|
|
|
题名
|
作者
|
年代
|
出处
|
被引量
|
| 1 | DNA条形码技术在大型红藻分子鉴定中的应用显示文摘本研究对浙江省枸杞岛贻贝养殖区大型海藻资源进行了调查,在形态学观察的基础上,选取93株红藻样品运用DNA分子条形码技术进行分子鉴定分析。采用的3个分子标记分别为rbcL(叶绿体基因组中1,5-二磷酸核酮糖羧化/加氧酶大亚基基因),COI(细胞色C氧化酶亚基I)和UPA(23 SrRNA基因片段,通用质体扩增区1基因片段。通过实验,我们共扩增出rbcL基因片段79条,扩增成功率为84.95%;共扩增出COI基因片段63条,扩增成功率为67.74%;共扩增出UPA基因片段76条,扩增成功率为81.72%。3个分子标记的测序成功率分别为:rbcL基因78.49%,COI基因29.03%,UPA基因72.04%。COI基因的扩增效率和测序成功率均低于rbcL和UPA基因。基于3个基因构建(Neighbor-joining,N—J)系统进化树表明,rbcL基因可以将红藻样品归类为5目,6科,7属,12种;COI基因可以将样品归类为4目,5科,5属,5种;UPA基因可以将样品归类为6目,7科,8属,11种。rbcL、COI和UPA3个基因结合可以将样品归类为7目8科11属21种。研究表明rbcL基因以及UPA基因较适合做为鉴定大型红藻的分子标记,C01基因做为红藻分子标记的潜力有待进一步开发和研究。 | 黄艳 孙彬 何培民 | 2018 | 基因组学与应用生物学2018，37，3： | 9 |
| 2 | 中国近海重要生态建群红藻真江蓠的群体遗传多样性显示文摘真江蓠(Gracilaria vermiculophylla)是中国近海潮间带生态系统结构组成和功能维持的重要支撑物种,但有关其群体遗传结构和多样性分布模式的研究目前仍较缺乏。本研究利用线粒体cox1序列对我国近海19个真江蓠地理群体进行了系统发育和群体遗传分析。461个长度为641 bp的cox1序列片段共含有21个多态位点,产生15个单倍型。基于cox1序列的系统进化分析、单倍型分析和主成分分析显示,19个真江蓠群体分化为南北两个类群,其中浙江嵊泗以北的13个群体形成北方类群,福建厦门以南的6个群体形成南方类群。遗传距离和分子方差分析显示真江蓠南北各类群内的遗传分化较小,南北类群间的遗传分化达到亚种水平。南北类群间的差异是我国近海真江蓠群体遗传变异的主要来源。 | 刘若愚 孙忠民 姚建亭 胡自民 段德麟 | 2016 | 生物多样性2016，24，7： | 5 |
| 3 | DNA条形码在淡水红藻中的应用评价——基于串珠藻科植物(英文)显示文摘研究采用4种DNA序列,分析了各片段序列特征以及在串珠藻科植物中种属水平的鉴定能力,包括线粒体COI-5P、cox2-3 spacer序列,以及叶绿体rbc L、UPA序列。结果表明,COI-5P、cox2-3 spacer、UPA以及rbc L序列的PCR扩增成功率分别为96%、100%、96%和98%。其中,COI-5P、cox2-3 spacer和UPA的片段大小符合标准DNA条形码的判定标准,即片段大小在300—800 bp,能够通过单对引物双向测序获得。系统发育分析的结果显示,这4种DNA片段在串珠藻属植物的鉴定中能够鉴定大部分的种类,但COI-5P、cox2-3 spacer以及rbc L序列均不能将两种中国特有种洪洞串珠藻B.hongdongense和长柄串珠藻B.longipedicellatum与弧形串珠藻B.arcuatum分开。在种水平的鉴定中,UPA基因的种间差异最大,显示了较好的分离效果,在串珠藻科植物的鉴定中可以作为一个标准的DNA条形码。 | 吉莉 冯佳 南方茹 陈乐 胡变芳 谢树莲 | 2017 | 水生生物学报2017，41，3： | 2 |
