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| 1 | 三种海豚线粒体COI基因的序列分析显示文摘对瓶鼻海豚(Tursiops truncatus)、中华白海豚(Sousa chinensis)和糙齿海豚(Steno bredanensis)的线粒体DNA COI基因进行了测序分析。PCR产物约700bp。扩增产物直接测序,去除引物序列后分别获得643、618和618bp的核苷酸序列。碱基组成平均为,T:31·07%,C:26·13%,A:27·27%,G:15·50%,GC含量为41·63%,其中碱基G的含量明显较低。与Gen Bank中9种鲸的同源序列比对,去除部分端部序列后得到597个比对位点,包括141个简约信息位点,43个单突变子,无插入/缺失位点。12种鲸的种间序列差异较大,其序列变异度在2·1%~17·1%之间。597个比对位点编码199个氨基酸,其中有9个氨基酸发生改变,其中一个氨基酸突变可将齿鲸亚目和须鲸亚目分开。NJ系统树表明,海豚科形成单系类群,瓶鼻海豚和中华白海豚的亲缘关系较近。上述分析表明,COI基因可用于鲸类的种类鉴定和系统发育分析。 | 李莉好 喻达辉 黄桂菊 郭奕惠 梁沛文 江世贵 贾晓平 | 2007 | 动物学杂志2007,42,3: | 9 |
| 2 | 瓶鼻海豚、中华白海豚和糙齿海豚线粒体16S rRNA基因的序列分析显示文摘采用聚合酶链式反应(PCR)技术扩增瓶鼻海豚、中华白海豚和糙齿海豚的线粒体DNA16S rRNA基因,获得了大约600bp的片段。扩增产物直接测序,去除引物序列后分别获得515、519和529bp的核苷酸片段。碱基组成平均为T25·8%,C20·7%,A32·1%,G21·4%,GC含量为42·1%。与35种鲸豚类的55条同源序列比对,去除部分端部序列后得到497个比对位点,包括14个插入/缺失位点和127个变异位点(104个简约信息位点,23个单突变子)。序列比较表明,我国水域的瓶鼻海豚和中华白海豚与国外种存在一定的差异。NJ聚类分析结果与目前的主流观点基本相同,即须鲸亚目形成单系群而齿鲸亚目则为多系群,后者包括海豚总科、抹香鲸总科、喙鲸总科和淡水豚总科。其中抹香鲸总科与须鲸亚目聚合在一起,然后与海豚总科聚合再与喙鲸总科相聚。淡水豚总科为一并系群并处于整个鲸豚类的基部,其中恒河豚科是最早分化的一支。但在海豚总科中,鼠海豚科的江豚则与一角鲸科的白鲸聚合一起,与形态分类不同。 | 李莉好 郭奕惠 黄桂菊 江世贵 贾晓平 喻达辉 | 2007 | 南方水产2007,3,4: | 5 |
| 3 | Cytb、12SrRNA基因进化速度对构建系统进化树的影响(英文)显示文摘[目的]论证线粒体Cytb和12SrRNA基因不同进化速率影响构建的系统树拓扑结构。[方法]从GenBank下载了蛇亚目12科15种蛇线粒体全序列,提取Cytb和12SrRNA基因序列,选用GTR+I+G核苷酸替代模型,基于最大似然法,用PAUP4.0软件分别构建2个基因的系统关系树。[结果]在选用相同的软件、建树方法和研究物种的情况下,构建的系统树拓扑结构差异主要是因为线粒体Cytb和12SrRNA基因进化速率不同产生的。[结论]在分子系统进化研究中,要针对不同的研究物种和研究目的,选择合适的基因构建系统进化树。 | 王利利 彭建军 于冬梅 胡诗佳 高赛飞 傅美兰 刘曦庆 | 2011 | Agricultural Science & Technology2011,12,1: | 2 |
| 4 | Cyt b和12S rRNA基因进化速度对构建系统进化树的影响显示文摘[目的]论证线粒体Cyt b和12S rRNA基因不同进化速率影响构建的系统树拓扑结构。[方法]从GenBank下载了蛇亚目12科15种蛇线粒体全序列,提取Cyt b和12S rRNA基因序列,选用GTR+I+G核苷酸替代模型,基于最大似然法,用PAUP4.0软件分别构建2个基因的系统关系树。[结果]在选用相同的软件、建树方法和研究物种的情况下,构建的系统树拓扑结构差异主要是因为线粒体Cyt b和12S rRNA基因进化速率不同产生的。[结论]在分子系统进化研究中,要针对不同的研究物种和研究目的,选择合适的基因构建系统进化树。 | 王利利 彭建军 于冬梅 胡诗佳 高赛飞 傅美兰 刘曦庆 | 2011 | 安徽农业科学2011,39,9: | 2 |
| 5 | 白鱀豚系统发生位置的研究显示文摘白鱀豚是世界上现存的4种淡水豚之一.在20世纪初至70年代,白鱀豚曾被归属于亚河豚科或恒河豚科.新建的白鱀豚科在1978年发表以后,各国学者采用不同的方法对白鱀豚的系统发生位置进行了研究.近年的形态学、古生物学和分子系统学研究都表明淡水豚类不是一个单系群,恒河豚类比其他3类更接近系统树的基部,白鱀豚类、亚河豚类和弗西豚类代表了从进化为海豚总科的主干分出的3个早期支系,支持它们都是独立的科.在经历了将近一个世纪的研究之后,淡水豚类是并系的,淡水豚类的4个现生属分别属于4个独立的科,白鱀豚类至少是一个科级的阶元,这3点已经成为鲸类学家的共同认识. | 周开亚 | 2002 | 自然科学进展2002,12,5: | 1 |
| 6 | 鲸类保护遗传学研究进展显示文摘简要介绍了mtDNA的PCR直接测序、微卫星microsatelliteDNA分型、组织相容性复合体 (majorhis tocompatibilitycomplex,MHC)分析等DNA分子标记技术在鲸类遗传变异、种群结构、进化历史、个体识别。 | 刘珊 杨光 | 2002 | 动物学杂志2002,37,5: | 1 |
| 7 | 白鱀豚BDNF基因的扩增和序列分析显示文摘利用聚合酶链式反应,首次从白鱀豚基因组DNA中扩增和克隆到脑源神经营养因子的编码区。在该段序列中含有一个长为747bp的开放阅读框,无内含子,编码一个由248个氨基酸组成的蛋白质,预计分子量为27953.7道尔顿。其中包括由18个氨基酸残基组成的信号肽区,111个氨基酸残基组成的前肽区及119个氨基酸残基组成的成熟区。序列分析表明,白鱀豚脑源神经营养因子基因编码区的核苷酸序列与其它哺乳动物相似性超过90%,而与猪牛相似性相对较高(分别为95%和94.7%)。氨基酸序列比较发现,白鱀豚BDNF前体蛋白的氨基酸序列与其它哺乳动物具有94.5%~99.5%的相似性,显示了极高的保守性。通过邻接法进行的系统发生分析中,鲸目和食肉目的物种分别聚为单系;与其它哺乳动物相比,鲸类与有蹄类的牛和猪的亲缘关系相对较近,这与鲸类和有蹄类之间具有相对较近的亲缘关系相符。 | 郭丽 孙鹏 邹振芳 杨光 魏辅文 | 2006 | 兽类学报2006,26,1: | 0 |