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| 1 | 我国放线菌系统学研究历史、现状及未来发展趋势显示文摘放线菌系统学是以实现对放线菌进行分类、鉴定、命名为目标的基础学科,因此它是放线菌资源研究和开发利用的重要理论基础。自20世纪50年代起,我国放线菌系统学的奠基人阎逊初院士及同事们就开创了我国放线菌系统学的研究,经过近六十年、几代人的艰苦努力,我国放线菌系统学工作者在国际微生物系统学权威杂志(International Journal of Systematics and Evolutionary of Microbiology,IJSEM)发表的有关放线菌新分类单元的论文数量连续十年排名稳居前列,部分学者在国际上发表的某些改良的分类技术和新修订的分类系统等为国际同行所广泛采用,这些均标志着我国放线菌系统学研究在国际上已成为微生物系统学界的一支重要力量。本文全面介绍了我国放线菌系统学研究的发展历程,同时对其发展现状给予理性分析,并就未来发展方向进行了展望。 | 李文均 职晓阳 唐蜀昆 | 2013 | 微生物学通报2013，40，10： | 30 |
| 2 | 微杆菌属ZZJ4-1菌株的耐热尿酸氧化酶基因的克隆及重组酶性质显示文摘为了研究微杆菌Microbacterium sp.ZZJ4-1菌株的耐热尿酸氧化酶(Uox)的性质,克隆其基因(uox),得到1个894 bp的开放阅读框。该基因与多数已报道的uox无明显同源性,仅与球形节杆菌Arthrobacterglobiformis的uox有72%的同源性。将基因插入质粒pET-15b构成pET-15b-uox表达载体,转化至Escherichiacoli BL21(DE3)中诱导表达。对重组Uox的主要理化性质研究表明:该酶由大小约为35 kDa的亚基组成;其最佳反应温度和pH分别为30℃和7.5;在65℃以下和pH 8.5~11.0范围内稳定;以尿酸为底物的Km值为0.22 mmol/L;Ag+、Zn2+、Cu2+和SDS均能完全抑制酶活,Tween 20、Tween 80和Triton X-100对酶活有一定的促进作用。该重组酶的耐热性是目前报道的重组Uox中最好的,这一特性有利于其在诊断治疗中的开发应用。 | 张鹏程 卢向锋 李倩延 林小清 刘辉 马晓航 | 2012 | 生物工程学报2012，28，7： | 6 |
| 3 | 碱性木聚糖酶在毕赤酵母的表达及酶学性质研究显示文摘将教酒链霉菌L1105第10家族碱性木聚糖酶基因去除纤维素结合域(CBD)后将功能结构域基因xynAe SC克隆到毕赤酵母表达载体。经筛选得到重组工程菌GS1153-20,用甲醇诱导后产酶活力达到最高683±9U/m L。结果表明,重组木聚糖酶的最适p H为7.2,且在p H 6.2~8.6有较高的相对酶活;其最适温度为70℃,40~60℃时相对酶活力都在70%以上;重组酶Xyn Ae SC以燕麦木聚糖为底物时,酶活力最高,相对酶活力为桦木的259.7%±10.7%;对甘蔗渣木聚糖的酶活力最低,只有对桦木木聚糖酶活的16.0%±1.5%。研究表明,碱性木聚糖酶基因成功地在毕赤酵母中表达,且去除CBD域后,其酶学性质并未改变。 | 熊科 杨玉焕 闫子祥 王晓玲 李秀婷 | 2015 | 食品与发酵工业2015，41，3： | 3 |
| 4 | 地中海拟无枝酸菌“硝酸盐效应”的研究进展显示文摘地中海拟无枝酸菌'硝酸盐效应'是指发酵基质中的硝酸盐在一定浓度下大幅度促进该菌合成利福霉素,并对初级代谢产生多种影响的现象。针对该效应,本实验室开展了多年的研究,阐明硝酸盐主要通过两个方面促进利福霉素的生物合成:一方面,硝酸盐增加利福霉素生物合成前体的供给(如UDP-葡萄糖、AHBA、丙二酰Co A以及甲基丙二酰Co A等),尤其是通过抑制体内脂肪酸的合成来保障利福霉素前体丙二酰Co A的供给;另一方面,硝酸盐提升利福霉素生物合成酶基因的表达。因此,在充足的利福霉素前体和合成酶系的协同效应下,菌体生成大量的利福霉素。进一步的工作将围绕'硝酸盐效应'的信号分子、信号转导途径以及相关基因的表达调控和翻译后修饰机制等方面展开。 | 邵志会 赵维 王颖 丁晓明 王金 姜卫红 赵国屏 | 2015 | 生物工程学报2015，31，6： | 3 |
