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11p/19q分子遗传学改变在脑胶质瘤中的临床意义显示文摘胶质瘤是最常见的中枢神经系统原发性肿瘤,约占中枢神经系统肿瘤的3/5。除常规检查外,分子生物学检测在研究胶质瘤临床特点中具有独特的意义。分子生物学检测主要是对记录独特信息的遗传物质变化进行精确检测,具体到肿瘤患者肿瘤的精确分型、可能的预后情况、适合使用的药物以及后续药物的疗效都可以通过基因检测来实现。分子生物学检测逐步在胶质瘤的精确分型、分子水平治疗及预后预测中得以应用,并随之探明了若干分子生物学改变如端粒酶逆转录酶(TERT)启动子突变、Ki-67基因过度表达、p53基因突变、染色体1p/19q杂合性缺失等,与脑胶质瘤有着密切的关系。李松丽 乔惠萍 刘星宇 张苗 2019中国实用医药2019,14,2:3
2基于机器学习筛选脑胶质瘤1p/19q共缺失特征基因及其在预测1p/19q共缺失中的作用显示文摘目的基于机器学习方法筛选脑胶质瘤1p/19q共缺失特征基因, 并探讨其在预测1p/19q共缺失中的作用。方法回顾性分析中国脑胶质瘤基因组图谱计划(CGGA)、癌症基因组图谱计划(TCGA)数据库中脑胶质瘤患者的肿瘤组织转录组测序数据及临床信息, 将CGGA693的数据作为试验组(508例), CGGA325(298例)和TCGA(545例)的数据作为验证组。采用单因素Cox回归方法和机器学习方法分别筛选试验组中1p/19q共缺失与1p/19q非共缺失者与免疫相关的差异表达基因。2种筛选方法共同具有的候选基因定义为1p/19q共缺失特征基因(以下简称特征基因)。在2个验证组中验证特征基因在1p/19q共缺失与非共缺失者间的差异。绘制受试者工作特征曲线(ROC), 计算试验组和验证组中特征基因预测1p/19q共缺失的曲线下面积(AUC);采用Kaplan-Meier生存分析法分析AUC值较大的特征基因与预后的关系。在试验组, 采用logistic回归分析方法, 基于特征基因及临床信息构建不同的1p/19q共缺失预测模型;采用AUC、赤池信息量准则、净重新分类指数、综合判别改善指数、决策曲线分析法综合评估每个模型的预测效能。另纳入南京医科大学附属常州第二人民医院神经外科行手术切除的22例脑胶质瘤标本, 采用实时荧光定量PCR法检测1P/19q类缺失者与非共缺失者特征基因mRNA的表达水平。结果试验组中共筛选出6个特征基因, 分别为血管生成素样蛋白2(ANGPTL2)、骨形成蛋白2(BMP2)、骨形成蛋白8b(BMP8b)、成纤维细胞生长因子11(FGF11)、组蛋白去乙酰化酶1(HDAC1)及滑行蛋白α(TXLNA)。2个验证组中, 6个特征基因在1p/19q共缺失与非共缺失组中的表达差异均有统计学意义(均P<0.001)。试验组和验证组的ROC显示, HDAC1、TXLNA基因预测1p/19q共缺失的AUC值均>0.9;生存分析显示, HDAC1、TXLNA基因低表达者的总生存期均长于高表达者, 差异均有统计学意义(均P<0.001)。共建立3个预测1p/19q共缺失模型:模型A (变量:TXLNA), 模型B (变量:TXLNA+HDAC1), 模型C[变量:TXLNA+HDAC1+年龄+世界卫生组织(WHO)分级+异柠檬酸脱氢酶突变] 。多个预测效能评估结果显示, 模型A对1p/19q共缺失的预测能力略逊于模型B、C, 但差异不大。1p/19q共缺失者TXLNA的mRNA表达水平低于非共缺失者(P<0.01)。结论 TXLNA是胶质瘤1p/19q共缺失特征基因, 其预测1p/19q共缺失的效能较高。沈亮 张楷 于震男 马杰 刘芳 2022中华神经外科杂志2022,38,12:1
3染色体1p/19q杂合性缺失与少突胶质细胞肿瘤临床病理特征的关系显示文摘目的 探讨染色体1p/19q杂合性缺失与少突胶质细胞肿瘤临床病理特征的关系.方法 采用荧光免疫原位杂交技术检测73例少突胶质细胞肿瘤1p/19q杂合性缺失,并随访观察预后.结果 少突胶质细胞肿瘤年轻患者(< 60岁)1p/19q缺失高于老年患者(>60岁,P<0.01);好发部位(额、顶、枕叶)的少突胶质细胞肿瘤1p/19q缺失与其他部位比较差异无统计学意义(P>0.05),与性别及肿瘤级别均无明显相关(P>0.05);少突胶质细胞肿瘤患者存在1p/19q联合缺失的中位生存时间为74个月,5年总生存率为72%;仅存在1p缺失者中位生存时间为43个月,5年总生存率为29%;而不存在1p/19q缺失者中位生存时间39个月,5年总生存率为18%.1p/19q联合缺失者中位生存时间长于仅存在1p缺失组,差异有统计学意义(P<0.05);且1p/19q缺失组中位生存时间也长于1 p/19q未缺失组,差异有统计学意义(P<0.05).仅存在1p缺失组中位生存时间虽然长于不存在1p/19q缺失组,但差异无统计学意义(Pp>0.05).结论 少突胶质细胞肿瘤1p/19q缺失与患者年龄明显相关,与患者性别、肿瘤发生部位及肿瘤级别无明显相关;少突胶质细胞肿瘤中染色体1p/19q杂合性缺失对患者的化疗敏感性及预后有关,可以作为分子分型的标准.徐姗 梅金红 王淳良 杨玄勇 王珊珊 2014中华实验外科杂志2014,31,12:1
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