|
|
|
题名
|
作者
|
年代
|
出处
|
被引量
|
| 1 | 从生物信息与网络药理角度认识姜黄素治疗膝骨关节炎的分子机制显示文摘背景:姜黄素是由中药姜黄中提取的一种植物多酚,可用于治疗膝骨关节炎,但具体机制尚不清楚。目的:基于生物信息学和网络药理学初步分析姜黄素治疗膝骨关节炎的分子机制,为膝骨关节炎的治疗提供新的研究方向。方法:通过中药系统药理学数据库及分析平台(TCMSP)数据库、蛋白质-化合物作用网(STITCH)数据库、Drugbank数据库、SEA数据库、SwissTargetPrediction数据库、药物靶标的蛋白质数据库(Binding DB)预测姜黄素的相关作用靶点,再结合基因表达数据库(GEO)公共数据库中关于姜黄素的相关芯片,使用GEO2R在线分析工具分析得到差异基因;同时检索治疗靶点数据库(TTD)、人类孟德尔遗传病(OMIM)数据库、DisGeNET数据库、Drugbank数据库和GeneCards数据库获得膝骨关节炎相关疾病靶点,明确姜黄素治疗膝骨关节炎的作用靶点,通过设置degree值得到关键靶点。利用STRING数据库构建药物-疾病共同靶点的蛋白质-蛋白质相互作用关系;并利用R语言对药物-疾病共同靶点进行GO分析和KEGG通路分析;利用IGEMDOCK软件对关键靶点进行分子对接。结果与结论:①通过检索上述药物数据库共获得姜黄素相关靶点339个;检索GEO数据库确定姜黄素相关序列号为GSE10896的芯片,筛选出397个差异基因;②检索上述疾病数据库共获得膝骨关节炎相关疾病靶点1903个,其中典型靶点有AKT1、NFKB1、RELA和IKBKB等;③利用STRING数据库构建129个共同靶点的蛋白质-蛋白质相互作用关系网络图;④GO分析功能富集显示,姜黄素治疗膝骨关节炎的生物学进程主要涵盖DNA结合转录因子、DNA结合转录激活剂活性、RNA聚合酶Ⅱ特异性、内肽酶活性、蛋白质丝氨酸/苏氨酸激酶活性、核受体活性、配体激活的转录因子活性、金属肽酶活性和磷酸酶结合等,信号通路主要表现为PI3K-Akt、MAPK、白细胞介素17、肿瘤坏死因子和缺氧诱导因子1信号通路;⑤分子对接结果显示关键靶点胰岛素样生长因子1受体、雌激素受体、EGFR、CYP19A1与靶蛋白有良好的亲和力;⑥结果证实,姜黄素治疗膝骨关节炎的机制涉及MAPK3、EGFR、雌激素受体1、MDM2、CYP19A1、MAPK14、雌激素受体和胰岛素样生长因子1受体共计8个关键靶点,还涉及PI3K-Akt、MAPK、白细胞介素17、肿瘤坏死因子和缺氧诱导因子1等主要信号通路,各靶点与各通路之间产生的交叉作用,可能会抑制炎症反应和软骨细胞凋亡,从而治疗膝骨关节炎。 | 邹昆 郭万首 邓雅文 张启栋 刘沛 王卫国 | 2021 | 中国组织工程研究2021，25，32： | 7 |
| 2 | Chinese herbal formulae defend against Mycoplasma gallisepticum infection显示文摘Mycoplasma gallisepticum HS strain(MG-HS)is a pathogen that causes chronic respiratory disease(CRD)in chicken,which is characterized by host respiratory inflammatory damage,brings huge economic losses to the poultry industry.Recently,emerging Chinese herbal medicines(CHM)have been used to treat CRD.This study was aimed to investigate the preventive and therapeutic effects and their potential mechanisms of Chinese herbal medicinal formulae(CHMF),which consisted of 10 kinds of Chinese herbal medicine including Scutellaria,Houttuynia cordate and licorice,on MGinduced CRD in chickens.With respect to the preventive effect,the results showed that CHMF could effectively recover the MG-induced decrease on body weight and feed