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| 1 | 线粒体DNA序列特点与昆虫系统学研究显示文摘昆虫线粒体DNA是昆虫分子系统学研究中应用最为广泛的遗传物质之一。线粒体DNA具有进化速率较核DNA快 ,遗传过程不发生基因重组、倒位、易位等突变 ,并且遵守严格的母系遗传方式等特点。本文概述了mtDNA中的rRNA、tRNA、蛋白编码基因和非编码区的一般属性 ,分析了它们在昆虫分子系统学研究中的应用价值 ,以及应用DNA序列数据来推导分类阶 (单 )元的系统发育关系时 。 | 王备新 杨莲芳 | 2002 | 昆虫知识2002，39，2： | 83 |
| 2 | 分子生物学技术在昆虫系统学研究中的应用显示文摘分子生物学技术应用于昆虫系统学研究 ,是 80年代末新兴起来的 ,近几年来发展相当迅速。为了把握这个研究方向 ,并促进这个研究领域的发展 ,作者从研究方法、研究内容、研究对象等方面着手 ,对近 10年来分子生物学技术应用于昆虫系统学中的研究进展进行了概括和总结。介绍了DNA序列测定、RFLP、分子杂交技术、RAPD、SSCP及DSCP等几种主要方法及其应用情况 ,并从种及种下阶元的分类鉴定、种上阶元的系统发育分析、分子进化、种群遗传变异及进化研究等方面总结了已有的研究成果 。 | 成新跃 周红章 张广学 | 2000 | 动物分类学报2000，25，2： | 79 |
| 3 | 基于mtDNA Cytb的六种果实蝇的分子鉴定(双翅目:实蝇科)显示文摘本研究首次对果实蝇属的桔小实蝇Bactroceradorsalis、瓜实蝇B.cucurbitae、南瓜实蝇B.tau、番石榴实蝇B.correcta、具条实蝇B.scutellata、黑漆实蝇B.scutellaris等6种实蝇mtDNACytb基因进行了测序。对这6种实蝇72个个体mtDNACytb基因中段420bp的碱基序列进行分析,得到38种单倍型,发现了116个变异位点,其中30个位点较为稳定。对这6种实蝇与其各自鉴别位点的对应关系研究表明,mtDNACytb基因可以作为这6种实蝇种类鉴别的分子标记。 | 朱振华 叶辉 张智英 | 2005 | 昆虫学报2005，48，3： | 55 |
| 4 | 贵州四个山羊品种mtDNA多态性及起源分化显示文摘采用15种限制性内切酶,研究贵州省4个山羊(caprasp.)品种共93只个体的线粒体DNA多态性。其中BamHⅠ、HindⅢ和SalⅠ3种酶的酶切类型存在多态。共检测到18种限制性态型,归结为3种mtDNA单倍型。单倍型Ⅰ和Ⅱ在贵州山羊4个品种中分布频率较高,分别为7742%和2150%,单倍型Ⅲ分布频率较低(108%);品种间亲缘关系聚类分析表明白山羊和黑山羊亲缘关系最近,其次为黔北麻羊,而与小香羊的亲缘关系最远。推测贵州山羊mtDNA单倍型Ⅰ和Ⅱ可能来源于两个母系祖先,其分化时间约在19万年前。 | 贾永红 史宪伟 简承松 朱文适 张亚平 何正权 廖正录 余应淮 李通权 | 1999 | Zoological Research1999，20，2： | 60 |
