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    题名 作者 年代 出处 被引量
1尾叶紫薇与紫薇F_1代群体主要表型性状与SSR标记的连锁分析显示文摘以母本尾叶紫薇与父本紫薇‘香雪云’及杂交F1代192株为试材,对株高、地径、叶长、叶宽及叶面积5个性状在群体中的遗传变异进行了统计和分析。结果表明:150对SSR引物筛选出F1群体亲本有多态性的引物对50个;5个表型性状在群体中呈连续分布,与其正态分布曲线拟合较好,并且彼此之间具有相关性。采用单因素方差分析法进行SSR分子标记和性状的连锁分析得到:SSR3-153、SSR40-131、SSR40-137与紫薇的叶宽显著性相关,贡献率分别为25.5%、12.1%、11.6%;SSR34-158、SSR34-161与紫薇的叶长显著性相关,贡献率分别为7.8%、9.1%;SSR10-172与紫薇的株高和地径显著性相关,贡献率分别为15.7%、10.3%。贺丹 唐婉 刘阳 蔡明 潘会堂 张启翔 2012北京林业大学学报2012,34,6:19
2东北雅罗鱼微卫星分子标记的筛选及特征分析显示文摘通过磁珠富集法筛选东北雅罗鱼的微卫星分子标记。采用限制性内切酶Sau 3AI对东北雅罗鱼基因组DNA进行酶切,选取400~900 bp的片段进行PCR全基因组扩增,并利用生物素标记的(CAG)8、(TGA)8、(AGAT)6、(GATT)6 4个探针进行微卫星片段的富集。将得到的片段与T载体连接后转入DH5α大肠杆菌中,然后以SaulA为引物对长出的菌落进行PCR扩增,挑取扩增后片段大小符合条件的菌落送生物公司测序。结果表明:1 416个阳性克隆中有1 047个克隆含有重复次数大于5次的微卫星序列,完美型占67.99%,非完美型为15.31%;混合性标记占16.70%。从中选出160个微卫星序列设计105对引物并合成,经过筛选,56对引物可扩增出清晰条带,其中23对具有多态性。选取18对多态性引物对达里湖东北雅罗鱼群体进行扩增,结果显示等位基因数为3~11,多态信息含量(PIC)为0.207 7~0.882 0,67%(12对/18对)的位点处于高度多态水平(PIC>0.5)。刘金亮 常玉梅 徐丽华 刘春雷 梁利群 韩国苍 高玉奎 柳玉海 2011华北农学报2011,26,1:16
3甜叶菊微卫星富集文库的构建与多态性标记的筛选显示文摘甜叶菊是我国一种重要特种经济作物,其分子标记相关遗传背景研究甚少。本研究基于生物素与链霉亲和素的强亲和性原理,用链霉亲和素顺磁颗粒捕捉人工合成的标记有生物素的寡核苷酸探针(AG)15,间接筛选出含有甜叶菊基因组微卫星序列的DNA酶切片段,将筛选得到的片段连接到pUC-T载体中,构建甜叶菊微卫星序列的富集文库。挑取354个克隆进行菌落PCR检验,从中筛选出158个阳性克隆进行测序。结果表明,134个(84.81%)克隆中含有微卫星序列,其中完美型85个(63.43%)、非完美型15个(11.19%)、复合型34个(25.38%)。根据微卫星序列共设计出71对微卫星引物,其中62对能扩增出稳定的条带。利用24个甜叶菊品系对这62对引物的遗传多样性的分析表明,有16个位点表现出多态性,等位基因数为2~8个,平均每个位点扩增得到4.5个等位基因,多态性信息含量在0.3163~0.7595之间,观测杂合度(Ho)与期望杂合度(He)的范围分别为0.2174~0.9167与0.3555~0.8076。通过聚类分析,将甜叶菊分为大小叶两大类。本研究开发出的微卫星标记可为甜叶菊的分子遗传育种提供有效的遗传标记。秦海峰 龙宁 吴建国 石春海 2014作物学报2014,40,3:11
4磁珠富集法筛选兰州鲇微卫星分子标记显示文摘兰州鲇(Silurus lanzhouensis)又名黄河鲶,隶属于鲇形目(Siluriformes)、鲇科(Siluridea)、鲇属(Silurus),是我国黄河中上游特有的大型经济鱼类。肉质细嫩、少刺、味道鲜美,具有很高的营养价值,俗有“黄河鲶鱼活人参”之称[1]。但由于过度捕捞、水利工程等因素,兰州鲇野生种群数量日益减少,已被《中国物种红色名录》列为濒危物种[2]。魏大为 连总强 吴旭东 王发新 肖伟 张利平 2014水生生物学报2014,38,4:10
5扁吻鱼微卫星分子标记的筛选及特征分析显示文摘通过磁珠富集法筛选扁吻鱼的微卫星分子标记。利用限制性内切酶Sau3AI对扁吻鱼的基因组DNA进行酶切,并选取片段大小在250~750 bp间的片段,利用PCR技术进行全基因组扩增,采用生物素标记的(CA)8探针对微卫星片段进行富集。富集后的片段与T载体连接后利用DH5α大肠杆菌进行转化,然后以Sau3AI为引物对菌落进行PCR扩增,扩增后选片段大小符合条件的菌落挑取至测序板,进行测序。结果表明:PCR筛选共获得563个阳性克隆,其中测序192个阳性克隆后发现有53个微卫星序列;序列分析表明,完美型占67.92%,非完美型为22.64%;混合性标记占9.43%。根据测序结果设计微卫星引物24对,经PCR扩增筛选,琼脂糖凝胶电泳结果显示,其中22对引物可扩增出清晰的条带,其中具有多态性的13对。利用13对多态性引物对扁吻鱼野生群体进行扩增,PCR扩增结果显示,等位基因数为3~6,多态信息含量(PIC)为0.625 3,12个位点处于高度多态水平(PIC>0.5)。郝卓然 梁利群 常玉梅 任波 2012华北农学报2012,27,B12:4
6荒漠植物红砂(Reaumuria soongarica)基因组微卫星富集文库的构建及特性显示文摘采用磁珠富集法构建了红砂(Reaumuria soongarica)基因组微卫星富集文库,通过测序结果对文库的特性进行了分析。结果表明:在获得的13 922条微卫星序列中完美型占88%,非完美型10%,混合型2%。微卫星重复基元显示5种类型,以三碱基基元(GGT)n、(TGG)n、(ACC)n最多,占总数的60.7%;其次为二碱基基元,主要是(AC)n、(GT)n、(CA)n,占38.6%;这5种微卫星重复基元的重复次数多集中在5~10。通过对随机挑选的100条微卫星序列设计引物,并以遗传距离和地理距离较远个体的基因组为模板进行扩增筛选,可有效扩增的引物为62对,并进一步测序筛选获得了12对多态性微卫星引物。磁珠富集法是开发红砂基因组微卫星序列的一种高效、可行的方法,构建的微卫星文库效率较高,富集量大,重复基元类型丰富,为红砂遗传进化和种质资源保护提供了可靠的数据支持和高效的分子遗传标记。殷恒霞 石勇 张雯 燕霞 马小飞 2016中国沙漠2016,36,2:3
