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| 1 | 棘皮动物线粒体基因组的基因重排、分子标记及系统发生分析显示文摘棘皮动物(echinoderms)是海洋生境中所特有的无脊椎动物重要类群,本文全面比较分析了棘皮动物29个物种的线粒体全基因组。线粒体基因组主编码基因的分析结果显示,海胆纲Echinoidea和海参纲Holothuroidea物种的基因排列完全相同;海星纲Asteroidea物种之间的基因排列也完全相同,然而与海胆纲、海参纲相比,存在一个长片段的倒位。海百合纲Crinoidea的栉羽星Phanogenia gracilis和花形羽枝Florometra serratissima主编码基因的基因排列完全相同,地中海海羊齿和海百合Neogymnocrinus richeri与此相比,均存在一个蛋白质编码基因(nad4L)的易位。蛇尾纲Ophiuroidea真蛇尾目Ophiurida的3个科(阳遂足科Amphiuridae、辐蛇尾科Ophiactidae和栉蛇尾科Ophiocomidae)主编码基因的基因排列完全相同,而同属于真蛇尾目,另外一个科(真蛇尾科Ophiuridae)的白色真蛇尾Ophiura albida和灰色真蛇尾Ophiura lutkeni,与同目的前3个科相比,存在3个蛋白质编码基因(nad1、nad2和cob)的倒位。蛇尾纲蔓蛇尾目Euryalida的海盘Astrospartus mediterraneus,与真蛇尾目5个线粒体基因组相比,存在主编码基因的重排。棘皮动物线粒体单基因的变异位点特征显示,nad5、nad4和nad2基因是理想的分子标记基因。基于29个线粒体基因组的氨基酸序列,通过两种方法(邻接法和最大似然法)所构建系统发生树的拓扑结构完全一致。支持其下分的5个纲(蛇尾纲、海参纲、海胆纲、海星纲和海百合纲)均为单系群。线粒体基因组的数据支持棘皮动物动物在纲层次的亲缘关系为:(((海胆纲+海星纲)+海参纲)+蛇尾纲)+海百合纲,海百合纲作为棘皮动物中最为古老的类群,位于系统发生树的根部。基于线粒体基因组构建的系统发生树,支持所有的科均为单系群;综合系统发生树及主编码基因的基因重排分析,均支持真蛇尾目并非单系发生,真蛇尾目的有效性还值得今后深入研究。 | 申欣 田美 孟学平 程汉良 阎斌伦 | 2013 | 海洋学报2013，35，5： | 3 |
| 2 | 棘皮动物线粒体基因组研究进展显示文摘线粒体基因组是存在于真核生物线粒体中的重要遗传物质,可独立进行复制、转录和蛋白质合成。与核基因组相比,线粒体基因组具有长度相对较短、点突变率高等特点,被认为是研究生物系统进化的重要对象之一。近年来,在海洋生物研究中,线粒体基因组已被广泛应用于遗传分析、种质鉴定、分子标记挖掘以及系统进化研究等领域并取得了丰富的成果。棘皮动物在全球海洋中分布广泛,属无脊椎动物的高等类群,也是无脊椎动物向脊椎动物进化的重要节点生物。目前已有97个物种完成了线粒体基因组的测序。棘皮动物的线粒体基因组包含37个基因,其中ND6基因均分布于轻链。海胆和海星的基因排列顺序最为保守。棘皮动物在绝大多数情况下会使用ATG作为起始密码子,使用TAA和TAG作为终止密码子。根据现有的线粒体基因组数据和分析方法可以阐明绝大多数棘皮动物的分类与系统进化关系,但仍有一些物种的分析结果缺乏足够的可信度。棘皮动物线粒体基因组研究尚有很多方面仍需进一步开展。 | 孙景贤 赵谭军 尹文露 刘丽 常亚青 湛垚垚 | 2021 | 海洋通报2021，40，1： | 1 |
| 3 | Quantitative Evaluation of the Larval Density of Sea Potato Acaudina spp.with Mitochondrial Molecular Marker显示文摘The sea potato Acaudina spp.is a species of sea cucumber,belonging to the class Holothuroidea under Phylum Echino-dermata.It becomes blooming recently in the East Sea of China,causing serious ecological problems.However,until now there are no molecular data for its larval identification and population genetic analysis.In this study,we firstly screened a mtDNA fragment and demonstrated that it was the species-specific molecular marker for the identification of Acaudina spp.We then developed a quantitative polymerase chain reaction(PCR)method to evaluate the larval density of Acaudina spp.based on this molecular probe.Utilizing this method,we examined 116 plankton samples collected in four seasons from 13 stations along the coastal region in Fu-jian province,China.The results showed that the high larval density was presented at stations 1,2,and 3,which were near a quay in the coast.The larval density increased from April and reached the highest value in June and July,suggesting temperature might be the main environmental factor on the effects of its population distribution and density.Our work provides an important molecular tool for species identification and risk evaluation of a potentially invasive species. | LI Xiang WANG Guilin LI Yunfan LIU Wei LU Chao GUO Yuchen HUANG Wen WANG Jinhui DONG Bo | 2021 | Journal of Ocean University of China2021，20，3： | 0 |
| 4 | 2011年《中国科学·生命科学》回顾(英文)显示文摘Research in the field of life science is movingforward at a high pace.Science China Life Sciences istrying to reflect this trend as much as possible bypublishing research articles of notable originaldiscoveries. | 昌增益 | 2012 | 生物化学与生物物理进展2012，39，12： | 0 |
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