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    题名 作者 年代 出处 被引量
1地毯草ISSR反应体系的建立与优化显示文摘在利用ISSR技术对地毯Axonopuscompessus(Sw )Beauv 种质资源的遗传多样性进行研究的实验过程中,对影响PCR扩增效果的一些因素诸如DNA的提取、模板DNA质量浓度、Taq酶的选择及其用量、Mg2+浓度、dNTP的用量以及退火温度等指标进行筛选和优化,筛选优化出可用于地毯草ISSR-PCR分析最适宜的PCR反应条件:10μLPCR反应体积中,10×Taq酶配套缓冲液(10mmol LTris_HCl,pH9 0,50mmol LKCl,0 1%TritonX_100),0 75UTaqDNA聚合酶(上海申能博彩),0 375μmol L引物,180μmol LdNTP,1 5~2 0mmol LMgCl2,10ng模板DNA。席嘉宾 郑玉忠 杨中艺 2004中山大学学报(自然科学版)2004,43,3:54
2文蛤(Meretrix meretrix)地理种群ISSR分子标记的初步研究显示文摘 利用ISSR(InterSimpleSequenceRepeate)技术对文蛤(Meretrixmeretrix)江苏和辽宁两个地理种群进行了PCR扩增.从100条ISSR引物中筛选出引物13条,每条引物检测出位点数1到8.平均每条引物可检测到位点数4 6个.实验结果表明:江苏文蛤的位点多态性(80 7%)高于辽宁文蛤的位点多态性(68 4%);种群内平均遗传距离分别为0 3105±0 090和0 2658±0 044,江苏文蛤也高于辽宁文蛤.从筛选得到的引物可以发现,文蛤简单重复序列中A、G碱基含量较高.通过对不同实验条件的对比,对ISSR PCR反应体系进行了优化.陈大鹏 沈怀舜 丁亚平 杨家新 沈颂东 许璞 2004南京师大学报(自然科学版)2004,27,3:41
3油茶优良无性系ISSR分子鉴别显示文摘采用ISSR分子标记,以1个普通油茶实生苗作为对照,对我国南方10个油茶优良无性系进行了遗传多样性分析。实验从99条引物中筛选出多态性较高的16条ISSR引物进行PCR扩增,共扩增出135个位点,其中多态性位点数为114个,多态性位点比率为84.44%。基因型间的平均遗传距离(GD)为0.419,其中优良无性系与对照之间的GD值相对较大,平均为0.58。聚类结果表明,油茶优良无性系与普通油茶实生苗存在较大的遗传差异,同时也较准确地进行了各优良无性系的分子鉴别,为油茶的良种选育提供了理论依据。张国武 钟文斌 乌云塔娜 谭晓风 杜天真 2007林业科学研究2007,20,2:48
4西瓜ISSR-PCR体系的正交优化研究显示文摘采用正交试验设计的方法,建立了西瓜ISSR分析的优化反应体系,即20μL反应体系中含有1×buffer,dNTP200μmol/L、Primer1.0μmol/L、MgCl21.5mmol/L、Taq酶1U和模板DNA40ng。适宜的扩增程序为94℃5min,94℃30s,53℃45s,72℃90s,35个循环;72℃5min,4℃保存。刘海河 侯喜林 张彦萍 2004果树学报2004,21,6:32
5ISSR标记技术在猕猴桃遗传研究中的运用显示文摘利用ISSR技术对采自四川省猕猴桃科研基地的14个猕猴桃品种进行了遗传多样性分析.通过引物筛选,从6个ISSR引物中扩增出103条带,其中84条为多态带,占82.41%.UPGMA聚类分析结果揭示了各品种间的亲缘关系.ISSR标记说明猕猴桃品种间遗传距离与地理分布有一定关系,地理位置较近的材料能聚在一起.分子标记可用于猕猴桃种质资源的分类、鉴定及良种选育.邹游 黄敏 侯若彤 吴成 杨志荣 2008西南师范大学学报(自然科学版)2008,33,1:31
