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1海岸带海陆交互作用过程及其生态环境效应研究进展显示文摘海岸带是地球表层物质、能量和信息流通交换最活跃区域之一,具有动态变化的盐度、溶解氧等地球化学梯度,其界面过程体现在大气降水-河水-海水-地下水-沉积物之间的物质循环和能量交换.在人类活动与气候变化双重影响下,海岸带面临着气候灾害、海岸侵蚀、海水入侵、滨海湿地退化、水体富营养化以及重金属、新型污染物等生态环境问题,成为地球科学和环境科学领域研究的热点.本文围绕海岸带水文-生物地球化学循环、人类活动影响下的海岸带环境问题、海岸带环境对气候变化的响应、海岸带海陆交互界面观测新技术新方法4个方面,综述了国内外研究进展与发展趋势,展望了海陆交互作用及其生态环境效应研究的未来发展方向.王焰新 甘义群 邓娅敏 谢先军 2020地质科技通报2020,39,1:22
2不同养殖方式方格星虫的营养组成比较显示文摘为研究相同海域滩涂和池塘养殖方格星虫(Sipunculus nudus Linnaeus)营养组成的异同,比较了2种养殖方式下的方格星虫体壁脂肪酸、氨基酸、矿物元素和基本营养物质组成。结果显示,滩涂和池塘养殖方格星虫体壁的粗蛋白、粗脂肪、灰分、脂肪酸总量相近(P>0.05)。滩涂和池塘养殖星虫的C22:0、C20:3(n-3)、C16:1、C18:2(n-6)、C23:0含量差异显著(P<0.05),且作为硅藻脂肪酸特征的C16:1(n-7)/C16:0比值和C20:5(n-3)也具有显著差异(P<0.05)。池塘养殖的方格星虫谷氨酸(Glu)、总氨基酸含量显著高于滩涂养殖(P<0.05),而必需氨基酸之间无显著差异(P>0.05)。池塘养殖方格星虫体壁和沉积物中的钾(K)、钠(Na)、镁(Mg)、钙(Ca)、硒(Se)含量均高于滩涂养殖方格星虫相应体壁和沉积物中的含量(P<0.05),而且2种养殖方式下的方格星虫体壁K、Se含量均显著高于相应沉积物中的含量(P<0.05)。综合分析表明,相同海域不同养殖方式并不会显著影响方格星虫的基本营养组成(粗蛋白、粗脂肪、灰分),但是对于Glu、总氨基酸以及C22:0、C20:3(n-3)、C16:1、C16:1(n-7)/C16:0比值和C20:5(n-3)等具有影响。方格星虫对K、Na、Mg、Ca、Se具有一定程度的富集作用,而对于铁(Fe)、锌(Zn)、锰(Mn)、铜(Cu)、铅(Pb)、铬(Cr)、镉(Cd)、钴(Co)等元素无明显富集作用。李俊伟 郭永坚 胡瑞萍 陈素文 颉晓勇 朱长波 李婷 2018南方水产科学2018,14,4:7
3光裸方格星虫增养殖对滩涂底质的影响显示文摘基于2016年春、秋两个季节的现场实验数据,研究光裸方格星虫(Sipunculus nudus Linnaeus)滩涂增养殖对滩涂底质的影响。实验对方格星虫单养区(S组)、方格星虫-贝类混养区(P组)和无星虫对照区(C组)进行了有机质、粒径组成、氧化还原电位(ORP)等指标测定,结果表明:1)秋季S组20~30cm层次有机质含量和细沙比例均显著高于春季,而C组仅表层物质有所增加,表明方格星虫具有较强的表层物质迁移能力,且其迁移深度为20~30cm。2)秋季C组各层氧化还原电位值(ORP)均无明显降低趋势,而S组仅10~20cm层次有一定程度降低,表明方格星虫增养殖并不会明显降低滩涂底质状况。3)P组各层有机质以及细沙含量增加,表明皱肋文蛤的过滤沉积作用可以提高滩涂颗粒物质的积累,且方格星虫混养会加速颗粒物质的向下迁移;P组皱肋文蛤的栖息层次(0~3cm、3~10cm)ORP明显低于S组(p<0.05),表明高密度的皱肋文蛤代谢活动会加剧0~10cm的底质恶化。4)方格星虫与皱肋文蛤具有生态互补作用,在同一区域进行增养殖可以提高滩涂物质利用率及碳汇功能;方格星虫扰动引入富氧水可以缓解皱肋文蛤栖息层次的底质。李俊伟 颉晓勇 郭永坚 朱长波 陈素文 丁贤 李婷 陈振国 2018热带海洋学报2018,37,1:4
