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1三带喙库蚊中分离的西藏环状病毒全基因序列测定及分析显示文摘西藏环状病毒(Tibet orbivirus,TIBOV)是环状病毒属中的新成员,首次分离自中国西藏自治区的圆斑按蚊,本研究首次对从三带喙库蚊标本中分离到的西藏环状病毒(HN11121株)进行全基因组序列测定和分子遗传进化分析。结果显示除第2节段以外,三带喙库蚊分离的HN11121病毒株与从圆斑按蚊分离的西藏环状病毒原始分离株(XZ0906)第1~10节段核苷酸和其编码的氨基酸序列长度相同,核苷酸和氨基酸同源性分别为70.3%(S6)~98.7%(S5)和79.8%(S6)~99.8%(S10);而HN11121病毒株与XZ0906病毒株第2节段核苷酸长度分别为2 850bp和2 838bp,分别编码950和946个氨基酸,核苷酸和氨基酸同源性分别为55.8%和47.1%。病毒VP2蛋白氨基酸位点差异结果显示从三带喙库蚊分离的HN11121病毒与从圆斑按蚊分离的XZ0906相比存在390个氨基酸差异位点。基于HN11121病毒株VP1基因和VP3基因核苷酸序列的系统进化分析结果显示HN11121属于环状病毒属西藏环状病毒,但是从三带喙库蚊分离的HN11121病毒与在圆斑按蚊分离的西藏环状病毒原始分离株(XZ0906)处在不同的进化分支。以上结果提示,从三带喙库蚊分离的西藏环状病毒(HN11121)与从圆斑按蚊分离的西藏环状病毒在病毒基因组和病毒基因组分子遗传进化均存在较大差异,鉴于三带喙库蚊是我国乙脑病毒的主要传播媒介,同时该蚊种也是我国南方广泛存在的蚊虫种类,因此加强三带喙库蚊中西藏环状病毒监测对于了解西藏环状病毒的生物多态性具有重要意义。范娜 曹玉玺 付士红 程睿 何英 雷雯雯 王环宇 鲁晓晴 梁国栋 2018病毒学报2018,34,5:11
2蠓虫及其传播的虫媒病毒显示文摘蠓虫是重要的吸血昆虫,其种类繁多、分布广泛,由于蠓虫可以通过吸血而传播多种人或动物性疾病,因此蠓虫也是重要的医学昆虫。本文重点叙述了蠓虫的生活习性,国内外蠓虫的种类,特别介绍了国内外吸血蠓虫及其传播的病毒,由蠓传病毒所引起的人类和动物性疾病及其公共卫生问题等,以此推动我国相关研究。范娜 程睿 鲁晓晴 王斌 梁国栋 2018中国热带医学2018,18,2:8
31株库蠓源版纳病毒的分离与全基因组序列分析显示文摘为分析云南省虫媒病毒的种类与遗传特征,在云南省师宗县采集库蠓进行病毒的分离与鉴定;通过全长cDNA扩增与高通量测序技术获取病毒全基因组序列,进行序列比对与系统发生树构建。结果显示,从采集的库蠓样本中分离出1株可在C6/36细胞上引起细胞病变的毒株(YNSZ043),病毒基因组为分节段双链RNA,琼脂糖凝胶电泳呈“2-4-3”的带型特征;电镜观察可见直径为70~80 nm,呈“指环状”,表面具有纤维突起的病毒粒子。全基因组测序结果显示,YNSZ043毒株为版纳病毒(Banna virus,BAV),基因组大小为20683 bp,由Seg-1(3762 bp)至Seg-12(861 bp)12个基因节段组成,与中国BAV毒株各基因节段的核苷酸序列相似性在64.8%~99.6%之间,氨基酸序列相似性在58.8%~100%之间,在系统发生树上YNSZ043毒株与中国分离的BAV聚为一簇,形成独立的中国进化支系。对决定BAV基因型的Seg-12分析结果显示,YNSZ043毒株属于A2基因型,该毒株的Seg-5/VP5与越南分离BAV毒株的核苷酸和氨基酸序列相似性高达97.1%和97.6%,表明该毒株的Seg-5基因节段很可能与越南毒株之间发生了基因重配。研究结果丰富了中国BAV的基因组序列,为开展云南省BAV的流行病学研究提供了参考。李占鸿 朱建波 寇美玲 杨振兴 李卓然 牛保生 姚萍芬 李华春 杨恒 2021中国畜牧兽医2021,48,3:6
4中华按蚊分离的版纳病毒全基因组序列测定与分子遗传进化分析显示文摘目的对分离自中华按蚊的版纳病毒进行病毒全基因组核苷酸序列测定和分子遗传学分析。方法使用分子病毒学方法测定病毒全基因组12节段核苷酸序列,以生物信息学软件进行序列比对、同源性和分子遗传进化分析。结果 2012年从云南省中缅边境地区中华按蚊分离的版纳病毒(YN12234病毒株)能在C6/36细胞引起细胞病变并稳定传代,该病毒为12节段RNA病毒。根据病毒VP1蛋白(RdRp)氨基酸序列进行的分子遗传进化分析发现,YN12234病毒属于呼肠孤病毒科东南亚12节段RNA病毒属版纳病毒。对第12节段基因序列的进一步分析显示,YN12234病毒属于A2基因型版纳病毒。系统进化分析结果还显示,从中华按蚊分离的版纳病毒与此前从中华按蚊分离的版纳病毒处在不同进化分支,且不同蚊虫分离的版纳病毒并非聚类在共同的进化分支。结论从中华按蚊分离的YN12234病毒株属于含有12节段的版纳病毒,分子进化分析结果提示包括云南省分离的YN12234病毒在内的目前国内外从蚊虫分离的版纳病毒并不存在病毒与蚊虫种类之间的媒介适应性。程睿 付士红 范娜 何英 雷雯雯 王环宇 王斌 鲁晓晴 梁国栋 2018中国媒介生物学及控制杂志2018,29,6:3