| 5 | 用mtCO技术测定云南及贵州四地区的牛带绦虫显示文摘目的 用 mt CO 技术鉴定云南省大理及贵州省都匀、从江等地所发现的是牛带绦虫或牛带绦虫亚洲亚种。 方法 采集成虫样本 ,抽提 DNA,PCR扩增线粒体细胞色素 C氧化酶 (mt CO )部分基因片段并测序 ,经PHYL IP软件包处理 ,计算遗传距离并构建系统发育树状图。 结果 云南省兰坪、大理和贵州省都匀的标本 mt CO 基因片段序列与已知牛带绦虫亚洲亚种的序列相同。贵州从江的标本 mt CO 基因片段序列与已知牛带绦虫的序列相同。两组基因片段的同源性达 97.4 4 % ,氨基酸序列同源性达 99.16 %。系统发育树状图显示 ,牛带绦虫亚洲亚种和牛带绦虫最为接近 ,远离猪带绦虫及其他绦虫。 结论 云南省兰坪、大理及贵州省都匀存在牛带绦虫亚洲亚种 ,贵州省从江发现的虫种为牛带绦虫。 | 王正蓉 包怀恩 | 2003 | 中国寄生虫学与寄生虫病杂志2003，21，1： | 57 |
| 6 | 山羊品种间线粒体DNA限制性片段长度多态性研究显示文摘本试验利用ApaⅠ、BamHⅠ、BclⅠ、BglⅠ、BglⅡ、ClaⅠ、DraⅠ、EcoRⅠ、EcoRⅤ、HaeⅡ、HindⅢ、KpnⅠ、PstⅠ、PvuⅡ、SacⅠ、SalⅠ、SmaⅠ和XhoⅠ计18种限制性内切酶,研究了来自欧洲、非洲及国内的5个山羊品种共计33只个体的mtDNA,共检测出27种限制性态型,可归结为8种单倍型。结果表明,国内2个山羊品种的基本单倍型为BamHⅠ-A、BclⅠ-B、ClaⅠ-A、EcoRⅠ-A、EcoRⅤ-A、HaeⅡ-A、HindⅢ-C和PvuⅡ-A,以及为BamHⅠ-A、BclⅠ-A、ClaⅠ-A、EcoRⅠ-A、EcoRⅤ-A、HaeⅡ-A、HindⅢ-C和PvuⅡ-A,而欧洲及非洲3个山羊品种基本的单倍型为BamHⅠ-B、BclⅠ-A、ClaⅠ-A、EcoRⅠ-A、EcoRⅤ-A、HaeⅡ-A、HindⅢ-B和PvuⅡ-A,这一结果提示本研究几个受试山羊品种可能有两种不同的母系来源;同时,各品种的分子聚类图也表明国内2个山羊品种间具有较近的亲缘关系,而欧洲品种和非洲3个品种间的亲缘关系较近,这一结果也支持上述几个受试山羊品种可能有不同野生祖先的结论,同时也验证了欧洲? | 李祥龙 张亚平 陈圣偶 曾凡同 邱祥聘 刘相模 | 1997 | Zoological Research1997，18，4： | 35 |
| 7 | 西藏牦牛mtDNA D-loop区的遗传多样性及其遗传分化显示文摘通过测定和分析西藏11个牦牛类群114个个体的mtDNA D-loop区全序列,对西藏牦牛的遗传多样性、类群间的亲缘关系及其遗传分化进行了研究。结果表明:①西藏牦牛mtDNA D-loop区全序列长度为890—896 bp,4种核苷酸T、C、A、G的平均比例分别为28.5%、25.3%、32.4%、13.8%,西藏牦牛mtDNA D-loop区富含碱基A+T,表现出一定的碱基偏好性。②共检测到130个变异位点,占分析总位点数的14.33%;其中单一多态位点85个,占多态位点总数的65.38%,简约信息位点45个,占多态位点总数的34.62%。序列变异中碱基缺失、插入和碱基替换等均有,其中碱基替换变异类型中转换114次,颠换12次,在转换变异类型中以A/G、T/C为主,占95.61%,在颠换变异类型中以A/T为主,占75%。③在114个个体中鉴定出90种单倍型,单倍型多样性为0.981±0.008,核苷酸多样性为0.01056±0.00701,均说明西藏牦牛具有丰富的单倍型类型。