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| 1 | 基于癌症基因组图谱构建胃癌预后评估模型显示文摘目的采用生物信息学方法,对癌症基因组图谱(TCGA)数据库中胃癌转录组数据进行分析,构建胃癌预后评估模型,筛选影响胃癌发生及预后的生物标志物。方法从TCGA数据库下载胃癌转录组数据及临床病理资料(胃癌样本375例,癌旁正常样本32例)并合并成矩阵,采用R'edgeR'包筛选差异表达基因(DEGs),采用R'Survival'包对DEGs进行Cox单因素、多因素回归分析,构建胃癌预后评估模型。结合临床病理特征,验证该模型在预后评估中的有效性。结果基于'edgeR'包共筛选出4 332个DEGs,纳入Cox单因素分析,结果显示710个DEGs与胃癌预后相关(P<0.01),取P<0.001的25个DEGs纳入Cox多因素分析,得到包含8个DEGs(BCHE、INPP5J、VCAN、IGFBP1、CGB5、HP、PSG9、AFF2)胃癌预后评估模型,基于模型风险评分将样本分为高、低风险组,Kaplan-Meier生存曲线结果显示高、低风险组5年总生存率(OS)分别为56.20%、17.27%(P<0.001),ROC曲线证实该预测模型有一定的准确性(AUC=0.758)。将临床病理特征纳入Cox回归分析,结果显示,高龄和风险评估模型评分为高风险是影响TCGA胃癌患者预后的独立危险因素。结论基于生物信息学方法构建的胃癌预后评估模型可成为胃癌预后判断的新指标。 | 王举 窦忠霞 姜洪伟 王永强 高小平 张勇 | 2018 | 天津医药2018,46,12: | 4 |
| 2 | 自然流产患者蜕膜组织中PSG1的表达研究显示文摘目的:探讨PSG1在正常妊娠人工流产与自然流产患者蜕膜组织的表达差异及临床意义。方法:收集30例妊娠患者的蜕膜组织,包括15例人工流产(N组)患者和15例自然流产(SA组)患者的蜕膜组织。采用免疫荧光鉴定所收集的标本,采用RT-q PCR、Western Blot、免疫组化的方法检测蜕膜组织的PSG1基因及蛋白的表达差异及细胞定位。结果:(1)在正常妊娠人工流产患者及自然流产的蜕膜组织中均可检测到PSG1基因及蛋白的表达。(2)PSG1 mRNA表达量两组间有统计学差异(P〈0.05),人工流产PSG1 mRNA表达较自然流产高。(3)WB检测PSG1表达量两组间有统计学差异(P〈0.05),人工流产PSG1表达较自然流产高。(4)免疫组化检测PSG1主要表达于细胞质中,且N组较SA组表达高。结论:自然流产患者的蜕膜组织中PSG1表达较正常妊娠者低,提示其可能参与蜕膜细胞的增殖及凋亡从而影响胚胎的生长和发育。 | 杜鑫 丘维钰 林炜娴 余庆英 郜洁 罗颂平 | 2018 | 中华中医药学刊2018,36,5: | 1 |
| 3 | 应用质谱技术筛选子痫前期的潜在生物学标志物显示文摘子痫前期(preeclampsia,PE)的病因至今尚未阐明,其导致孕产妇和围产儿较高的病死率,因此早期疾病的预测和预防非常重要。PE是一种多系统疾病,单一或一小部分生物学标志物不太可能准确预测该疾病。基于质谱(mass spectrometry,MS)的蛋白质组学研究发现了大量可能参与PE发病相关的生物学标志物。参考国内外文献将基于MS的蛋白质组学筛选出的子痫前期潜在生物学标志物归纳为促血管生成因子、抗血管生成因子、胎盘生长因子、氧化与抗氧化因子及促炎性细胞因子等,并就这些蛋白质生物学标志物做一简要综述,试图寻找彼此间的联系,为预测PE及研究该疾病的病理生理机制提供参考。 | 孙春蕾 谢莹莺 | 2023 | 医学研究杂志2023,52,5: | 0 |
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