| 4 | 一种绿色真江蓠的分子鉴定显示文摘应用rDNA-ITS和线粒体cox1片段扩增序列,分析了厦门杏林湾的2株绿色未知江蓠(Gracilaria sp.;四分孢子体GR-1和雌配子体GR-2)及2株紫褐色真江蓠(G.vermiculophylla;四分孢子体PU-1和雌配子体PU-2).运用MEGA5.0估算了4个供试样本与GenBank中相似度最高序列的遗传距离并构建了系统发育树.ITS序列分析显示绿色未知江蓠GR-1、GR-2都与真江蓠聚集在一起,推断两者与真江蓠的亲缘关系非常近.cox1片段序列分析表明,绿色未知江蓠GR-1、GR-2和紫褐色真江蓠PU-1、PU-2都与索引的真江蓠聚集在相同类群.其中GR-1、GR-2与真江蓠JQ619142、JQ619143的相似度都为100%,它们之间的遗传距离范围在0.000~0.002,低于种群内部的遗传距离范围0.000~0.015,从分子水平上确定了绿色未知江蓠是真江蓠.联合ITS和cox1片段序列的分子标记适用于真江蓠的种质鉴定. | 钟晨辉 黄瑞芳 林琪 郑雅友 李雷斌 刘波 | 2014 | 应用海洋学学报2014，33，2： | 2 |
| 5 | 几种江蓠属海藻3个分子序列的系统学分析显示文摘分析了我国沿海几种常见的江蓠属(Gracilaria)海藻的18S rRNA基因、cox2-3间隔区以及RUBISCO间隔区的分子序列,并结合GenBank现有的相关数据进行了分子系统学关系分析,为江蓠属的系统进化和分类地位提供了新的佐证。结果表明,基于cox2-3间隔区、以及RUBISCO间隔区序列构建的MP(Maximum parsimony)进化树较为相似,而与基于18S rRNA构建的进化树略有不同。这主要是由于18S rRNA更为保守的原因;扁江蓠与脆江蓠在3个系统树中均聚合成支,显示了它们之间具有较近的亲缘关系;龙须菜与江蓠属海藻具有较远的遗传距离,在3个进化树中,龙须菜也均位于进化树的基部,单独成支,证实龙须菜并不隶属于江蓠属,且分化相对较早。 | 赵小波 逄少军 刘峰 | 2013 | 海洋科学2013，37，6： | 1 |
| 6 | 亮管藻(Hyalosiphonia caespitosa)的分子鉴定与生长特性研究显示文摘基于rbcL与COI基因序列分析,对分布在辽宁省大连海域的亮管藻(Hyalosiphonia caespitosa)进行了分子鉴定,并对其外部形态、生长过程、各月份生物量、成熟个体比例及成熟个体生物量/总生物量(R/T指数)的变化等进行了详细的研究.结果表明:①大连海域6个采集地点样本的rbcL与COI基因序列间无碱基差异,均与产自加拿大的亮管藻聚在同一进化支中,确定为亮管藻;②藻体直立,单生或丛生,线形圆柱状,有明显的主轴或分枝,颜色为红色或紫红色,质地胶质,固着器为盘状;③亮管藻生物量4月达到最大,平均生物量为3.483g/m^2.6月藻体全部成熟且均为四分孢子体.④亮管藻的生长周期为12月至次年6月,属于一年生海藻. | 王宏伟 李佳俊 卞瑶 王永宇 王昊林 | 2019 | 辽宁师范大学学报(自然科学版)2019，42，2： | 0 |
| 7 | 帚状江蓠质体UPA和线粒体COⅠ基因的序列比较及其系统进化分析显示文摘为研究海南省帚状江蓠(Gracilaria edulis)野生群体的种质资源、遗传多样性状况及红藻门物种间亲缘关系,采集海南省文昌和莺歌海潮间带的野生帚状江蓠,采用PCR扩增获得帚状江蓠质体UPA基因片段(质体23S rRNA V区域)和线粒体COⅠ基因片段,分别对其进行序列比较及系统进化分析。结果表明,UPA基因片段T、C、A、G的含量分别为26.2%、16.2%、30.3%、27.3%;COⅠ基因片段T、C、A、G的含量分别为39.2%、15.1%、27.6%、18.1%;UPA和COⅠ基因片段的A+T的平均含量分别为56.5%和66.8%。UPA基因片段长度为370bp,共检测出1种单倍型,无多态性位点;COⅠ基因片段长度为664bp,共检测出2种单倍型,3个多态性位点,均为简约信息位点。与UPA基因相比,COⅠ基因具有更高的变异度,更适合用于帚状江蓠遗传多样性的分析。基于UPA和COⅠ基因片段对帚状江蓠进行系统进化分析,两者结果一致,结合形态学分析表明,帚状江蓠应是江蓠属内独立的分支。 | 徐瑞 陈素文 段亚飞 张文文 王珺 周传朋 王芸 | 2023 | 海洋渔业2023，45，3： | 0 |
您所在的机构暂未开通此部分的功能，请联系管理员