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| 1 | 大额牛瘤胃细菌CMC-1蛋白结构和功能的生物信息学分析显示文摘为了深入了解大额牛瘤胃细菌CMC-1蛋白的结构和功能,试验利用ProtParam、TMHMM Server 2.0、ProtScale、NCBI Conserved Domains、SignalP 5.0、TargetP、PSORTⅡserver、SOPMA、SWISS-MODEL、NCBI protein BLASTp和MEGA 7.0等在线工具和软件,对CMC-1蛋白的理化性质、跨膜区、亲水性/疏水性、结构域、信号肽及亚细胞定位、二级结构、三级结构、系统进化等内容进行分析。结果表明:CMC-1蛋白的相对分子质量为47 026.01,理论等电点为5.68,带负电荷的残基总数为49个,带正电荷的残基总数为41个,估计半衰期为100 h,属于亲水型稳定的跨膜脂蛋白,定位于线粒体中,含有一个主要由α-螺旋、无规则卷曲、扩展链、β-转角组成的保守结构域,三级结构同源建模有较高的置信度;CMC-1蛋白在进化树中独立成支,与普雷沃氏菌科细菌HUN156糖苷水解酶家族5中的纤维素酶蛋白同源性较高。说明CMC-1蛋白是与普雷沃氏菌科细菌HUN156纤维素酶蛋白有较高亲缘关系的亲水型跨膜脂蛋白,可能来源于一个新的微生物种或一个新的纤维素酶基因。 | 张光荣 袁再美 孙丽媛 邓茗月 王荣蛟 和世春 王寒雪 毛华明 杨舒黎 | 2021 | 黑龙江畜牧兽医2021，，3： | 3 |
| 2 | 大额牛瘤胃细菌CDT-1蛋白的生物信息学特征研究显示文摘为了研究从云南大额牛(Bas frontalis)瘤胃微生物宏基因组文库中发掘出的纤维糊精酶-1(CDT-1)蛋白的生物信息学特征,试验使用ProtParam、TMHMM Server 2.0、ProtScale、NCBI Conserved Domains、SignalP 5.0、TargetP 2.0、PSORTⅡserver、SOPMA、SWISS-MODEL、NetN Glyc 1.0 Server、NetP hos 3.1 Server、NCBI protein BLASTp和MEGA 7.0等在线分析工具和软件,分析CDT-1蛋白的基本理化性质、跨膜区、亲水性/疏水性、结构域、信号肽、亚细胞定位、二级结构、三级结构、N端糖基化位点和丝氨酸、苏氨酸和酪氨酸的磷酸化位点及系统进化情况等生物信息学特征。结果表明:CDT-1蛋白的相对分子质量为38082.24,理论等电点为4.80,带负电荷的残基总数为45个,带正电荷的残基总数为29个,估计半衰期为30 h,属于亲水型稳定的脂蛋白,定位于细胞壁和细胞外,含有1个由α-螺旋、无规则卷曲、扩展链和β-转角组成的保守结构域,三级结构同源建模有较高的可信度,有2个N端糖基化位点和26个磷酸化位点,可能具有较高的酶活力;CDT-1蛋白与系统进化树中的内切葡聚糖酶的纤维素酶蛋白高度同源。说明CDT-1蛋白是来源于内切葡聚糖酶中的纤维素酶蛋白的亲水型稳定脂蛋白。 | 周子健 吴东旺 张光荣 和虎生 杨舒黎 | 2022 | 黑龙江畜牧兽医2022，，9： | 1 |
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