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| 1 | 基于不结球白菜转录组EST-SSR标记开发及多态性分析显示文摘由转录组测序信息获得的EST-SSR标记具有通用性好、保守性高、多态性丰富、共显性遗传等优点,广泛应用于植物种质资源的遗传多样性分析。本研究通过对不结球白菜(Brassica rapa ssp.chinensis)转录组高通量测序,挖掘SSR位点和开发EST-SSR标记,并进行引物的初步验证及其多态性分析。在不结球白菜转录组的48817条Unigene序列中共搜寻到17009个SSR位点,发生频率为18.44%,SSR分布频率为34.84%。不结球白菜SSR位点共包括212种重复基元。其中,单、二和三核苷酸重复为不结球白菜转录组SSR的主要类型,占SSR总量的98.31%。单核苷酸重复最多,占总量的39.70%,其优势重复单元为T/A(26.83%)。利用Primer Premier 3.0设计EST-SSR引物,在批量设计的引物中随机挑选40对进行合成并初步验证,25对引物在92份不结球白菜种质资源中均能扩增出预期大小的条带。其平均等位基因数3.72个,有效等位基因数(effective number of alleles,Ne)、Shannon’s指数(Shannon’s index,I)、多态性信息指数(polymorphism information content,PIC)和基因多样性(gene diversity,GD)分别为2.7108、0.9991、0.4884和0.5452。所获得的EST-SSR引物可为不结球白菜及芸薹属其他植物的遗传结构分析、种质资源利用及遗传图谱构建提供有效的分子标记。 | 杨丹青 何晓丽 杜志杰 王树彬 孙笠维 林义章 邵贵荣 钟凤林 | 2020 | 农业生物技术学报2020，28，1： | 8 |
| 2 | 基于KASP标记的贵州禾群体遗传多样性与结构分析显示文摘贵州禾是贵州省特有的一种原生态水稻(Oryza sativa L.),目前对其历史形成过程尚不清楚。因此,本研究选择了121份贵州禾资源和其他地区194份水稻品种,利用120个KASP标记对其遗传多样性和群体结构进行了研究。遗传多样性研究结果表明,贵州禾遗传多样性较为丰富,具有较多的多态性位点数和观测等位基因数。遗传距离结果表明贵州禾与贵州地方粳稻遗传距离最小为0.0197,遗传一致度最高为0.9805;贵州禾与江苏地方粳稻遗传距离和遗传一致度分别为0.0276,0.9727次之。群体结构分析表明当K=3时,90%的贵州禾群体单独聚为一类,而且绝大多数属于粳稻,主要与江苏地方粳稻和贵州地方粳稻聚为一大类。本研究表明贵州禾区别于其他地方粳稻,具有独特的遗传结构,与贵州及江苏地方粳稻的亲缘关系更为密切。本研究结果对了解贵州禾的群体结构及与其他地区水稻品种的亲缘关系,以及探讨贵州禾起源提供一定的理论指导。 | 吴娴 徐海峰 张志斌 王倩 宫彦龙 张习春 龙思芳 罗秦欢 宋莉 王忠妮 朱速松 | 2021 | 分子植物育种2021，19，4： | 6 |
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