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1宿根甘蔗根际土壤细菌多样性分析中培养法与非培养法比较研究显示文摘采用培养法和非培养法提取甘蔗根际土壤微生物的总DNA,基于通用引物PCR扩增构建两种方法的细菌16SrDNA文库,并进行核糖体DNA扩增片段限制性内切酶分析(ARDRA),通过部分克隆序列测定构建细菌克隆文库的系统发育树,进而对基于传统的细菌平板培养法和直接提取总细菌DNA的非培养法进行比较分析.结果显示,非培养法文库的香侬–威纳指数、辛普森指数、丰富度分别为4.94、0.998、28.91,均高于培养法文库中相应的多样性参数(分别为4.27、0.996、16.79),均一度数值都>0.95.结合统计学数据和序列测定信息,反映出甘蔗根际土壤存在着丰富的细菌多样性,但平板培养法所展现的多样性低于直接提取法,表明前者存在着很大的局限性,而非培养法文库中主要是未培养微生物的16S rDNA序列,这从一个侧面反映了土壤样品中未培养微生物占很大比例.因此,在土壤微生物群落研究中,必须结合新的分子生态学技术手段,如采用直接提取总DNA的方法进行研究,才能比较全面地认识土壤微生物多样性.黄祖新 黄镇 叶冰莹 陈由强 陈如凯 2011应用与环境生物学报2011,17,5:9
2微生物降解石油烃修复石油污染的研究显示文摘随着工业和经济的发展,环境问题成为人们普遍关注的焦点,石油污染成了不可忽视的问题。微生物降解法治理石油污染是一种有效控制污染的理想方法。综述了石油烃降解菌的种类,降解机理及筛选鉴定方法,介绍了微生物降解石油烃的影响因素,并对研究方向提出了建议。郭长禄 赵彦宏 王艳芳 李文杰 姜岩 张贤明 田西鹏 王嘉培 2016应用化工2016,45,6:8
3限制性内切酶酶切确证河豚鱼成分PCR检测结果显示文摘动植物成分的聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)检测往往出现假阳性结果,为了有效排除河豚鱼成分检测中出现的假阳性现象,提高检测结果的准确性,应用河豚鱼PCR检测引物进行河豚鱼成分的PCR检测与限制性内切酶NmeAⅢ酶切确证实验。18个供试样品中3个样品无PCR扩增产物,判为阴性结果,15个样品初步判为疑似阳性。应用限制性内切酶NmeAⅢ对疑似阳性样品的PCR产物进行酶切与电泳分析,电泳图谱与河豚鱼阳性对照不同的2个样品,判定为假阳性结果,电泳图谱与阳性对照相同的4个未知学名的河豚鱼加工样品,确证为阳性结果,即检出河豚鱼成分,PCR产物序列经GenBank同源性序列查询比对(BLAST)予以验证,建立了简便的河豚鱼成分PCR检测结果确证方法。曲良苗 陈文炳 缪婷玉 邵碧英 彭娟 江树勋 2014食品科学2014,35,8:6
4新疆两典型微咸水湖水体免培养古菌多样性显示文摘微咸水湖是湖泊演化过程中的一个重要中间状态,以新疆两典型微咸水湖-赛里木湖和柴窝堡湖水为研究对象,采用微孔滤膜收集菌体,SDS-酚-氯仿抽提法直接提取湖水总DNA,利用古菌16S rRNA基因通用引物进行PCR扩增,分别构建两湖古菌16S rRNA基因克隆文库。用限制性内切酶HaeⅢ对随机挑选的阳性克隆子进行酶切分型,分别得到7个和8个可操作分类单元(Operational Taxonomic Units,OTUs),两文库覆盖率均大于98%。BLAST比对和系统发育分析表明赛里木湖全部克隆子归属于泉古菌门(Crenarchaeota),97%的克隆子与不同环境免培养氨氧化泉古菌有较高的序列相似性(>97%)。柴窝堡湖水古菌归为3个门:Thaumarchaeota(81.2%)、广古菌门(Euryarchaeota)(13%)和泉古菌门(Crenarchaeota)(5.8%),81.2%的克隆子与具有氮代谢功能的氨氧化古菌纯培养物具有较高的序列相似性(97%—98%),13%的克隆子与已分离到的产甲烷古菌序列同源性大于97%。研究发现新疆微咸水湖可能存有大量新划分的古菌Thaumarchaeota门类群、可培养氨氧化及产甲烷古菌类群,两典型微咸水湖泊中古菌类群多样性较低且群落组成差异大。邓丽娟 娄恺 曾军 徐赢华 史应武 张煜星 2012生态学报2012,32,21:5
5聚合酶链反应-酶切分型鉴定广州地区环境水源军团菌显示文摘【目的】探讨聚合酶链反应-酶切分型在快速鉴定环境水源军团菌方面的应用价值,并了解广州地区环境水源军团菌的分布状况。【方法】对广州地区采集的44份环境水样,作军团菌分离培养,再对分离菌株进行16Sr DNA PCR-酶切分型鉴定、16S rDNA基因测序和mip基因测序鉴定。【结果】在广州地区环境水源分离的112株军团菌,经聚合酶链反应-酶切分型鉴定、16S rDNA基因测序和mip基因测序鉴定,检出嗜肺军团菌66株,非嗜肺军团菌46株,其中菲氏军团菌20株,戈氏军团菌17株,橡树岭军团菌7株,长滩军团菌2株。【结论】聚合酶链反应-酶切分型检测环境水源军团菌是一种简便、快速、特异的鉴定方法;在广州地区环境水源中普遍存在军团菌,主要是嗜肺军团菌,其次是菲氏军团菌,戈氏军团菌,橡树岭军团菌和长滩军团菌。赵利伟 胡朝晖 宣瑞红 刘洋敏 朱庆义 王娟 詹晓勇 2010微生物学报2010,50,11:4
62010年中国海洋微生物学研究成就显示文摘2010年中国学者对海洋微生物学的研究涵盖基础研究、应用研究以及基础研究与应用研究结合的产物,对方法学的探求越来越追求精准快速并向检测对象的多样性发展,对海洋病毒、海洋真菌、养殖生物病患、分类鉴定、生态和环境微生物学等方面的研究都有新的突破,发表的海洋微生物学论文约有350篇,其中水产学科的论文约有150篇,其余为基础性质的论文。学者们关注海洋微生物学的主要眼光正在从水产方面扩展,中国海洋微生物学研究正日臻成熟。孙丕喜 郑风荣 陈皓文 2012广西科学院学报2012,28,4:0
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