6应用ISSR分析油茶无性系的遗传多样性显示文摘以23个油茶无性系叶片的DNA作为实验材料,从60个随机引物中筛选出10个最优引物,并扩增出102条谱带,其中多态性谱带70条,多态性比率为68.6%,谱带大小为200~2000bp。Shannon遗传信息指数为0.4793,平均观察等位基因数和有效等位基因数分别为2.000和1.519;遗传距离为0.1542~0.6931,油茶无性系之间具有较高多态性。运用平均聚类法分析23个油茶无性系的亲缘关系及多样性,在遗传距离为0.392时,23个油茶无性系聚为4类:湘林156、湘林210和湘林4号等18个油茶无性系为第1类;岑软2号和湘林97号为第2类;湘林34号和湘林11为第3类;湘林81号单独为1类。其中,湘林4号与湘林29的亲缘关系最近,湘林34与湘林78的亲缘关系最远。在此基础上,分析了油茶ISSR聚类结果与油茶农艺学性状的关系,从而为油茶优良无性系甄别、亲缘关系分析以及种质资源利用,在分子水平上积累了有效证据。王保明 陈永忠 谭晓风 彭邵锋 石明旺 2008东北林业大学学报2008,36,6:32
7栉孔扇贝、华贵栉孔扇贝及其种间杂交子代、种内交配子代的ISSR分析显示文摘通过对栉孔扇贝、华贵栉孔扇贝及其两者的种间杂交子代、种内交配子代的ISSR标记分析,研究了4种子代群体之间以及子代群体与共享亲本个体间的遗传关系。使用3组ISSR引物,得到清晰的扩增位点169个,平均多态位点检出率66.44%。分析结果显示:杂交子代个体中具有来自父母本的扩增位点,表明杂交子代确为杂种;杂交子代群体不仅具有较高的遗传多样性,而且在与亲本个体和其他子代群体间的遗传关系上表现出与种内交配子代的明显差异;另外杂交子代与2种亲本的遗传关系上并不对等,表现出明显的倾向性,更加偏向于母本一方。刘广绪 包振民 胡景杰 王师 姚冰 战爱斌 2006中国海洋大学学报(自然科学版)2006,36,1:30
8黄瓜SRAP反应体系的正交设计优化显示文摘采用正交试验设计方法,对影响黄瓜SRAP反应体系的5种因素(dNTP、模板DNA、引物、Taq聚合酶及变性剂)4个水平进行优化筛选,确立了适合黄瓜SRAP分析的优化反应体系,即在10μL PCR反应体系中含有1μL 10×PCR buffer,150μmol/L dNTP,30 ng模板DNA,0.3μmol/L引物、1.5 U Taq聚合酶,PCR产物变性时用10μL变性剂。王振国 张海英 于广建 张峰 王永健 许勇 郭绍贵 宫国义 2007华北农学报2007,22,4:28
914份杏种质的ISSR分析显示文摘以冀光为试材,研究了PCR反应体系的主要成分及退火温度对杏ISSR扩增结果的影响.同时,从42对ISSR引物中筛选出12对扩增条带清晰、多态性好的引物进行扩增,并运用UPGMA聚类分析法,分析了12份杏种质的亲缘关系及多样性.结果表明:在20 μL的反应体系中,模板DNA含量在10~80 ng均能得到较好的扩增;dNTP用量对扩增无明显影响;而引物、Mg2+的最适浓度分别为0.25 μmol/L、0.25 mmol/L;Taq酶在0.5~4 U均能得到好的扩增条带;退火温度在50~52.1℃范围内均能得到清晰的条带;并在此基础上建立了杏ISSR反应体系.当相似系数在0.444~0.452之间时,将12份杏材料划分为3类:①普通杏(Amentaca vulgaris),西伯利亚杏(A.sibirica),辽杏(A.mandshurica),藏杏(A.holosericea)类型;②仁用杏品种一窝蜂;③紫杏(A. dasycarpa).冯晨静 张元慧 徐秀英 师国洪 刘威生 孟庆瑞 杨建民 2005河北农业大学学报2005,28,5:26
10毛白杨ISSR反应体系的建立及优化显示文摘为应用ISSR技术开展毛白杨遗传变异分析、辅助育种、品种鉴定、系统进化等研究,以(GTG)6为引物,通过单因子实验分别研究了退火温度、引物浓度d、NTP浓度、Mg2+浓度、Taq DNA聚合酶用量对毛白杨ISSR-PCR反应的影响,建立并优化了适宜于毛白杨ISSR分析的扩增体系:20μL PCR反应体系,1×Taq DNA酶缓冲液(10 mmol/L Tris--HCl,50 mmol/L KCl,0.1%Trion X-100,pH 9.0),1.5 mmol/L MgCl2,1.0 U Taq酶,10 ng模板DNA,0.2μmol/L引物,0.2 mmol/L dNTP.引物(GTG)6的最适退火温度为61℃.冯夏莲 何承忠 张志毅 安新民 杨凯 张有慧 2006北京林业大学学报2006,28,3:25
