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116S rRNA基因克隆文库分析比较牙周炎患者和健康人口腔唾液微生物多样性显示文摘【目的】通过对同一地区、同一民族牙周炎患者和健康人的唾液微生物群落结构的分析,探寻牙周炎患者口腔微生物的多样性。【方法】采集甘肃东乡族自治县的东乡族牙周炎患者和健康人唾液各5例,分别记作DP(东乡牙周)和DH(东乡健康),提取细菌总DNA,构建16S r RNA基因克隆文库,测序后利用MOTHUR、MEGA 4.0、Clustal X 3.0等软件对测序结果进行分析。【结果】所有样本共检测出115个OTUs(DP 60,DH 75),归属于6个门,27个属。TM7是DP组特有的优势菌门。仅在DP组中检测到的优势菌属是梭菌属(Fusobacterium)、卟啉单胞菌属(Porphyromonas)、消化链球菌属(Peptostreptococcus)和TM7_genera。【结论】发现牙周炎患者与健康人口腔唾液微生物存在一定差异。其中,TM7、梭菌属和消化链球菌属在牙周病中的作用值得进一步研究。吴芳 李俊平 汪珍珍 王译彬 焦康礼 周建业 李志强 余占海 2016微生物学通报2016,43,6:14
2不同喂养方式婴儿肠道菌群分布特征显示文摘目的探讨不同喂养方式婴儿肠道菌群分布特征。方法62例30~120d健康婴儿按喂养方式分为:母乳喂养、国产奶粉喂养、进口奶粉喂养及混合喂养4组。采集婴儿新鲜粪便标本。均分成2份,一份通过厌氧法分离培养并计数肠道双歧杆菌;另一份提取总DNA,通过肠杆菌基因问共有序列一PcR指纹图谱法寻找不同组间差异条带并进行克隆、测序及序列比对分析。结果母乳喂养组与混合喂养组肠道双歧杆菌数[(9.10±1.33)cug;(8.62±1.35)cfu/g]高于国产及进口奶粉喂养组[(7.62±1.22)cfu/g;(7.32±0.80)cfu/g,t=3.23,P〈0.05];母乳喂养组与混和喂养组之间及2个奶粉喂养组之间差异无统计学意义。不同组间ERIC—PCR条带比对分析发现2条差异条带(A:1100bp;B:1000bp),其中A条带主要见于母乳、国产奶粉及混合喂养组,B条带主要见于进口奶粉组;测序及局部序列排比检索基本工具分析结果显示,A、B序列同源菌均为长双歧杆菌;序列编码产物A可能为糖代谢相关酶类;B可能为蛋白代谢相关酶类。结论母乳及混合喂养婴儿肠道中双歧杆菌数量多于奶粉喂养婴儿;国产奶粉喂养婴儿肠道中菌群分布更接近于母乳喂养婴儿。孙凤春 张文卿 吕锐 于红 陈云庆 2015中华实用儿科临床杂志2015,30,11:4
3应用PCR-DGGE技术分析鸭场水样样本中细菌群落结构显示文摘为了解贵州省部分鸭场环境中细菌群落结构多样性概况,试验采用变性梯度凝胶电泳(PCR-DGGE)技术对贵州省三穗县8个鸭场24份水样样本中细菌群落组成和优势菌群进行分析,并建立DGGE指纹图谱,细菌16S r DNA V3区特异性片段经DGGE凝胶分离、切胶、测序及Quantity One软件分析。结果表明:共有30条特异性条带,测序可见17条条带归属于变形菌门(Proteobacteria)细菌种属,3条条带属于厚壁菌门(Firmicutes)细菌种属,2条条带属于酸杆菌门(Acidobacteria)细菌种属,另外有8条条带未确定细菌种属。DGGE图谱可见条带5,11,12出现在1~6号鸭场水样样本中,表明该细菌种属为1~6号鸭场的优势菌属;而条带1,2,3均出现在1~8号鸭场水样样本中,表明这三种细菌种属均为8个鸭场的优势细菌种属。说明应用PCR-DGGE技术能够客观反映出鸭场环境中真实的细菌群落结构信息,鸭场环境中微生物多样性十分丰富。嵇辛勤 李世静 陈佳琪 雷云 陈强 2016黑龙江畜牧兽医2016,,3:2
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