④90种单倍型分为2个聚类簇(Ⅰ、Ⅱ),聚类簇Ⅰ包含80种单倍型,占全部单倍型的88.89%,涵盖本研究中所有的西藏牦牛类群;聚类簇Ⅱ中有10种单倍型,占单倍型总数的11.11%,涉及的类群有工布江达、帕里、丁青、巴青、江达、类乌齐、桑桑、桑日、斯布,说明西藏牦牛可能有2个母系起源。⑤西藏牦牛类群间核苷酸分歧度(Dxy)在0.503%—1.416%之间,聚类分析和AMOVA分析显示西藏牦牛可分为两大类,康布牦牛、嘉黎牦牛为一类,其余的牦牛类群为另一类。 | 张成福 徐利娟 姬秋梅 信金伟 钟金城 | 2012 | 生态学报2012，32，5： | 32 |
| 8 | 线粒体DNA在昆虫系统学研究中的应用显示文摘综述了 mt DNA的组成和各部分的进化特点 ,以及它们用于昆虫系统学研究的优点。mt DNA进化快的 CO ~ CO 、ND5和 A+T- rich区部分适合亲缘关系较近类群的系统学研究 ,进化慢的 12 s r DNA、16 s r D-NA和 ND1、ND2部分适合亲缘关系较远类群的系统学研究。并对 m t DNA在昆虫系统学研究中的应用前景作了展望 。 | 徐庆刚 花保祯 | 2001 | 西北农林科技大学学报(自然科学版)2001，29，z1： | 27 |
| 9 | 新疆3种雅罗鱼线粒体DNA控制区序列的差异和系统进化关系显示文摘对分布在新疆的准噶尔雅罗鱼 (Leuciscusmerzbacheri)、贝加尔雅罗鱼 (Leuciscusleuciscusbaicalensis)和高体雅罗鱼 (Leuciscusidus) 3个鱼种共 2 4尾个体的线粒体DNAD loop控制区核苷酸序列进行了测定 ,获得 2 4条长度为 6 6 7~ 6 6 9bp的同源基因序列。 3种雅罗鱼之间的序列差异在 6 39%~ 9 89%之间 ,贝加尔雅罗鱼与高体雅罗鱼种间序列同源性高 ,变异程度小 ;贝加尔雅罗鱼与准噶尔雅罗鱼种间序列同源性最低 ,变异程度最大。所采集的贝加尔雅罗鱼两个地理群体 (赛里木湖和额尔齐斯河 )内mtDNA的平均核苷酸碱基序列差异为 1 0 7%和 1 0 8% ;两群体间的序列差异为 1 0 7% ,显示两个地理群体间无明显分化。DNA序列数据显示 ,这 3种鱼类线粒体DNAD loop序列变异丰富 ,2 4尾个体呈现独自的单倍型。同源基因序列平均含AT碱基 6 4 1% ,GC碱基 35 9% ,显示准噶尔雅罗鱼、贝加尔雅罗鱼、高体雅罗鱼的线粒体DNAD loop区核苷酸组成的不均一性。分子系统树提示 ,贝加尔雅罗鱼与高体雅罗鱼亲缘关系较近 ,准噶尔雅罗鱼是 3种雅罗鱼中较古老的鱼种。 | 胡文革 段子渊 王金富 盛金良 马润林 | 2004 | Acta Genetica Sinica2004，31，9： | 26 |
| 10 | 中国主要家鹅品种的遗传分化研究显示文摘利用PCR和DNA测序技术扩增了15个中国家鹅品种线粒体DNA控制区部分序列(1042 bp).研究结果表明:伊犁鹅与14个品种间的核苷酸分歧度最高,为3.805%~4.067%;不同品种内核苷酸多样度表现出较大的差异,为0~0.116%.除伊犁鹅外的14个家鹅品种中,豁眼鹅与其他品种间的核苷酸分歧度为0.211%~0.272%,明显高于其他品种间的0~0.094%.中国家鹅品种的遗传分化格局与地理分布有关,豁眼鹅的分歧时间较早,遗传漂变是导致豁眼鹅遗传分化的主要因素(Nm=0.02~0.54),基因流则是另外13个家鹅品种间遗传分化不明显的主要因素(Nm=12.0~65.33). | 王继文 邱祥聘 曾凡同 史宪伟 张亚平 | 2005 | Acta Genetica Sinica2005，32，10： | 25 |
