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| 1 | 大口黑鲈转录组SNPs筛选及其与生长的关联分析显示文摘为开发人工饲料代替冰鲜杂鱼养殖大口黑鲈的分子标记,以食用冰鲜鱼和配合饲料的同批大口黑鲈为研究材料,利用RNA-Seq(RNA sequencing)技术挖掘SNPs(Single nucleotide polymorphisms)标记,并以关联分析筛选可用于育种的候选标记。转录组进行测序共获得174 M数据,8681个SNPs位点。挑选其中具有表达差异的50个SNPs位点进行SNa Pshot分型,结果39个分型成功,其中有4个为假阳性,通过转录组技术开发出SNPs标记35个,成功率为70.0%。为进一步检验这些标记是否可用于评估驯食饲料的大口黑鲈选育研究,研究以327尾摄食人工配合饲料的大口黑鲈为试验材料,SPSS软件进行一般线性模型分析SNPs的不同基因型与生长性状的相关性,结果显示有2个SNPs位点与体质量、全长和体高等生长性状存在显著相关性(P<0.05),可作为候选标记用于大口黑鲈的分子辅助育种。由于转录组数据直接反应基因的表达情况,从中挖掘与性状相关的优势基因型与分子标记的成功率高,效果较好。同时也为解决大口黑鲈选育研究中标记缺乏提供了有效途径,为选育提供遗传依据、加速育种进程。 | 全迎春 马冬梅 白俊杰 刘浩 李胜杰 刘海涌 | 2016 | 水生生物学报2016，40，6： | 16 |
| 2 | 藏猪和大约克猪MYL1基因多态性及差异表达分析显示文摘为研究猪不同品种的MYL1基因的多态性及mRNA表达差异。本试验以藏猪和大约克猪作为实验动物,采用一代测序技术对藏猪(59头)和大约克猪(58头)MYL1基因起始密码子上游3 kb区域进行多态性检测;利用实时荧光定量PCR技术检测MYL1基因在背最长肌、背脂、肝脏组织差异表达情况。结果表明:藏猪和大约克猪在起始密码子上游3 kb区域发现T-159A突变位点并呈极显著差异(P<0.01);MYL1基因在背最长肌表达量最高,其次是背脂,肝脏的最低,在背最长肌中藏猪MYL1基因表达量极显著高于大约克猪(P<0.01),在背脂和肝脏组织中,藏猪MYL1基因表达量显著高于大约克猪(P<0.05)。推测T-159A位点可能是参与肌肉生长发育的重要调控位点。本研究为下一步开展MYL1基因对猪生长性能及其肉品质的影响提供参考依据。 | 巩兴龙 段梦琪 张健 李雨晴 张芳芳 赵雪 强巴央宗 商鹏 | 2021 | 基因组学与应用生物学2021，40，2： | 0 |
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