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| 1 | SARS冠状病毒的密码子偏爱性分析显示文摘为了分析SARS(SevereAcuteRespiratorySyndrome)冠状病毒的密码子偏爱性(codonpreference),为SARS冠状病毒基因表达中宿主系统的选择提供参考.运用EMBOSS(TheEuropeanMolecularBiologyOpenSoftwareSuite)的CHIPS(CodonHeterozygosityinaProtein codingSequence)和CUSP(Createacodonusagetable)程序对SARS冠状病毒的6个编码蛋白的基因进行分析,并将这6个编码序列拼接在一起进行全基因组的密码子偏爱性分析.分析结果与大肠杆菌、酵母及人的密码子偏爱性进行比较.结果显示SARS冠状病毒的CHIPS分析Nc(effectivenumberofcodons)值为53.338,S、E、M、N蛋白、3CL水解酶、RNA聚合酶的Nc值分别为45.733,61.000,59.040,46.618,46.924,51.902.编码SARS冠状病毒A,P,R,S,T,L等氨基酸的不同密码子使用频率有较大差异.大肠杆菌有25个、酵母有12个、人有20个密码子与SARS冠状病毒密码子使用偏爱性差异较大.因此可以得出结论:编码SARS冠状病毒氨基酸的密码子出现的频率较均一.SARS冠状病毒的密码子偏爱性与真核生物较接近,与原核生物相差较远,其基因表达选择在酵母等真核系统可能更为合适. | 王艳 马文丽 郑文岭 | 2003 | 生命科学研究2003，7，3： | 29 |
| 2 | 冠状病毒的新成员——SARS-CoV的基因组特性显示文摘20 0 3年 3月 ,人类发现一种新的冠状病毒SARS CoV ,这种病毒是非典型性肺炎 (SARS)的病原体。SARS CoV的基因组序列已经由包括中国科学家在内的全世界的科研人员测定完成。该文对国际报道的SARS病源的基因序列进行了收录 ,阐述了SARS CoV基因组的基本特性 :SARS CoV的基因组长约 2 8~ 30kb ,与冠状病毒科的基因组长度相符合 ,其中包括 11个编码序列 ,基因组的组织方式也与其他冠状病毒类似 ,从表面蛋白 (S蛋白 )、外膜蛋白 (M蛋白 )和核蛋白 (N蛋白 )上看 ,SARS病毒与其他冠状病毒的对应蛋白进化关系接近。同时发现 ,在某些区域 ,SARS病毒的基因序列与其他冠状病毒存在相当大的差异 ,具有自身比较保守的基因组序列结构。而且氨基酸的序列也与其他冠状病毒有很大程度的不同。基因信息的冗余分析表明 ,SARS CoV具有较低的冗余度 ,即发生变异的可能性比较大。虽然SARS CoV外表与冠状病毒类似 ,亲缘关系未超出冠状病毒科界限 ,但由于蛋白基因与氨基酸的序列与其他冠状病毒有本质不同 ,因此可能不是其他冠状病毒的变异体 ,而是一种与冠状病毒类似、但早已独立存在。 | 张文广 李金泉 周欢敏 | 2003 | Acta Genetica Sinica2003，30，6： | 5 |
| 3 | 顾孝诚教授与北京大学生物信息中心显示文摘顾孝诚(1930~2012年),北京大学生命科学学院教授.曾任北京大学生物学系主任,国家高技术研究发展计划(简称863计划)蛋白质工程评审专家组组长,蛋白质工程和植物基因工程国家重点实验室主任、学术委员会主任,国际遗传工程及生物技术中心学术委员会委员、主任.顾孝诚教授一生致力于生命科学研究和国际学术交流,对生命科学和技术的发展前沿具有敏锐的洞察力. 20世纪80年代,正值现代生物技术快速发展时期,她参与筹建了蛋白质工程及植物基因工程国家重点实验室,为重点实验室发展奠定了很好的基础.1987~1988年,顾孝诚教授积极推动中国科学院动物研究所、清华大学和北京大学联合申请并最终建立了“生物膜与膜生物工程国家重点实验室”. 20世纪90年代,当生物信息学刚刚兴起时,她及时筹建了北京大学生物信息中心,并成为欧洲分子生物学网络组织的中国国家节点. 2004年,顾孝诚教授积极参与筹建北京大学分子医学研究所,全身心地投入讨论设计分子医学研究所的方向、结构、规模、运行机制、人员引进、经费预算等方面问题.她还十分关心我国药品质量安全的教学、研究及国际交流,积极推动北京大学药物信息与工程研究中心的建立.顾孝诚教授十分重视人才培养和引进. 20世纪80年代,顾孝诚教授作为“中美生物与生物化学考试及申请项目”(CUSBEA项目)中方协调人,与美方协调人吴瑞教授共同组织学生的选拔,受到CUSBEA学生高度尊敬和爱戴,并被由该项目学生发起成立的吴瑞基金会授予终身成就奖. 