| 11 | 我国六个地区银鲫种群线粒体DNA多态性的研究显示文摘本文用一对引物对我国6个地区的银鲫进行mtDNA-ND5/6片段的PCR扩增,扩增产物(约2.5Kb)用6种限制性内切酶进行限制性片段长度多态性(RFLP)分析。共获得11种图谱和7种限制性类型(基因型)。根据各群体间的遗传距离构建了UPG聚类关系图。结果表明,6个银鲫种群中,云南群体与贵州群体的关系以及黑龙江与安徽群体之间的关系最近,它们分别归为一个群体;河南群体相对独立,它与黑龙江和安徽群体的遗传关系较近;江西群体与各群体间的亲缘关系最远。 | 姚纪花 楼允东 江涌 | 1998 | 水产学报1998，22，4： | 26 |
| 12 | 中国主要鹅品种的线粒体DNA多态性与起源分化研究显示文摘运用19种限制性内切酶对中国11个家鹅品种138个样本进行了mtDNA的限制性片段长度多态性(RFLP)分析。在使用的19种内切酶中,有7个酶检测出多态。综合27种限制性态型(restrictionmorph),可得到6种mtDNA单倍型(hopotype)。伊犁鹅与另外10个鹅品种没有共享的单倍型,遗传距离和UPGMA聚类分析也表明,伊犁鹅与这些品种具有不同的起源。EcoRV、HaeⅡ、HincⅡ和KpnⅠ4种酶的限制性态型可作为鉴别两种起源家鹅的母系遗传标记。起源于鸿雁的10个鹅品种群体内出现一定的遗传差异,其群体多态度(π)、单倍型间平均遗传距离(P)、品种间平均净遗传距离(δnet)分别为0.025%、0.266%和0.029%。白羽鹅品种在形成过程中经历过创立者效应(foUndereffect)。这10个鹅品种可能起源于两个不同地理区的鸿雁类群。 | 史宪伟 曾凡同 邱祥聘 张亚平 | 1998 | Acta Genetica Sinica1998，25，6： | 25 |
| 13 | 云南保山猪线粒体DNA D-loop区序列初步分析显示文摘为了解云南保山猪(Baoshanpig)的遗传多样性及其遗传背景,我们测定了19个个体线粒体DNAD loop高变区I15363~15801片段序列438bp。检测到10种单倍型,包括8个多态位点,其中5次T/C转换、1次G/A转换、1次G/C颠换和1次A/T颠换,其A、T、G、C碱基的平均含量分别为35.4%、26.9%、13.2%和24.5%,A+T含量(62.3%)明显高于G+C含量(37.7%)。对于保山猪的保种及其持续利用有着重要的理论指导意义。 | 开兴 连林生 聂龙 史宪伟 张亚平 | 2003 | 遗传2003，25，5： | 23 |
| 14 | 鲫鱼遗传多样性的初步研究显示文摘用17种限制性内切酶对鲫属普通鲫鱼低背型、高背型、异育银鲫、日本白鲫及华南鲤的变种红鲤共 124个个体的线粒体DNA(mtDNA)进行了 RFLP分析,14种酶具多态,共计43种限制性态型、 11种单倍型。结果表明:(1)基于 mtDNA群体间的净遗传距离所构建的聚类关系对应于形态分类。(2)普通鲫鱼的群体遗传分化指数GST值表明云南和湖北的普通鲫鱼已出现地理分化。它们之间无相同的限制性单倍型,因此,在短期内未发生基因交流;云南普通鲫鱼 GST值为0.142,各水域的群体中均出现相同的单倍型Ⅰ型,表明处于半家养状态的鲫鱼与近水域间存在基因交流。(3)核型上能明显区分的云南普通鲫鱼低背型和高背型群体,各自在线粒体DNA上存在较丰富的群体内变异,但高背型群体具独特的单倍型,故不支持关于高背型群体可能是近期内由低背型经染色体的简单多倍化而形成的推论。 | 罗静 张亚平 朱春玲 肖武汉 | 1999 | Acta Genetica Sinica1999，26，1： | 21 |