52018年甘肃省平凉市流行性乙型脑炎病毒的分子特征显示文摘为研究甘肃省2018年蚊虫携带流行性乙型脑炎病毒(简称乙脑病毒)的分子特征,2018年7月上旬在甘肃省平凉市4个县采集蚊虫标本,采用实时荧光定量RT-PCR方法开展乙脑病毒筛查;通过高通量测序方法对乙脑病毒基因扩增阳性蚊虫标本进行深度测序研究。结果显示,本次调查在4个县共采集蚊虫1800只,均为三带喙库蚊,分36批研磨和检测。定量RT-PCR结果显示10批(27.8%)蚊虫样本呈乙脑病毒基因扩增阳性。对10批样本进行高通量测序共获得59.7 M读序,其中5.3 M(8.9%)条读序能够比对到病毒基因组数据库上,经注释属于14科15属28种病毒。在其中7批样本中检出乙脑序列共1357条,基因组覆盖度为9.5%-83.1%。系统进化分析显示甘肃省2018年采集的三带喙库蚊中乙脑病毒为基因I型。何小周 董茂星 殷启凯 胡玉坤 付士红 张益 李樊 李洋 何英 王佶 聂凯 申辛欣 许松涛 梁国栋 张晓曙 王环宇 马学军 2021病毒学报2021,37,2:2
6蚊传呼肠孤病毒研究进展显示文摘虫媒病毒由吸血节肢动物叮咬脊椎动物传播。呼肠孤病毒科由9~12节段的双链RNA病毒组成,病毒颗粒为大小在60~80 nm之间呈20面体对称的球型结构,目前国际病毒分类委员会(ICTV)命名及未列入分类的呼肠孤病毒共有两亚科15属150余种。该科病毒既能感染呼吸道,又能感染胃肠道,分布广、媒介及宿主众多。本文对目前全球发现的蚊传呼肠孤科病毒种类进行总结,对我国既往和新发现命名的蚊传呼肠孤病毒科病毒的媒介、地理分布和致病性调查进行分类汇总,为疾病预防控制策略的制定提供基础数据。田杰 郭晓芳 2021中国人兽共患病学报2021,37,8:2
7广东湛江地区啮齿动物携带版纳病毒系统发育分析显示文摘目的通过对广东湛江地区啮齿动物携带的版纳病毒进行系统发育分析,揭示版纳病毒这一人兽共患病原体的序列特征和遗传进化关系。方法采用笼捕法捕捉啮齿动物,分别采集其肺脏、肝脏、脾脏和肠内容物,使用宏病毒组技术富集病毒颗粒建库测序,比对美国国立生物技术信息中心(NCBI)病毒数据库将注释所得版纳病毒重叠群(contigs)使用生物信息软件分析其与参考毒株基因组序列的覆盖率和相似度,并绘制特定目的片段的系统发育树。结果在板齿鼠、褐家鼠、黄胸鼠、黄毛鼠、鼩鼱的肝脏、肺脏、脾脏、肠内容物样本中均注释到了大量版纳病毒序列(Reads),拼接所得的版纳病毒湛江株覆盖95.6%~100.0%的参考株(NC004211)基因组序列,与参考基因组序列相似性为90.4%~98.3%,基本确认拼接序列为版纳病毒的全长序列。版纳病毒湛江株VP1-VP12等12个基因片段与我国云南地区发现SC043株、YN12243株以较高置信值聚集成簇,亲缘关系较近。结论版纳病毒在湛江地区野生小型兽类哺乳动物(啮齿动物、鼩鼱)中普遍携带,对类似虫媒病毒性脑炎症状患者要进行鉴别诊断,防范新发传染病。郝玮 陆家海 2020热带医学杂志2020,20,10:2
8云南省沧源县蠓虫携带版纳病毒全基因核苷酸序列特征分析显示文摘目的研究沧源县蠓携带版纳病毒的全基因及其遗传进化特征。方法2018年在沧源县采集蠓,研磨后将上清液接种BHK-21细胞进行病毒分离的同时用宏转录组学方法检测蠓携带病毒情况,用Perl、Mafft等软件进行病毒序列比对、同源性和分子遗传进化分析。结果通过宏转录组学方法,从CYC1801组中获得1株版纳病毒的全基因序列,对全基因进行分析显示,节段4和节段7与越南株亲缘关系较近,其余节段均与中国株亲缘关系较近,根据节段12基因序列的系统进化分析,CYC1801与A2基因亚型处于同一进化分支,属于A2型版纳病毒。结论沧源县蠓携带有版纳病毒并可能作为传播媒介引起疾病流行,需加强监测及防控。杨丽芬 王娟 杨卫红 邝国鹏 冯云 2022中华实验和临床病毒学杂志2022,36,3:0
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