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| 1 | Epigenetic regulation and epigenomic landscape in rice显示文摘Epigenetic regulation has been implicated in the control of complex agronomic traits in rice(Oryza sativa),a staple food crop and model monocot plant. Recent advances in high-throughput sequencing and the moderately complex genome of rice have made it possible to study epigenetic regulation in rice on a genome-wide scale. This review discusses recent advances in our understanding of epigenetic regulation in rice, with an emphasis on the roles of key epigenetic regulators, the epigenomic landscape, epigenetic variation, transposon repression, and plant development. | Xian Deng Xianwei Song Liya Wei Chunyan Liu Xiaofeng Cao | 2016 | National Science Review2016,3,3: | 8 |
| 2 | 基于高通量测序筛选分枝(瓜)列当甜瓜寄生体系中的转移miRNA显示文摘吸器是瓜列当从甜瓜维管束获得养分的通道,同时也是瓜列当与甜瓜进行sRNAs、病毒、糖类、蛋白质等物质交换的场所,但miRNA是否能够通过吸器在列当和寄主之间转移尚不清楚。本研究以分枝(瓜)列当甜瓜寄生体系为研究对象,分别选取寄生有瓜列当的甜瓜根系、瓜列当寄生于甜瓜的寄生部位和寄生点上方2~3 cm列当茎秆为处理,以未接种列当的甜瓜根部为对照,对4个样本进行取样及sRNA测序,共产生56 832 594条clean reads,鉴定得到216种miRNA,其中包括69个已知的保守miRNA及147个新miRNA。在被瓜列当寄生后,甜瓜中35个miRNA差异性表达,其中,17个miRNA显著下调表达,主要参与寄主的防御相关信号转导;18个miRNA显著上调表达,主要参与DCL酶的合成和诱导防御相关基因的表达。GO分析表明这些差异表达的miRNA主要参与了分子功能条目,共计5个类别;KEGG分析表明它们主要参与了16种不同的途径。利用实时荧光定量PCR验证了13个差异表达miRNA的表达趋势,其趋势与sRNA测序结果相符,表明sRNA测序结果可信。另外筛选鉴定到3个已知甜瓜miRNA转移至瓜列当,这些转移miRNA主要参与miRNA的生物合成、RNA的转运和活性氧的清除;3个新瓜列当miRNA转移至甜瓜,其功能主要参与mRNA的合成、胞吞作用和信号传导,表明miRNA在瓜列当寄生寄主时存在双向转移。本研究结果为揭示瓜列当与甜瓜互作的分子机制提供了一定理论基础,也为瓜列当的防治提供了新思路。 | 孙畅 姚兆群 曹小蕾 卞鹏轩 刘倩倩 赵思峰 | 2022 | 石河子大学学报(自然科学版)2022,40,2: | 0 |
| 3 | 超表达miR528增强盐胁迫下水稻幼苗K^(+)稳态显示文摘为了探究miR528是否参与维持盐胁迫条件下水稻(Oryza sativa)幼苗K;的稳态及其可能的调控机制,以miR528超表达株系miR528-OE1、miR528-OE2和T-DNA插入突变体mir528及其相应的野生型水稻为试验材料,研究盐胁迫条件下miR528的表达模式,分析盐胁迫条件下不同水稻材料的生长情况、地上部和根K;含量、根K;流速及K;通道基因的表达量。结果表明,水稻幼苗miR528受盐胁迫诱导表达。与无盐胁迫处理(对照)相比,miR528-OE1、miR528-OE2地上部和根鲜、干质量受盐胁迫抑制程度低于其野生型水稻中花11(ZH11),而突变体mir528的根鲜、干质量受盐胁迫抑制程度高于其野生型水稻Dongjin(DJ)。盐胁迫条件下,ZH11地上部、根K;含量分别下降至对照的43.41%、23.67%,miR528-OE1、miR528-OE2地上部、根K;含量均极显著或显著高于ZH11,而突变体mir528根K;含量显著低于DJ。瞬时盐胁迫迅速诱导根K;外排,在盐处理后3~4 min出现峰值,miR528-OE根K;外排的峰值明显低于ZH11,而突变体mir528根K;外排的峰值明显高于DJ。在正常条件下,与ZH11相比,miR528-OE1、miR528-OE2幼苗根GORK(Guard cell outward rectifying K;channel)基因表达量显著提高;与DJ相比,突变体mir528幼苗根GORK基因表达量显著降低。在盐胁迫处理1 h时,miR528-OE1、miR528-OE2幼苗根GORK基因表达量分别显著、极显著下降;而与DJ相比,突变体mir528幼苗根GORK基因表达量显著增加。综上,超表达miR528能提高水稻的耐盐性,提高盐胁迫条件下水稻对K;的保留能力,这可能是通过下调GORK基因的表达量来实现的。 | 雷振山 王童童 季新 张天海 王付娟 董丽平 赵亚帆 刘娟 | 2022 | 河南农业科学2022,51,4: | 0 |