| 5 | 微生物药物产生菌功能基因组学研究进展显示文摘微生物药物是一类化学结构和生物活性多样的次级代谢产物,近年来其多个产生菌基因组序列已经被测定完成,在此基础上开展的功能基因组研究方兴未艾,并在抗生素生物合成、形态分化、调控、系统发育与进化以及次级代谢产物挖掘等方面有着新的发现,展现出广阔的研究前景。本文重点阐述了四种重要抗生素产生菌功能基因组学的研究现状,集中于青霉素高产的遗传机制、红霉素产生菌红色糖多孢菌基因组与转录组分析、链霉素产生菌灰色链霉菌中A因子调控网络、阿维菌素产生菌作为次级代谢物异源表达的通用宿主与超高产菌株构建以及新型天然产物的挖掘等研究内容,同时简要介绍了当前我国微生物药物产生菌基因组学的研究概况,并从基础与应用两个角度对其未来发展趋势进行了展望。 | 吴杭 白林泉 周秀芬 邓子新 | 2013 | 中国抗生素杂志2013，38，3： | 2 |
| 6 | S-丙二酰转移酶基因失活对地中海拟无枝酸菌产利福霉素的影响显示文摘为提高利福霉素的产量,构建了S-丙二酰转移酶基因失活的地中海拟无枝酸菌。利用融合PCR构建S-丙二酰转移酶基因的同源重组载体,通过电击转化导入到地中海拟无枝酸菌中,使之发生同源重组,以安普霉素为标记,筛选了S-丙二酰转移酶基因失活菌株,并对比了突变菌株与原始菌株的利福霉素SV产量。成功构建了S-丙二酰转移酶基因的同源重组载体,获得了地中海拟无枝酸菌突变株A.mediterranei △fab D,失活菌株的利福霉素SV产量为168.08 mg/L,比原始菌提高了9.94%。S-丙二酰转移酶基因的失活,弱化了突变菌株脂肪酸的合成,强化了利福霉素的合成。 | 何思雨 成文玉 金红星 | 2017 | 生物技术通报2017，33，8： | 1 |
| 7 | A systematic study of the whole genome sequence of Amycolatopsis methanolica strain 239T provides an insight into its physiological and taxonomic properties which correlate with its position in the genus显示文摘The complete genome of methanol-utilizing Amycolatopsis methanolica strain 239T was generated,revealing a single 7,237,391 nucleotide circular chromosome with 7074 annotated protein-coding sequences(CDSs).Comparative analyses against the complete genome sequences of Amycolatopsis japonica strain MG417-CF17T,Amycolatopsis mediterranei strain U32 and Amycolatopsis orientalis strain HCCB10007 revealed a broad spectrum of genomic structures,including various genome sizes,core/quasi-core/non-core configurations and different kinds of episomes.Although polyketide synthase gene clusters were absent from the A.methanolica genome,12 gene clusters related to the biosynthesis of other specialized(secondary)metabolites were identified.Complete pathways attributable to the facultative methylotrophic physiology of A.methanolica strain 239T,including both the mdo/mscR encoded methanol oxidation and the hps/hpi encoded formaldehyde assimilation via the ribulose monophosphate cycle,were identified together with evidence that the latter might be the result of horizontal gene transfer.Phylogenetic analyses based on 16S rDNA