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1一种改进的蛋白质相互作用网络全局比对算法显示文摘改进更新匹配节点对的邻居节点得分之后的节点相似性得分计算方法,对匹配节点对的邻居节点相似性得分进行更新,综合使用节点间生物相似性得分、网络拓扑结构相似性得分和相互作用相似性得分对蛋白质相互作用网络进行匹配比对和迭代调整最佳匹配,以使得匹配结果更加贴近生物真实性.实验结果表明,给出的蛋白质相互作用网络全局比对算法整体上获得了更高的比对总分和检测到较多拥有共同基因本体的蛋白质对数.周钰乔 钟诚 2017小型微型计算机系统2017,38,4:1
2基于consR的并行图匹配方法显示文摘随着社交网络、生物网络规模的迅速扩大,能够快速、高效地实现对这些网络的匹配、查询等工作已经成为许多应用领域的迫切需求。给定两个网络图,图匹配的过程即为对图G1中的每个节点在图G2中找到唯一一个相对应的最为相似的节点,使得给定的两个图的匹配边的数量最多。文中基于大图匹配方法 consR,进行了两方面的优化:当图的节点数目较少时,优化了图G1、G2的相似性矩阵计算策略,从而使得图匹配的计算更加快捷;当图的节点数目较大时,针对匹配过程中最为耗时的步骤进行并行优化处理。实验结果表明,在与consR方法计算出的匹配结果保持一致的情况下,一定程度上缩短了图匹配计算时间。田豪爽 戴东波 张惠然 谢江 2015计算机技术与发展2015,25,7:0
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