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| 1 | 基于分子网络的广西壮族自治区HIV传播热点和跨地区传播特征分析显示文摘目的基于分子网络分析广西壮族自治区(广西)HIV传播热点和跨地区传播特征,为优化艾滋病精准防控策略提供证据。方法整合1997-2020年采集的5996条广西HIVpol区序列和165534条公开发表的非广西HIVpol区序列,使用HIV-TRACE工具以0.5%成对基因距离阈值构建分子网络。结果进入广西HIV传播热点分子网络的序列比例为31.5%(1886/5996)。在HIV跨地区传播分子网络中,省内连接占51.6%(2613/5062),国内连接占48.0%(2430/5062),国际连接占0.4%(19/5062)。与广西跨地区连接的主要地区为广东省(49.5%,1212/2449)、北京市(17.5%,430/2449)、上海市(6.9%,168/2449)、四川省(5.7%,140/2449)、云南省(4.2%,102/2449)、陕西省(3.8%,93/2449)、浙江省(2.8%,69/2449)、海南省(2.0%,49/2449)、安徽省(1.5%,37/2449)和江苏省(1.3%,33/2449),其余地区与广西跨地区连接比例均<1.0%。进入广西HIV传播热点分子网络风险较高的影响因素包括≥50岁(相比于25~49岁,aOR=1.68,95%CI:1.46~1.95)、男性(相比于女性,aOR=1.21,95%CI:1.05~1.40)、未婚(相比于已婚,aOR=1.18,95%CI:1.00~1.39)、高中及以上文化程度(相比于初中及以下,aOR=1.21,95%CI:1.04~1.42)和男男性传播(相比于异性性传播,aOR=1.77,95%CI:1.48~2.12)。跨地区连接风险较高的影响因素包括男性(相比于女性:aOR=1.74,95%CI:1.13~2.75),高中及以上文化程度(相比于初中及以下,aOR=1.96,95%CI:1.43~2.69)、自由职业/待业/退休(相比于农民,aOR=1.50,95%CI:1.07~2.11)、男男性传播(相比于异性性传播,aOR=3.28,95%CI:2.30~4.72)。结论广西存在HIV传播热点,广西与国内地区组成复杂的跨地区传播网络。后续研究应针对分子网络分析推断的高风险人群开展社会网络调查,及时识别隐匿传播链,减少HIV二代传播。 | 江河 唐凯玲 黄精华 李剑军 梁淑家 刘玄华 庞贤武 朱秋映 陈欢欢 周月姣 蓝光华 | 2022 | 中华流行病学杂志2022，43，9： | 5 |
| 2 | 四川省某县级市HIV高危传播者危险因素研究显示文摘目的了解四川省某县级市新诊断的感染者分子传播网络特征,分析相关传播危险因素,为精准预防提供科学依据。方法采用序贯纳入原则纳入某县级市2019年3月至2021年8月的新诊断HIV感染者。采用巢式PCR扩增法对HIV-1 pol基因区进行扩增,通过比较序列、构建系统发育树和计算成对距离,最终构建分子传播网络。高危传播者的相关影响因素分析采用χ2检验或者Fisher确切概率法,多因素分析采用Logistic回归。结果共获得有效序列461份,检测出6种毒株亚型,分别为CRF01_AE(51.41%)、CRF07_BC(34.06%)、B(9.76%)、CRF08_BC(3.25%)、CRF55_01B(1.08%)和C(0.43%)。基因距离在0.009时的成簇数最高,245条序列入网,形成54个传播簇,入网率为53.15%。多因素分析显示:≥50岁比18~49岁成为高危传播者的概率高(OR=2.042,P=0.026);职业中其他/不详(OR=0.360,P=0.014)低于农民,CRF07_BC亚型(OR=0.170,P<0.01)、CRF08_BC(OR=0.068,P=0.011)低于CRF01_AE亚型,B亚型(OR=4.131,P=0.001)高于CRF01_AE亚型。结论调查地区HIV感染来源多元化,应重点加强B亚型、≥50岁老年人群以及农民的长期与动态监测,采取有效干预,防止感染。 | 钟霞 袁丹 伍霞 李娜 肖洁 李苑 李一平 何佳 聂颖 湛江 杨义 梁姝 | 2022 | 中国艾滋病性病2022，28，6： | 1 |
| 3 | 2012—2020年宁夏HIV-1感染者分子传播网络特征分析显示文摘目的分析宁夏HIV-1感染者分子网络特征及传播网络的影响因素,为制定有效干预措施提供科学依据。方法收集442份2012—2020年新报告的HIV-1感染者血清样本,通过巢式PCR扩增HIV-1pol区基因序列,根据pol基因序列进行病毒亚型分析,基于最适基因距离构建分子网络,分析分子传播网络特征及其影响因素。结果共获得398条HIV-1pol区基因序列,发现6种HIV-1基因型,以CRF07_BC和CRF01_AE亚型为主,分别占60.05%和25.88%。CRF07_BC、CRF01_AE和CRF55_01B逐年发现数量呈上升趋势(P<0.05)。有247条序列进入分子网络,入网率为62.06%(247/398),共形成50个传播簇,簇内节点数为2~152个,其中有一个大簇,节点数为152个(61.54%,152/247)。入网率最高是CRF07_BC亚型(73.22%),其次是CRF55_01B(72.73%),测序时是否耐药和CD4^(+)T淋巴细胞计数是入网率影响因素(P<0.05)。结论宁夏HIV-1基因亚型多样,以CRF07-BC为主要优势毒株,并随着时间有增长趋势。分子网络呈聚集性分布,CD4^(+)T淋巴细胞计数<200/mm^(3)和测序时耐药的感染者更易进入网络,成为高风险传播者,应持续开展针对有效的干预措施,以降低HIV的新发感染。 | 宋玲 杨东智 曹慜 赵立华 李海军 | 2022 | 宁夏医学杂志2022，44，6： | 1 |
