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| 1 | 福建省首株基孔肯雅病毒株的分离、鉴定及全基因特征分析显示文摘为获得基孔肯雅病毒(Chikungunya virus,CHIKV)毒株并了解其分子生物学特征,本研究通过将2018年6月从菲律宾输入的基孔肯雅热(Chikungunya fever,CHIKF)病例发病1d的血清标本接种C6/36细胞进行病毒分离,并成功分离到福建省首株CHIKV毒株FJCHIKV1801。利用高通量测序方法对该毒株进行测序,成功获得完整的基因序列,全长12139 bp。通过E1、E2结构蛋白重要氨基酸位点分析发现所获毒株E1蛋白氨基酸出现了可能增强埃及伊蚊的适应性突变K211E。最大似然法系统进化树分析结果显示毒株FJCHIKV1801的基因型属于亚洲基因型;其进化关系与2014年菲律宾分离的毒株Philippines 2014(MF773563)最为接近,提示毒株可能来源于菲律宾,这与该毒株源病例来源于菲律宾的流行病学调查结果相一致。本研究所建立的CHIKV病毒分离、基因测序和分析的方法可用于追溯可能的传染来源及监测病毒氨基酸变异情况,为CHIKF突发疫情处置提供技术支持。 | 俞婷婷 林琦 阚乃鹏 游丽斌 翁育伟 王金章 | 2022 | 病毒学报2022，38，6： | 2 |
| 2 | 天津市输入性基孔肯亚病毒全基因组序列分析显示文摘目的分析天津市1例输入性基孔肯亚病毒(CHIKV)的全基因组序列特征与进化,为CHIKV的监测与防控提供科学依据。方法收集2019年11月4日于天津市第二人民医院采集的血清标本200μl提取核酸,设计叠瓦式引物扩增CHIKV基因组全长,然后利用Illumina Miniseq平台进行高通量测序。结果本研究的CHIKV属于ECSA基因型印度洋分支,与大部分中国分离株一致,相似性为92.72%~99.86%,在国际上与巴基斯坦分离株亲缘关系最近(99.74%)。天津CHIKV在关键位点E1-D284E和E2-I211T处有两处突变,与ECSA基因型一致。此外,天津CHIKV还具备两个关键毒力位点E2-12T和E2-82G,以及nsP3-R524Opal终止子突变。结论天津CHIKV具备较强毒力,且具备在白纹伊蚊中传播的能力,提示应继续加强对CHIKV的监测。 | 谭昭麟 吕莉琨 谢彤 李力 吕杰 李晓燕 | 2022 | 中华检验医学杂志2022，45，2： | 0 |
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