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1豆科树种刺槐、黄檀、合欢根瘤菌的数值分类及16S rDNA-PCR RFLP研究显示文摘测定了从豆科树种刺槐、黄檀、合欢根瘤中分离获得的 5 1个菌株与 18株参比菌株的唯一碳源、氮源利用 ,抗生素抗性 ,耐逆性和酶活性等 132个表型性状 ,并用MINTS软件进行聚类分析 .结果表明 ,全部供试菌株在 5 9%的相似性水平上分为两大群 :一个群为慢生菌群 ,另一群为快生和中慢生菌群 .在 85 .1%的相似性水平上分为 5个亚群 ,其中亚群 4不与任何已知参比菌株聚在一起 ,可能为新种 .同时 ,表型性状测定结果发现某些菌株对抗生素 (30 0 μg/mL)、温度 (40℃ )有较强抗性 ,大多数菌株能在较宽的pH值范围内生长 (pH 5~ 12 ) .这些具有抗逆特性的菌株为我国西部大开发中种植豆科植物接种适宜的根瘤菌提供了宝贵的种质资源 .在数值分类的基础上 ,又对 47株菌进行了 16SrDNA PCRRFLP分析 ,经SPSS软件聚类后 ,划分为 7个亚群 .在较大类群的划分上 ,与数值分类的结果有较好的一致性 .16SrDNA PCRRFLP遗传图谱共有 30种类型 .表型及遗传型分析结果表明 ,豆科树种根瘤菌具有极大的多样性 .图 2表 2参陈文峰 陈文新 2003应用与环境生物学报2003,9,1:16
2我国蚕豆根瘤菌的多样性和系统发育研究显示文摘采用数值分类、16S rDNA PCR-RFLP、IGS PCR-RFLP等方法对分离自我国11个省的50株蚕豆根瘤菌及11株参比菌株进行了表型测定和遗传型研究,同时对5株蚕豆根瘤菌的代表菌株进行了16S rDNA全序列测定.表型测定的结果表明,在80%的相似水平上供试菌株分为4个群,各群间存在地区交叉;16S rDNA PCR-RFLP的聚类结果与数值分类的聚类结果有很好的一致性;IGSRFLP反映的多样性更明显,形成的遗传群较多,可用于菌株间的鉴别.实验结果表明我国蚕豆根瘤菌具有极大的表型多样性和遗传多样性.系统发育研究结果表明,蚕豆根瘤菌的代表菌株均位于快生根瘤菌属(Rhizobium)系统发育分支,与R.leguminosarum USDA2370的全序列相似性达99.9%,说明蚕豆根瘤菌属于Rhizobium,系豌豆根瘤菌的一个生物型.路敏琦 李俊 姜昕 李力 沈德龙 曹凤明 2007应用与环境生物学报2007,13,1:15
3河北地区花生根瘤菌的系统发育多样性研究显示文摘【目的】了解中国北方地区花生根瘤菌的多样性状况。【方法】采用16SrDNAPCR-RFLP、16S~23SIGSPCR-RFLP和16SrRNA基因的序列分析方法对分离自河北地区的58株花生根瘤菌以及Rhizobium、Agrobacterium、Sinorhizobium、Mesorhizobium和Bradyrhizobium的参比菌株进行系统发育多样性比较分析。【结果】16SrDNAPCR-RFLP方法在细菌属水平上聚群良好;而16S~23SIGSPCR-RFLP则适于属和种水平上的聚群。3种方法在系统发育上得到基本一致的结果。其中有38株花生根瘤菌是与Bradyrhizobium关系密切的慢生菌株,并且与B.japonicum和B.liaoningense的关系最为接近,与有关中国西南地区和华中地区花生根瘤菌的报道结果相似。然而供试菌株中还存在6株快生和10株中慢生花生根瘤菌,其中快生菌在系统发育关系上接近R.yanglingense、R.mongolense和R.gallicum。【结论】河北地区的花生根瘤菌具有更大的多样性。刘杰 汪玲玲 汪恩涛 李颖 陈文新 2006中国农业科学2006,39,2:10
4常用DNA标记的评述及在花生上的应用显示文摘简要介绍了5种传统的、最常用的DNA分子标记(RFLP、RAPD、AFLP、SSR和SNP)的技术原理及它们的优缺点,也总结了TRAP这种新产生的分子标记的技术原理、优点及应用前景。综述了这几类分子标记在花生种质进化、遗传多样性分析、分子图谱构建及抗虫、抗病等方面的研究。利用SSR和RAPD标记能够发现野生种和栽培种多态性进而实现分子标记对花生的遗传多样性分析,可以将许多花生品种分为不同的品种群,能够对花生进行种质进化研究。RFLP和AFLP技术利于花生图谱构建,利用DNA中特定的限制性酶切位点上碱基对的改变及酶切位点之间的分子重排,可以发现花生品种间的DNA许多多态性位点,进而绘制分子标记图谱。AFLP技术在花生青枯菌和花生抗黄曲霉的研究方面有很大进展。RAPD技术在花生根瘤菌、花生线虫病等方面已有显著进展。最后对分子标记在花生育种中的应用前景进行了简单展望。刘峰 石运庆 闫彩霞 李春娟 毕玉平 单世华 2008分子植物育种2008,6,1:6
5分子标记技术在花生上的应用研究显示文摘主要介绍了RFLP、RAPD、SSR、AFLP等四种分子标记技术的原理、方法、特点及其在花生上的应用现状:①RAPD、SSR、AFLP都可以分析花生品种的多样性;②RAPD技术可以对杂交后代进行鉴定;③利用RFLP、RAPD技术绘制花生指纹图谱;④利用分子标记技术研究花生根瘤菌;⑤基于花生的RFLP、RAPD技术的改进。同时,展望了分子标记技术在花生上的应用前景,以期对花生的分子标记育种有所帮助。类承斌 万勇善 刘风珍 2005中国农学通报2005,21,8:5
6AFLP标记技术及其在花生上的应用研究显示文摘AFLP是检测DNA多态性的一种分子标记技术。综述了该技术原理、方法、特点及其在花生遗传多样性、抗性相关分子标记、根瘤菌、指纹图谱等方面应用的研究进展。郭静佩 王晓林 周鹏 周延清 2011河南农业科学2011,40,2:2
7四川攀西干热河谷区根瘤菌的多样性研究显示文摘采用数值分类、BOXAIR-PCR和16S rDNA PCR-RFLP方法,对分离自四川攀西干热河谷区11种豆科植物上的43株根瘤菌的表型和遗传多样性进行了研究.数值分类结果表明,攀西地区根瘤菌具有极大的表型性状多样性,在80%相似性水平上绝大多数供试菌株单独成群,能耐60℃(10min处理)的高温,在低温(10℃)或者低pH(4.0)条件下生长很差.与数值分类结果相比较,BOXAIR-PCR的分群结果更分散,说明供试菌株在遗传性状上也具有多样性.在数值分群基础上,选取15个代表菌株进行16S rDNA PCR-RFLP分析.结果表明,供试的15株代表菌株遗传差异明显,仅CCBAU61224与Rhizobium leguminosarum USDA2370T,CCBAU61303与Agrobacterium tumerfacienseIAM13129T具有相同的遗传图谱类型.数值分类和16S rDNA PCR-RFLP分析具有较好的一致性,BOXAIR-PCR适合于对根瘤菌种内菌株间的遗传多样性研究.胡清华 张小平 陈强 李登煜 陈文新 LINDSTROM K 2007应用与环境生物学报2007,13,5:1
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