11黄连ISSR反应条件优化的研究显示文摘以黄连(味连,Coptis ChinensisFranch.)基因组DNA为模板,通过单因子、双因子实验研究了ISSR反应体系中主要成分(Mg2+、dNTP、引物、模板、TaqDNA聚合酶)以及热循环参数(退火温度、循环数、变性时间、退火时间、延伸时间)对扩增结果的影响,并找出各自的最适条件,建立了适合黄连ISSR分析的反应体系和扩增程序,即在25μL反应体系中,内含1×PCR buffer、1.5mmol.L-1Mg2+、200μmol.L-1dNTP、0.3μmol.L-1引物、40ng模板、1UTaqDNA聚合酶。扩增程序为94℃预变性5min,然后进行35个循环:94℃变性30s,(据不同引物的退火温度)复性1min,72℃延伸1.5min,循环结束后72℃延伸7min,-4℃保存。这一优化系统的建立为今后利用ISSR标记技术进行黄连鉴定及种质遗传多样性分析提供了一个标准化程序。陈大霞 李隆云 鲁成 钟国跃 瞿显友 彭锐 2007植物研究2007,27,1:25
12穗花杉ISSR引物反应条件的优化与筛选显示文摘在研究穗花杉(Amentotaxus aragotaenia)的遗传多样性过程中,为了获得清晰、重复性好ISSR扩增结果,对影响ISSR-PCR的多个因素包括模板浓度、Taq酶的选择和用量、Mg^2+和dNTPs浓度及退火温度等指标等进行了筛选和优化,确定了穗花杉ISSRPCR分析的最适扩增条件:20μL PCR反应体系中,2μL 10×Taq酶配套缓冲液,1.8UTaq聚合酶(上海生工公司),0.2μmol·L^-1引物,0.18mmol·L^-1 dNTP,1.5~2.5mmol·L^-1 MgCl2,10ng·μL^-1模板DNA。用来自不同居群7个个体,以100个ISSR引物进行PCR扩增,筛选出扩增效果较好的10个引物。得到了92个位点,其中45个多态性位点,多态性位点比例为49%。朱柏芳 朱笃 邓荣根 李思光 2006植物研究2006,26,3:24
13春兰ISSR-PCR反应体系的优化显示文摘以春兰为材料,对影响ISSR-PCR扩增结果的因素如模板DNA、dNTPs、MgCl2、primer、Taq DNA聚合酶的浓度及引物退火温度、反应循环数进行了探讨,确立了适合春兰ISSR-PCR分析的最佳反应体系和PCR扩增参数:在15μL反应体系中含1×buffer,O.2mmol/L dNTPs,2.0mmol/LMgCl2,0.2μmoll/L引物,0.3UTaq DNA聚合酶,20ng模板DNA。PCR扩增程序:94℃预变性2.5min ;94℃变性45S,48-58℃退火(退火温度随引物不同而定)45s,72℃延伸2min,35个循环;72℃延伸5min。高丽 杨波 2006华中农业大学学报2006,25,3:23
14红树植物海漆ISSR条件的优化显示文摘在利用ISSR分析对海漆Excoecariaagallocha的遗传多样性进行了研究。为获得清晰、重复性的ISSR扩增结果,对影响ISSR_PCR的多个因素,包括DNA的提取、模板浓度、TAQ酶的选择与用量、Mg2+和dNTP浓度等进行了比较、优化,确定了海漆ISSR_PCR分析最适宜的扩增条件:10μLPCR反应体积中,1×Taq酶配套缓冲液(10mmol LTris·HCl,pH9 0,50mmol LKCl,0 1%TritonX-100),0 6~0 7UTaqDNA聚合酶(上海申能博彩生物科技有限公司),0 2μmol L引物,0 2mmol LdNTP,1 5~2 0mmol LMgCl2,10ng模板DNA。张志红 谈凤笑 何航航 吴令辉 钟才荣 施苏华 2004中山大学学报(自然科学版)2004,43,2:22
