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1人白细胞分化抗原19蛋白结构与功能的生物信息学分析显示文摘目的运用生物信息学方法对人白细胞分化抗原19(B-lymphocyte antigen CD19,以下简称CD19)蛋白的理化性质、空间结构、蛋白质的修饰位点以及相互作用网络进行分析。方法从蛋白质数据库(Universal Protein, UniProt)获取人CD19蛋白的序列信息,并运用ExPASy、SignalP 5.0 Server、TMHMMServer v.2.0、SOPMA、SWISS-MODEL、UniProt数据库、STRING、Pymol等对人CD19蛋白进行全面、系统的分析。结果软件预测及已经解析的结构显示,人CD19蛋白由信号肽、胞外域、跨膜域及胞内域组成,其胞外域结构主要由β折叠片组成,跨膜域由一段α螺旋组成,已报道的磷酸化位点有6个,N糖基化位点有5个。与人CD19蛋白形成蛋白网络的蛋白有10个,分别是CD79A、CR2、LYN、CD79B、CD81、SYK、VAV1、BTK、BCL6和IGLL5。人CD19蛋白参与的信号通路有B细胞受体信号通路、Fc epsilon RI信号通路等,此外,还参与原发性免疫缺陷以及EB病毒感染等。结论经过软件分析及结构预测分析,阐述了人CD19蛋白的结构与功能的关系,为免疫治疗药物的开发提供参考依据。俞小娟 张峰 于传飞 武刚 段茂芹 杨雅岚 崔永霏 郭璐韵 王兰 2021微生物学免疫学进展2021,49,5:1
2生物信息学方法预测新型冠状病毒Omicron变异株抗原表位显示文摘目的 通过生物信息学方法预测新型冠状病毒Omicron变异株的抗原表位,为病毒抗原表位多肽疫苗的设计开发提供依据。方法 以新冠病毒Omicron变异株(GenBank:OM095411.1)为研究对象,利用生物信息学服务器和免疫学工具预测新冠病毒S、M、N、E蛋白的杀伤性T细胞表位、辅助性T细胞表位和线性B细胞表位。同时,基于免疫表位数据库(IEDB)、抗原性预测(Vaxigen)、致敏性预测(AllerTOP)等表位生物学性质分析数据库对候选表位进行生物学性质分析。结果 筛选得到具有抗原性、无毒性或致敏性的杀伤性T细胞表位38个、辅助性T细胞表位15个和线性B细胞表位6个,主要位于S蛋白和M蛋白。结论 抗原表位的预测筛选方法可行,研究筛选出的候选表位,可为开发针对新冠病毒Omicron变异株多肽疫苗提供借鉴。孙琦 何为 马玥 李渊源 黄转青 杨森 杨飞 张莹 徐风华 2022军事医学2022,46,12:0
3SARS-CoV-2 E蛋白表达及其多克隆抗体的制备显示文摘目的制备新型冠状病毒E蛋白和抗E蛋白多克隆抗体。方法原核质粒pMAT9s-2019-nCoV-E经鉴定验证正确后,转化BL21感受态细胞,IPTG诱导表达目的蛋白,经尿素梯度复性、Ni柱层析获得纯化的重组E蛋白,免疫兔获抗E多克隆抗体。真核重组质粒pcDNA3.1(+)-2019-nCoV-E经鉴定后提取质粒,免疫家兔获抗E多克隆抗体,通过Western blot和间接ELISA测定多克隆抗体特异性及效价。结果原核、真核重组质粒鉴定正确,重组E蛋白以包涵体形式表达分子质量单位约为53 ku;ELISA法测定抗E多克隆抗体效价分别达1∶16000和1∶12800。Western blot显示,重组E蛋白能被抗SARS-CoV-2 E多克隆抗体识别。结论获得重组E蛋白及兔源抗SARS-CoV-2 E多克隆抗体,可为新冠病毒感染的血清抗体筛查、抗原蛋白检测,以及药物靶点研究、E蛋白生物学特性研究和新冠快速检测试剂的研发提供支持。杜昆朋 陈柯 闫硕 高岩 徐海山 郑皖怿 李猛 付玉荣 伊正君 2021中国病原生物学杂志2021,16,12:0
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