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| 1 | Diversity characterization and association analysis of agronomic traits in a Chinese peanut (Arachis hypogaea L.) mini-core collection显示文摘Association mapping is a powerful approach for exploring the molecular basis of phenotypic variations in plants.A peanut(Arachis hypogaea L.)mini-core collection in China comprising 298 accessions was genotyped using 109 simple sequence repeat(SSR)markers,which identified 554 SSR alleles and phenotyped for 15 agronomic traits in three different environments,exhibiting abundant genetic and phenotypic diversity within the panel.A model-based structure analysis assigned all accessions to three groups.Most of the accessions had the relative kinship of less than 0.05,indicating that there were no or weak relationships between accessions of the mini-core collection.For 15 agronomic traits in the peanut panel,generally the Q t K model exhibited the best performance to eliminate the false associated positives compared to the Q model and the general linear model-simple model.In total,89SSR alleles were identified to be associated with 15 agronomic traits of three environments by the Q t K model-based association analysis.Of these,eight alleles were repeatedly detected in two or three environments,and 15 alleles were commonly detected to be associated with multiple agronomic traits.Simple sequence repeat allelic effects confirmed significant differences between different genotypes of these repeatedly detected markers.Our results demonstrate the great potential of integrating the association analysis and marker-assisted breeding by utilizing the peanut mini-core collection. | Huifang Jiang Li Huang Xiaoping Ren Yuning Chen Xiaojing Zhou Youlin Xia Jiaquan Huang Yong Lei Liying Yan Liyun Wan Boshou Liao | 2014 | Journal of Integrative Plant Biology2014，56，2： | 14 |
| 2 | 芝麻种质资源及相关分子生物学研究进展显示文摘芝麻是重要的优质传统油料作物,素有'油料皇后'的美称。我国拥有丰富的芝麻种质资源,深入研究、评价和有效利用芝麻种质资源是保护其遗传多样性、拓宽遗传基础进而提高芝麻产量和品质的关键。本文对芝麻种质资源的收集保存、鉴定评价、利用现状、品种选育概况及相关分子生物学研究进展进行综述,期望能对芝麻遗传及应用研究提供一些参考。 | 宫慧慧 赵逢涛 裴伟 孟庆华 | 2016 | 植物遗传资源学报2016，17，3： | 12 |
| 3 | 基于国外期刊英文文献浅析芝麻研究现状与发展趋势显示文摘对1984-2013年国外科技期刊发表的芝麻相关英文文献进行了收集、整理和分析,重点阐述了其年度变化、期刊类别和学科分布情况,综述了国外芝麻相关各学科领域研究现状,对今后我国芝麻种质资源、遗传育种、病害防控、高产栽培、精深加工等研究发展趋势进行了讨论与思考,为芝麻生产与加工技术研发以及专业文献数据库建设提供参考。 | 裴新涌 李春明 秦灵灵 | 2014 | 河南农业科学2014，43，5： | 7 |
| 4 | DNA分子标记在芝麻种质资源研究中的应用进展显示文摘DNA分子标记技术可应用于芝麻种质资源的遗传多样性分析、遗传连锁图谱构建、分子标记辅助育种、基因定位、品种鉴定及亲缘关系研究等方面。综述了芝麻主要DNA分子标记(SSR、EST-SSR、ISSR、RAPD、AFLP、SRAP等)的研究与应用现状,并对其进行综合评价,以期为今后开展芝麻品种溯源提供研究思路。 | 王贝贝 吴兴泉 刘楷影 朱立娜 | 2015 | 河南农业科学2015，44，8： | 4 |
