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1食线虫真菌基因组测序和分析研究进展显示文摘食线虫真菌作为线虫的天敌,是一种潜在的线虫病害的生防制剂。食线虫真菌通过形成特殊的捕食器官或产生粘性孢子和毒素等方式捕捉和侵染线虫。近年来,随着测序技术的进步和生物信息学的应用,越来越多真菌基因组已经被测定和报道。目前,已经有7种食线虫真菌的基因组被报道,包括捕食线虫真菌寡孢节丛孢(Arthrobotrys oligospora)、线虫卵寄生真菌厚垣普可尼亚菌(Pochonia chlamydosporia)和内寄生真菌明尼苏达被毛孢(Hirsutella minnesotensis)等。本文对食线虫真菌的基因组特点、毒力相关基因家族的扩张、捕食器官形成调控和进化机制进行了系统地总结,对组学时代食线虫真菌研究面临的关键问题进行了评述。马妮 杨雪伟 甄政毅 郑雅情 杨乐 李青 张克勤 杨金奎 2018微生物学通报2018,45,4:2
2Duddingtonia flagrans几丁质酶CTS3/CTS4的分子特征及亲缘关系显示文摘【目的】探究捕食线虫性真菌Duddingtonia flagrans几丁质酶的生物学特性与亲缘关系。【方法】对捕食线虫性真菌D.flagrans几丁质酶CTS3和CTS4基因进行克隆和测序,并对其编码蛋白的信号肽、亲/疏水性、催化结构域、保守序列、二级与三级结构等分子特征进行预测以及其他真菌几丁质酶的亲缘关系进行分析。【结果】几丁质酶CTS3和CTS4含有几丁质酶催化结构域的2个高度保守序列(SIGG和DGFDLDXE)及1个典型的(α/β)8桶状结构域,属于糖苷水解酶18家族(GH18)。CTS3和CTS4几丁质酶均为分泌型蛋白,在N端的第1~25和1~18个氨基酸分别为其信号肽序列,C端均含有糖苷水解酶18家族结构域。分子结构分析表明,几丁质酶CTS3和CTS4三级结构具有(α/β)8的TIM桶形结构,中心部分为平行的β⁃折叠组成的内桶,外桶由α1~α8组成;底物结合区域位于保守序列β3和β4链形成的环状裂隙。亲缘关系分析表明,CTS3和CTS4与昆虫致病真菌几丁质酶同源性较高,它们聚为一支,推测在侵染宿主的过程中具有相似的生物学功能。【结论】2个几丁质酶基因分子特征与亲缘关系的阐明,为研发新型家畜消化道线虫病生防制剂奠定了基础。韩雨璇 张亚萍 李柠杏 张嘉华 李能秀 焦健 才学鹏 乔军 孟庆玲 2023西南农业学报2023,36,11:0
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