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| 1 | TCP1 Modulates DWF4 Expression via Directly Interacting with the GGNCCC Motifs in the Promoter Region of DWF4 in Arabidopsis thaliana显示文摘Our previous studies indicated that TCP1 is a positive regulator of the brassinosteroid(BR) biosynthesis pathway by mediating the transcription of DWF4,one of the key BR biosynthetic genes in Arabidopsis thaliana.Whether TCP1 can directly bind to the promoter region of DWF4,however,has not been experimentally demonstrated.Here we provide our biochemical and genetic evidence that TCP1 mediates the expression of DWF4 by directly associating with the two GGNCCC motifs in the promoter region of DWF4.The expression levels of DWF4 are positively correlated to TCP1 abundance in planta.Electrophoretic mobility shift assays(EMSAs) using various synthetic DNA fragments suggest that the GGNCCC core sequence is critical for TCP1 binding.DNA sequences flanking the GGNCCC motifs are less important for the association of TCP1.Using DWF4p-GUS transgenic plants as an assay system,it is clearly indicated that these motifs are required for the positive regulation of DWF4 transcription by TCP1.More significantly,whole genome microarray analyses indicate that TCP1 can directly or indirectly regulate the expression of many other genes known to be important for normal plant growth and development. | Yahu Gao Dongzhi Zhang Jia Li | 2015 | Journal of Genetics and Genomics2015，42，7： | 14 |
| 2 | Genome-Wide Expression Pattern Analyses of the Arabidopsis Leucine-Rich Repeat Receptor-Like Kinases显示文摘像受体的蛋白质 kinases (RLK ) 是在房间房间和房间环境通讯起关键作用的 transmembrane 蛋白质的一个大组。基于细胞外的领域结构, RLK 被分类进超过 21 个亚科,充满白氨酸的重复 RLK (LRR-RLKs ) 在象 Arabidopsis 和米饭那样的植物在之中属于最大的亚科。在 Arabidopsis,有近似 223LRR-RLKs,但是哪个中的仅仅大约 60 个机能上地迄今为止被描述了。为了系统地在调整调查 LRR-RLKs 的 theroles,种生长,开发,和压力改编,我们产生了 promoter::GUS 为在 Arabidopsis 的所有 223 LRR-RLK 基因的转基因的植物并且在各种各样的发展舞台分析了他们的详细表达式模式。Theresults 提供 forfunctionally 阐明的珍贵资源这个大、必要的发信号的蛋白质亚科。 | Yunzhe Wu Qingqing Xun Yi Guo Jinghua Zhang Kaili Cheng Tao Shi Kai He Suiwen Hou Xiaoping Gou Jia Li | 2016 | Molecular Plant2016，9，2： | 13 |
| 3 | 干旱胁迫下枇杷叶片的转录组分析显示文摘分析干旱胁迫下枇杷叶片的转录组,挖掘功能基因并对其差异表达基因进行筛选和分析,为枇杷抗旱提供理论依据。利用新一代高通量测序技术测序,对测序结果进行de novo拼接、功能注释和ORF预测,将差异表达基因在COG、GO和KEGG数据库中进行比对注释。测序结果表明,获得转录本共88 530个,平均长度为740.64 bp,ORF41 748条。COG、GO和KEGG数据库将转录本分别划分为24,54个功能类别及291条代谢通路中。25 197个差异表达的基因在30条代谢通路中显著富集,与酶活性、激素合成代谢和信号转导等相关的差异基因积极响应枇杷干旱,其中双萜类、油菜素类固醇和类胡萝卜素3条生物合成途径中的差异基因呈现出较为一致的表达。采用实时荧光定量(qRT-RCR)对选取的差异基因进行验证,其中过氧化物酶、蛋白激酶byr2、丝氨酸苏氨酸蛋白激酶、脱落酸8'-羟化酶、吲哚-3-乙酰乙酸合酶相关基因上调表达,细胞色素P450 734A1基因下调表达。为枇杷提供了较为全面的基因信息和代谢途径数据,为干旱胁迫下枇杷分子调控机制的深入研究奠定了基础。 | 王丹 龚荣高 | 2017 | 华北农学报2017，32，1： | 5 |
| 4 | 水稻OsMPK15的cDNA克隆和转录水平分析显示文摘MAPK基因参与水稻的生物与非生物胁迫应答及生长发育过程,通过克隆水稻OsMPK15并初步研究其表达特性,为后续功能研究奠定基础。采用RT-PCR技术从日本晴水稻的根组织中克隆OsMPK15的cDNA编码区,并采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)技术分析OsMPK15在不同组织中以及不同非生物胁迫下的表达特性。结果表明,从日本晴水稻根组织中克隆的OsMPK15的cDNA编码区序列与生物信息学预测的结果一致,OsMPK15的第13-304位为丝氨酸/苏氨酸激酶结构域,属于水稻MAPK家族E组。qRT-PCR结果表明,该基因在水稻幼穗期各组织表达存在差异,主要在叶和叶鞘中表达。干旱和盐胁迫均可诱导OsMPK15在水稻幼苗根中表达量的上调,但表达模式具有不同的规律。同时,OsMPK15对3种胁迫相关激素ABA、JA和SA处理均产生应答,其中以ABA诱导OsMPK15表达上调幅度最大。 | 石佳 杨丹丹 葛慧雯 杜京尧 梁卫红 | 2018 | 生物技术通报2018，34，6： | 1 |
| 5 | 高粱SbRLK2基因的克隆及表达模式分析显示文摘LRR-RLK家族基因编码的类受体激酶,在植物、动物的抗病过程中起着重要作用,本研究从高粱转录组测序的差异表达序列中筛选到1条具有完整开放阅读框的LRR-RLK基因序列,设计特异性引物并克隆,通过生物信息学方法分析该基因的序列特征、编码蛋白的理化特性、结构域以及进化关系等,并应用荧光定量PCR技术分析该基因在高粱不同组织中的表达活性。结果表明,克隆得到的LRR-RLK基因开放阅读框为1 233 bp,命名为'SbRLK2'。SbRLK2编码410个氨基酸,具有典型的LRR型类受体蛋白激酶结构DNA仅与小米及二穗短柄草具有较高同源性:其编码的蛋白与禾本科LRR-RLKs具有较高的同源性。SbRLK2蛋白质理论分子量为45.017 kD,理论等电点为5.85;是稳定疏水性蛋白,具有1个跨膜结构,不存在信号肽;亚细胞预测该基因主要在细胞核(30%)、微体(29%)、和线粒体(10%)中发挥生物学作用。组织特异性表达分析发现,SbRLK2在高粱的花序和叶中高表达,表达量分别是根部的41.3倍和54.3倍。SbRLK2基因在抗病高粱品种中表达量在接种丝黑穗病菌24 h后大幅度增加,72 h后表达量有所回落,而在感病品种中的表达量则一直较低,表达差异极显著,说明该基因与高粱的抗丝黑穗病相关。本研究结果为SbRLK2基因对高粱抗病的响应模式研究提供了理论参考。 | 张瑶 陈磊 马乐 张朝政 乐超银 | 2020 | 分子植物育种2020，18，22： | 0 |
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