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1基于对接的植物激素3D-QSAR和分子动力学模拟显示文摘采用分子对接和分子动力学(MD)模拟方法研究植物雌激素类化合物与雌激素受体的相互作用机制,对接结果表明,雌激素受体活性位点的疏水和氢键作用是影响植物雌激素化合物活性的主要原因,植物雌激素类化合物主要与氨基酸残基GLU353、ARG394、HIS524和LEU525之间形成氢键.然后以对接后的分子构象进行分子结构叠合,结合比较分子力场分析(CoMFA)和比较分子相似性指数分析(CoMSIA)方法建立了3D-QSAR模型.CoMFA模型的交叉验证相关系数(Q2)和非交叉验证相关系数(R2)值分别为0.676和0.994,标准估计误差SEE和F统计量分别为0.143和342.115;CoMSIA模型的Q2=0.565,R2=0.972,SEE=0.286和F=111.480.结果表明,CoMFA和CoMSIA模型具有良好的稳定性和预测能力,可为植物雌激素的雌激素效应研究提供有力的支持.采用MD模拟研究了小分子和受体蛋白的动力学情况,为对接结果的合理性提供了验证.蒙延娟 易忠胜 艾芳婷 张爱茜 2014环境化学2014,33,6:3
2计算毒理学在内分泌干扰物筛选上的应用和展望显示文摘内分泌干扰物通过干扰内分泌系统导致多种疾病,如生殖疾病、肥胖症甚至癌症。然而,面对环境中大量潜在的内分泌干扰物,传统的体外、体内评估方法由于成本高、耗时长等问题,难以实现内分泌干扰物的高通量筛查。计算毒理学逐渐发展成为被美国环保局(Environmental Protection Agency,EPA)、经济合作与发展组织(Organization for Economic Co-operation and Development,OECD)等机构所推荐的内分泌干扰物筛选与预测方法。本文综述了计算毒理学在内分泌干扰物筛选上的进展,主要包括分子对接和分子动力学模拟的应用,并对有害结局路径(adverse outcome pathway,AOP)的方法进行介绍和展望。陈钦畅 谭皓月 史薇 于红霞 2017生态毒理学报2017,12,3:2
3Photoelectron spectroscopy of terpenoids and prediction of their rate constants in atmospheric oxidation reactions显示文摘The electronic structures of six mono-terpenoids and two of their oxygenated derivatives were studied by He I photoelectron spectroscopy(PES).The observed bands were interpreted on the basis of empirical arguments and theoretical calculations.The first vertical ionization potentials for β-pinene,α-terpinene,terpinolene,γ-terpinene,limonene,myrcene,citral,and terpinene-4-ol were determined to be 8.73,7.57,8.26,8.30,8.53,8.68,8.71,and 8.77 eV,respectively.Most of these values have not been determined by PES before.The correlations of the first vertical ionization potentials of these compounds to the natural logarithms of rate constants for their reactions with the radicals OH,NO3,and O3 were determined.The correlation coefficients for their reactions with OH,NO3,and O3 were 0.97,0.91,and 0.95,respectively.This method is a powerful technique for predicting the rate constants for the atmospheric oxidation reactions of terpenoids.WANG XiaoPeng TONG ShengRui GE MaoFa WANG WeiGang WANG DianXun 2010Chinese Science Bulletin2010,55,35:0
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