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| 1 | 核桃JrCOR413基因家族鉴定与表达分析显示文摘为解析核桃COR413基因家族在响应冷胁迫中的作用,本研究利用生物信息学技术在核桃全基因组筛选并鉴定COR413家族基因,对该家族成员进行结构和表达分析。结果表明,核桃COR413基因家族包含6个基因,编码7条蛋白,分布在4条染色体上,开放阅读框为549~804 bp,翻译蛋白范围为182~267个氨基酸,等电点为8.15~9.93,全部为碱性稳定蛋白;含有典型的WCOR413高度保守的结构域。聚类分析发现,该类基因可与拟南芥高度同源,并分为2个亚组。在低温胁迫48 h后经转录表达分析,JrCOR5在2个核桃品种中显著升高,并且在花器官和嫩茎转录表达较高;结合qPCR分析,JrCOR5在冷胁迫48 h显著升高,达到90倍以上。因此,推测JrCOR5可能在核桃响应冷胁迫过程中起到重要作用。本研究结果将为解析核桃JrCOR413基因家族成员在响应冷胁迫过程中的分子机制研究奠定基础。 | 刘凯 李瑶玲 李洋 王红霞 赵书岗 安秀红 张志华 | 2022 | 河北农业大学学报2022，45，2： | 2 |
| 2 | 基于GEO数据库分析低温胁迫下拟南芥关键差异基因显示文摘为了筛选低温胁迫下拟南芥关键差异基因,通过检索GEO数据库中关于拟南芥耐低温性的相关芯片,利用GEO2R进行差异基因的筛选,在DAVID数据库中对差异表达基因进行GO功能分析和KEGG通路富集分析,利用STRING数据库构建差异基因蛋白质-蛋白质相互作用关系(PPI)网络。结果表明:确定芯片GSE3326中的GSM74894、GSM74895、GSM74900和GSM74901等4个样本为研究对象,共筛选出970个差异基因,其中486个上调基因,484个下调基因;通过DAVID在线功能富集分析,共得到生物过程31个条目、细胞组成11个条目、分子功能31个条目和KEGG富集通路共7个条目;发现COR15B、COR47、RHL41、CBF2、LTI30、DREB2A、AT4G36010、AT1G16850、AT1G51090、GolS3等10各关键差异基因。 | 贾祥 苗彦军 包赛很那 | 2020 | 高原农业2020，4，6： | 0 |
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