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| 1 | 高温胁迫下茄子qRT-PCR内参基因筛选及稳定性分析显示文摘为筛选茄子(Solanum melongena L.)高温胁迫下稳定表达的内参基因,以不同茄子品系(种)为研究对象,利用实时荧光定量PCR技术对来自茄子高温胁迫转录组数据库8个候选内参基因(SmEF1a、SmEF2、Sm40s RPS29、Sm60s RPL24、SmTRX、SmCK I、SmDAHPS I、SmUCP)和SmActin在不同试验情况下进行表达检测,并结合GeNorm、Norm Finder、Best Keeper和ReFinder软件综合评价9个内参基因的表达稳定性。结果表明,在茄子热敏品系05-1和耐热品系05-4经高温处理不同时间的样品和不同组织样品以及10个耐热性不同的茄子品系(种)中,9个内参基因的表达丰度及稳定性存在差异;茄子热敏品系05-1和耐热品系05-4高温胁迫处理不同时间样品中表达稳定性最好的是SmEF1a和SmUCP;其不同组织中表达水平最稳定的是SmEF1a和SmTRX;高温胁迫下不同茄子品系(种)中以SmTRX和SmEF2的表达稳定性最好。综合来看,SmEF1a和SmTRX在所有茄子试验样品中的表达稳定性最好,而SmActin和SmCK I的表达稳定性较差。 | 庞强强 李植良 罗少波 陈日远 金庆敏 黎振兴 李德明 孙保娟 孙光闻 | 2017 | 园艺学报2017,44,3: | 19 |
| 2 | 罗汉果实时荧光定量PCR内参基因的选择显示文摘罗汉果为药食两用的传统中药,研究从罗汉果转录组中选取了Actin,18SrRNA,ubiquilin,ef1-α,ef1-β,Tubulin作为候选基因,通过实时荧光定量PCR,利用ge Norm,Norm Finder,Best Keeper,Delta CT,Ref Finder软件和方法对6个候选参考基因在不同罗汉果样品中的表达稳定性进行分析,首次筛选出了不同时期的有籽和无籽罗汉果果实中较理想的内参基因,结果发现18SrRNA在所有罗汉果样品中表达最稳定,是样品基因分析适合的内参基因,对采用qRT-PCR方法分析罗汉果基因表达中内参基因的选择具有指导作用,也为罗汉果生物合成途径基因及其他不同条件下基因差异表达研究提供参考,确保罗汉果基因表达分析结果的可靠性。 | 涂冬萍 莫长明 马小军 赵欢 唐其 黄杰 潘丽梅 韦荣昌 | 2015 | 中国中药杂志2015,40,2: | 14 |
| 3 | 三个耐冻性不同的马铃薯野生种中FAD2基因的克隆及表达分析显示文摘以3个耐冻性和冷驯化能力不同的马铃薯野生种Solanum commersonii、S.acaule和S.cardiophyllum为材料,利用RT-PCR技术克隆出不饱和脂肪酸合成途径中的关键酶基因ω-6脱氢酶基因(FAD2),分别命名为Cmm-FAD2(GenBank登录号为KF214782)、Aca-FAD2(KF214781)和Cph-FAD2(KF214783)。序列分析表明,该基因在3个马铃薯野生种中核苷酸长度都为1326 bp,编码441个氨基酸残基。3个野生种FAD2基因核苷酸序列和蛋白序列比对结果表明,在18个位点的差异核苷酸中有8个位点的差异导致对应的氨基酸残基变化,其中第11和第44氨基酸残基处,耐冻且有冷驯化能力的S.commersonii和S.acaule有相同的氨基酸,而冷冻敏感S.cardiophyllum的氨基酸却不同。二级结构预测结果表明S.commersonii和S.acaule的FAD2蛋白与S.cardiophyllum FAD2蛋白的α-螺旋、延伸链和随机卷曲存在明显差异。蛋白多序列比对和进化树分析表明,3个马铃薯野生种的FAD2基因与番茄的亲缘关系最近,其次是与马齿笕。qPCR分析表明,12 d冷驯化使FAD2基因在3个马铃薯野生种中都上调表达,S.commersonii和S.acaule的FAD2基因表达水平均高于S.cardiophyllum,且差异显著。 | 李飞 徐建飞 刘杰 段绍光 卞春松 Jiwan P.PALTA 金黎平 | 2014 | 作物学报2014,40,1: | 8 |
