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1福建沿海葡萄牙牡蛎养殖群体遗传多样性的AFLP分析显示文摘应用AFLP方法对福建沿海葡萄牙牡蛎自然苗群体(福清、莆田、石狮、厦门)和人工苗群体(宁德、连江、石狮、诏安)进行了遗传多样性分析。采用4对选择性引物组合对8个养殖群体239个个体进行扩增,共得到331个位点,多态位点233个。8个养殖群体的多态位点比例、Nei’s基因多样性指数和Shannon遗传多样性指数分别为57.10%~69.54%,0.196 7~0.249 2,0.290 2~0.362 6。其中4个自然苗群体的多态位点比例、Nei’s基因多样性指数和Shannon遗传多样性指数均高于4个人工苗群体。遗传分化系数Gst及AMOVA分析表明,8个养殖群体的遗传变异主要来源于群体内个体间。UPGMA聚类图及PCA聚类图分析表明,人工苗群体和自然苗群体之间及人工苗群体内都存在一定的遗传分化,而自然苗群体内所有个体基本是随机交叉聚类,没有形成明显的类群分支。以上结果表明,自然苗群体的遗传多样性高于人工苗群体,群体间存在一定的遗传分化。巫旗生 宁岳 曾志南 王晓清 祁剑飞 马晓 林凤飞 2013上海海洋大学学报2013,22,3:7
2卵形鲳鲹养殖群体与野生群体遗传多样性的AFLP分析显示文摘利用AFLP技术对北部湾卵形鲳鲹野生群体和养殖群体进行遗传多样性分析和比较,可为卵形鲳鲹种质优化提供基础依据。研究采用10对引物组合在2个群体中共扩增出513个位点,其中多态位点数为133个,占总位点数的25.93%,两个群体平均多态位点比率为23.59%和18.32%,遗传多样性相对贫乏。养殖群体中低频位点明显减少而隐性纯合基因位点显著增加表明养殖群体丢失了低频基因。群体遗传结构分析表明,两群体间的遗传距离比较小,群体遗传结构相似。彭敏 陈晓汉 陈秀荔 蒋伟明 杨春玲 李咏梅 2011西南农业学报2011,24,5:4
3岱衢洋与官井洋大黄鱼养殖群体遗传多样性的AFLP分析显示文摘应用扩增片段长度多态性技术(AFLP),比较研究了岱衢洋大黄鱼养殖群体和官井洋大黄鱼养殖群体的遗传多样性。9对选择性引物组合,在2个群体的40个个体中共扩增出381个位点,其中多态位点为288个。2个养殖群体的多态位点比例、Nei′s基因多样性指数、Shannon多样性指数分别为65.01%和57.50%,0.162 3和0.1175,0.254 7和0.185 6,显示岱衢洋大黄鱼F2代养殖群体的遗传多样性高于官井洋大黄鱼繁育多代养殖群体的遗传多样性。UPGMA聚类分析图显示2个群体各自聚成一支。遗传分化系数Gst及AMOVA分析表明,2个群体的遗传变异主要来源于群体内个体间,但群体间已有一定程度的遗传分化。娄剑锋 雷世勇 竺俊全 吴雄飞 2015海洋科学进展2015,33,3:3
4中国近海鮸鱼遗传多样性的细胞色素b全序列分析显示文摘分析了中国近海连云港、舟山和福州38尾鮸鱼线粒体细胞色素b(Cytb)基因的1 140 bp序列,共检测到39个变异位点和5个简约信息位点;共有27个单倍型,总的单倍型多样性为0.960±0.020,核苷酸多样性为0.00271±0.00030,表现为高单倍型多样性和低核苷酸多样性;Tajima's中性检验为负值且显著(-2.36010,P<0.05),在简约性网络图中单倍型呈星状分布,核苷酸不配对分析呈单峰曲线,表明中国近海鮸鱼经历过种群扩张,推测扩张年代约为8万年前。在邻接树和简约性网络图中不同地理来源的单倍型交错分布,群体间有较低的Fst值(-0.0190~-0.0081)和较高的Nm值(-62.53~-26.82),分子方差分析(群体间-1.12%)表明群体间未出现明显的遗传分化,可作为一个管理保护单位,推测鮸鱼生活史中存在一定规模的洄游以及扩张后的群体尚未在迁移与漂变间达到平衡是未检测到显著地理和谱系结构的主要原因。夏月恒 章群 高志远 陈德荫 李贵生 2013广东农业科学2013,40,3:3
5甘肃金鳟AFLP体系建立及应用显示文摘甘肃金鳟是中国自主培育的虹鳟新品种,为进行其种质资源研究和遗传管理,以其尾鳍为试验材料,提取基因组DNA,对影响甘肃金鳟扩增片断长度多态性(AFLP)反应体系进行优化,包括模板DNA浓度、基因组酶切时间、选择性扩增中Mg2+、预扩增产物稀释倍数及选扩性引物M+3/E+3配比等进行比较分析,建立了适于甘肃金鳟的AFLP反应体系。即:100ng基因组DNA,3U EcoR I37℃酶切3h,再Mse I65℃酶切5h;然后用1U的T4连接酶连接12h,选扩25μL PCR反应体系中Mg2+2.0mmol/L,预扩产物稀释30倍,选扩引物M+3/E+3配比为8∶1,所得产物经电泳和银染后可获得清晰条带,效果良好;最后,筛选出了适宜甘肃金鳟品种分析的13对选择性引物。苏军虎 张艳萍 娄忠玉 焦文龙 王太 杨建宝 吴建平 魏彦明 2011中国农学通报2011,27,7:3