| 5 | 芝麻产量相关性状与SSR标记的关联分析显示文摘为挖掘控制芝麻产量相关性状的基因位点,本研究利用多态性较高的72个SSR标记,对来自国内外96份芝麻品种资源进行遗传多样性和群体遗传结构分析,在此基础上采用TASSEL3.0软件的MLM(Mixed Linear Model)方法对株高、株蒴数、每蒴粒数、蒴长、蒴宽、千粒重、始蒴部位、空稍尖8个产量相关性状进行SSR标记的关联分析。结果表明:72个标记共检测出446个等位变异,变异范围为2~14个,平均6.2个;引物的多态性信息含量(PIC)变异范围为0.242 1~0.821 0,平均为0.540 7;基因多样性指数的变异范围在0.550 4~0.989 7,平均值为0.747 7。群体遗传结构分析将供试材料分为3个亚群。关联分析结果显示,51个标记位点与株高、蒴长、每蒴粒数、始蒴部位、空稍尖显著关联,各标记对表型变异的解释率在13.29%~32.08%。有5个位点在多个环境或均值下被重复检测到,是较为稳定等位变异,如与株高相关联的位点Hs1775-A 2、SIM201-A1;与每蒴粒数、始蒴部位和株蒴数分别关联的标记位点Hs1514-A1、SIM004-A3和SIM002-A1。 | 宫慧慧 张玉娟 宋华东 赵逢涛 孟庆华 | 2018 | 中国油料作物学报2018，40，2： | 2 |
| 6 | 芝麻物种特异性定性PCR方法的建立显示文摘为鉴别食品中芝麻成分的真实性,建立了一套芝麻物种特异性定性PCR方法。根据Sesamum indicum 2S albumin-like序列,设计了3对芝麻物种特异性定性PCR引物,并对引物的特异性、最适反应浓度和最适退火温度进行了筛选和优化,建立了芝麻物种特异性定性PCR检测方法。进一步对方法的灵敏度、检出限和对芝麻加工品的适用性进行了测试。结果显示,引物sesame-1F/1R的特异性最好,最优反应条件为引物浓度0.4μmol·L^(-1),退火温度60℃;该方法能够检测出芝麻质量分数为0.1%的样品,且对于芝麻油、芝麻酱2种性状的加工样品均有很好的扩增。该方法能够鉴别食品中芝麻成分,为食品质量安全监管提供了有力的技术支撑。 | 王庆平 王成 兰青阔 陈锐 赵新 沈晓玲 王永 檀建新 | 2017 | 天津农业科学2017，23，5： | 2 |
| 7 | 育成青稞品种的粒型性状的非条件与条件关联分析显示文摘籽粒粒型性状在优质高产大麦育种过程中是一种重要的目标性状。为了了解中国青藏高原青稞育成品种中籽粒性状的表型及遗传特征,本研究以60份青稞育成品种为材料,对其各个品种的粒长、粒宽和千粒重3个性状进行了考察,利用TASSEL软件中的MLM模型对籽粒的3个粒型性状进行了条件和非条件关联分析,并利用BSA方法对影响粒型性状的位点进行了发掘。结果表明,青稞育成品种间存在丰富的籽粒粒型变异。分别发现了8个、7个与13个SRAP标记与粒宽、粒长与千粒重呈显著关联,其中的6个SRAP位点在条件关联分析中也被发现,条件关联分析的结果表明青稞千粒重受粒宽的影响大于受粒长影响较小。相关性分析也得到相似结果。同时利用BSA方法,检测到了80个SRAP标记与粒型性状相关,其中的6个标记在非条件关联分析中找到。这些结果可以为青稞的籽粒粒型改良和高产青稞育种提供帮助。 | 刘新春 赖运平 袁金娥 巴桑玉珍 余毅 冯宗云 | 2017 | 分子植物育种2017，15，11： | 1 |
| 8 | 基于BSA-seq技术挖掘芝麻株高相关候选基因显示文摘为了进一步挖掘芝麻株高相关基因,为适机收芝麻新品种选育提供理论指导,以冀航芝1号和DW607为亲本构建F 2群体,并构建以株高为目标性状的极端混池,利用BSA-seq技术,采用ED和Δ(SNP-index或InDel-index)2种方法挖掘株高相关的染色体区段,注释区段内的基因信息,利用GO和KEGG等数据库分析注释基因的功能。结果发现,亲本之间共获得298634个SNP和76360个InDel,混池之间共获得24048个SNP和9630个InDel;基于SNP标记的ED方法关联到5个染色体区段,ΔSNP-index方法关联到3个染色体区段,两者的交集有3个;基于InDel标记的ED方法关联到5个染色体区段,ΔInDel-index方法关联到8个染色体区段,两者的交集有8个;4个染色体区段同时被SNP和InDel标记关联到,共注释到330个基因,比对到的前20个KEGG通路主要包括植物激素信号转导和能量代谢;GO富集结果表明,有18个基因参与生长素响应,可能是参与株高调控的关键基因。 | 崔彦芹 郭元章 侯少锋 李思达 关中波 徐桂真 | 2021 | 华北农学报2021，36，S01： | 1 |
| 9 | 基于重测序的41份芝麻种质资源全基因组序列分析显示文摘为揭示贵州不同生态区域芝麻种质全基因组突变类型,通过41份芝麻种质资源的全基因组重测序对单核苷多态性(Single Nucleotide Polymorphism,SNP)、小片段插入缺失(Insertion-deletion,InDel)和结构变异(Structural Variation,SV)等进行检测并注释,明确各突变在全基因组范围内的突变数量与位置信息,并基于SNP数据对41份芝麻种质资源进行种群结构分析。结果表明,共检测到SNP位点20940797个,InDel位点2989500个,SV位点138135个,其中SI_35材料的SNP、InDel、SV三个变异类型位点数量均为最多,分别为1032613个、144363个、5328个。群体结构分析结果显示,41份芝麻种质资源包含4个亚群;主成分分析结果显示,各芝麻种质在主成分1、主成分2之间的相互距离及位置基本符合进化树和群体机构的分析结果。本研究为贵州芝麻种质资源的研究提供了初步的进化框架。 | 宋成孝 舒中兵 邓宽平 金松 覃成 | 2022 | 种子2022，41，5： | 0 |
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