| 4 | 马铃薯突变体赤霉素代谢关键酶基因差异表达分析显示文摘为揭示马铃薯株高突变与赤霉素代谢途径关键酶基因的关系,以马铃薯株高突变株系4P2-9为材料,利用实时荧光定量PCR方法中的相对定量RT-PCR建立双标准曲线,以Actin基因为内参基因,对高原4号及其株高突变材料4P2-9中的赤霉素代谢相关基因的表达情况进行了检测。结果显示,4P2-9的株高及节间数显著低于对照材料(P<0.05),节间长度显著高于对照(P<0.05),赤霉素代谢的关键酶基因KS、KO和GID1表达量显著下调,分别为对照材料的0.725倍、0.657倍和0.890倍;GA20ox1和GA2ox1基因的表达量表现为上调,分别为对照材料的1.557倍和1.425倍。结果表明,赤霉素代谢过程中关键酶基因表达量的改变是造成4P2-9材料株高变化的原因之一,而GA20ox1和GA2ox1基因的表达量的上调是促使株高降低的主要因素。 | 石建斌 杨永智 王舰 | 2016 | 生物技术通报2016,32,1: | 4 |
| 5 | 马铃薯StCIPK基因家族鉴定及表达特征分析显示文摘钙调磷酸酶B样蛋白相互作用蛋白激酶(CIPK)是一种重要的Ca^(2+)离子信号传感器,在植物逆境胁迫应答和生长发育过程中发挥着重要作用。本研究利用同源比对方法从马铃薯全基因组中鉴定得到了27个StCIPK基因,并将其分为A~E 5个亚族。这些基因分布在马铃薯的12条染色体上,其编码蛋白长度为403~703 aa,等电点为5.03~8.20,分子质量为45 740.63~79 470.35 Da。该基因家族分为内含子缺失和内含子富集两类。亚细胞定位预测结果表明,StCIPK家族主要分布于细胞质和叶绿体。蛋白二级结构分析表明,StCIPK蛋白以α螺旋和不规则卷曲为主,β转角占比最少。StCIPK家族的启动子区域含有多个与抗逆境胁迫应答相关的应答作用元件。实时荧光定量PCR结果表明多数StCIPK基因能够强烈响应植物生长调节剂脱落酸处理。质量分数10%的聚乙二醇处理后,StCIPK09在24 h内均上调表达,StCIPK03在处理后6和12 h表达最高,分别是0 h的274.7和179倍。200 mmol·L^(-1)NaCl处理后6个基因相对表达量在2 h最高;StCIPK03在12 h响应强烈,为0 h的94.9倍。低温胁迫后6 h StCIPK03相对表达量为对照的286.4倍。本研究为马铃薯CIPK基因功能验证及利用分子育种进行抗逆遗传改良提供理论参考。 | 杨宏羽 李瑞瑞 何雷 余斌 师桂英 | 2022 | 植物生理学报2022,58,10: | 2 |
| 6 | 马铃薯抗低温胁迫研究进展显示文摘低温胁迫是影响马铃薯生长、导致马铃薯减产的重要环境因素,研究马铃薯的抗寒性具有重要意义。综述国内外马铃薯抗低温胁迫研究进展,包括抗低温胁迫的生理机制、耐寒品种的选育和驯化、马铃薯基因工程3个方面。 | 杨金辉 林萱 宋勇 | 2014 | 中国园艺文摘2014,30,10: | 1 |
| 7 | 叶面喷施水杨酸对马铃薯绿原酸含量及关键酶基因表达的影响显示文摘以二倍体马铃薯CIP-65为试验材料,用0.01、0.10、1.00 mmol/L 3种不同浓度的SA溶液对马铃薯叶片进行喷施处理,然后采用紫外分光光度法和q RT-PCR法对CGA含量和CGA合成关键酶—羟基肉桂酰辅酶A奎尼羟基肉桂转移酶HQT基因的表达水平进行检测,分析水杨酸(SA)对马铃薯叶片中绿原酸(CGA)含量及关键酶基因表达的影响。结果表明:低浓度SA(0.01mmol/L)处理后,马铃薯叶片中的CGA含量明显提高,HQT基因的表达也被激活,与绿原酸变化趋势一致;中等浓度(0.1 mmol/L)的SA处理也明显提高了马铃薯叶片中的HQT表达量和CGA含量,但CGA含量的增幅低于0.01 mmol/L的SA处理;高浓度(0.1 mmol/L)的SA处理在一定程度上促进了HQT基因的表达,但绿原酸的含量与处理前相比差异不大。因此,较低浓度的SA喷施处理能够促进马铃薯叶片中HQT基因的表达和CGA的积累。 | 杨慧芹 余万都 张丽颖 高冬丽 尚轶 马玲 | 2021 | 西南林业大学学报(自然科学)2021,41,5: | 0 |