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| 1 | 有害藻华的宏条形码分析:机会与挑战显示文摘宏条形码分析(metabarcoding analysis)是通过对野外样本的分子标记(即条形码)进行PCR扩增、测序,并利用测序结果分析野外样本物种组成、物种相对丰度,及其时空动态变化。这项在近20年里逐步发展起来的分子技术,得益于DNA测序技术的快速发展,包括测序通量的提升和测序成本的降低,以及生物信息学分析方法的快速开发。基于可操作分类单元(operational taxonomic units,OTUs)分析方法,特别是最近的扩增子序列变异(amplicon sequence variants,ASVs)方法的开发,极大促进了宏条形码分析的应用。在世界及我国的海洋生态领域,宏条形码分析的应用还处于起步阶段。随着分析方法的日趋成熟,可适用于不同应用领域的分子标记不断增加,以及参考数据库的不断完善,宏条形码分析将释放出广阔的应用潜力。可以预期,宏条形码分析将在系统分析我国近岸海域有害藻华物种(及其他浮游生物物种)的组成和相对丰度中起关键作用,通过发现新物种,辨别隐存种,跟踪物种的生物地理学,进而帮助解析有害藻华暴发机理。 | 陈楠生 | 2020 | 海洋科学2020，44，7： | 11 |
| 2 | 中国海洋浮游植物和赤潮物种的生物多样性研究进展(三):南海显示文摘中国南海是世界上最大的边缘海之一,位于印太交汇区的北端。独特的地理环境和气候条件使其生态环境极其复杂,使得南海海域的赤潮具有特殊性和典型性。近20年来,南海赤潮现象呈攀升态势,对水产养殖业、滨海旅游业、海洋生态系统及人类健康都有着严重的危害。为了系统了解南海海域浮游植物,尤其是赤潮物种的种类组成、相对丰度及年际变化,本文对近30年间(1987—2018)南海海域涉及浮游植物调研的44个航次数据进行了统计和比较分析,共记录到500种浮游植物、65个鉴定到属的未定种和1个未定类的三深碎裂藻。其中,硅藻(289种和37个未定种)和甲藻(186种和21个未定种)占绝大多数,包括赤潮物种149种。其中大部分浮游植物尚未得到系统的分子鉴定。比较发现不同航次报道的物种数目相差较大,种类相似度不高,硅藻和甲藻的相对优势地位无明显演替现象。南海海域最常见的赤潮物种以硅藻为主,包括菱形海线藻、中肋骨条藻、洛氏角毛藻、尖刺拟菱形藻、柔弱拟菱形藻、球形棕囊藻、夜光藻和锥状斯氏藻。本文将为比较研究不同海域赤潮物种的生物多样性,解读宏基因组学及宏条形码分析结果提供参考。 | 陈楠生 张梦佳 | 2021 | 海洋与湖沼2021，52，2： | 3 |
| 3 | Mechanisms of high-frequency dinoflagellate blooms of Scrippsiella trochoidea in Daya Bay,South China Sea显示文摘Harmful algal blooms(HABs),such as dinoflagellate blooms,have adverse eff ects on coastal water environments,causing seafood contamination and aquaculture economic losses.Based on historical HAB records data(1983-2017)and phytoplankton data(1982-2008),field investigation and laboratory experiments on frequently bloomed dinoflagellate species,we analyzed the possible mechanisms of high frequency dinoflagellate blooms in Daya Bay,South China Sea.The HAB records data show that the proportion of dinoflagellate blooms increased from 15% before 1994 to 77.27% after 2011.The bloom occurred mostly in summer(57.58%)in Yaling Bay(76.92%).The species inducing dinoflagellate blooms tended to be singular over time,with high proportion of Scrippsiella trochoidea(42.86%-88.88%).Laboratory experiment and field investigation of S.trochoidea bloom showed that this species grew rapidly at 30℃ and 32.1℃(r=0.47,P<0.05),respectively.Results indicate that temperature rise in Yaling Bay was aff ected by nearby nuclear plant effluent,which favored the S.trochoidea bloom.Coincidently,nearly 70% of S.trochoidea blooms occurred in about 7 days after local spring tide and strong wind(wind velocity>7 m/s),which disturbed the resting cysts in the sediment and bring them into surface layer.Taking into account of environmental parameters,algae source,and atmospheric conditions,the probable mechanism of S.trochoidea bloom could be explained.The cysts were resuspended by the spring tide or strong wind,germinated at the bottom layer,reproduced rapidly at higher temperature,and then aggregated in the inner bay(Yaling Bay),resulting the frequent S.trochoidea bloom.Considering the influences of global warming and human activities,it should be taken more attention that dinoflagellate blooms might increase along the coastal waters. | Yuan TIAN Simin HU Xianzhi LIN Hui HUANG Xingyu SONG Yan YAN Xuedong XIE Tao LI Sheng LIU | 2021 | Journal of Oceanology and Limnology2021，39，4： | 0 |
| 4 | 环境DNA分析大亚湾夜光藻藻华对真核浮游生物群落的影响显示文摘夜光藻是全球广泛分布的藻华种之一,其摄食作用对浮游生物的群落结构有着重要影响。利用环境DNA技术和Spearman相关性分析,文章研究了2021年1月中旬大亚湾夜光藻高丰度站位浮游生物的群落结构与生物相关性。结果显示,夜光藻高丰度站位的海水温盐条件为温度14.4~18.3℃、盐度32.52‰~33.14‰。夜光藻丰度较高的站位中,卡顿藻科、海链藻科等浮游植物类群的相对丰度均值为2.41%和2.23%,明显高于其他站位的0.75%和0.62%;同时拟哲水蚤科与长腹剑水蚤科等类群的相对丰度均值为8.22%和4.46%,明显低于其他站位的64.13%和11.12%。结合Spearman相关性分析表明,夜光藻丰度增加可能导致其对拟哲水蚤科等类群摄食压力增加,拟哲水蚤科类群丰度减少降低了卡顿藻科、海链藻科、原甲藻科、隐芽藻科等浮游植物类群的摄食压力,使其生物丰度增加;同时夜光藻摄食压力增加使得裸甲藻科、圆筛藻科等浮游植物丰度下降。因此,夜光藻丰度增加影响了水域中真核浮游生物群落结构。综上结果表明,环境DNA技术有助于认识夜光藻在浮游生物群落中的生态地位,可用于浮游生物各类群之间的关系分析。 | 陈靖夫 钟瑜 王磊 郭雨沛 邱大俊 | 2022 | 热带海洋学报2022，41，5： | 0 |
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