| 15 | 广东国境口岸不同蚊种COI序列分析和分子鉴定方法显示文摘〔目的〕建立国境口岸不同蚊种的细胞色素C氧化酶亚基I(COI)分子和氨基酸鉴定方法并分析其系统进化关系。〔方法〕设计1对扩增COI部分编码区的PCR引物,对广州机场、江门和湛江等国境口岸采集的致倦库蚊、三带喙库蚊、白纹伊蚊、中华按蚊、骚扰阿蚊等成蚊和实验室喂养的蚊幼虫进行PCR扩增和序列测定,分析COI核苷酸和氨基酸的系统进化关系。〔结果〕5种蚊种的COI基因扩增片断长度均为415bp,A+T含量为68.77%~70.6%。同源性比较表明,不同蚊种间COI片断碱基变异颠换数都明显高于转化数,核苷酸序列及其编码的氨基酸序列同源性分别为85.1%~93.7%和92.0%~99.3%。COI核苷酸系统进化关系显示,所有蚊虫的COI分子鉴定与其形态学结果吻合,但骚扰阿蚊位于一单独的分支上,其亲缘关系与其它蚊种最远。COI基因编码的氨基酸系统进化与蚊虫形态学亲缘关系一致,库蚊属、伊蚊属、阿蚊属聚类为库蚊亚科,中华按蚊与其它蚊种的亲缘关系最远。〔结论〕建立的COI核苷酸和氨基酸鉴别技术可成功地应用于国境口岸范围内成蚊和幼蚊的属和种的区分,后者更能区分高级分类阶元亚科和正确反映蚊虫的系统发育关系。这可以弥补蚊虫形态特征信息量的不足等传统分类系统的缺点,为广东口岸和其它国境口岸范围内外来的或新发现的蚊种的鉴别提供了分子水平的技术依据。 | 师永霞 相大鹏 李祖海 洪烨 李小波 幸芦琴 郭波旋 黄吉城 郑夔 | 2008 | 中国国境卫生检疫杂志2008，31，2： | 19 |
| 16 | 缢蛏六群体线粒体DNA-COI基因序列变异及群体遗传结构分析显示文摘利用线粒体DNA细胞色素氧化酶亚基(COI)基因序列片段对江浙闵沿海地区缢蛏三个野生群体(江苏射阳-WS、浙江象山-WX,福建霞浦-WP)和三个养殖群体(江苏射阳—CS、浙江象山-CX、福建焦城-CJ)的遗传结构进行初步分析。以特异引物进行PCR扩增,经纯化、测序、同源序列比对获得长度为556 bp的核苷酸序列,其中A+T含量为66.2%,显著高于G+C含量。在缢蛏六群体98个个体中共检测到了56个单倍型和66个核苷酸多态位点,多态位点比例为11.7%。野生群体的平均核苷酸差异数和核苷酸多样性指数略高于养殖群体,但是野生群体和养殖群体的单倍型多态性指数均大于0.9,其单倍型较为丰富。此外,六群体均有各自特有的单倍型,但只有射阳野生群体与其他群体无共享单倍型,具有鉴定该群体的特异碱基序列。遗传距离和聚类结果显示,养殖群体与象山野生群体和霞浦野生群体间亲缘关系较近。 | 牛东红 李家乐 沈和定 姜志勇 | 2008 | 海洋学报2008，30，3： | 18 |