4光裸星虫Hsp90基因的全长克隆及其在全组织和卵母细胞中的表达分析显示文摘热休克蛋白Hsp90在蛋白质正确折叠、胞内物质运输、细胞增殖调控、配子发生等过程中发挥重要的作用。本研究利用RACE技术克隆获得了光裸星虫热休克蛋白Hsp90(SnHsp90)cDNA全长序列。SnHsp90全长3110 bp,其中,3´UTR为582 bp,5´UTR为72 bp,开放阅读框为2456 bp,编码818个氨基酸。序列分析结果显示,SnHsp90蛋白具有1个信号肽,存在B型Hsp90的3个标签序列FLREL、IGQFGVGFYS、LPLNVSRE以及保守模块GxxGxG,表明SnHsp90属于Hsp90B亚族。与其他物种的Hsp90氨基酸序列比对发现,SnHsp90与鸭嘴海豆芽(Lingula anatine)Hsp90相似度最高,为77.72%。三维结构建模发现,Hsp90在不同物种之间的空间构象具有较高保守性。系统进化树分析显示,SnHsp90先与小头虫(Capitella teleta)、水蛭(Helobdella robusta)等环节动物的Hsp90聚为一支,再与鸭嘴海豆芽等其他无脊椎动物聚为一大支,而脊椎动物聚为另一大支,表明SnHsp90与小头虫Hsp90亲缘关系最近。RT-PCR结果显示,SnHsp90在光裸星虫的体壁、收吻肌、肾管等组织中均有表达。SnHsp90也可在卵母细胞不同发育时期表达,其中,在卵黄旺盛合成前期(Egg2)和外排卵母细胞期(Egg6)显著高表达(P<0.05),暗示,SnHsp90可能参与到光裸星虫卵母细胞的蛋白质正确折叠、卵黄合成与环境抗逆等过程。研究结果为进一步探究光裸星虫卵母细胞发育的分子机制积累了基础资料。周丹 苏泳霖 钟如卓 郭志诚 邬婧 郑哲 王庆恒 2020渔业科学进展2020,41,5:4
5方格星虫矿物元素组成及其生物富集特征显示文摘目的研究方格星虫体壁肌肉和体腔液中的矿物元素组成及其与沉积物生境之间的相关性,旨在为方格星虫体内矿物元素开发利用和沉积物内元素的生物富集特征分析提供依据。方法在无扰动养殖区(N)、高强度采挖区(H)、中等强度采挖区(R)收集方格星虫和沉积物样品,应用电感耦合等离子体质谱法测定样品中的矿物元素。采用Pearson相关性分析和生物富集系数探讨方格星虫体壁元素与环境沉积物的关系。结果方格星虫肌肉中矿物元素含量表现为钾>钠>镁>钙>铁>锌>铜>锶>砷>硒等,体腔液中的矿物元素含量表现为钠>钾>镁>钙>铁>锶>锰>硒>砷>钒>钼>铅>镉>钴。Pearson相关分析发现,方格星虫肌肉钒元素含量和体腔液中的镉、钙元素均与沉积物具有显著正相关关系。方格星虫体壁肌肉中生物富集系数较高的矿物元素包括钾、镉、铜、硒、钼、锡和砷等,体腔液中生物富集系数较高的矿物元素包括钾、镉、钙、钠、锶等。不同处理组方格星虫体壁、体腔液中的矿物元素富集系数均表现出相近的变化趋势。高强度采挖组(H组)方格星虫体壁肌肉中的钾元素生物富集系数显著高于无扰动养殖组(N组)和中等强度采挖组(R组),而H组的镉、铜、钼生物富集系数显著低于N和R组(P<0.05)。高强度采挖组(H组)方格星虫体腔液中的钾、锶元素生物富集系数显著高于无扰动养殖组(N组)和中等强度采挖组(R组),而H组的镉、铜元素生物富集系数显著低于N组和R组(P<0.05),不同采挖方式可能影响了相关元素的分布或结合状态。结论方格星虫体壁和体腔液矿物元素组成丰富,具有重要的开发利用价值。方格星虫对于不同元素的生物富集能力不同,部分元素含量受环境沉积物的影响。李俊伟 胡瑞萍 郭永坚 朱长波 陈素文 齐占会 李婷 2021中国海洋药物2021,40,2:3
6光裸方格星虫生物扰动对沉积物氮磷物质释放的影响显示文摘通过测定养殖箱内(24 cm×17 cm×16 cm))的沉积物管道数量和水体氮磷指标,研究方格星虫生物扰动对沉积物氮磷物质释放和表层物质迁移的影响。养殖箱底部铺设粗沙(3200 g,有机质含量27.6 mg·g^-1),上层为细沙(2200 g,有机质含量11.0 mg·g^-1),星虫密度分别为0条·箱^-1(T0))、1条·箱^-1(T1))、2条·箱^-1(T2))和4条·箱^-1(T4)),各组均设4个重复,实验时间为11 d。数据显示:1)方格星虫组沉积物侧面和底部的管道数量增加,并且表层细沙向下迁移,方格星虫密度越大,管道数量越多。