| 4 | 四川省彭州市50岁及以上人群HIV-1分子传播网络特征分析显示文摘目的:分析HIV-1感染者分子传播网络特征及其传播的相关危险因素,为HIV-1精准预防提供依据。方法:对2019年4月至2021年8月四川省彭州市新报告≥50岁HIV感染者的340份血样,采用巢式PCR扩增法对pol基因区进行扩增、清理、拼接剪辑,多序列对比构建系统进化树区分亚型,计算成对基因距离,在基因距离阈值为0.90%时成簇数最多(41个),构建分子传播网络。分析HIV分子传播网络特征及入网危险因素,进行χ2检验及logistic回归分析。采用SPSS 19.0软件进行统计学分析。结果:340份样本中,扩增成功330份(97.06%,330/340)。确定6种HIV-1亚型,包括CRF01_AE(56.67%,187/330)、CRF07_BC(27.88%,92/330)、B(11.21%,37/330)、CRF08_BC(3.33%,11/330)、CRF55_01B(0.61%,2/330)和C(0.30%,1/330)。入网率为58.79%(194/330),研究对象HIV-1分子传播网络的入网危险因素logistic回归分析结果显示,相比于文盲,初中(OR=0.35,95%CI:0.13~0.97)与高中/中专文化程度(OR=0.14,95%CI:0.02~0.97)的入网可能性较低;相比于农民,职业不详(OR=0.40,95%CI:0.17~0.95)的入网可能性较低;相比于CRF01_AE亚型,CRF07_BC(OR=0.20,95%CI:0.11~0.35)和CRF08_BC亚型(OR=0.09,95%CI:0.02~0.45)的入网可能性较低。结论:四川省彭州市农村地区中老年群体中艾滋病传播来源多元化,艾滋病干预工作应重点定位于低文化程度的中老年农民,同时加强检测与溯源调查。 | 钟霞 袁丹 刘杨 伍霞 李娜 李一平 何佳 廖瑞平 杨义 梁姝 | 2022 | 中华流行病学杂志2022，43，7： | 1 |
| 5 | Advances in research of HIV transmission networks显示文摘Transmission network analysis is a crucial evaluation tool aiming to explore the characteristics of the human immunodeficiency virus epidemic,develop evidence-based prevention strategies,and contribute to various areas of human immunodeficiency virus/acquired immunodeficiency syndrome prevention and control.Over recent decades,transmission networks have made tremendous strides in terms of modes,methods,applications,and various other aspects.Transmission network methods,including social,sexual,and molecular transmission networks,have played a pivotal role.Each transmission network research method has its advantages,as well as its limitations.In this study,we established a systematic review of these aforementioned transmission networks with respect to their definitions,applications,limitations,recent progress,and synthetic applications. | Zhi-Long Dong George Fu Gao Fan Lyu | 2020 | Chinese Medical Journal2020，，23： | 1 |
| 6 | 深圳市男男性行为人群艾滋病病毒主要流行亚型的分子网络特征分析显示文摘目的了解深圳市艾滋病病毒(HIV)感染者中男男性行为人群(men who have sex with men,MSM)三种主要亚型分子网络特征,为控制MSM HIV的传播提供线索。方法收集深圳市2017至2019年新报告MSM HIV感染者资料和血样,使用在线工具和Mega分析亚型、HyPhy计算成对基因距离、Cytoscape实现分子网络可视化及SPSS进行统计分析。结果获得2848名MSM HIV感染者pol区基因序列,分为11种亚型,其中CRF07_BC、CRF01_AE、CRF55_01B占91.22%。三种亚型总入网率为32.32%,形成194个簇和1291条边。入网的MSM HIV感染者主要集中在35岁以下、汉族、未婚、外省或外籍、商业服务、无性病史、201~500个/μL CD4^(+)T细胞,CRF01_AE感染者主要集中在高中或中专、CRF07_BC感染者主要集中在大专及以上、CRF55_01B感染者主要集中在初中及以下。CRF01_AE感染者中,201~500个/μL CD4^(+)T细胞的入网率最高;CRF07_BC感染者易发生大簇聚集;CRF55_01B感染者中,初中及小学学历的入网率最高。结论CRF01_AE感染者中,201~500个/μL CD4^(+)T细胞数传播风险最高,CRF07_BC大簇中感染者传播风险较高,CRF55_01B感染者中,初中及小学的传播风险最高。 | 黄元妹 袁苑 郑陈丽 李浩 朱悦 李思美 张燕 谭唯 赵锦 | 2022 | 实用医学杂志2022，38，21： | 1 |
| 7 | HIV传播簇的风险测量及公共卫生应对研究进展显示文摘开展HIV传播簇探测,及时、精准实施公共卫生应对和干预,是结束艾滋病流行的重要途径和方法。传播簇风险测量指标可分为基于传播簇既往增长的指标、基于传播簇成员特征分析的指标以及基于传播簇系统进化分析的指标三类。依据传播簇风险测量指标识别风险传播簇,将卫生服务拓展至与传播簇关联的尚未感染HIV者、既往确诊和尚未确诊的HIV感染者,可实现精准干预。本文对现有的HIV分子传播簇风险测量指标及其公共卫生应对措施进行综述,为我国艾滋病精准防控提供参考。 | 颜欢畅 刘裕 唐时幸 顾菁 郝元涛 | 2023 | 中华流行病学杂志2023，44，4： | 0 |
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