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1核转录因子NFYB和NFYC促进红系终末分化显示文摘目的利用单细胞转录组数据分析挖掘红系终末分化的潜在转录因子,并重点对预测得到的核转录因子NFYB和NFYC在红系终末分化中的表达和功能进行探究。方法使用人骨髓红系终末分化单细胞转录组数据,结合SCENIC分析预测分化阶段特异性转录调控因子。利用公共测序数据集重点分析预测出的NFYB和NFYC在人与小鼠红系终末分化不同阶段中的表达;荧光激活细胞分选技术(FACS)分选小鼠胎肝体外红系终末分化各阶段的细胞,检测Nfyb和Nfyc的表达水平。在小鼠胎肝红系分化体系中使用慢病毒感染,分别敲低Nfyb和Nfyc,检测红系终末分化及脱核的变化。结果通过SCENIC分析预测出NFYB和NFYC是红系终末分化早期的调控因子,在人与小鼠的红系终末分化早期表达较高,晚期则降低。在小鼠胎肝体外红系分化体系中分别敲低Nfyb和Nfyc,均可显著抑制红系终末分化(P<0.05)及脱核(P<0.05)。结论NFYB和NFYC促进红系终末分化过程。余东林 杨希 阴佳滢 刘雪会 吕湘 2022基础医学与临床2022,42,6:0
2血液系统疾病生物样本库的建立显示文摘目的 探讨建立设施完备、信息互通的规范化血液系统疾病样本采集、存储、管理、服务体系,实现全方位血液系统活细胞及相关血液成分的规范化保藏,为临床研究及转化应用提供资源保障。方法 血液系统疾病生物样本库集收集处理、质量控制、基因分析、功能鉴定于一体,另设有独立的存储区,具有与临床诊疗数据、组学信息联通的一体化信息管理系统,以保藏血液系统疾病骨髓活细胞为特色,建立规范化样本接收、处理、存储及使用流程,定期进行质控检测,完善共享机制及运营模式。结果 血液样本资源库已保藏血液系统活细胞等各类样本共计超40万份,实现全部临床诊疗科室与疾病类型的样本全覆盖,并建立疾病来源i PSC七百余株。随机抽取新鲜和冻存样本6例,质量检测全部合格,为所院高质量科研产出提供样本支持。结论 通过全流程管控实现血液病理活细胞及相关组分的规范化收集、制备、存储和使用,建成以整合生物样本、临床诊疗数据、生物信息学等生物医学信息与资源为一体的“干湿”结合升级版生物样本库。韩星星 马艺戈 梁昭 李玥 夏爽 李磊 祁仕林 李长虹 郑学通 宋振 程涛 马士卉 2023实用器官移植电子杂志2023,11,5:0
3单细胞测序在造血系统研究中的应用与展望显示文摘目的单细胞测序(single cell sequencing,SCS)是一项在细胞个体层面进行精准化分析的技术。它提供了全新的角度去识别单个细胞的种类、功能、状态,以及与其他细胞的相互关联,极大深化了人们对细胞异质性、基因与分子功能多样性等方面的理解。随着各个技术环节的不断优化,SCS技术已广泛应用于多个研究领域,其中造血系统研究便是该技术运用的范例。SCS不仅在基础研究中,协助完成了生理和病理生理条件下的相关造血细胞图谱的构建,探索了血细胞发育分化的可能路径,而且在临床诊治过程中,有效推动疾病发生、进展和转归等机制的破解,促进个体疗效差异显著、易于复发等现象的潜在因素的挖掘。现就SCS的技术概况、发展趋势及其在造血系统的应用进行评述,以期为后续SCS技术的积极与合理应用提供参考。王军平 陈乃成 2021第三军医大学学报2021,43,17:0
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