or orthologues of AMETH_3452,a novel actinobacterial class-specific conserved gene against 62 or 18 Amycolatopsis type strains,respectively,revealed three major phyletic lineages,namely the mesophilic or moderately thermophilic A.orientalis subclade(AOS),the mesophilic Amycolatopsis taiwanensis subclade(ATS)and the thermophilic A.methanolica subclade(AMS).The distinct growth temperatures of members of the subclades correlated with corresponding genetic variations in their encoded compatible solutes.This study shows the value of integrating conventional taxonomic with whole genome sequence data. | Biao Tang Feng Xie Wei Zhao Jian Wang Shengwang Dai Huajun Zheng Xiaoming Ding Xufeng Cen Haican Liu Yucong Yu Haokui Zhou Yan Zhou Lixin Zhang Michael Goodfellow Guo-Ping Zhao | 2016 | Synthetic and Systems Biotechnology2016，1，3： | 1 |
| 8 | 林可霉素基因工程研究的新进展显示文摘林可霉素是一种由林可链霉菌产生的林可酰胺类抗生素,主要用于防治由革兰阳性菌引发的感染。近年来,随着林可链霉菌基因组测序的完成,林可霉素基因工程研究进展迅速。本文就近期林可霉素生物合成及其调控的研究进行总结,并重点介绍在结构基因、调控基因、抗性基因和代谢前体基因的改造方面实现林可霉素定向高产,以及新型林可霉素衍生物创制的新进展。 | 蔡新露 许婉莲 许玉荣 吴杭 张部昌 | 2022 | 中国抗生素杂志2022，47，6： | 0 |
| 9 | AMETH_3452基因在拟无枝酸菌中的系统发育分析显示文摘AMETH_3452基因是拟无枝酸菌(Amycolatopsis)中发现的一个放线菌的保守基因,位于拟无枝酸菌属中的环形基因组中间位置。为进一步探究该基因的序列特征并挖掘该基因的应用潜力,本研究将该基因构建在pET28载体上,在大肠杆菌中进行表达,使用蛋白预测网站进行了二级结构和保守区分析,对其直系同源基因在拟无枝酸菌属进行了系统发育分析。AMETH_3452蛋白在大肠杆菌的上清液中可溶性表达。该基因在拟无枝酸菌属的核酸同源性为79.23%~99.02%,在300~500 bp的序列一致性较高。该蛋白序列共269个氨基酸,作为分子标记在76个拟无枝酸菌中进行系统发育分析后发现,东方拟无枝酸菌分支和甲基拟无枝酸菌分支稳定性高,同时可将东方拟无枝酸菌分支分成AORIS和AMEDS 2个可稳定的分支。以上研究将为AMETH_3452基因作为检测环境、动物或临床上的放线菌或系统发育应用研究提供依据。 | 唐标 吴静 郑华军 赵维 杨华 | 2021 | 浙江农业科学2021，62，4： | 0 |
| 10 | 筛选地中海拟无枝酸菌无痕基因敲除菌株的简便方法显示文摘将抗生素抗性基因作为标记筛选无痕基因敲除菌株比较费时,因而建立筛选无痕基因敲除菌株的简便方法。通过敲除茄红素生物合成途径中第一个反应的酶编码基因dxs(1-脱氧-D-木酮糖-5-磷酸合酶基因),获得白色地中海拟无枝酸菌突变菌株,以此菌株为受体菌,对S-丙二酰转移酶基因(mtf)进行无痕敲除。针对菌落本身携带颜色的地中海拟无枝酸菌(橘红色),利用茄红素合成酶基因dxs无痕敲除获得了白色菌株,在此基础上进行mtf的无痕敲除。以茄红素生物合成途径中任意一个反应的酶编码基因作为标记,很容易筛选得到无痕基因敲除的突变菌株。 | 张巧巧 金哲男 金红星 | 2018 | 微生物学杂志2018，38，4： | 0 |
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