| 17 | 海南黄牛和徐闻黄牛线粒体DNA的多态性及其品种分化关系显示文摘本文以ApaⅠ、AvaⅠ、BamHⅠ、BglⅠ、BglⅡ、DraⅠ、EcoRⅠ、EcoRⅤ、HindⅢ、HpaⅠ、PstⅠ、SalⅠ、ScaⅠ和XhoⅠ等14种限制性内切酶分析来自海南岛的海南黄牛和雷州半岛的徐闻黄牛的线粒体DNA限制性片段长度多态性(mtDNAARFLP)。结果只有一种限制性内切酶(SalⅠ)在海南黄牛中检测到多态性,并且其中的C型(15.0,1.3)尚未见报道。我们的结果还显示,两个品种6个个体的mtDNA基因单倍型全部表现为A型,即瘤牛的血统。徐闻黄牛和海南黄牛mtDNA极低的遗传变异度表明两个品种的亲缘关系很近,从而在分子生物学水平为其合称为雷琼黄牛提供了佐证。 | 聂龙 陈永久 王文 宿兵 兰宏 张亚平 杨关福 张细权 李加琪 | 1996 | Zoological Research1996，17，3： | 16 |
| 18 | 基于线粒体ND1和16SrRNA基因序列探讨中国蝴蝶12科的系统发育关系(鳞翅目:双孔次亚目:蝶类)显示文摘对中国12科共32种代表蝶类的ND1基因和16S rRNA基因进行了序列测定(包括新测30种ND1基因和9种16S rRNA基因)和比较分析,同时采用邻接法、最大似然法和贝叶斯法构建了12科蝶类的系统发育树,探讨了其高级分类群的系统发育关系。序列分析的结果显示:经比对处理后的两个基因总长度为869 bp,其中保守位点373个,可变位点496个,简约信息位点375个;A+T的平均含量为80.2%,明显高于C+G的平均含量19.8%。分子系统树表明:蛱蝶科不是单系群;珍蝶类、斑蝶类和喙蝶类位于蛱蝶科内;粉蝶科和凤蝶科具有共同祖先。据此建议:绢蝶科应归入凤蝶科;蚬蝶科归入灰蝶科;珍蝶类、斑蝶类和喙蝶类作为蛱蝶科中的亚科,眼蝶类从蛱蝶科中分离出来独立成科。另外,环蝶类的系统分类地化还有待于进一步研究。 | 邹方振 郝家胜 黄敦元 张大秀 朱国萍 朱朝东 | 2009 | 昆虫学报2009，52，2： | 16 |
| 19 | 几个绵羊品种线粒体DNA限制性片断长度多态性比较研究显示文摘用ApaⅠ等 15种识别 6碱基的限制性内切酶研究了蒙古羊、乌珠穆沁羊、湖羊和小尾寒羊线粒体DNA的RFLP。结果表明 ,在所研究的个体中共检测到 3 2个酶切位点 ,16种限制性态型 ,其中BglⅠ表现出多态 ,XhoⅠ无切点。 16种限制性态型可归结为 2种基因单倍型 ,即单倍型Ⅰ (BglⅠ A)、单倍型Ⅱ (BglⅠ B) ,单倍型Ⅰ为受试绵羊品种的基本单倍型。线粒体DNA多态度π值平均为 0 0 192 % ,表明受试绵羊品种线粒体DNA多态性比较贫乏。 | 李祥龙 田庆义 刘铮铸 孙乃权 马广星 | 2001 | 畜牧兽医学报2001，32，4： | 16 |
| 20 | 不同区域日本稻蝗Cytb基因序列及相互关系显示文摘对中国 7个不同地理区域的日本稻蝗共 19个个体的线粒体 DNA细胞色素 b基因中间部分序列进行测定 ,比较其同源性 ,计算碱基组成 ,并用中华稻蝗和景泰突颜蝗为外群构建不同单倍型的 NJ分子系统树。在获得的432 bp的序列中 ,A+T约占 70 .5 % ,其中 13个核苷酸位点存在变异 (约占 3.0 % ) ,4个位点引起了氨基酸的变异。就每个氨基酸密码子来看 ,第三位点的 A+T含量较高 ,达 87.4%。由系统树显示 ,6个单倍型共形成 3个聚类簇 。 | 任竹梅 马恩波 郭亚平 | 2002 | 山西大学学报(自然科学版)2002，25，3： | 16 |
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