6长江口及邻近海域鮸鱼的遗传多样性分析显示文摘为了解长江口及其邻近海域鮸鱼(Miichthys miiuy)的群体遗传多样性,采用线粒体COⅠ基因测序,对长江口(崇明)及邻近海域(舟山)2个鮸鱼群体的遗传变异进行了分析。结果表明,599 bp的COⅠ序列中包含22个变异位点,其中简约信息位点7个。60个个体中,共定义了20个单倍型,平均单倍型多样性指数(Hd)为0.676 8±0.069,核苷酸多样性指数(Pi)为0.002 29±0.000 37,表现为高单倍型多样性和低核苷酸多样性。分子方差分析(AMOVA)表明99.12%的遗传变异出现在种群内,仅有0.88%出现在种群间。群体间的遗传分化系数为FST=0.008 83(P>0.05),2个群体间无显著遗传分化。NJ系统树显示,2个地理来源的单倍型没有明显的地理群聚和谱系结构。中性检验和碱基岐点分布(Mismatch distribution)分析结果表明鮸鱼群体可能发生过种群扩张事件。研究结果可为鮸鱼渔业资源的合理开发和利用提供必要的参考。郭垚示 孙鑫序 张玉荣 楼宝 詹炜 毛国民 陈睿毅 2014海洋通报2014,33,3:3
7福建东山和广东阳江褐毛鲿养殖群体遗传多样性的AFLP分析显示文摘应用AFLP分子标记技术对福建东山和广东阳江褐毛鲿养殖群体进行了遗传多样性分析。采用6对选择性引物组合对2个群体60个个体进行扩增,共扩增出313个位点,多态位点85个。东山和阳江褐毛鲿养殖群体的多态位点比例、Nei's基因多样性指数、Shannon遗传多样性指数分别为24.60%和25.56%、0.0795和0.0768、0.1210和0.1176,2个群体的遗传多样性均处于较低水平。遗传分化系数Gst及AMO-VA分析表明,2个群体的遗传变异主要来源于群体内个体间。UPGMA聚类图及PCA分析显示,群体间具有典型的地理特征,且出现了一定程度的遗传分化。巫旗生 曾志南 宋传福 宁岳 陈朴贤 2012福建水产2012,34,6:2
83个花鳗鲡地理种群的AFLP分析显示文摘应用AFLP分子标记技术首次对澳大利亚、海南岛和菲律宾3个种群的共60尾花鳗鲡(Anguilla marmorata)幼鱼样品进行了遗传多样性分析。4对选择性扩增引物共扩增得到180个位点,平均每对引物扩增出45个位点。澳大利亚、海南岛和菲律宾3个种群的多态位点分别为78.33%、79.44%和84.44%,Nei′s遗传多样性指数分别为0.330 2±0.188 9、0.337 2±0.194 6和0.357 1±0.176 7,Shannon′s多样性指数分别为0.477 3±0.264 7、0.484 4±0.270 2和0.514 6±0.243 3;根据基因分化系数和AMOVA分析估算,3个花鳗鲡种群遗传变异分别有89.25%和96.07%存在于种群内,10.75%和3.93%存在于种群间。基因分化系数、AMOVA分析、遗传距离、基因流、系统树和显性基因型频率分析结果表明:3个花鳗鲡种群间出现了遗传分化,地理距离越大遗传分化程度越高,三者之间出现一定的基因交流。研究结果对花鳗鲡养殖具有指导意义。朱友芳 林凤钦 王艺磊 谢芳靖 2011海洋科学2011,35,8:2
9分子标记技术在海洋生物研究中的方法选择显示文摘为加快对海洋生物的基础性研究,依据掌握基因组信息量的不同,应用分子标记技术对海洋生物生物学研究的技术方法进行选择。选择包括3类:一类为在海洋生物基因组信息未知的情况下对分子标记技术方法的选择;一类为在掌握较少海洋生物基因组信息的情况下对分子标记技术方法的选择;一类为在掌握海洋生物基因组较多背景信息的情况下对分子标记技术方法的选择。旨在为海洋生物遗传多样性领域的研究提供参考,以期加快海洋资源的合理开发以及优良种质培育的进程。王惠君 孙妍 王文泉 范庆君 王仕明 谢诗宏 2018江苏农业科学2018,46,21:1
10江苏近海鮸胃含物初步分析显示文摘鮸是江苏近海重要的经济鱼类之一。根据2018年11月(秋季)与2019年4月(春季),在江苏近海中南部采集到的鮸胃含物样品进行其摄食习性的研究分析。结果表明,从鮸胃含物中共鉴定出4大类19种生物饵料。并且生物饵料的秋季多样性指数H’值为2.31,均匀度J’值0.76,优势度指数D值为4.34;春季的多样性指数H’值为1.23,均匀度J’值为0.42,优势度指数D值为4.12。采取百分比相对重要性指数(IRI%)和综合指标优势度指数(Ip)分析结果较一致,鱼类和虾类是江苏中南部近海鮸秋季和春季主要的生物饵料,其相对重要性指数百分比和综合指标优势度分别为35.79%和59.15、16.73%和11.17。优势饵料生物为矛尾虾虎鱼(IRI%=6.65%,Ip=13.83)和凤鲚(IRI%=9.37%,Ip=12.46)。经过相似性分析,秋季和春季鮸食性组成相似性显著,说明两个季节上鮸胃含物组成基本一致。王储庆 汤建华 熊瑛 吴磊 王燕平 施金金 闫欣 葛慧 2020浙江海洋大学学报(自然科学版)2020,39,4:0
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