实验期间水体悬浮颗粒物无明显变化(P>0.05)),且处理组之间亦无显著差异(P>0.05)),表明方格星虫扰动对表层沉积物的再悬浮作用无明显影响。2)实验前3天水体中的亚硝态氮、硝态氮、氨氮和总无机氮均无明显增加,而在第4天亚硝态氮、硝态氮、总无机氮表现增加趋势,并且星虫密度越大含量越高(P<0.05))。实验期间,各组活性磷含量呈现下降趋势,并且T0组平均含量低于其他三组。结果表明,底层有机质含量高于表层时,方格星虫生物扰动可以促进底层含氮物质的释放,并且密度越大促氮释放作用越明显;方格星虫对沉积物含磷物质的释放影响较小,可能与其含量较低和转化过程有关。李俊伟 胡瑞萍 郭永坚 陈素文 朱长波 颉晓勇 张文文 陈振国 2019生态科学2019,38,5:2
7光裸星虫(Sipunculus nudus)不同发育时期卵细胞内参基因的筛选显示文摘内参基因的选择对功能基因表达量的归一化处理尤为重要。为了筛选出光裸星虫不同发育时期卵子的最适内参基因,利用qRT-PCR测定了甘油醛-3-磷酸脱氢酶(GAPDH)、肽基脯氨酰顺反异构酶A(PPIA)、60S核糖体蛋白L10(60S-L10)、铁蛋白(Ferritin)、β-肌动蛋白(β-actin)、泛素C(UBC)、真核生物翻译起始因子(eIF)、NADH脱氢酶(NDH)、28S核糖体RNA(28S)、TATA盒结合蛋白(TBP)、18S核糖体RNA(18S)和琥珀酸脱氢酶A亚基(SDHA)共12个候选内参基因的表达水平,并通过4个程序(geNorm,NormFinder,BestKeeper以及RefFinder)综合分析了各基因的表达稳定性。结果显示:(1)12个候选内参基因均能获得特异性扩增产物,但表达情况各异;(2)对候选内参基因进行综合打分,得到候选内参基因稳定性排名为18S>GAPDH>28S>β-actin>UBC>e IF>NDH|TBP>PPIA|Ferritin>60S-L10>SDHA。18S和GAPDH稳定性较好,可作为不同发育时期卵细胞基因表达研究的单内参基因,或最优组合内参基因。张家炜 邬婧 周丹 郑哲 王庆恒 2020基因组学与应用生物学2020,39,2:2
8光裸星虫Cdc25基因的克隆及在卵母细胞中的表达分析显示文摘细胞分裂周期蛋白25 (cell division cycle 25, Cdc25)是一种重要的双特异性磷酸酶,对卵母细胞减数分裂进程和胚胎发育具有重要的调控作用。本研究利用RACE技术克隆获得了光裸星虫(Sipunculus nudus) Cdc25(Sn-Cdc25)cDNA全长。Sn-Cdc25全长为4 130 bp,其中3’UTR为1 849 bp,5’UTR为427 bp,开放阅读框为1 854 bp,编码617个氨基酸。序列分析显示,Sn-Cdc25蛋白分子量为69.58 kD,具有M相诱导磷酸酶结构域(M-phase inducer phosphatase domain)和硫氰酸酶同源结构域(rhodanese-like domain)两个典型的Cdc25蛋白结构域,以及能催化去磷酸化过程的活性位点序列HCX_(5)R。多序列比对发现Cdc25同源蛋白的C端同源性较N端的高。三级结构预测表明Cdc25同源蛋白及其活性位点的三级结构构象高度相似。motif分析中共发现5个motifs,其中motif 1和motif 2分别为Paxillin LD基序和MYND结构域结合基序。系统进化树分析显示,无脊椎动物和脊椎动物的Cdc25分别聚为两大支。RT-qPCR结果显示,在不同发育时期卵母细胞中,Sn-Cdc25的表达差异显著,具有两个峰值,从卵黄形成初期至卵黄旺盛合成后期(O1~O3)Sn-Cdc25表达量上升可能与Cdc25促进DNA的复制过程相关;而从体腔液中进入到肾管后(O4~O5),表达量的迅速上升可能有利于成熟促进因子(maturation promoting factor, MPF)的活化。研究结果为深入认识星虫动物卵母细胞发育调控机制和优化人工繁育技术积累基础资料。苏泳霖 叶健铭 刘琪 曾业涛 张丞澍 王庆恒 2021基因组学与应用生物学2021,40,4:1
