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| 1 | 16S rRNA基因测序分析技术在食品污染菌监测中的应用显示文摘目的将16S rRNA基因测序分析技术应用于食品安全风险监测中非目标(相似、少见或非典型)致病菌的鉴定,为食源性疾病防控提供更多病原学证据。方法采集18份畜类、18份禽类和9份鱼类共45份生鲜样品,目标致病菌按照GB4789标准检测,非目标菌进行16S rRNA基因测序,将全长序列在GenBank中比对确定细菌种属,通过MEGA6构建细菌16S rRNA基因进化树,判定细菌种属间的亲缘关系。结果 45份生鲜样品中检出19株目标致病菌,包括沙门氏菌、空肠弯曲菌、单增李斯特菌和副溶血弧菌,而34株非目标菌16S rRNA基因全长序列能分别比对出13种细菌,其中8种19株菌属于致病或条件致病菌,包括霍乱弧菌、溶藻弧菌、结肠弯曲菌、奇异变形杆菌、粪肠球菌和铜绿假单胞菌,以及在深圳乃至省内首次报道的布氏弓形菌和海藻希瓦氏菌。结论深圳市售生鲜食品受到多种食源性致病菌污染,特别是非目标检出的致病菌,对此认为16S rRNA基因测序分析技术是一套有效的细菌监测适宜技术,能提高食源性疾病和食物中毒的防控水平。 | 胡鹏威 刘楚云 何娇明 张祥 袁月明 袁梦 段永翔 | 2019 | 现代预防医学2019,46,11: | 5 |
| 2 | 母婴感染单增李斯特菌16S rRNA检测及RAPD指纹图谱研究显示文摘目的研究母婴感染的单增李斯特菌分子生物学特性,并对其进行同源性分析,为流行病学调查提供参考。方法取母婴的血液等临床标本,做常规细菌培养及染色检查,使用VITEK2Compact全自动微生物分析仪进行鉴定,采用K-B纸片扩散法做药敏试验。提取分离菌的基因组DNA,采用通用引物PCR扩增16SrRNA片段,回收后测序,与GenBank中收录菌株的16SrRNA基因序列进行BLAST序列同源性比对。从200条随机引物中筛选10条随机引物(P1-P10),采用随机扩增多态性DNA(RAPD)技术对分离菌DNA进行电泳图谱的同源性分析。结果分离菌经常规鉴定为威氏李斯特菌。药敏试验显示分离菌氨苄西林/舒巴坦、头孢哌酮/舒巴坦、青霉素、红霉素、万古霉素、复方新诺明、利福平、左氧氟沙星、庆大霉素、环丙沙星均敏感,对头孢曲松与头孢他啶均耐药。PCR扩增分离菌16SrRNA全序列为1 471bp,经BLAST序列比对,与F2365菌株的同源性达99.4%,确定为单增李斯特菌。RAPD指纹图谱表明10条随机引物中有5条引物扩增的电泳图谱带型一致。结论 16SrRNA序列分析技术及RAPD指纹图谱分析表明母婴感染的单增李斯特菌株间同源,对母婴感染的预防与诊治有重要意义。 | 贾微 孙铭艳 安丰晓 王保强 陶元勇 | 2015 | 中国病原生物学杂志2015,10,6: | 4 |
| 3 | 1株非典型李斯特菌的鉴定分析显示文摘目的 对生禽肉中分出的1株可疑李斯特菌进行鉴定分析和总结,为不典型单核细胞增生李斯特菌的检测提供参考,避免造成漏检。方法 通过染色镜检,溶血试验,动力试验,李斯特菌显色平板上菌落形态观察对可疑菌进行初步鉴定,然后分别用梅里埃VITEK 2 Compact全自动细菌鉴定系统、梅里埃基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(matrix-assisted laser desorption ionization-time of flight mass spectrometry, MALDI-TOF MS)系统、16S rRNA序列分析和全基因组测序对可疑菌进行鉴定。结果 VITEK 2 Compact鉴定该菌为英诺克李斯特菌,MALDI-TOF MS、16S rRNA和全基因组测序鉴定该菌为单核细胞增生李斯特菌。结论 该菌为单核细胞增生李斯特菌。鉴定非典型分离株时,可能会被自动化系统误判,建议通过分子生物学方法或MALDI-TOF MS对李斯特菌分离株进行确认。 | 万圣 吕磊 叶承华 郑水萍 | 2023 | 中国卫生检验杂志2023,33,1: | 1 |
| 4 | 运用16S rRNA基因分析鉴定鲫鱼的致病菌显示文摘应用16S rRNA基因序列分析法分析鉴定从鲫鱼病变部位分离的未知菌种,证实这一方法运用于水产致病菌检测的可行性.使用设计的引物PCR扩增16S rRNA基因序列并测序,根据序列的同源性比对来鉴定菌种.结果显示:16个未知细菌样品中被鉴定出的菌株分别属于芽孢杆菌、气单胞菌、短波单胞菌、希瓦氏菌等,其中气单胞菌属于常见的致病菌.结论:16S rRNA基因序列分析是一种快速、精准、便捷的鉴定技术,可作为鉴定水产鲫鱼致病菌的重要手段. | 徐兵 王夏斌 | 2018 | 常熟理工学院学报2018,32,5: | 0 |
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