系)鉴定与纯度分析中的应用显示文摘阐述了常用DNA指纹图谱技术(RFLP、RAPD、SSR、AFLP等)以及其他的几种DNA指纹图谱技术(SCAR、ISSR、SNP、SRAP、TRAP等)的原理、优点及其应用研究概况,认为利用DNA指纹技术通过鉴定品种DNA水平上的差异来鉴定品种真实性和纯度,具有准确可靠、成本较低、不受环境因素影响、便于实现鉴定自动化,且可鉴定表型上难于鉴别的品种等优点;已初步应用于多种作物的品种真实性和纯度分析,有些已实现商业化。虽然DNA指纹技术还存在许多不足,该文认为利用DNA指纹图谱鉴定品种纯度和真实性是品种鉴定的发展趋势,应加大力度不断完善和发展DNA图谱鉴定技术,实现DNA指纹鉴定的简单化、自动化和商业化。 | 孔祥彬 张春庆 许子锋 | 2005 | 生物技术2005，15，4： | 25 |
| 19 | 西瓜种质资源遗传多样性的SRAP分析显示文摘【研究目的】研究西瓜材料之间的亲缘关系及其分类,为进一步利用和创新材料、培育新的品种提供依据;【方法】采用SRAP技术对64份西瓜种质资源的遗传多样性进行了研究;【结果】从700多个引物组合中筛选出了51个条带清晰、多态性高的引物组合来分析供试材料,共产生431条扩增带,其中243条带具有多态性,多态性频率平均为56.4%,除去非洲野生型57号材料,其它材料间多态率为39.4%。将243条多态性SRAP条带,利用NTSYS软件计算了64个材料间的遗传相似系数,其变化范围为0.47~0.97,除非洲野生型材料57号等4个差异较大的材料,其它材料间变化范围仅为0.87~0.97;【结论】说明目前西瓜育种的大多数材料间同源性较高,遗传分化较小,其遗传基础非常狭窄。该研究结果对利用特殊种质、合理选择杂交亲本具有一定的参考价值。 | 张爱萍 王晓武 张岳莉 赵亮 许敏杰 | 2008 | 中国农学通报2008，24，4： | 25 |
| 20 | SRAP技术在遗传的研究进展显示文摘SRAP是一种新型的DNA分子标记,具有简便、稳定、中等产率和容易得到选择条带序列的特点。SRAP利用独特的引物设计对开放读码框(ORFs)进行扩增,上游引物长17bp,对外显子进行特异扩增,下游引物长18bp,对内含子区域、启动子区域进行特异扩增,因个体不同及其物种的内含子、启动子与间隔长度不等而产生多态性。本文阐述SRAP的原理和操作流程,综述了SRAP标记目前在植物遗传图谱构建、遗传多样性、基因定位、基因克隆、杂种优势利用等方面的研究进展及应用前景。 | 李建军 刘志坚 肖层林 贺立伟 | 2007 | 现代生物医学进展2007，7，5： | 22 |
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