15莪术不同种和居群的ISSR-PCR分析显示文摘目的:应用ISSR-PCR标记技术研究不同种及居群莪术的亲缘关系和遗传多样性。方法:对蓬莪术、广西莪术和温郁金共8个居群的37个样本进行ISSR-PCR分析,用POPGEN32软件分析其遗传相似系数及遗传距离,UPGMA方法聚类,构建亲缘关系系统图。结果:5条引物共扩增出65个位点,其中34个位点是多态性位点,多态位点百分率为52.3%。遗传相似系数变化范围0.6864~0.9997。Neig基因多样性(H)指数为n1521,Shannon信息指数(I)为0.2338,莪术种内的遗传多样性低于种间。结论:莪术居群间的遗传变异较大,而居群内部的分化程度很低。不同居群的莪术与种的特性和地理分布有一定相关性,为莪术的品种鉴定及栽培育种提供了分子生物学依据。王晓慧 汤晓闯 杨恩秀 刘德军 李敏 李校堃 2008中国中药杂志2008,33,18:21
16白芷种质资源遗传多样性的ISSR研究显示文摘目的应用ISSR分子标记技术分析中药白芷的遗传多样性。方法对4大类商品白芷及白芷近缘野生种兴安白芷共20个居群的白芷种质进行ISSR分析,利用NTSYS2.1e软件分析遗传相似系数,UPGMA方法聚类,构建亲缘关系系统图。结果9条引物共得到97条扩增条带,其中多态性条带37条,占38%;20个居群的样品聚为两大类。结论不同产地栽培白芷的遗传多样性水平较低,种质间的亲缘关系较近;而兴安白芷与4大类商品白芷存在遗传差异。郭丁丁 马逾英 唐琳 陈要臻 吕强 2009中草药2009,40,10:21
17棕榈ISSR反应条件的筛选与优化显示文摘应用ISSR技术对棕榈(Trachycarpusfortunei)进行分析研究,对影响ISSR反应的各因子进行探讨,确定了该研究的最佳反应条件,建立了棕榈ISSR反应的最佳反应体系,为进行棕榈居群遗传多样性的研究奠定了基础。李文表 周先叶 李勇 张寿洲 2006广西植物2006,26,2:21
18燕麦ISSR反应体系的建立与优化显示文摘以10个燕麦品种的基因组DNA为模板,从退火温度、TaqDNA聚合酶、Mg2+、dNTP、引物5个方面对ISSR分子标记体系进行摸索并设计优化试验,建立了一套燕麦ISSR优化反应体系,即:25μl反应体系中,18.3μlddH2O,2.5μl 10×buffer,2.0μmol/L Mg2+,250μmol/L dNTP,1.5 U Taq DNA聚合酶,0.3μmol/L引物,10ng DNA模板。反应程序为:94℃预变性3 min;94℃变性30s,55℃退火30s,72℃延伸1 min,34个循环;72℃延伸5 min,4℃保存。刘欢 慕平 赵桂琴 孙丽坤 2010中国草地学报2010,32,4:21
19ISSR分子标记分析杏鲍菇菌株遗传差异研究显示文摘试验应用ISSR技术分析了杏鲍菇生产性菌株的DNA序列多态性,从20个引物中筛选出11个ISSR引物对12个杏鲍菇生产性菌株基因组DNA进行PCR扩增。结果表明,这些杏鲍菇菌株遗传相似系数为0.68~1.00。采用平均分类法UPGMA分析表明,在遗传相似系数为0.83处可将这12个杏鲍菇生产性菌株分成3类。冯伟林 蔡为明 金群力 范丽军 2009中国食用菌2009,28,1:20
20风信子ISSR-PCR体系的优化及引物筛选显示文摘以风信子基因组DNA为ISSR-PCR扩增模板,采用单因素试验方法,对影响PCR扩增体系中Mg2+浓度、dNTPs、模板DNA及引物浓度、Taq酶的用量5个因素进行研究,建立了风信子ISSR-PCR扩增最佳反应体系,即:20μL反应体系中分别加入2μL10×Buffer、1.4μL Mg2+(25mmol/L)、1.5μL dNTPs(2.5mmol/L)、1.5μL引物(10pmol/μL),0.2μLTaq酶(5U/μL),1.2μL模板(30ng/μL),ddH2O补足体积。并以此体系对110条引物进行筛选,最终获得了多态性高,重复性好的引物12条。胡凤荣 王斐 王志强 任翠 鲍仁蕾 2013分子植物育种2013,11,1:19
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