conversion ratio.Histopathological analysis showed that both prevention and treatment of CHMF could significantly alleviate the severe respiratory inflammation induced by MG infection.Moreover,compared with the MG infection group,both the prevention groups and the treatment groups of CHMF could effectively reduce the expression of MG adhesion protein(p MGA1.2)to inhibit the proliferation of MG,and thus effectively inhibit the expression of MG-induced inflammatory factors interleukin-1β(IL-1β)and tumour necrosis factor-α(TNF-α).In summary,these findings confirm that CHMF can protect chickens from various tissue damage caused by MG infection and has no adverse effects on the performance of chickens in the short term.And its efficacy against MG is equal to or better than that of tiamulin. | WANG Ying-jie LIANG Ya-xi HU Fu-li SUN Ying-fei ZOU Meng-yun LUO Rong-long PENG Xiu-li | 2022 | Journal of Integrative Agriculture2022，21，10： | 1 |
| 3 | 药物发现过程中人工智能的应用研究进展显示文摘人工智能(AI)和机器学习不仅使药物发现和开发实现了质的飞跃,而且帮助药物开发进程进入现代化。机器学习和深度学习算法已应用于药物发现各个阶段,如先导化合物的筛选、多肽合成及小分子药物的发现、最佳给药剂量的确定、类药化合物的设计和药物不良反应的预测、蛋白质间相互作用的预测、虚拟筛选效率的提高、定量构效关系(QSAR)建模和药物重新定位、理化性质和药物靶标亲和力的预测、化合物的结合预测和体内安全性分析、多靶点配体药物分子的设计以及临床试验的设计。简要综述了AI算法和传统化学相结合以提高药物发现的效率以及AI在药物发现过程中的应用研究进展,以期为AI应用于药物发现提供一定参考。 | 李双星 李一昊 林志 张頔 杨艳伟 屈哲 李言川 霍桂桃 吕建军 | 2023 | 药物评价研究2023，46，9： | 0 |
| 4 | 基于网络药理学和分子对接探究姜黄素治疗糖尿病视网膜病变的药效机制显示文摘目的应用网络药理学及分子对接的相关理论方法探究姜黄素治疗糖尿病视网膜病变(DR)的作用机制。方法利用SEA及SwissTargetPrediction数据库在线预测化合物作用的靶点;通过CTD数据库提供与疾病相关的各种靶点;运用Venny数据库映射匹配不同基因,并取二者交集;采用GeneMANIA数据库构造出交集基因的蛋白互作网络图,采用Cystoscape软件进行更精确的分析和可视化,借助WebGestalt数据库进行富集分析,最后利用AutoDock Vina对核心靶点进行分子对接。结果得到姜黄素作用靶点52个,DR对应的靶点1599个,共同作用的靶点48个。核心靶点为丝氨酸/苏氨酸-蛋白激酶1(AKT1)、肿瘤坏死因子α(TNF-α)、表皮生长因子受体(EGFR)、信号转导及转录激活因子3(STAT3)以及热休克蛋白90α家族A类成员1(HSP90AA1)。富集分析结果显示,这些靶点主要与EGFR酪氨酸激酶抑制剂耐药性信号通路、缺氧诱导因子1(HIF-1)信号通路、白细胞介素-17(IL-17)信号通路以及晚期糖基化终末产物-晚期糖基化终末产物受体(AGE-RAGE)信号通路等有关。结论姜黄素可能通过调控多条信号通路来抑制炎症反应和对抗氧化应激等过程,从而发挥治疗DR的作用。 | 杜媛媛 王熠昀 赵蓉 张积 季晓燕 陆佳羽 嵇芳芳 娄慧 江自远 黄江 | 2023 | 中华实验眼科杂志2023，41，12： | 0 |
您所在的机构暂未开通此部分的功能，请联系管理员