20世纪80年代末~90年代初,国内生命科学领域人才奇缺,顾孝诚教授竭尽全力,为北京大学生命科学学院引进了陈章良、朱玉贤等一批年轻学者. CUSBEA项目设立的“顾孝诚讲座奖”,每年对生命科学领域取得创新性成果的年轻学者,尤其是在中国工作的年轻学者,予以表彰和鼓励.顾孝诚教授对科学出版和传播事业表现出极大的热情.她曾担任《中国科学:生命科学》英文版顾问编辑,为提升期刊语言质量和学术质量做了大量工作,在期刊发展规划上提出了许多宝贵意见,为期刊的发展和进步作出了突出贡献.斯人已逝,精神长存!今年是顾孝诚教授去世10周年,我们特发表北京大学罗静初教授的文章,以深切缅怀顾孝诚教授.相信顾孝诚教授严肃认真的工作态度和可敬可亲的优秀品质一定会引导和激励广大科研工作者奋勇前行,不断攀登科技创新高峰. | 罗静初 | 2022 | 中国科学:生命科学2022，52，10： | 1 |
| 4 | SARS病毒的基因组研究概述显示文摘对SARS -CoV的基因组特征、基因组序列、基因组变异 ,以及基因组编码蛋白作了综述 ,提示SARS -CoV基因组为无分段的单链正义RNA ,存在极强的变异能力 ,其对应氨基酸序列也存在极多的变异点 ,探索了解SARS | 李新 | 2004 | 怀化学院学报2004，23，5： | 0 |
| 5 | SARS冠状病毒S蛋白S1片段基因克隆和变异分析显示文摘目的 :获得SARS冠状病毒S蛋白S1片段基因的克隆。方法 :将SARS病毒RNA基因组逆转录合成cDNA ,PCR得到阳性条带 ,将其亚克隆到pUCm T载体中进行酶切及测序分析 ,并与Genbank中核苷酸序列进行同源性分析。结果 :阳性克隆经酶切鉴定 ,目的基因片段长度为 1 90 5bp ,与Genbank中另外 4 5株的SARS病毒株的S蛋白S1片段基因比较 ,共有 1 3个位点发生突变 ,其中有 8处为同义突变 ,5处为错义突变。结论 :成功克隆SARS冠状病毒S蛋白S1片段基因 ,为该基因的表达及功能研究奠定了基础。 | 吴淑珍 张洪勤 包其郁 毕云天 黄慧聪 | 2005 | 温州医学院学报2005，35，1： | 0 |
| 6 | SARS冠状病毒Orf3和Orf4的克隆和分析显示文摘目的 :克隆SARS冠状病毒的Orf3和Orf4两个开放性读框 ,并对其进行DNA序列和蛋白质结构分析。方法 :通过RT PCR ,从SARS冠状病毒基因组中扩增得到特异性片段 ,利用TA克隆将PCR产物克隆入PUCm T载体并进行测序、同源性比较和蛋白质结构分析。结果 :RT PCR扩增出的特异产物与预期长度相符 ,序列分析表明 ,其核苷酸序列与已发表的SARS病毒的Orf3和Orf4同源性在 99%以上。结论 :成功克隆SARS冠状病毒Orf3和Orf4两个开放性读框 ,为表达及功能研究奠定了基础。 | 张洪勤 吴淑珍 毕云天 包其郁 | 2005 | 温州医学院学报2005，35，1： | 0 |
| 7 | 三种不同原理的间接酶联免疫吸附试验方法在严重急性呼吸道综合征诊断中的比较研究显示文摘目的比较不同原理的间接酶联免疫吸附试验(ELISA)方法在严重急性呼吸道综合征(Severeacuterespirato-rysyndrome,SARS)诊断中的应用,以便研制开发更先进的诊断试剂,应对可能发生的SARS再次流行。方法对山西省疾病预防控制中心(CDC)送检的正常成年人血清标本44份,首都医科大学附属宣武医院住院SARS患者血清标本62份,宁夏回族自治区CDC送检SARS患者及疑似患者血清28份,分别采用三种不同原理的间接ELISA试剂进行抗体检测:①美国CDC采用全病毒灭活抗原包被,检测血清IgA、IgM、IgG抗体的试剂;②国内某公司采用全病毒灭活抗原包被,检测血清IgG及IgM抗体试剂;③基因工程表达并纯化刺突蛋白(spikeprotein,S蛋白)和核衣壳蛋白(nucleocapsidprotein,N蛋白)抗原包被,检测血清中IgM及IgG抗体的试剂。结果通过比较研究显示:试剂①与试剂③的特异性较高,3种试剂的敏感性有较高的一致性。结论由于全病毒裂解抽提液作包被抗原其生产过程存在生物安全隐患,要求条件高,所以基因工程表达并纯化的蛋白来制备SARS冠状病毒抗体检测试剂有自身的优越性。由于N蛋白具有较强的免疫原性,在各毒株之间的变异又很小,因此以体外基因重组N蛋白代替全病毒裂解液蛋白,是SARS抗体检测试剂的发展方向。 | 朱贞 张燕 毛乃颖 刘中华 崔爱利 蒋小泓 陈彪 韩玉霞 詹军 吴立平 许文波 | 2005 | 中国计划免疫2005，11，3： | 0 |
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