9不同加工方式沙虫干品的脂肪酸组成比较显示文摘为研究不同加工方式下方格星虫(Sipunculus nudus)脂肪酸组成特征,采用气相色谱仪检测水煮烘干和暴晒干燥两种加工方式下方格星虫体壁脂肪酸种类和含量。结果显示,水煮干燥和暴晒加工方格星虫体壁中分别检测出21种、20种脂肪酸,分别包含12种、11种不饱和脂肪酸(UFA),两种加工方式具有相同的饱和脂肪酸(SFA)种类(9种)。水煮加工的饱和脂肪酸(SFA)、单不饱和脂肪酸(MUFA)和多不饱和脂肪酸(PUFA)含量分别为7.97、1.21和5.56 mg/kg,而暴晒加工的SFA、MUFA、PUFA分别为5.84、0.34和2.47 mg/kg。水煮加工方格星虫的体壁饱和脂肪酸含量显著高于暴晒加工(P<0.05)。两种加工方式方格星虫体壁中的不饱和脂肪酸占总脂肪酸的45.96%和32.98%,而SFA∶MUFA∶PUFA比值分别是1∶0.15∶0.7和1∶0.06∶0.42。两种加工方式样品中的十一碳酸、油酸和亚油酸分别是SFA、MUFA、PUFA含量最高的。在单不饱和脂肪酸中,水煮加工样品中的十八碳一烯酸的含量显著高于暴晒加工(P<0.05);在多不饱和脂肪酸中,水煮烘干样品中的9,12-十八碳二烯酸、6,9,12-十八碳三烯酸、8,11,14-二十碳三烯酸、5,8,11,14,17-二十碳五烯酸显著高于暴晒加工(P<0.05)。综合分析表明,不同加工方式会影响方格星虫干品中的脂肪酸含量,水煮干燥加工方式的脂肪酸保留率高于直接暴晒方式。陈振国 班庭辉 王明显 梁龙子 陈文清 2020河北渔业2020,,10:0
10光裸星虫CyclinB基因克隆及其在卵母细胞中的表达分析显示文摘【目的】探究细胞周期蛋白B(CyclinB)基因在光裸星虫(Sipunculus nudus)卵母细胞发育成熟过程中的作用,为揭示光裸星虫卵母细胞发育的分子机制提供理论依据。【方法】利用RACE克隆光裸星虫CyclinB(Sn-CyclinB)基因cDNA序列,通过ProtParam、DNAMAN 9.0、COBALT、SOPMA、Phyer2、Pfam及BLAST等在线软件进行生物信息学分析,并以实时荧光定量PCR检测分析Sn-CyclinB基因在光裸星虫卵母细胞不同发育时期的表达情况。【结果】Sn-CyclinB基因cDNA序列全长2468 bp,包括141 bp的5'端非翻码区(5'-UTR)、1097 bp的3'端非翻码区(3'-UTR)及1230 bp的开放阅读框(ORF),编码409个氨基酸残基,在3'-UTR中存在3个胞质多聚腺苷酸化元件(CPE)、1个翻译调控元件(TCE)和1个K-box翻译调控元件。Sn-CyclinB蛋白分子量为46.304 kD,理论等电点(pI)为8.68,具有CyclinB特征序列(FLRRxSK)和Cyclin降解框(RxALGxIxN),属于亲水性蛋白,含有周期蛋白框(Cyclin box);其二级结构中α-螺旋、延伸链、β-转角和无规则卷曲分别占56.72%、3.91%、0.73%和38.63%;CyclinB蛋白C端的保守性较N端高;与其他物种相比,光裸星虫Cyclin降解框(RALGTISN)的位置前移了13个氨基酸;光裸星虫与小头虫和欧洲帽贝的CyclinB蛋白三级结构高度相似。基于CyclinB氨基酸序列相似性构建的系统发育进化树分为无脊椎动物和脊椎动物两大支,其中光裸星虫与小头虫及水蛭等无脊椎动物聚为一支。Sn-CyclinB基因在光裸星虫卵母细胞不同发育时期均有表达,且整体上呈双峰型变化趋势,其相对表达量的峰值分别出现在卵黄旺盛合成后期(O3)和肾管发育时期(O5)。【结论】Sn-CyclinB蛋白具有CyclinB特征序列,其3'-UTR含有多种与翻译调控相关的调控元件,参与光裸星虫卵母细胞减数分裂G_(1)/S期和G_(2)/M期的转换,对促进卵母细胞减数分裂有序进行起重要作用。邬婧 苏泳霖 周丹 钟如卓 郭志诚 王庆恒 2021南方农业学报2021,52,7:0
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