7花卉遗传连锁图谱构建与QTL定位的研究进展显示文摘近年来,随着分子生物学特别是分子标记技术的飞速发展,花卉的育种工作开始由传统的杂交育种逐渐转变为分子育种。而建立遗传连锁图谱、定位QTL等分子标记辅助育种已经成为近年植物分子育种的研究热点之一。目前,遗传连锁图谱的构建多集中在农作物及林木领域,花卉的遗传连锁图谱还处于发展阶段。构建高密度的遗传连锁图谱和精细的QTL定位能够加快花卉的育种研究。本研究综述了国内外花卉遗传连锁图谱构建的研究进展,包括构建遗传连锁图谱所需要的亲本和分离群体,主要使用的分子标记方法,花卉遗传连锁图谱中的QTL定位,并对花卉遗传连锁图谱构建中存在的问题进行了探讨,对今后的发展提出了一些建议并对研究前景进行了展望。贺丹 雷雅凯 王政 刘艺平 张曼 何松林 2017分子植物育种2017,15,3:1
8基于高密度遗传图谱的水稻卷叶QTL定位显示文摘水稻叶片适度卷曲能提高光能利用率,增加产量。本研究以0738-28-1B (生育中后期叶片卷曲)和岗46B (叶片平展)为亲本构建大小为139个单株的F2作图群体,利用ddRADseq技术得到32 960个高质量多态性SNP、Indel标记,构建了包含1 196个bin标记的高密度遗传图谱,相邻bin之间的平均距离为1.12 cM。结合亲本和群体剑叶卷曲度表型数据,对卷叶性状进行QTL定位,检测到2个QTL位点。qRL-3定位在第3染色体8.24~10.13 Mb区间上,表型贡献率为9.76%;qRL-9定位在第9染色体19.69~19.84 Mb区间上,表型贡献率为25.40%,被认为是控制叶片内卷的主效位点,增效位点均来自亲本0738-28-1B。本研究结果为主效QTL位点的进一步精细定位提供了依据,同时为理想株型育种和超高产育种提供了新的卷叶基因资源。莫春红 李加胜 荆豪争 刘勤 赵许兵 赵冰峰 龚晓平 2019分子植物育种2019,17,1:0
9QTL Analysis of Anoxic Tolerance at Seedling Stage in Rice显示文摘Coleoptile lengths of 7-day-old seedlings under anoxic stress and normal conditions were investigated in two permanently segregated populations and their parents in rice (Oryza sativa L.). Using anoxic response index, a ratio of coleoptile length under anoxic stress to coleoptile length under normal conditions, as an indicator of seedling anoxic tolerance (SAT), QTLs for SAT were detected. Two loci controlling SAT, designated as qSAT-2-R and qSAT-7-R, were detected in a recombinant inbred line (RIL) population (247 lines) derived from a cross between Xiushui 79 (japonica variety) and C Bao (japonica restorer line). qSAT-2-R, explaining 8.7% of the phenotype variation, was tightly linked with the SSR marker RM525. qSAT-7-R, explaining 9.8% of the phenotype variation, was tightly linked with the marker RM418. The positive alleles of the two loci came from C Bao. Six loci controlling SAT, designated as qSAT-2-B, qSAT-3-B, qSAT-5-B, qSAT-8-B, qSAT-9-B and qSAT-12-B, were detected in a backcross inbred line (BIL) population (98 lines) derived from a backcross of Nipponbare (japonica)/Kasalath (indica)//Nipponbare (japonica). The positive alleles of qSAT-2-B, qSAT-3-B and qSAT-9-B, which explained 16.2%, 11.4% and 9.5% of the phenotype variation, respectively, came from Nipponbare. Besides, the positive alleles of qSAT-5-B, qSAT-8-B and qSAT-12-B, which explained 7.3%, 5.8% and 14.0% of the phenotype variation, respectively, were from Kasalath.WANG Yang Guo Yuan HONG De-lin 2010Rice science2010,17,3:0
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